真核生物细胞质tRNA生物合成研究的进展

tRNA是蛋白质翻译机器中的必需成分,它对细胞的生长和增殖及器官的发育起着决定性作用.tRNA生物合成包括tRNA基因的转录、转录后的加工和修饰.对tRNA生物合成的研究还包括tRNA在细胞中的运输、tRNA生物合成的质量监控及其与其他重要细胞途径（如mRNA生物合成、DNA损伤应答和细胞周期）之间的相互作用,以及tRNA生物合成在生长发育和疾病中的作用.本文主要介绍了近年来真核生物细胞质tRNA生物合成研究的一些重要进展.     

植物发育分化分子生物学研讨会在沪举行

由中国科学院生物局委托,上海植物生理研究所筹备召开的植物发育分化分子生物学研究讨论会于二月二十一日至二十三日在沪举行。与会代表四十余人,生物局有关领导出席了会议。植物发育与分化的分子生物学研究,是由中科院上海植生所和中科院植物所共同承担的院重大项目。这次会议主要对该项目一年多来的工作进行交流和总结并制订下一步工作计划。     

19届国际tRNA学术研讨会在上海召开

19届国际tRNA学术研讨会于2002年4月6日至11日在中科院上海生科院召开,来自中、美、法、英、德、日、俄等十多个国家的120多人参加了会议。由中国科学院生物化学与细胞生物学研究所研究员金由辛和国际生物化学与分子生物学联合会主席、欧盟-中国生物技术合作小组负责人、丹麦Aarhus大学教授B.Clark担任会议主席。这是该系列会议第一次在发展中国家召开。会议开幕后,首先由金由辛作了“中国的tRNA研究”的报告,回顾了中国酵母丙氨酸tRNA全合成等工作。4天会议发言中,共有62人作了报告,各报告后均有热烈讨论。报告涉及tRNA基因、转录成熟、加工、转运,细胞器中     

迎21世纪生命科学学术研讨会暨中科院上海生化所99学术年会隆重举行

世纪之交国内生命科学领域内的一次重要的学术活动———中科院上海生化所的“迎21世纪生命科学学术研讨会暨上海生化所99学术年会”,于1999年12月23～24日,假座中科院上海学术交流中心隆重举行。与会的科研人员和研究生近400人。这次学术活动在国家自然科学基金委、中科院国际合作局、中科院生物局和上海市科委的支持下,邀请了十多位海内外学有所成的优秀学子,他们分别来自美国、加拿大、日本、德国及中国香港特别行政区。他(她)们与上海生化所的十多位科学家在大会上作了高水平的学术报告,会议气氛热烈。到会的各级领导来自国家自然科学基…     

祝贺沈昭文教授90华诞

祝贺沈昭文教授９０华诞中国科学院上海生物化学研究所于１９９５年６月１６日上午为著名老一辈生物化学家、中科院上海生化所研究员、中国生物化学与分子生物学会名誉理事、《生命的化学》期刊创办人沈昭文教授举行了９０华诞庆祝活动。中国生化学会、上海生化学会、《生...     

血管生成素与tRNA片段化

tRNA主要功能是转运氨基酸参与蛋白质合成,在蛋白质生物合成过程中起着关键性的作用．近年来发现,tRNA是细胞内小RNA分子的重要来源,具有其它重要的生物学功能．来源于成熟tRNA分子的tRNA片段根据切割位置及生成机制的不同,主要分为两类：一类是tRNA半分子（tRNA halves）;另一类是较小的tRNA片段,称为tRFs( tRNA fragments)．在哺乳动物细胞中,tRNA半分子由血管生成素在tRNA分子反密码环处切割生成．本文主要针对tRNA半分子的加工机制、功能及在临床上的潜在应用进行综述．     

人线粒体tRNA t6A修饰酶OSGEPL1的功能位点鉴定

tRNA t⁶A是一种进化上保守的转录后修饰,对翻译和蛋白质稳态平衡至关重要,其缺失严重影响细胞生命和高等生物的组织和器官发育.三界生物系统中的tRNA t⁶A修饰酶随着生物复杂性的增加而进化出多层次的调控机制.人YRDC和OSGEPL1负责线粒体中tRNA t⁶A的生物合成.YRDC催化L-threonine,HCO₃^-/CO₂和ATP生成TC-AMP中间体,其上的TC-基团由OSGEPL1催化转移至tRNA A37的第6位氮原子上,形成tRNA t⁶A.本研究分析了OSGEPL1与人线粒体tRNA的相互作用和其t⁶A催化活性之间的关系.基于OSGEPL1-tRNA复合体预测模型,进一步分析了OSGEPL1的金属离子结合位点、TC-AMP结合位点和tRNA结合位点.研究结果对于理解OSGEPL1-tRNA-TC-AMP复合体的分子识别和催化调控提供了理论见解和实验数据.     

tRNA核酸内切酶的研究进展

tRNA在蛋白质合成过程中起着极其重要的作用。在所有的生物体内,tRNA首先以前体形式转录,然后必需经过一系列的加工后才能成为有功能的tRNA分子。tRNaseZ、RNaseP和tRNA剪接内切酶是参与tRNA前体加工的三种主要的核酸内切酶,分别参与tRNA前体3′末端、tRNA前体5′末端和内含子剪接的加工。这三种酶具有不同的结构特征,并且利用完全不同的催化机制水解磷酸二酯键。tRNaseZ和RNaseP都是金属酶,活性中心分别需要Zn^2＋和Mg^2＋的参与;而tRNA剪接内切酶活性中心不需要金属离子,是一个由不同催化亚基上的关键氨基酸残基构成的组合式活性中心。     

镁离子稳定tRNA高级结构及其重要意义--生化所tRNA研究的一段历史回顾

镁离子稳定tRNA高级结构并具有重要的生理功能已经写入生物化学教科书。上世纪60年代初,中国科学院上海生物化学研究所的研究者与国外同行同时发现了这一现象。镁离子稳定tRNA的高级结构在tRNA的序列分析中可以得到较大的片段,甚至tRNA半分子。将这一事实运用于“片段重叠”法测定tRNA序列工作中,极大地推动了tRNA的序列测定。     

第八届全国激光生物学学术会议暨《激光生物学报》创刊十周年庆祝会会议纪要

一、会议概况由中国遗传学会主办、湖南师范大学承办的“第八届全国激光生物学学术会议暨《激光生物学报》创刊十周年庆祝会”于 2 0 0 2年 1 1月 1 0日至 1 3日在长沙市岳麓山下的湖南师范大学国际学术交流中心召开。来自北京、天津、上海、重庆、广东、广西、福建、浙江、江苏、安徽、湖北、山东、内蒙、四川、陕西、甘肃、湖南等省、市、自治区的代表近 70人参加会议。代表中有参加历届学术会议的老专家、教授 ,还有一批新学者、年轻的博士、硕士研究生。他们主要来自中科院生物物理所、中科院遗传与发育所、中科院近代物理所、中国科技…     

2011年新当选中国科学院院士李林研究员介绍

2011年中科院院士增选结果12月9日揭晓,51名科学家新当选为中科院院士,中国蛋白质专业委员会委员、上海生物化学与细胞生物学研究所李林研究员当选。李林,1961年生,1983年毕业于南京大学生物系,1989年在中国科学院上海生物化学研究所获博士     

tRNA衍生片段的鉴定及对靶分子的调节机制

随着测序技术的发展和对tRNA衍生小分子(tRNA-derived small RNA,tsRNAs)的深入研究,越来越多的tsRNAs及其功能在各物种中被鉴定。tsRNAs根据切割位点的不同可分为tRNA衍生片段(tRNA-derived fragment,tRF)和tRNA应激诱导RNA(tRNA-derived stress-induced RNA,tiRNA),其中tRF是一类具有调节功能的非编码RNA。为了加深对tRF的研究,近年来一些基于测序数据的tRF鉴定方法和相关数据库不断涌现,前者主要包括Telonis等人的算法和tDRmapper方法,后者主要有tRFdb、tRF2Cancer和MINTbase等。同时这两者为tRF的深入研究提供了更有效的工具。大量的研究表明,tRF主要以类似miRNA的方式对RNA、DNA及蛋白质进行调节,但也存在特异的作用方式。随着对这三者的深入研究,研究人员发现tRF在人类疾病的各种生物过程中也扮演着重要的角色,例如可以作为生物标志物。因此本文主要对tRF的鉴定方法、数据库、对靶分子的调节机制及其与人类疾病的关系作一综述。     

tRNA转录后修饰的功能及其与人类疾病的关系

转移核糖核酸(tRNA)的转录后修饰对tRNA正常行使生物学功能具有重要意义,这些功能包括tRNA的正确折叠和维持其稳定性、在核糖体上正确解码。虽然tRNA转录后大部分核苷酸修饰形式在20世纪70年代已被鉴定出,但最近才在大肠杆菌及酵母中鉴定出催化这些tRNA核苷酸修饰的酶的绝大部分基因。这些修饰酶基因的鉴定为研究tRNA转录后修饰的生物功能开启了新的大门。人胞质tRNA和线粒体tRNA(mt tRNA)都存在大量核苷酸修饰,这些修饰的缺陷常常与多种人类疾病相关。因此,研究tRNA核苷酸修饰有助于我们了解相关疾病的发病机理。     

第七届全国生物膜学术讨论会在昆明召开

第七届全国生物膜学术讨论会于１９９９年１１月８日至１１日在云南省昆明市召开。本次会议由中国生物物理学会、中国细胞生物学会和中国生物化学与分子生物学会联合举办,中科院昆明动物所和中国细胞生物学会云南省分会协办。来自全国各地的共１５０余名学者参加了会议。会议分综述报告和学术交流两部分。共有１０位专家就目前生命科学研究的热点在生物膜领域的研究进展作了综述报告：中科院上海生物化学研究所的林其谁研究员长期从事生物膜尤其是线粒体膜的研究工作,就线粒体与细胞凋亡的关系作了报告;中科院上海细胞生物学研究所的裴钢…     

本刊举行庆祝创刊40周年座谈会

中国植物生理学会暨本刊编辑部于1991年9月3日在中科院上海植生所举行了庆祝本刊创刊40周年(1951～1991)座讲会。参加座讲会的有中国植物生理学会在沪历届理事,本刊在沪历届编委,以及复旦大学、华东师大、上海师大、上海农科院、上海农学院、上海技术师院、上海园林科研所、上海中药研究所和中科院上海植生所等单位的植物生理学同仁和本刊作者、读者共60余人。中国科技期刊编辑学会、《中国药理学报》和《生命的化学》等兄弟期刊负责人到会祝贺。     

人类线粒体tRNA生物合成与线粒体疾病

线粒体是普遍存在于真核细胞中的一类细胞器.每个线粒体含有多个拷贝的闭合环状双链DNA. 人类线粒体DNA (mitochondrial DNA, mtDNA)共编码22种线粒体tRNA(mitochondrial tRNA,mt tRNA), 2种rRNA 及13种多肽.mt tRNA独特的结构特点决定了它们与具有典型三叶草结构的细胞质 tRNA不同.编码mt tRNA的基因突变频率较高,这可能是引起线粒体功能障碍的主要原因之一. 同时 ,这与很多病理现象相关.目前发现,大量与mt tRNA生物代谢和功能相关的核因子包括加工内切酶、 tRNA修饰酶和氨酰-tRNA合成酶.这些核因子的异常导致了疾病相关的tRNA致病突变.由此可见mt tRNA功能对于线粒体活性的重要性.     

科研项目的基金申请管理

中国科学院上海生物化学研究所（以下称上海生化所）是我国生命科学研究领域中具有优势、以基础研究为主的研究所。其主要学科是生物化学和分子生物学,有着多领域的综合优势和长期以来形成的良好的学术交流环境及严谨的学风。根据国家科委、基金委、中科院和其他有关部委制定的生命科学“九五”发展计划或纲要,在组织各类科研项目申请前,首先,科研管理人员自己要熟悉各类项目申请指南,在理解卜肖化政策的前提下,结合我所确定的重点发展领域和科研优势领域,做好针对各类项目的申请指南宣传、讲解工作,使科研人员了解熟悉项目的申请、…     

抓技术进步 促企业发展

抓技术进步促企业发展杨元祥（上海华新生物高技术有限公司２００２３３）关键词：科技进步,创业发展在国内外现代生物技术产业发展竟争日益激烈的形势下,上海华新生物高技术有限公司按照邓小平同志“发展高科技,实现产业化”的指示,在中国科学院院士刘新垣教授的推动下,由上海华联制药公司、中科院上海生物化学研究所、香港沪康药业有限公司、中科院上海生物工程研究中心四方合资组建。     

《细胞-干细胞》:研究揭示受精卵DNA去甲基化重要机制

<正>近日,中科院上海生科院生化与细胞所一项最新研究发现,小鼠早期胚胎中母源和父源基因组在单细胞的受精卵阶段,均会发生大规模的DNA主动和被动去甲基化,DNA双加氧酶Tet3介导了主动去甲基化的发生,而糖苷酶TDG并不参与该过程。相关研究成果在线发表于学术期刊《细胞-干细胞》。该研究由中科院上海生科院生化与细胞所徐国良研究组、李劲松研究组和北京大学生命科学学院生物动态光学成像中心汤富酬研究组共同完成。研究中,科学家利用最近发展的单细胞简并代表性甲基化测序、发夹DNA甲基化测序以及测定等表观修饰分析技术,结合生殖系选择性敲     

我的回顾

王德宝教授是我国老一辈生物化学家,中国科学院学部委员学部主席团成员。在核酸研究中,成绩卓著,在培养人才中,也付出了心血。他在上海生化所建立了我国第一个核酸研究组,在他领导下,完成了酵母丙氨酸tRNA的人工合成,享有国际声誉。他在国内外重要杂志上发表论文百余篇。