荧光标记寡核苷酸探针及其应用

寡核苷酸探针的标记非常重要。近年来 ,用荧光染料对探针进行非放射性标记受到很大重视 ,并取得了迅速发展 ,广泛应用于核酸序列测定、基因检测以及疾病诊断等。以下就寡核苷酸探针的荧光标记及其应用作一简要综述。     

等Tm检测探针寡核苷酸芯片在p53突变热点检测中的应用

用等长探针检测基因的点突变,不同GC含量探针的碱基错分辨率很难均一。尝试利用探针近似等Tm的原则设计、制备了检测抑癌基因p53外显子7中密码子245、248、249单碱基突变及缺失的寡核苷酸芯片。实验得到较好的碱基错配分辨率,检测不同位点的碱基错配分辨率较为一致,芯片检测结果与测序结果一致。实验结果为制备检测p53常见热点突变的寡核酸芯片奠定了基础。     

反义寡核苷酸的抗病毒作用及其研究进展

根据靶核酸序列设计的具有一定长度的反义寡核苷酸可与靶核酸特异结合,从而发挥调节基因表达的功能。本文涉及反义寡核苷酸及其类似物的抗病特性、抗病毒机理、反义寡核苷酸的毒性和药物动力学以及未来的发展前景。     

基因突变及其表达

基因突变亦称为“点突变”,因为从细胞水平来看,基因是染色体上的一“点”;从分子水平看,基因突变是     

反义寡核苷酸的化学修饰

反义寡核苷酸的功能在很大程度上取决于其稳定性、生物利用度及与靶基因结合或反应的特性．通过特定的化学修饰可以改变这些物理、化学特性,从而增加其抗病毒、抗肿瘤及对其他特定基因的表达抑制活性．     

高效薄层色谱法纯化合成寡核苷酸及其衍生物

在分子生物学研究的许多领域均需要一定纯度的寡核苷酸.目前寡核苷酸的纯化方法主要有高效液相色谱法及电泳法两种.这两种方法不仅需要一定的仪器设备而且纯化周期长(2—3d)、回收率低(50%—80%).文中报道建立了一种高效薄层色谱纯化寡核苷酸及其衍生物的方法.该方法可在3—4h 内获得寡核苷酸纯品,平 均回收率可达97.7%.     

合成寡核苷酸的简易纯化方法

由手工或机器合成寡核苷酸到使用它们的过程中,纯化步骤经常成为速度限制因素,因为目前采用的常规纯化方法比较繁复,特别当样品数和每份样品量多时,往往难以满足工作的需求。有鉴于此,1986年Lloyd等报道了一个简易的纯化方法,似可克服上述不足。笔者从1986年以来曾多次参照Lloyd等法(仅在某些细节上略作改变)纯化由合成机合成的脱氧寡核苷酸片段(其长度为30-mer—50-mer),效果不错,在此作一介绍,以供参考。     

反义寡核苷酸递送方法研究进展

如何将反义寡核苷酸 (AS ODNs)有效递送进入细胞是反义核酸领域面临的一大难题。近年来 ,出现了多种寡核苷酸 (ODNs)的递送方法。在培养细胞中 ,使用的递送方法包括阳离子载体包裹、特异受体的配体导向、ODNs偶联修饰、细胞膜辅助穿透以及利用逆转录病毒载体转染等 ,其应用有效增强了AS ODNs的作用效果 ,大幅度降低了AS ODNs的使用浓度 ;在体内 ,由于临床使用裸露AS ODNs连续给药能达到一定的反义效果 ,而使递送方法的研究和应用尚处于初步尝试和探索之中 ,迄今报道的递送方法有脂类和非脂类两类。     

化学修饰寡核苷酸在核酸配基扩增技术中的应用

核酸酸基扩增技术（SELEX)可从极大容量的随机寡核苷酸文库中筛选得到与靶分子高特异性和高亲和力结合的核酸配基。对寡核苷酸进行化学修饰,可以提高核酸配基的稳定性,增加其功能多样性及生物利用度。SELEX在基础研究、诊断和治疗试剂的研制及药物筛选等领域有广泛用途。     

用合成的寡核苷酸探针鉴定中国人β-地中海贫血基因突变

用人工合成的六种对β-地中海贫血基因特异的寡核苷酸作为杂交探针,对10例β-地中海贫血病人及其父母的β-珠蛋白基因进行分析,鉴定出六种β-地中海贫血突变:(1)TATA Box-28 A→G;(2)IVS-1n.5 G→C;(3)Codon 17 A→T;(4)codons 41—42—46p;(5)Codons 71—72+A;(6)IVS-2 n.654C→T。本文分析的中国人β-地中海贫血患者中,上述六种突变所占的百分比分别为5％,10％,10％,40％,20％和15％。     

寡核苷酸合成的一种优化方法

为提高寡核苷酸的合成效率,结合本实验室研制出的探针并行合成装置,提出了一种寡核苷酸合成的优化方法,可有效减少合成的循环次数,同时使合成成本降低、合成时间缩短,合成效率大大提高。     

寡核苷酸的优化设计

在核酸分子杂交、ＤＮＡ序列测定和通过ＰＣＲ放大ＤＮＡ片段等实验中 ,都需要使用寡核苷酸作为探针或引物 ,而对这些反应的质量起最重要影响作用的 ,就是这些寡核苷酸探针或引物。用优化的寡核苷酸进行实验能够很快得到好的结果 ,而用不够合适的寡核苷酸时 ,常常得出似是而非的结果 ,不仅大大增加了后续实验的工作量 ,还可能一无所获。怎样优化设计寡核苷酸呢 ?至少有下列收稿日期 :2 0 0 1 0 4 0 9几个方面的问题需要考虑。1 .估测可能形成的ＤＮＡ或ＲＮＡ双链的稳定性寡核苷酸 ,无论是ＤＮＡ的或者ＲＮＡ的 ,都有形成双链结构的潜在可能…     

寡核苷酸阵列比较基因组杂交技术及其应用

阵列-比较基因组杂交技术（array comparative genomic hybridization, array CGH）能在全基因组水平和/或高分辨率基础上检测染色体拷贝数的变化,主要应用于遗传学和肿瘤学研究。Array CGH中微阵列探针通常是PCR扩增的BAC克隆或cDNA分子。最近几年,寡核苷酸阵列比较基因组杂交（oligonucleotide array CGH, oaCGH）逐渐开始应用。oaCGH与BAC array CGH比较,具有操作更简便、探针设计更灵活、分辨率更高等多项优点,预计oaCGH将逐步取代利用BAC克隆片段或cDNA分子的array CGH。oaCGH的应用及其与其它高通量检测技术的结合将促进新的癌症相关基因、肿瘤耐药基因的发现。本文综述了现有主要oaCGH平台在空间分辨率、探针长度、灵敏度、特异性等方面的特点及其应用,概括了oaCGH近年来的进展。     

cDNA微阵列与寡核苷酸芯片的制备方法

cDNA微阵列和寡核苷酸芯片是常见的合成后点样的DNA微阵列。点样方法主要是通过物理吸附或共价结合的方式将探针固定于载体上,本总结了近年来国内外献报道的cDNA微阵列制备方法;在多聚赖氨酸包被的玻璃基片表面制备cDNA微阵列;用琼脂糖包被的玻璃基片制备cDNA微阵列;在氨基或醛基修饰的玻璃基片表面制备cDNA微阵列;寡核苷酸芯片的制备方法;氨基修饰的玻片与5′末端带氨基的寡核苷酸探针通过不同的linker连接;硅烷化寡核苷酸直接点样于玻片上制成寡核苷酸微阵列;硫代寡核苷酸通过二硫键与巯基修饰的玻片连接;水凝胶芯片固定寡核苷酸。丙烯酰胺硅烷化的基片与5′丙烯酰胺修饰的寡核苷酸连接。并展望了基因芯片的应用前景。     

寡核苷酸芯片在微生物检测中的应用

近几年来发展起来的基因组研究技术———基因芯片技术为微生物检测提供了一种强有力的手段。目前国内外已广泛地开展了利用寡核苷酸芯片对多种微生物 (主要是病毒和细菌 ,少量有真菌 )进行相关检测的研究 ,并在对微生物病原体检测、种类鉴定、功能基因检测、基因分型、突变检测、基因组监测等方面获得了成功。由于寡核苷酸探针具有可根据研究需要任意设计、特异性高等特点 ,寡核苷酸芯片在微生物检测中有着巨大的应用价值 ,具有广阔的应用前景。     

寡核苷酸引导的定向诱变

由寡核苷酸引导的体外诱变技术又称定向诱变技术,它包括下列步骤;克隆待诱变的DNA至phagemid;制备单链DNA模板;设计并合成特殊的诱变寡核苷酸(在寡核苷酸中,除其中少数几个待诱变的碱基外,其余均与单链DNA模板上的待定区域互补);合成双链DNA。通过上述步骤,我们使Stx—B基因的N末端产生了新的BamH1位点,在C末端产生了新的Bgl I识别序列,从而为Stx—B基因融合至LamB基因创造了条件。该法是遗传工程中不可缺少的重要手段之一。     

植物反义寡核苷酸的研究进展

本文介绍了近年来植物中反义寡核苷酸的研究现状,它包括反义ＤＮＡ、反应ＲＮＡ和Ｒｉｂｏｚｙｍｅ。反义寡核苷酸能特异地拮抗内源或外源基因表达,这为研究某特定基因功能提供了更有效的方法,此外也为培育抗病植株,建立植物反向筛选系统,次生代谢调控及农艺性状改良提供了可能途径。