第五届国际白细胞分化抗原会议及新命名的分化抗原

第五届国际白细胞分化抗原会议及新命名的分化抗原郑永唐,贲昆龙（中国科学院昆明动物研究所６５０２２３）１９９３年１１月３—７日在美国波士顿召开了第五届国际人白细胞分化抗原会议,与会代表共１０００多名,大陆学者１０余名。会议交流论文８５４篇。全世界５００...     

中国银杏目植物化石的几个命名问题

依据《国际植物命名法规》（维也纳法规）第6.4条, 我国两种银杏目植物化石具有不合法的形态种名。Sphenobaiera biloba S. N. Feng （1977）和S. rugata Z. Q. Wang （1984, Dec.） 分别为S. biloba Prynada （1938）和S.？ rugata Z. Y. Zhou （1984, Mar.）的晚出同名。兹遵照国际植物命名法规（第7.3和53.1条）为上述两种植物分别建立新名称。另两个形态种名Ginkgoites elegans S. Yang, B. N. Sun ＆ G. L. Shen （1988）和Baiera ziguiensis F. S. Meng （1987）在发表时都未曾明确指定模式标本, 因而是不合格发表的名称（法规第12和37条）。本文为之分别指定主模式, 并建立新种。Ginkgoites elegans Z. Y. Cao （1992）一名虽然被Ginkgoites elegans S. Yang, B. N. Sun ＆ G. L. Shen （1988）先期占用, 因其为合格发表名称, 仍可应用, 而后一名称不是合格发表的, 并不具备命名上的优先权。     

SLAⅠ类基因最新命名进展

介绍了国际动物遗传学会（ISAG）SLA命名委员会2004年制定的依据基因测序及进化树分析的SLAⅠ类基因系统命名法,详细叙述了对SLAⅠ类基因座、等位基因组、等位基因及单倍型的命名规则,其中概括介绍了命名新等位基因对基因序列的具体要求。SLAⅠ类基因系统命名法对于人类移植免疫学、猪免疫遗传及抗病育种具有重要意义。     

病毒的分类与命名进展概况

早在60年代,业已知道感染脊椎动物、无脊椎动物、植物和细菌的病毒约数百种,但这些病原体的分类与命名处于混乱状况。1966年,在莫斯科举行的国际微生物学代表会议上,成立了国际病毒命名委员会(International Committee on Nomenclatureof Viruses,简称ICNV),其目的是寻求一个各种病毒通用的分类系统,该委员会是在病毒应如何分类与命名的激烈争论中诞生,同时也在各种意见极为分歧的争论中获得发展。1971年,由wildy整理并发表了“ICNV第一次报告——病毒的分类与命名”,描述并承认43个病毒属和组的名称,还确定了两个病毒科:乳多空病毒科(Papovavi-     

在墨尔本召开的第18届国际植物学大会做出的有关名称发表要求的变化——电子出版物对你意味着什么？

《国际植物命名法规》的修订由每六年一次的国际植物学大会（IBC）命名分会来决定。第18届国际植物学大会在澳大利亚墨尔本举行;命名分会于2011年7月18日至22日召开,其决议获得7月30日的全体会议通过。“墨尔本法规”有几个重要的变化,将影响新名称的发表。这些变化中的两个将在“墨尔本法规”出版前的几个月,即于2012年1月1日起生效。通过以移动文档格式（Portable Document Format;pdf）在线发表的具有国际标准连续出版物号（ISSN）或国际标准图书编号（ISBN）的电子出版物,将构成有效发表。新分类群名称的合格发表所必须的拉丁文描述或特征集要将更改为拉丁文或英文描述或特征集要。此外,自2013年1月1日起,被处理为真菌的生物的新名称必须在原始资料（某一名称合格发表时与之有关的所有资料）中引证一个由一家公认的存储库（例如MycoBank）签发的标识码,才构成合格发表。本文提供了有关电子出版物的新规则的草案文本,并概述了相应的最佳做法。     

关于晚古生代楔叶属(楔叶纲)的名实问题

简要回顾Sphenophyllum Koenig和Sphenophyllum Brongniart的研究历史,详细讨论该属命名中存在的问题。这两者是基于相同的模式（即Sphenophyllites emarginatus Brongniart,1822）建立的。根据2006年《国际植物命名法规》（维也纳法规）规则32．1,14．4和附录Ⅲ,Sphenophyllum Koenig因没有明确的发表日期（出版年）,故为非法名称,应予废弃;而Sphenophyllum Brongniart因广为使用已被提议为保留名,其命名异名Sphenophyllites Brongniart,1822应被废弃。因此,正确名称应是Sphenophyllum Brongniart,1828。     

新版国际植物命名法规(维也纳法规)中的主要变化

出版于2006年9月的最新版的《国际植物命名法规》,即维也纳法规（Vienna Code）,取代了圣路易斯法规（Saint Louis Code）而成为管理植物学（包括藻类学和真菌学）科学命名的唯一有效法规。本文报道了维也纳法规和圣路易斯法规之间的主要区别。这些区别包括两版法规在起始日期、有效发表、合格发表、化石植物、多型真菌、拼写和附录诸方面的不同。     

中国兰科植物新资料

本文报道了２个新种（元阳石豆兰ＢｕｌｂｏｐｈｙｌｌｕｍｙｕａｎｙａｎｇｅｎｓｅＴｓｕｉ,长帽隔距兰ＣｌｅｉｓｏｓｔｏｍａｌｏｎｇｉｏｐｅｒｃｕｌａｔｕｍＴｓｉ）、２个新组合（翼萼卷瓣兰ＢｕｌｂｏｐｈｙｌｌｕｍｒｅｔｕｓｉｕｓｃｕｌｕｍＲｃｈｂ．ｆ．ｖａｒ．ｏｒｅｏｇｅｎｅｓ（Ｗ．Ｗ．Ｓｍｉｔｈ）Ｔｓｉ,角萼卷瓣兰Ｂ．ｒｅｔｕｓｉｕｓｃｕｌｕｍＲｃｈｂ．ｆ．ｖａｒ．ｔｉｇｒｉｄｕｍ（Ｈａｎｃｅ）Ｔｓｉ）和１个新命名（细茎毛兰ＥｒｉａｔｅｎｕｉｃａｕｌｉｓＳ．Ｃ．ＣｈｅｎｅｔＴｓｉ）。     

生物谱系命名法规简评

基于林奈命名法和林奈分类系统的生物分类系统已经存在250多年并仍然为广大生物学工作者使用,由此产生的国际动物、植物、细菌的命名法规亦执行了100年(1905年,国际植物命名法规第1版产生),并在不断修订.随着分类方法的不断进步,林奈分类系统的一些缺陷逐渐显露,一种被称为生物谱系命名法规(PhyloCode)的新的命名法出现在人们眼前.这种基于系统发育系统学的命名法规一经问世就引起诸多争论,但是,作为一种新的命名法规,无论与传统的命名法规融合还是独立发展,对于已有的分类系统都是一个新的机遇和挑战.     

ICNP与SeqCode：组学时代原核生物命名面临的机遇与挑战

自1936年细菌学家Buchanan负责起草专门的细菌命名法规以来,国际原核生物命名法规(International Code of Nomenclature of Prokaryotes, ICNP)在不断发展和完善过程中,积极促进了原核生物分类学及相关学科的发展。随着组学技术在原核生物多样性研究中的应用,越来越多未培养的细菌和古菌新类群被发现,却因为ICNP要求活的生物材料作为命名模式(nomenclatural type),而无法获得生效名称(validly published name)。2022年,原核生物命名法规从序列数据描述原核生物命名法(Code of Nomenclature of Prokaryotes Described from Sequence Data, SeqCode)正式发布,以补充ICNP在未培养微生物类群命名方面的不足。SeqCode不希望和ICNP产生较大分歧,并尽可能保留在将来和ICNP合并的可能性。然而,作为两种独立运行的命名法规,尚不明确SeqCode和ICNP并存会对学术界产生怎样的影响。本文系统介绍了ICNP和SeqCode各自的发展历程和主要内容,分析了二者的优势和局限性,并呼吁微生物学相关领域的学者共同关注原核生物命名法规并应用于实践,以期构建更加合理、有效的原核生物名称系统。     

赤子爱胜蚓对两种土壤中细菌群落结构组成及多样性的影响

本研究探讨赤子爱胜蚓（Eisenia fetida）对不同土壤细菌群落结构的影响,以便利用蚯蚓改善土壤生物学质量。选取华南地区赤红壤和水稻土,分别接种赤子爱胜蚓进行10 d室内盆钵培养,运用16S rDNA Illumina Miseq高通量测序技术对培养前后土壤的细菌群落结构进行分析。结果显示：（1）经赤子爱胜蚓取食后,两种土壤的细菌群落结构均发生了改变。赤红壤中增加了5个非优势细菌门,分别为FBP、纤维杆菌门（Fibrobacteres）、OP11、柔膜菌门（Tenericutes）和Thermi;Cytophagia、Spartobacteria和疣微菌纲（Verrucomicrobiae）从非优势细菌纲变为优势细菌纲;Solibacteres从优势细菌纲变为非优势细菌纲。水稻土中海绵菌门（Poribacteria）为新增加的1个非优势细菌门;螺旋体门（Spirochaetes）从非优势细菌门变为优势细菌门;4个非优势细菌门消失,分别为SBR1093、SC4、WS4和WS5;螺旋体纲（Spirochaetes）和疣微菌纲从非优势细菌纲变为优势细菌纲;浮霉菌纲（Planctomycetia）从优势细菌纲变为非优势细菌纲;酸杆菌门（Acidobacteria）、放线菌门（Actinobacteria）、拟杆菌门（Bacteroidetes）、绿弯菌门（Chloroflexi）、厚壁菌门（Firmicutes）、浮霉菌门（Planctomycetes）、变形菌门（Proteobacteria）和疣微菌门（Verrucomicrobia）依然是两种土壤中的优势类群;（2）赤红壤中酸杆菌门的相对丰度显著下降44.90%,拟杆菌门的相对丰度显著上升14.88%;水稻土中酸杆菌门、绿弯菌门、芽单胞菌门（Gemmatimonadetes）、硝化螺旋菌门（Nitrospirae）、浮霉菌门和疣微菌门等6种细菌类群的相对丰度分别显著下降49.05%、20.44%、64.01%、35.00%、33.56%和24.38%,而拟杆菌门和螺旋体门的相对丰度分别显著上升28.85%和154.17%;（3）两种土壤细菌丰度的变化情况存在差异：赤红壤细菌丰度呈上升趋势,水稻土细菌丰度呈下降趋势,而两种土壤的细菌多样性变化则均呈下降趋势。本研究说明,经赤子爱胜蚓取食后赤红壤和水稻土的细菌群落结构组成和多样性均发生变化,为深入理解蚯蚓与土壤微生物群落的相互作用机制提供参考依据。     

中国蕨类植物志中两色鳞毛蕨学名的纠正

两色鳞毛蕨（Dryopteris bissetiana（Baker）C．Chr．）在中国是比较常见和熟知的一种蕨类植物。《中国植物志》和《云南植物志》中采用的是一不合法的学名。在此给予纠正。     

草鱼肠道纤维素降解细菌的分离与鉴定

为更好地弄清草鱼（Ctenopharyngodon idella）肠道纤维素降解细菌的种类,采用羧甲基纤维素（CMC）作为唯一碳源的选择性培养基,分别从草鱼肠道内容物和肠道黏膜中分离到了40株产纤维素酶细菌。16S rRNA基因序列的分析结果显示,大多数产纤维素酶细菌为气单胞菌属（Aeromonas）的种类,其次为肠杆菌属（Enterobacter）的细菌以及未经分离纯培养的细菌（Uncultured bacterium）。进一步研究细菌产纤维素酶能力发现,纤维素酶活性显著性高于其他菌株的分别是A. veronii MC2、A. veronii BC6、肠杆菌科（Enterobacteriaceae）中一种未经分离纯培养的细菌BM3（Uncultured bacterium BM3）和A. jandaei HC9。草鱼肠道中简答气单胞菌（A. jandaei）、类志贺邻单胞菌（Plesiomonas shigelloides）、阴沟肠杆菌（E. cloacae）以及产气肠杆菌（E. aerogenes）是被作为产纤维素酶细菌的首次报道。       

国际动物学命名法规（第四版）（International Code of Zoological Nomenclature）

本书是关于动物分类单元名称的命名和正确使用的国际性法规，是获得国际动物命名法委员会认可的《国际动物命名法规》英文版第四版的中文译本（简体字版），包括对第四版中主要变化的说明、导言，共18章90条条款和词汇，以及具有荐则地位的附录和国际动物命名法委员会章程。     

志留纪晚期拟莱尼蕨植物Junggaria（准噶尔蕨属）的命名问题

基于《国际植物命名法规（维也纳法规）》,文中简要讨论了志留纪晚Pridoli世拟莱尼蕨植物Junggaria （准噶尔蕨属）命名中存在的突出问题,指出过去使用的JunggariaDou,1983以及J·spinosa Dou,1983和J.sphaerica (Senkevitsch) Cai,1995均未合格发表。因...     

aac（6＇）-Ib-cr介导的喹喏酮类新耐药机制研究进展

AAC（6＇）-Ib是重要的氨基糖苷乙酰基团转移酶,其变异基因aac（6＇）-Ib-cr可同时作用于氨基糖苷类和氟喹诺酮类两类结构不同的抗生素,是引起细菌耐药性的一种重要作用机制。该文主要对aac（6＇）-Ib-cr介导的喹诺酮类新耐药机制相关研究进行综述。     

病毒命名与分类系统研究进展

病毒的命名过去不够统一,有些病毒是以宿主、病理特点、致病症状、病毒颗粒形态进行命名,有些病毒是以地名和人名进行命名,还有些病毒是以字母和数字命名。病毒的分类系统也不一致,动物病毒分类等级设立科、属、种;而植物病毒分为组、亚组、种。为了力求分类和命名的统一,１９９２年Ｍａｒｔｅｌｌｉ首先提出了植物病毒的科、属、种分类原则,１９９３年８月在英国格拉斯哥召开的第９届国际病毒大会上,国际病毒分类委员会（ＩＣＴＶ）采纳了这一分类原则,并且新设立了一些植物病毒的科、属［１］,１９９５年在ＩＣＴＶ所公布的病毒…     

细菌芽孢基因表达的调控

细菌芽孢基因表达的调控范玉贞（河北省衡水师范专科学校生物系,０５３０００）在一定条件下,某些细菌生长到一定阶段,在细胞内形成一个圆形、椭圆形或圆柱形的休眠体,称为芽孢（或内生孢子）。能否形成芽孢是细菌种的遗传特征,而且现已查明具有芽孢的细菌（芽孢细菌...     

青藏铁路沿线唐古拉山口土壤微生物的ARDRA分析

通过构建16S rDNA文库及文库的限制性片段长度多态性分析（ARDRA）,对青藏铁路沿线唐古拉山口的土壤微生物多样性进行了研究。采用限制性内切酶HaeIII和RsaI对克隆文库中的90个克隆子进行了酶切分型,根据ARDRA酶切图谱的不同,可将其分为23个OTUs。16SrDNA序列分析结果表明,该克隆文库中主要包括变形菌门（Proteobacteria）的alpha、beta、detla亚类、厚壁菌门（Firmicutes）、放线菌门（Actinobacteria）、拟杆菌门（Bacteroidetes）、酸杆菌门（Acidobacteria）及浮霉菌门（Planctomycetes）等8类细菌及未培养细菌。Alpha变形细菌为该文库中的主要菌群,占克隆总数的33.3%;其次为未培养细菌,占克隆总数的22.2%,Bradyrhizobium为优势菌属。研究结果揭示,青藏铁路唐古拉山口的土壤微生物种群不仅具有丰富的多样性,还存在丰富的潜在新菌种。     

一种简便鉴定细菌、真菌的显微镜

最近,以色列Ben-Gurion大学应用生物科学研究所Erukhimovitch等介绍了一种傅立叶转换红外显微镜[Fourier-transform infrared（FTIR）microscopy]广泛而又敏感地测定细胞的分子转换而用于鉴定细菌、真菌。这种新型显微镜比通常已广泛应用的傅立叶转换红外光谱仪（FTIR spectroscopy）有明显优势,即后者只能测定一个样品的一定局限范围,而前者则可测定更广范围的标本,是更简便、快速且准确可信的鉴定细菌、真菌的新仪器,用于各种人类和动物感染细菌和真菌的鉴别。