营养基因组学的DNA芯片研究

本文通过对饮食影响基因表达的实例,结合DNA芯片（DNAchip）技术及研究方法,分析和展望最新生物科学技术在食物与营养及药膳和中药研究中的应用前景。     

DNA微阵列(或芯片)技术原理及应用

DNA微阵列或芯片(DNA microarray or chip)技术是近年发展起来的又一新的分子生物学研究工具.它是利用光导化学合成、照相平板印刷以及固相表面化学合成等技术,在固相表面合成成千上万个寡核苷酸探针,或将液相合成的探针由微阵列器或机器人点样于尼龙膜或硅片上,再与放射性同位素或荧光物标记的DNA或cDNA杂交,用于分析DNA突变及多态性、DNA测序、监测同一组织细胞在不同状态下或同一状态下多种组织细胞基因表达水平的差异、发现新的致病基因或疾病相关基因等多个研究领域.     

三点测交基因连锁作图计算的新方法

提出了三点测交基因连锁作图的一种新的计算方法,弥补了经典经典计算方法的不足之处,使基因连锁作图更准确。     

绵羊线粒体DNA的父系遗传

通过多赛特公羊与小尾寒羊杂交家系(Pmt家系)mtDNA D-loop PCR-RFLP和重复序列区扩增进行的分子长度多态分析发现, 该家系存在mtDNA父系遗传现象, 通过D-loop 5'端PCR-SSCP分析也发现了该家系的父系遗传现象, 提示绵羊(Ovis aries)存在mtDNA的父系遗传, 进而对mtDNA父系遗传的机制进行了讨论.     

基于COI序列快速鉴定花蓟马的DNA条形码芯片初探

利用DNA条形码信息研制DNA芯片,建立快速高效的花蓟马鉴定方法.以3种花蓟马属,共9个样本的COⅠ基因片段序列为研究材料,应用软件Primer Premier5搜索出9个样本的12种motif基因序列,应用这12种motif序列制作虚拟DNA条形码芯片.虚拟电子杂交20个样本的COⅠ基因片段序列.结果显示,设计的虚拟DNA芯片能够鉴定本研究中的3种花蓟马,利用DNACOⅠ基因片段,设计DNA芯片在理论上可行.     

细菌基因转录谱的DNA微点阵芯片分析

基于DNA微点阵芯片技术的细菌基因转录谱研究是基因功能分析的重要手段之一。本文阐述了细菌DNA芯片基因转录谱分析的基本问题,包括mRNA和双色荧光实验设计,详细介绍了目前细菌体内外DNA芯片基因转录谱的具体应用情况,并说明了体内外基因转录谱研究的优劣和互补。     

植物表观遗传与DNA甲基化

表观遗传在植物生长发育过程中起着极其重要的作用。甲基化是基因组DNA的一种主要表观遗传修饰形式,是调节基因功能的重要手段。介绍了植物体中胞嘧啶甲基化现象,RNA指导的DNA甲基化的信号分子、作用机制,以及与RNA介导的基因沉默机制之间的区别和RNA对转座子的表观控制。     

雪豹的微卫星DNA遗传多样性

利用微卫星DNA标记,对来自青海囊谦县、治多县以及甘肃阿克塞县3个地区的36份雪豹(Panthera uncia)粪便DNA样品进行了遗传多样性研究。结果显示,在8个微卫星位点上共检测到57个等位基因,有效等位基因数为2.190~5.488,平均每个位点的等位基因数为7.130,基因频率分布不均匀;期望杂合度为0.543~0.847,平均0.759;多态信息含量为0.458~0.829,平均0.722;表明这8个微卫星位点均为高度多态性位点,有较丰富的遗传多样性。3个样地雪豹居群之间的遗传距离与地理距离相关,地理距离最近的青海省囊谦县和治多县的雪豹居群遗传距离最小。根据雪豹平均遗传分化度Fst(0.053)、平均基因流(4.488)以及STRUCTURE聚类分析结果(当K=1时,ln P(D)值最大),推测3个居群间虽然有一定的遗传距离,但均来自同一个种群,暂无分化现象。     

DNA分子标记、基因组作图及其在植物遗传育种上的应用

本文总结了现代分子生物学所发展的各类分子标记及其在遗传图谱构建中的作用,还综述了遗传图谱与物理图谱的构建、数量与质量性状定位及分子标记在作物育种中的应用。     

PLCε基因敲除小鼠微卫星DNA遗传监测分析

目的利用多态性微卫星DNA位点分析PLCε基因敲除小鼠的遗传特性。方法用所筛选的15个微卫星DNA位点对28只PLCε基因敲除小鼠的DNA进行了PCR扩增,通过基因片段大小来分析群体的遗传多样性。结果 13个微卫星DNA位点中（D1Mit365、D3Mit51、D4Mit235、D6Mit102、D7Mit281、D8Mit113、D9Mit23、D10Mit180、D13Mit88、D16Mit145、D17Mit36、D18Mit94、D19Mit97）每个位点的28只小鼠DNA片段泳动距离一致,呈现单态性,表明该群体符合近交系的遗传特性;而利用Dq（敲基因型）和Dy（野生型）两个位点对28只小鼠的PCR扩增结果进行了鉴别分析,其中敲除基因型小鼠为6只;野生型为7只;杂合型为15只。结论利用微卫星标记技术可以对群体进行遗传质量监测,并能有效地鉴别不同的基因型,为小鼠的遗传质量监测提供了一种可行的方法。     

遗传标记及其在家禽遗传育种中应用的研究进展

概述了现代分子生物学所发展的各类遗传标记的发展和现状及其在家禽遗传育种中的应用,同时也探讨了数量与质量性状基因定位在动物遗传育种中的应用。     

问号钩端螺旋体基因组DNA芯片的研制

目的 研制并初步评估问号钩端螺旋体(简称钩体)赖型赖株的基因组DNA芯片。方法 利用Primegens引物设计软件筛选出问号钩体赖型赖株全基因组中的特异性基因进行引物设计。对成功设计出相应引物的3 290个基因用聚合酶链反应方法进行扩增,以纯化后的产物点样制备芯片。并用双色荧光杂交策略对芯片质量进行了初步平估。结果 共获得3 290个基因产物用于点样。参考株自身杂交实验结果表明:该芯片有较高的点一致性、信噪比和较低的假阳性率。结论 成功制备了包含问号钩体赖型赖株3 290个目的基因的基因组DNA芯片,并可用于基于该芯片的问号钩体比较基因组学的研究。     

鱼类线粒体DNA的遗传与进化

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DNA芯片技术研究进展及其在分子营养上的应用

DNA芯片技术是近年发展起来的又一新分子生物学研究工具,可使研究者得以自动化、快速、平行地对大量的生物信息加以分析,在基因组水平上研究基因表达。这种技术为从基因组水平研究基因表达水平与生理反应及生理状况的改变之间的关系提供了强有力的手段。通过比较不同营养水平或不同环境条件下的组织细胞基因达到表达谱差异,可以从基因组水平阐明各种营养成分或环境因素对动物机体的基因表达的影响,从而进一步揭示营养生理的机制和环境对动物影响的机理。DNA芯片技术为分子营养的研究开辟了一条崭新的道路,在从DNA芯片的原理、种类、实验设计、统计方法及在分子营养上的应用作一综述。     

褐家鼠线粒体DNA遗传多态性的研究

通过碱变性法提取线粒体ＤＮＡ,用地高辛标记的探针Ｓｏｕｔｈｅｒｎ杂交限制性酶切多态性（ＲＦＬＰ）分析,研究中国家鼠Ｒａｔｔｕｓｎｏｒｖｅｇｉｃｕｓ遗传多态性。采用ＡｐａⅠ、ＡｖａⅠ、ＢａｎＨＩ、ＢｃｌⅠ、ＢｇｌⅠ、ＣｌａⅠ、ＥｃｏＲⅠ、ＥｃｏＲⅤ、ｈｉｎｄⅢ、ＰｖａⅡ、ＳｃａⅠ和ＸｂａⅠ等１２种限制性内切酶分析来自我国８个地区２６只褐家鼠的线粒体ＤＮＡ,共检出２０种限制性态型和１１种ｍｔＤＮＡ单倍     

医学分子遗传学：第八讲 重组DNA技术与基因定位

人体基因组是一个十分复杂的结构,每单倍体基因组大约有3×10~9bp组成,分成22条常染色体和1条性染色体。据估计,在人体基因组上存在着大约50,000—100,000个结构基因,平均每分摩(cM)染色体上分布着20个结构基因。人体基因组大约有33cM,由此推算出人体基因组上含有约66,000个结构基因。现在已经明确地鉴定出了1,600多个人体基因,     

三点测验遗传特点的原因

利用图解，阐述了“三点测验”中，为什么F1能产生8种配子；进而阐述了为什么F1产生的配子中“亲组合型”配子多，而“重组合型”配子少、特别是“双交换重组合型”配子比例极小，并指出双交换值的最大值和基因的位置是如何影响交换值大小的。     

一种新的DNA芯片的封闭方法

提出了一种新的DNA芯片的封闭方法：1-碘丙烷封闭方法,并对1-碘丙烷和琥珀酸酐两种不同的封闭方法的封闭效果进行了比较实验,研究封闭试剂、封闭时间对氨基DNA芯片杂交结果所产生的影响。结果表明： 1-碘丙烷封闭效果明显好于琥珀酸酐的封闭效果,用1-碘丙烷封闭后的芯片进行杂交,芯片杂交信号强、背景噪声低,灵敏度高,整个封闭过程实验操作简单,时间短,1h即可达到所需效果。1-碘丙烷可以作为一种很好的DNA芯片封闭试剂。Abstract: Suggested a new blocking method for DNA microarray: 1- iodo -propane .we compared the difference between the two block reagents and the blocking results in different blocking time. The results showed that 1-I-prppane is batter-blocking reagent than succinic anhydride in DNA chip.1h blocking time is enough for blocking.     

一种新的DNA芯片的封闭方法

提出了一种新的DNA芯片的封闭方法:1-碘丙烷封闭方法,并对1-碘丙烷和琥珀酸酐两种不同的封闭方法的封闭效果进行了比较实验,研究封闭试剂、封闭时间对氨基DNA芯片杂交结果所产生的影响。结果表明:1-碘丙烷封闭效果明显好于琥珀酸杆的封闭效果,用1-碘丙烷封闭后的芯片进行杂交,芯片杂交信号强、背景噪声低,灵敏度高,整个封闭过程实验操作简单,时间短,1h即可达到所需效果。1-碘丙烷可以作为一种很好的DNA芯片封闭试剂。     

DNA计算的发展现状及未来展望

随着高性能计算需求的不断增长,传统计算模式面临着前所未有的巨大挑战.在众多新兴计算技术中,DNA计算系统以其低能耗、并行化等特点而广受关注.DNA电路(DNA circuit)是实现DNA计算的基础,也是该领域重要的分子信息调控和处理技术.文中重点介绍了DNA计算的基本原理,并总结了最新的研究进展,最后讨论了基于DNA...