重庆市1264株粪肠球菌和屎肠球菌耐药性监测

【摘 要】 目的 了解2011年中国重庆市主要7所教学医院临床分离粪肠球菌和屎肠球菌对各类抗菌药物的耐药性。方法 重庆市主要7所教学医院(6所综合性医院,1所儿童医院)按统一方案、采用统一的材料、方法和判断标准(CLSI 2011年版)进行粪肠球菌和屎肠球菌的耐药性监测。数据用WHONET 5.5软件按照CLSI 2011年版折点进行分析。结果 共分离到非重复粪肠球菌589株、屎肠球菌675株,对利奈唑胺、万古霉素、替考拉宁仍极敏感,耐药率<2%,万古霉素耐药粪肠球菌和屎肠球菌检出率分别为0.3%、0.7%。粪肠球菌对青霉素、氨苄西林、呋喃妥因的耐药率较低,分别为14.8%、8.6%和5.1%,对高浓度庆大霉素的耐药率分别为46.9%;屎肠球菌耐药性明显高于粪肠球菌,对青霉素和氨苄西林耐药率接都在90％左右。儿童和成人耐药率存在一定差别。结论 本市医院肠球菌感染以屎肠球菌为主, 粪肠球菌次之,两者耐药性明显不同, 监测其耐药情况对指导临床用药具有重要意义。     

粪肠球菌和屎肠球菌耐药性分析

目的 监测我院肠球菌中粪肠球菌株和屎肠球菌株的耐药性,为临床合理应用抗菌药物提供依据。方法 采用法国生物梅里埃公司的GPI板进行细菌鉴定及药敏试验,应用whonet5软件统计粪肠球菌和屎肠球菌的耐药率。结果 粪肠球菌和屎肠球菌对氯霉素、呋喃妥因、万古霉素有较好体外抗菌活性,耐药率都在50%以下,对万古霉素的耐药率在1%以下。粪肠球菌对青霉素、高水平庆大霉素、环丙沙星、利福平、红霉素等大部分抗菌素的耐药率有逐年下降趋势,而屎肠球菌对环丙沙星、利福平、呋喃妥因等抗菌素的耐药率则有上升趋势,屎肠球菌对大多数抗菌素耐药率都高于粪肠球菌。结论 粪肠球菌和屎肠球菌呈多重耐药,临床用药应结合药敏试验结果合理选择抗菌药物。     

肠球菌的临床感染与耐药性分析

目的了解温州医学院附属第一医院临床分离主要肠球菌的分布及其对常用抗菌药物的耐药现状,以指导临床合理用药。方法对2008年至2011年临床分离的635株粪肠球菌和屎肠球菌的标本来源和药敏结果进行回顾性分析。结果各种临床标本中两种肠球菌的分布比例存在差异,总体以尿液标本所占比例最多,且屎肠球菌的总体分离率高于粪肠球菌。粪肠球菌对利奈唑胺、氨苄西林、万古霉素、呋喃妥因和替考拉宁的耐药率都在5．0％以下,对莫西沙星和青霉素G的耐药率也仅为7．0％和6．7％;屎肠球菌对莫西沙星、左旋氧氟沙星、环丙沙星、氨苄西林、青霉素G和红霉素的耐药率都在90．0％以上,对利奈唑胺、万古霉素、替考拉宁和奎奴敏感。粪肠球菌的多重耐药株占总数的26．4％,屎肠球菌的多重耐药株占总数的78．2％。结论粪肠球菌和屎肠球菌对15种抗菌药物的耐药情况不同,屎肠球菌具有更高的耐药率和更广的耐药谱。临床应根据药敏试验的结果合理选择抗菌药物,以防止耐药菌株的产生和播散。     

临床分离肠球菌的分布特点及耐药性变迁

目的分析临床分离肠球菌的分布特点及耐药性变迁,为临床合理应用抗生素提供依据。方法从中国医科大学附属盛京医院门诊和住院病人采集血液、尿液、手术切口分泌物、腹腔引流液等标本,应用法国生物梅里埃API细菌鉴定系统进行细菌的分离和种属鉴定,用K-B纸片琼脂扩散方法对不同肠球菌做药物敏感试验。结果肠球菌属的数量占全部分离到细菌种类的第6位。其中屎肠球菌的构成比,2002年为30.9%,2006年上升到71.6%,超过粪肠球菌的比例。肠球菌主要分布于ICU、普通外科、呼吸内科、肾内科、干诊、感染科和新生儿科病房。粪肠球菌对青霉素、氨苄西林和呋喃妥因的耐药率分别从2002年的53.6%、38.5%和30.4%下降到2006年的4.5%、0和4.5%,屎肠球菌对氯霉素的耐药率从2002年的37.1%下降到2006年的14.3%,两种菌对万古霉素和替考拉宁的敏感性均高,但临床出现耐万古霉素和耐替考拉宁的肠球菌。结论中国医科大学附属盛京医院临床肠球菌出现新的分布特点,屎肠球菌比例有增加趋势。调查肠球菌尤其是屎肠球菌感染的危险因素和采取相应的防治措施是当前研究的重要课题。     

一株益生性粪肠球菌的安全性评价

目的 研究1株微生态活菌制品生产用粪肠球菌的安全性。 方法 采用目前肠球菌安全性评价主要方法,测定粪肠球菌GMCC 0460.3株的全基因组序列并分析毒力和耐药性相关基因;以生物化学方法测定其耐药性和有毒代谢产物的产生情况;经口灌胃小鼠测定其动物体内毒力。 结果 该株肠球菌对卡那霉素和磺胺类药物耐药,耐药谱窄;基因组存在多种肠球菌毒力基因;生化试验表明其溶血性阴性、氨基脱羧酶活性阴性、硝基还原酶活性较低、细胞表面疏水性较低、生物膜形成能力较弱;动物实验结果表明该株菌在小鼠体内无明显毒性作用。 结论 粪肠球菌GMCC0 460.3株实验评价的结果显示了良好的安全性。     

267株肠球菌分布及耐药性分析

目的 了解肠球菌的分布特征和耐药特点,指导临床合理用药.方法 采用美国Dade Behring Mi-croscan Walkaway40全自动细菌鉴定及药敏测试仪对267株肠球菌进行鉴定和药敏测试,用全国医院感染监测网软件和P检验进行分析.结果 267株肠球菌以屎肠球菌和粪肠球菌为主,分别占60.7%和31.5%,以尿液和脓液中分离出最多,其次为血液和胆汁,依次是56.6%、14.2%、10.9%、9.7%,占总标本的91.4%.肠球菌不同种间的耐药性差异存在显著性.屎肠球菌的耐药率相对较高,除对万古霉素的耐药率3.7%最低,四环素37.7%外,对其它抗菌药物的耐药率均超过了50%.粪肠球菌的耐药率虽比屎肠球菌低,但对红霉素、四环素、氨基糖苷类的耐药性仍高,在60%以上.屎肠球菌和粪肠球菌对高浓度庆大霉素和链霉素的耐药率均在55%以上.共检出耐万古霉素株11株,对万古霉素的耐药率为4.1%.结论 肠球菌可引起多种部位感染,呈多重和高耐药性,耐万古霉 素的菌株出现,增加了感染控制难度,应引起临床重视.     

400株肠球菌临床耐药性分析

了解2001~2003年肠球菌对常用抗菌药物的耐药性,为临床治疗肠球菌感染提供参考。采用Kirby-Bauer纸片扩散法进行药敏试验。结果显示:2001~2003年肠球菌属的耐药率呈上升趋势。万古霉素和替考拉宁依然是敏感性最高的抗生素。青霉素、氨苄西林和呋喃妥因对粪肠球菌具有较好的抗菌活性,敏感率分别为62.5%、67.1%和92.4%。屎肠球菌对除糖肽类抗生素以外的所有临床常用抗菌药物显示高水平耐药。可见,动态监测肠球菌的耐药状况对指导临床治疗具有重要意义。     

肠球菌属细菌的临床分布与耐药性分析

目的了解2012-2017年临床分离肠球菌的分布特征及耐药性,为临床合理用药提供依据。方法采用全自动微生物分析仪进行菌株鉴定及药敏试验,对肠球菌的临床分布与耐药情况进行统计分析。结果共分离出1 432株肠球菌,其中粪肠球菌为603株(42.11%),屎肠球菌为596株(41.62%)。肠球菌属细菌标本来源以尿液、胆汁和全血为主,分别占39.66%、34.50%和11.59%,其中粪肠球菌主要来自普外科、泌尿外科和ICU,而屎肠球菌主要来自ICU、普外科和消化内科。肠球菌总体对红霉素的耐药率最高(67.81%),其次为四环素(47.49%)、环丙沙星(47.00%)和左旋氧氟沙星(46.44%),对利奈唑胺和万古霉素的耐药率较低,分别为4.89%和1.19%。粪肠球菌对奎奴普丁/达福普汀、四环素的耐药率分别为83.91%和64.01%,明显高于屎肠球菌(均P0.05)。屎肠球菌对红霉素、青霉素G、氨苄西林、喹诺酮类的耐药率均超过85.00%,且均高于粪肠球菌(均P0.05)。粪肠球菌和屎肠球菌对利奈唑胺的耐药率分别为6.80%和2.18%,对万古霉素的耐药率分别为0.66%和0.67%。结论肠球菌感染病原菌以粪肠球菌和屎肠球菌为主,肠球菌属细菌对万古霉素和利奈唑胺仍然保持较高的敏感性,不同种的肠球菌其耐药性差异显著。     

粪肠球菌噬菌体vB_EfaP_IME195的生物学特性及其全基因组分析

【目的】以粪肠球菌为宿主菌,从医院的污水中筛选出相应的粪肠球菌噬菌体v B_Efa P_IME195,简称IME195,研究其生物学特性;并通过高通量测序得到其全基因组,深入研究其基因组学特征。【方法】以临床的耐药粪肠球菌为宿主菌,利用医院污水筛选噬菌体并纯化;对噬菌体IME195生物学特性进行了深入研究,包括电镜观察噬菌体形态、最佳感染复数、一步生长曲线、噬菌体IME195对紫外线的敏感度、对温度的耐受程度、对p H的耐受程度、对氯仿是否敏感;通过蛋白酶K/SDS法提取噬菌体IME195全基因组;Ion Torrent高通量测序;测序后进行噬菌体全基因组序列组装、注释、进化分析和比较分析。【结果】通过噬菌体梯度稀释,双层培养基平板法得到噬菌斑边缘分明、斑体透明的裂解性噬菌体IME195,最佳感染复数为0.01,一步生长曲线显示IME195的潜伏期为30 min,暴发量为11。该噬菌体对紫外线比较敏感,对5%浓度的氯仿不敏感,噬菌体对高温比较敏感,该噬菌体在p H 6.0-8.0范围内具有良好的裂解活性;电镜观察结果显示该噬菌体属于尾病毒目短尾噬菌体科;全基因组分析表明:噬菌体IME195基因组大小只有18 607 bp(Gen Bank登录号为KT932700),G+C含量仅为33%。BLASTn比对结果表明,该噬菌体和Gen Bank中的噬菌体v B_Efae230P-4只有82%的相似性。对噬菌体IME195进行了全基因组功能注释和进化分析。【结论】分离鉴定了一株粪肠球菌噬菌体,进行了生物学特性、全基因组测序和生物信息学深入分析,为噬菌体治疗多重耐药细菌奠定了基础。     

雏鸡源致病性粪肠球菌的分离鉴定及其耐药性分析

[背景]粪肠球菌(Enterococcus faecalis)是人和动物肠道正常菌群之一,也是一种条件性致病菌.近年来,粪肠球菌引起人和动物感染的报道越来越多.[目的]探明引起某养鸡场雏鸡发病死亡的病原及其致病性和有效治疗药物.[方法]结合临床症状和病理剖检,开展病原菌分离、生理生化特性检测和16S rRNA基因序列分...     

Degradation of tannic acid and purification and characterization of tannase from Enterococcus faecalis

Tannins, present in various foods, feeds and forages, have anti-nutritional activity; however, presence of tannase in microorganisms inhabiting rumen and gastrointestinal tract of animals results in detoxification of these tannins. The present investigation was carried out to study the degradation profile of tannins by Enterococcus faecalis and to purify tannase. E. faecalis was observed to degrade tannic acid (1.0% in minimal media) to gallic acid, pyrogallol and resorcinol. Tannase from E. faecalis was purified up to 18.7 folds, with a recovery of 41.7%, using ammonium sulphate precipitation, followed by DEAE-cellulose and Sephadex G-150. The 45 kDa protein had an optimum activity at 40 °C and pH 6.0 at substrate concentration of 0.25 mM methyl gallate.     

创伤弧菌毒力相关因子的全基因组关联分析研究

【目的】创伤弧菌是致死率最高的弧菌物种,但目前尚无在全基因组层面挖掘毒力相关因子的研究。本研究以创伤弧菌分离来源(临床和环境)作为不同表型,通过与260株基因组序列进行关联分析,挖掘毒力相关因子,从而进一步了解创伤弧菌致病因素。【方法】对139株创伤弧菌分离株进行高通量测序,获取其全基因组序列;与公共数据库已公开发表的121株基因组整合,使用pyseer软件进行全基因组关联分析,对与不同分离来源显著相关的基因进行注释和解读。【结果】共发现11个基因与临床分离株显著相关,其中9个是本研究新发现的创伤弧菌潜在毒力相关因子。【结论】本研究使用群体基因组学和统计遗传学方法,在全基因组范围扫描挖掘了创伤弧菌毒力相关因子,为深入揭示该物种致病机制、设计新的疫苗和治疗靶点提供了重要依据。     

High efficiency introduction of plasmid DNA into glycine treated Enterococcus faecalis by electroporation

Summary A highly efficient electroporation system for Enterococcus faecalis was developed by systematically optimizing different parameters. One parameter found to be particularly critical for electroporation was cultivation of E. faecalis in medium containing a high glycine concentration, prior to electroporation. Osmotic stabilization of cells with 0.5 M sucrose was also found to be critical during glycine treatment. 10⁶ transformants per microgram of plasmid DNA were consistently obtained within 48 h. Electrocompetent preparations of E. faecalis could be stored at –70° C without loss of competence.     

粪肠球菌MG 2108对小鼠结肠炎症的缓解作用及机制研究

【目的】为了筛选能抑制鼠类柠檬酸杆菌(Citrobacter rodentium)诱发的小鼠结肠炎的益生菌,并研究其干预机制。【方法】对4株筛选的菌株进行人工模拟胃肠液耐受试验,并体外测试它们对鼠类柠檬酸杆菌的抑制能力,最终筛选出粪肠球菌(Enterococcus faecalis)MG 2108。72只雄性7周龄ICR小鼠经过适应性饲养7d后,被随机分为2组：正常对照组(MC组,24只,生理盐水)和炎症对照组(IC组,48只,1×10¹⁰CFU/mL灌胃鼠类柠檬酸杆菌),7d后各采12只小鼠,通过结肠组织HE染色和炎症因子检测实验,判断炎症模型建成。原MC组(剩下12只小鼠)更名为NC组,用以区别建模前后的正常对照组,IC组随机分成3组：自然恢复组(IR组,12只,生理盐水)、环丙沙星组(CF组,12只,4mg/mL环丙沙星)和粪肠球菌MG 2108组(EF组,12只,1×10⁸CFU/mL粪肠球菌MG 2108)。18d后结束灌胃,所有小鼠麻醉后眼球取血,解剖。【结果】粪肠球菌MG 2108可以缓解和修复鼠类柠檬酸杆菌引发的小鼠结肠和肝脏损伤,并且通过降低炎症细胞因子的表达水平和增加紧密连接蛋白的表达水平,促进了结肠炎症组织的修复。它改变了肠道微生物菌群结构,EF组的肠杆菌属(Enterorhabdus)和阿克曼菌属(Akkermansia)等有益菌群的丰度增加,同时短链脂肪酸也显著增加(P<0.05),并且优于CF组和IR组。【结论】粪肠球菌MG2108是一株有利于肠道健康的益生菌,治疗鼠类柠檬酸杆菌诱导的小鼠结肠炎效果优于环丙沙星,自然恢复组效果明显差于EF组。     

Sequence of the 50-kb Conjugative Multiresistance Plasmid pRE25 from Enterococcus faecalis RE25

The complete 50,237-bp DNA sequence of the conjugative and mobilizing multiresistance plasmid pRE25 from Enterococcus faecalis RE25 was determined. The plasmid had 58 putative open reading frames, 5 of which encode resistance to 12 antimicrobials. Chloramphenicol acetyltransferase and the 23S RNA methylase are identical to gene products of the broad-host-range plasmid pIP501 from Streptococcus agalactiae. In addition, a 30.5-kb segment is almost identical to pIP501. Genes encoding an aminoglycoside 6-adenylyltransferase, a streptothricin acetyltransferase, and an aminoglycoside phosphotransferase are arranged in tandem on a 7.4-kb fragment as previously reported in Tn5405 from Staphylococcus aureus and in pJH1 from E. faecalis. One interrupted and five complete IS elements as well as three replication genes were also identified. pRE25 was transferred by conjugation to E. faecalis, Listeria innocua, and Lactococcus lactis by means of a transfer region that appears similar to that of pIP501. It is concluded that pRE25 may contribute to the further spread of antibiotic-resistant microorganisms via food into the human community.     

食品中蜡样芽孢杆菌耐药性及其机制研究进展

蜡样芽孢杆菌是常见的食源性致病菌之一,其产生的毒素会引起食物中毒。蜡样芽孢杆菌主要引起2种类型的食物中毒,即呕吐和腹泻综合征,并可造成各种局部和全身感染。随着抗生素的广泛、大量使用,蜡样芽孢杆菌的耐药性不断增强,现已有报道出现多重耐药性。本文对蜡样芽孢杆菌的耐药现状及耐药性机制进行了综述,以期正确理解蜡样芽孢杆菌耐药性的特点及其规律,从而为防治蜡样芽孢杆菌耐药性的产生及合理用药提供理论依据。     

Genome-wide association study identifies novel loci associated with resistance to bovine tuberculosis

Tuberculosis (TB) caused by Mycobacterium bovis is a re-emerging disease of livestock that is of major economic importance worldwide, as well as being a zoonotic risk. There is significant heritability for host resistance to bovine TB (bTB) in dairy cattle. To identify resistance loci for bTB, we undertook a genome-wide association study in female Holstein–Friesian cattle with 592 cases and 559 age-matched controls from case herds. Cases and controls were categorised into distinct phenotypes: skin test and lesion positive vs skin test negative on multiple occasions, respectively. These animals were genotyped with the Illumina BovineHD 700K BeadChip. Genome-wide rapid association using linear and logistic mixed models and regression (GRAMMAR), regional heritability mapping (RHM) and haplotype-sharing analysis identified two novel resistance loci that attained chromosome-wise significance, protein tyrosine phosphatase receptor T (PTPRT; P=4.8 × 10⁻⁷) and myosin IIIB (MYO3B; P=5.4 × 10⁻⁶). We estimated that 21% of the phenotypic variance in TB resistance could be explained by all of the informative single-nucleotide polymorphisms, of which the region encompassing the PTPRT gene accounted for 6.2% of the variance and a further 3.6% was associated with a putative copy number variant in MYO3B. The results from this study add to our understanding of variation in host control of infection and suggest that genetic marker-based selection for resistance to bTB has the potential to make a significant contribution to bTB control.     

屎肠球菌对斑节对虾肠道代谢组学及炎性因子的影响

【背景】屎肠球菌(Enterococcus faecium)作为乳酸菌属的潜在益生菌,因其具有良好的生物学特性在动物养殖中应用广泛,但是屎肠球菌对肠道代谢组学的研究很少。【目的】以斑节对虾为试验动物,初步探究屎肠球菌R8对肠道代谢组学及炎性因子的影响,为屎肠球菌作为益生菌在对虾养殖中的应用提供理论基础。【方法】将400条斑节对虾随机分配,设计饲料中屎肠球菌添加量分别为107、108、109 CFU/g的3个试验组,不添加屎肠球菌为对照组进行试验,养殖周期为28 d。养殖周期结束后测定斑节对虾免疫球蛋白M (immunoglobulin M,IgM)、对虾酚氧化酶(phenoloxidase,PO)、白介素6 (interleukin 6,IL-6)、补体片段3a (complement fragment 3a,C3a)的活性含量并运用LC-MS代谢组学研究肠道内源代谢物的变化,分析差异代谢物和相关的代谢通路。【结果】添加屎肠球菌对斑节对虾炎性因子有积极的影响,增加了斑节对虾体内免疫球蛋白IgM、对虾酚氧化酶、补体片段3a的含量,降低了其体内IL-6的含量,对肠道差异代谢物的分析发现,对...     

香坊肠球菌和罗伊氏乳杆菌在无菌猪肠道中的定殖

【背景】已有研究表明,微生物在宿主肠道中的定殖受宿主、肠道环境、微生物物种特性和菌株来源等多个因素的影响。一般认为,来源于同类宿主的微生物菌株,在该类宿主肠道中具有定殖优势,但缺乏在物种和菌株水平上研究微生物自身特性在宿主肠道中定殖的研究报道。【目的】将不同来源(同类宿主肠道、非同类宿主肠道和非肠道环境)、具有不同生物学特性的3株香坊肠球菌(Enterococcus xiangfangensis)和4株罗伊氏乳杆菌(Lactobacillusreuteri)对无菌猪肠道进行定殖,在物种和菌株2个水平上探究物种特性和菌株来源对宿主肠道定殖的偏好性,揭示影响微生物定殖效率的关键因素。【方法】在本项研究中,将从藏猪(Tibetan pigs)、小鼠(ob/ob mice)、食蟹猴(Macaca fascicularis)和发酵食品中分离得到的多株香坊肠球菌和罗伊氏乳杆菌,制成混合菌剂对无菌巴马香猪(Bama miniature pig)进行为期4周的饲喂,并通过实时荧光定量PCR方法检测这7株菌在无菌猪肠道中的定殖情况。【结果】在物种水平上,香坊肠球菌和罗伊氏乳杆菌在无菌猪体内具有相近的定殖...