杨树重要品种( 无性系) 的AFLP 指纹分析

品种的准确鉴定及其遗传相关性的了解对杨树育种和品种管理具有非常重要的意义。本试验采用AFLP对来自青杨组和黑杨组的21 个重要杨树品种( 无性系) 的鉴定与遗传相关性进行了研究。结果显示, 筛选的4对AFLP 引物总共产生了181 条多态性带,尤其是每对引物对每个品种都产生了独特的指纹图谱; 聚类分析和多维尺度分析将试验材料大体上分为五类, 结果不仅显示了组间不同品种的差异, 而且大体上区分了我国原生品种和外来品种。本研究表明, 所有品种都可被筛选的引物准确鉴定, 遗传相关性的推断结果与它们的系谱或分类基本一致。另外, 本研究还表明AFLP 技术完全可用于大规模地构建杨树树种DNA 指纹图谱、进行树种鉴定和遗传相关性的研究。     

美洲黑杨无性系AFLP指纹分析

１９９２年由Ｚａｂｅａｕ和Ｖｏｓ发明的扩增酶切片段长度多态性ＡＦＬＰ标记技术（Ｅｕｒｏｐｅａｎｐａｔｅｎｔ,０５３５８５８Ａ１,１９９３０３３１）,是目前国际上构建ＤＮＡ指纹图谱的最新方法,ＡＦＬＰ能检测到大量的基因位点,因而灵敏度高。选用不同的...     

萝卜品种指纹图谱SRAP与AFLP分析

应用SRAP与AFLP两种分子标记技术进行了萝卜品种鉴定分析。对萝卜基因组DNA的SRAP-PCR反应体系中引物、Mg2 、dNTPs浓度进行优化,确定最优体系为引物0.3μmol.L-1,dNTP 0.2 mmo.lL-1,Mg2 3.0 mmo.lL-1。对SRAP-PCR中的退火温度(50℃)设置了12个梯度处理,以em2-me2为引物时带型无明显差异。7个供试萝卜材料的SRAP和AFLP指纹图谱分析表明,供试材料均可被SRAP和14个AFLP引物准确鉴定,每对引物组合都产生独特的指纹图谱。11个SRAP引物组合共产生155条带,多态性条带84条。聚类分析与相对遗传距离(GD)表明,供试材料聚为4类,CB-03-2与SHCB-02-1亲缘关系最近(GD=0.054 9);齐虹大连和Heiseng的亲缘关系最远(GD=0.203 4)。基于16个AFLP标记引物组合分析结果表明,供试材料聚为3类,CB-03-2和SHCB-02-1的亲缘关系最近。SRAP与AFLP综合分析结果表明,供试材料可聚为3类,其中CB-03-2与SHCB-02-1亲缘关系最近(GD=0.047 6)。     

21个枣品种（系）的AFLP指纹分析

采用AFLP技术,利用从30对引物中筛选出的10对多态性较好的引物,对21个枣品种(系)的基因组DNA进行了分析,共扩增出条带531条,其中多态性条带216条,多态性位点百分比为40.68%.采用UPGMA法,对AFLP扩增结果进行了聚类分析,将供试品种(系)分为6类,并得到了18个品种(系)的特征性AFLP标记,可为分子水平进行枣种质鉴定提供参考.     

萝卜品种指纹图谱SRAP与AFLP分析

应用SRAP与AFLP两种分子标记技术进行了萝卜品种鉴定分析。对萝卜基因组DNA的SRAP-PCR反应体系中引物、Mg²⁺、dNTPs浓度进行优化,确定最优体系为引物0.3 μmol·L^-1,dNTP 0.2 mmol·L^-1,Mg²⁺ 3.0 mmol·L^-1。对SRAP-PCR中的退火温度（50℃）设置了12个梯度处理,以em2-me2为引物时带型无明显差异。7个供试萝卜材料的SRAP和AFLP指纹图谱分析表明,供试材料均可被SRAP和14个AFLP引物准确鉴定,每对引物组合都产生独特的指纹图谱。11个SRAP引物组合共产生155条带,多态性条带84条。聚类分析与相对遗传距离（GD）表明,供试材料聚为4类,CB-03-2与SHCB-02-1亲缘关系最近(GD=0.054 9);齐虹大连和Heiseng的亲缘关系最远(GD=0.203 4)。基于16个AFLP标记引物组合分析结果表明,供试材料聚为3类, CB-03-2和SHCB-02-1的亲缘关系最近。SRAP与AFLP综合分析结果表明,供试材料可聚为3类,其中CB-03-2与SHCB-02-1亲缘关系最近(GD=0.047 6)。     

云南栽培种及野生种芋头的AFLP指纹分析

目的:分析云南芋头种质资源遗传多样性。方法:应用扩增片段长度多态性(AFLP)指纹技术,用3对AFLP引物对采集自云南省的9份芋头栽培品种及1份野生品种进行研究,分离AFLP多态性条带。结果:共分离到60个AFLP多态性条带,AFLP多态位点百分率为96.77%,云南芋头种质资源在DNA分子水平上表现出丰富的遗传多样性。聚类分析将10份芋头品种分为2组,遗传距离为0.101～0.908。结论:AFLP指纹技术是筛选品种间差异基因的有效方法,研究结果为云南省芋头品种鉴定、遗传相关性分析、特殊功能基因的分离等工作提供了一定的理论基础。     

糙皮侧耳(Pleurotus ostreatus)的AFLP指纹图谱分析

在对糙皮侧耳(Pleurotus ostreatus)的AFLP分析条件进行优化的基础上,利用该技术建立了14株产自不同地区的糙皮侧耳：DNA指纹图谱,并进行了数据分析。结果表明,在合成的14条引物的不同组合中,引物对E-3／M-3可以产生较多的DNA多态片段,E-AGC／M-CAT引物对的扩增效果最好,共获得184条DNA扩增带,其中多态性条带i101条,占54．89％。利用UPGMA法对所获数据进行聚类分析,计算得到糙皮侧耳菌株之间的遗传距离,发现不同品种间遗传距离差异较大,从0．192到0．754,说明糙皮侧耳的遗传多样性比较丰富。绘制的指纹分析树状图表明,14个糙皮侧耳菌株被分为6个组群,其中P17和杂3的相似性系数最高,达到了81．2％,而侧5与其他菌株的亲缘关系相对最远。     

无籽西瓜品种SSR指纹图谱构建及遗传多样性分析

利用SSR标记构建了27份中国无籽西瓜主栽品种的DNA指纹并进行了遗传多样性分析。24对多态性引物共扩增出66种基因型,基因型数2-5个不等,平均2.75个。平均多态性信息量(PIC)为0.37,变化范围为 0.19～0.66。有4个品种具有特征谱带。27个品种遗传相似系数变化范围为 0.7045～1.0,平均0.8683。组合24对引物,除无法区分‘郑抗无籽1号’与‘雪峰花皮无籽’,其余品种均能一一区分开。采用类平均法进行聚类分析,在相似系数0.83处,可将27个品种分为3大类。     

51个春兰(Cymbidium goeringii)品种的AFLP遗传多样性分析

为了揭示春兰品种的遗传多样性和亲缘关系,为春兰种质资源的有效利用和开发提供依据,采用AFLP技术对51个春兰品种进行了遗传多样性分析,经筛选得到了8对条带清晰、多态性高的引物,共扩增出1315条DNA片段,其中多态性条带为1217条,平均1对引物扩增条带164条,多态性带152条,多态性位点频率为92.5%,表明春兰品种具有丰富的遗传多态性。49个品种含有特有带。51个品种间遗传相似系数变化范围为0.501~0.716,聚类分析表明,51个春兰品种共分为5个类群,来自同一地区的品种并没有聚在一起,表明春兰品种的遗传背景混乱。AFLP分子标记技术能有效地分析春兰品种的遗传多样性和亲缘关系。     

漆树品种的AFLP分析及评价(简报)

漆树(Toxicodendron vernicifluum(stokes)F.A.Barkley)隶属于漆树科(Anacardiaceae)漆树属(Tox- icodendron)的落叶乔木,是我国重要的特用经济林木。漆树栽培与生漆使用在我国已有几千年的历史,在长期栽培过程中形成了许多农家品种,它们具有一定的形态特点,适应一定的生长环境,并具有产漆量高、生漆品质好等特性。     

AFLP在橡胶树优异种质研究中的应用

采用377DNA测序仪（P.E.Corp.)用AFLP技术对25种分别具有高产／低产、抗白粉病／感白粉病、抗寒／不抗寒、死皮／不死皮性状的橡胶树（Hevea brasiliensis Mull.Ary)无性系（其中Wickham种质15种,Amazon野生橡胶树种质10种）进行了指纹图谱分析,从64对引物组合中选出2对引物组合构建了所有被研究种质的指纹图谱。2对引物共扩增出518条带,多态性比率超过98．6％。遗传多样性分析表明,橡胶树种质间遗传距离为0．25－0．81,RRIM600种质内遗传距离为0．07－0．17。通过基因分型分析获得一条大小为320bp的抗白粉病种质特有的片段。根据以上的AFLP数据进行了聚类分析,结果表明所有被研究种质几乎是依次聚成一个大类。     

AFLP Fingerprinting Analysis of Elite Hevea brasiliensis Germplasm

There are more than 6 000 clones of Hevea brasiliensis Mull. Ary germplasm in the germplasm garden of Chinese National Key Biotechnology Laboratory for Tropical Crops and some of them are elite germplasm demonstrated by production and previous studies. AFLP (amplified fragment length polymorphism) fingerprinting analysis was performed on 25 clones (15 of Wickham clones and 10 of Amazon wild clones which possess phenotypes with high-yielding/low-yielding, cold-tolerance/cold-sensitivity, oidium-resistance/oidium-sensitivity, tapping panel dryness (TPD)/healthy) respectively through a 377 DNA sequencer (P. E. Corp.) and PAGE electrophoresis results were analyzed by using GeneScanTMand GenotypeTM Analysis software (P.E.Corp.). The fragment profiles of different clones were obtained. Five hundred and eighteen fragments were generated by two primer combinations screened from 64 primer combinations and 511 fragments appeared to be polymorphic (98.6%). Genetic distance ranged from 0.25 to 0.81 between clones and ranged from 0.07 to 0.17 within RRIM600 clone. A specific 320 bp fragment of the oidium-resistant clones was found through genotype analysis. These results showed that AFLP fingerprints were highly reproducible and powerful and can be widely used in germplasm identification and genetic diversity analysis of Hevea brasiliensis. In addition, based on the AFLP data, cluster analysis was performed. Cluster results showed that all the clones studied were almost clustered into a group one by one.      

部分两用桃品种(系)指纹图谱的建立

以近亲个体'顺10-16'、'青北10-7'和'贺春'为材料建立了两用桃AFLP研究体系,从64对引物组合中筛选出了E-AAT/M-ACT、E-AAT/M-CTG、E-ACA/M-CTG和E-ACA/M-CTT等4个多态性好、分辨率高的引物组合;应用该体系对'锦春'等23个两用桃品种(系)进行AFLP分析,结果共扩增出127条带,其中多态性带62条,多态性百分率48.8%,以其中特异性较高的23个多态性条带构建了这23个两用桃品系的指纹图谱,为两用桃品种鉴定及保护奠定了基础.     

鼠尾草属部分物种AFLP指纹图谱构建及遗传多样性分析

为了建立适用于鼠尾草属植物的AFLP技术体系,并对鼠尾草属部分物种遗传多样性进行分析。作者经筛选得到24对有效AFLP引物组合,共检测1616个有效扩增位点;其中22对AFLP引物组合针对不同材料可检测到特异性扩增位点,每对引物检测强度从1到16个位点不等;依据AFLP数据计算的22个鼠尾草属植物材料间231个配对遗传相似系数介于0.5677～0.9898,显示了丰富的遗传多样性;系统树显示AFLP分析可以将11个鼠尾草属植物准确区分,其中种内不同居群的材料可有效聚为亚组,说明本文所构建的AFLP技术体系能够有效应用于鼠尾草属植物种间及种内鉴定、遗传多样性分析及系统发育研究中。     

应用AFLP技术探讨半夏属五个种的亲缘关系

利用扩增酶切片断多态性（AFLP）方法研究半夏属内5个种之间的亲缘关系。应用POPGENE及SPSS软件对所得“1”、“0”二元矩阵进行遗传距离,遗传相似性及聚类分析。实验发现鹞落坪半夏与虎掌之间的遗传差异小,鹞落坪半夏可能是虎掌的一个特化分支群体;虎掌和鹞落坪半夏组与本属其他种之间遗传差异较大,相似性较小;盾叶半夏和滴水珠是姐妹群关系,盾叶半夏虽然叶形与同属其他种有显著差异,但遗传距离及相似性分析对比不支持其独立于半夏属其他种,而作为完全独立进化类群的结论。为半夏属分类及系统进化关系提供了分子生物学证据。     

DNA Isolation and AFLP Fingerprinting of Nectarine and Peach Varieties (Prunus persica)

Traditional identification of peach and nectarine varieties relies on the assessment of agronomic traits of the adult plant. This leads to a significant delay of time, constraints to breeders in the surveillance of germplasm and a risk for fruit growers and exporters. We describe a method for rapid assessment of peach and nectarine varieties based on AFLP fingerprinting and extraction of high quality DNA. The best primer pairs were selected from 64 primer combinations that reliably distinguished 8 peach and 6 nectarine varieties. A graphical representation of the detected polymorphisms was shown to simplify the analysis.