两种竹鸡线粒体DNA的遗传变异

采用PCR和直接测序的方法测定灰胸竹鸡(Bambusicola thoracica)与棕胸竹鸡(B.fytchii)线粒体DNA(mtDNA)控制区1142bp的序列,分析二者间的遗传变异。两种竹鸡间共发现32个变异位点,其中20个转换,12个颠换。灰胸竹鸡mtDNA控制区的碱基含量T34.26%、C25.98%、A24.84%和G14.96%,棕胸竹鸡的分别是T34.47%、C25.60%、A25.03%和G14.93%。t-检验分析显示,两种竹鸡mtDNA控制区的T和C含量差异显著。在系统发生树上,两种竹鸡在系统发生树各聚成一支,支持率达到100%。两种竹鸡间的遗传距离是0.0396。根据分子钟计算,它们大约在200万年前分歧进化。推测它们的物种形成主要受更新世第二次寒冷期的影响。     

笼养灰胸竹鸡的繁殖行为

于1999年3－7月对笼养条件下灰胸竹鸡的繁殖行为进行了观察。结果表明,笼养灰胸竹鸡仍保留求偶,交配和产卵等野外繁殖行为,但营巢,邻域,孵卵和育雏行为基本消失,求偶和交配于3出现,5月达到高峰,8月以后繁殖行为基本消失,本文还分析了笼养灰胸竹鸡繁殖期的觅食行为。     

灰胸竹鸡消化系统形态解剖初探

观察和测定了13只灰胸竹鸡消化系统的解剖参数,结果表明:雌性和雄性体重分别为227.39 g和216.79 g,体长分别为237.22 mm和230.00 mm;腺胃粘膜表面具有40～50枚圆形乳头,肌胃较发达;雌性和雄性的食道分别长约93.96 mm和99.75 mm,肠道总长分别为683.83 mm和672.95 mm,肝脏分别重4.87 g和5.20 g,胰脏分别重0.38 g和0.45 g.此研究为进行竹鸡的人工驯养和生物学研究提供解剖学资料.     

灰胸竹鸡血清某些生化参数的测定

运用自动生化分析仪测定了21只野生成年灰胸竹鸡的血液生化参数,结果表明:雌性在总蛋白、白蛋白和球蛋白水平,以及谷丙转氨酶活性均高于雄性(P>0.05),雌性白蛋白/球蛋白却较雄性低;同样,雌性个体的总胆红素、总胆固醇和甘油三酯的含量分别较雄性高8.33%、23.08%和15.38%(P>0.05).提示雌性个体的代谢较雄性个体要强,可为深入探讨竹鸡的机体代谢规律提供资料.     

灰胸竹鸡的生物学特性及经济价值

本文从形态特征、生活习性、繁殖和血液生理生化特点等方面介绍了灰胸竹鸡生物学特性和经济价值,对灰胸竹鸡的人工驯养与繁殖,以及保护性开发具有重要意义。     

笼养灰胸竹鸡的活动时间分配

采用直接观察法对灰胸竹鸡在笼养条件下的活动时间分配及行为特点进行研究,结果表明笼养条件下灰胸竹鸡的主要行为有走动、站立、取食、静卧4种,一天中有两个活动高峰,雄鸡的活动强于雌鸡;白天休息时间占40%以上,采食集中在上午和傍晚进行;站立、取食、静卧发生的频次在雌雄之间无显著差异（P〉0．05）,而走动的频次雄鸡极显著的高于雌鸡（P〈0．01）,各行为每频次在持续时间上差异不显著（P〉0．05）。     

东北地区狍种群的遗传多样性研究

狍为我国重要的经济动物,并且是国家一级保护动物东北虎的主要猎物之一。因此,深入了解狍各地理单元内种群的遗传变异,可以为我们制定保护管理策略提供依据,进而使珍稀濒危物种得到有效的保护和管理。本文对88个不同狍个体(来自8个不同地点)的线粒体DNA控制区的部分序列进行了测定和群体分析,获得了463bp的片断,并检测到59个变异位点,占分析长度的7.84%,且这59个变异位点皆为碱基置换,未出现碱基插入或缺失的现象,定义了30种单倍型,核苷酸多样性平均值为0.02641,种群总体遗传多样性较高。从Tajima’sD和FuandLi’sD值的估算结果来看,这8个狍种群相对于中性进化的歧异度并没有明显的偏离(P0.1),没有明显的证据显示这8个狍种群间存在很强的平衡选择。30个单倍型整体上将东北狍种群分为3个亚群,分子变异分析表明3个亚群间基因流Nm均大于1,说明这3个狍亚群间存在着基因流。     

塔里木马鹿(Cervus elaphus yarkandensis)遗传结构及遗传多样性分析

目的:塔里木马鹿(Cervus elaphus yarkandensis)为马鹿的新疆特有亚种,自20世纪50年代以来,由于自然和人为因素影响,种群数量急剧下降,现已隔离成3个孤立的小种群,即沙雅种群、尉犁种群和且末种群.为了更好地保护这一濒危野生动物.方法:基于塔里木马鹿线粒体控制区部分序列对3个种群的控制区结构和遗传多样性进行了研究.结果:在34个序列比对中得到342bp的片段,含变异位点12个,占分析序列长度的3.51%,由此定义了6个单倍型.显示出3个种群总的核苷酸多样性较低(0.01351±0.00063),单倍型多样性较高(0.693±0.051);就单个种群而言,且末种群的遗传多样性最低,而沙雅种群最高.从Tajima's D和Fu and Li's D值的估算结果来看,塔里木马鹿尉犁和沙雅种群相对于中性进化的歧异度并没有明显的偏离(P>0.1),且末种群则出现了明显的偏离(分别为P<0.05和P<0.02),这预示着3个塔里木马鹿种群间可能存在一定的平衡选择.分子变异分析表明,沙雅和尉犁种群间基因流Nm大于4,说明这2个塔里木马鹿种群间存在着非常丰富的基因流,且末种群分别与沙雅、尉犁种群间基因流Nm均小于1,而且末种群分别与沙雅和尉犁种群产生了明显的遗传分化(Fst分别为0.409;0.718,P值均小于0.001),以及3个塔里木马鹿种群单倍型间的序列差异为0.012.结论:以上数据都显示了3个塔里木马鹿种群的单倍型间已经出现了明显分化.结合系统发生关系分析,应将沙雅种群和尉犁种群联合建立管理单元进行重点保护.     

中国圈养梅花鹿的遗传多样性和遗传结构

东北梅花鹿(Cervus nippon hortulorum)的野生种群已濒临灭绝,但其圈养种群遍布全国各地,是我国圈养梅花鹿的主要品种(亚种)。为了探讨圈养梅花鹿种群作为东北梅花鹿野外放归项目资源种群的可行性,测定了来自9个圈养种群45只梅花鹿个体的线粒体DNA控制区的部分序列,以此分析我国圈养梅花鹿种群的遗传多样性和遗传结构。结果表明,我国圈养梅花鹿种群的遗传多样性并不贫乏,种群之间并没有发生显著的遗传分化。因此,东北地区的圈养梅花鹿种群可以作为野外放归项目的资源种群,而野外放归项目的建群者应来源于东北地区的多个圈养种群。     

中国胭脂鱼线粒体控制区遗传多样性分析

利用PCR技术扩增了采自长江宜昌江段和清江的8尾中国胭脂鱼线粒体DNA控制区全序列,研究发现该种具有脊椎动物线粒体控制区的一般结构,在获得的958bp的碱基序列中,共检测出32个多态性核苷酸变异位点,多态位点比例为0.033。核苷酸的变异位点除一个为缺失外,其余全部为碱基转换。变异位点主要集中在55-365bp高变异区,而其他区域突变稀少,个体的变异在0-1.36%之间,表现出较大的个体多态性差异。中国胭脂鱼的线粒体控制区的变异远大于美国胭脂鱼（Moxostoma robustum)的0.016。     

江西井冈山国家级自然保护区爬行动物多样性研究

2002～2005年对井冈山国家级自然保护区的爬行动物进行了调查,发现当地5种新记录：乌龟（Chinemys reevsii）、平胸龟（Platyternon megacephalum）、多疣壁虎（Gekko japonicus）、银环蛇（Bungarus muhicinctus）和短尾蝮（Agkistrodon brevicaudus）。井冈山自然保护区共有爬行动物41种,隶属于3目9科27属,其中蛇类占80．49％。保护区的爬行动物以东洋界种为主占总数的82．93％,其次是广布种占总数的17．07％,无古北界种。结果表明井冈山自然保护区爬行动物种类丰富,这与保护区所处的地理位置和特殊的地形和气候条件等相关。     

红腹锦鸡线粒体DNA控制区结构和遗传变异研究

红腹锦鸡(Chrysolophus pictus)是中国特有珍稀鸟类,仅见于中国中部和西部的山地,为国家二级重点保护动物.采用聚合酶链式反应和直接测序的方法测定了采自湖南新宁县和龙山县的28只红腹锦鸡线粒体DNA控制区序列.在获得的1 123 bp的碱基序列中,碱基含量为T 32.79%、C 26.07%、A 26.62%和G14.52%,共检测出20个多态性核苷酸变异位点,其中简约信息位点11个.对比其它已报导的雉类控制区结构,对红腹锦鸡控制区结构进行了分析,识别了其高变Ⅰ区、中间保守Ⅱ区和保守Ⅲ区,找到了与终止相关的序列TAS以及保守序列(F、E、D、C).28个样本共发现11种单倍型,其中单倍型hap1和hap2的比例很高.新宁种群的遗传多样性比龙山种群的高,两个种群存在基因流较频繁,未出现明显遗传分化.     

基于线粒体DNA控制区的斑翅草螽不同地理种群遗传分化研究

采用PCR扩增结合DNA克隆测序技术,分析了斑翅草螽Conocephalus maculates 9个地理种群mtDNA控制区序列的变异及遗传多样性。切除侧翼RNA基因序列后,最终获得的斑翅草螽mtDNA控制区比对后全长为676 bp,平均碱基组成T(37.8%),C(11.7%),A(41.3%)和G(9.1%)。共检测到98个可变位点,占总位点数的14.5%,其中,9处碱基插入/缺失,74处转换(40个T/C,34个A/G),50处颠换(18个A/T,11个T/G,15个A/C,6个C/G)。共定义46个单倍型,其中,4个为种群间共享单倍型(H02、H05、H08和H10),其余42个为各种群独有单倍型,包括6个种群内共享单倍型(H09、H11、H15、H18、H26和H38)。单倍型总数占实验个体总数的69.7%,除四川峨眉山外,其余种群单倍型百分比均﹥50%。通过两两地理种群间的FST值差异显著性检验,将这些群体分为4组,分别为SC+CQ,GX+FLB+HN+YN,XZ和HB。以长瓣草螽C.gladiatus、峨眉草螽C.emeiensis、悦鸣草螽C.melaenus、竹草螽C.bambusanus为外群,构建的斑翅草螽mtDNA控制区单倍型NJ法系统树形成3个自举支持度较高的分支,其中,分支A由28种单倍体组成,包括本研究中除四川峨眉山(SC)和重庆万州(CQ)以外的7个种群;分支B由12种单倍体组成,包含除菲律宾拉乌尼翁(FLB)和江西南昌(JX)以外的7个种群;分支C由6种单倍型组成,全部来自西藏林芝(XZ)的单倍型。聚类结果表明,斑翅草螽不同地理种群间的遗传分化并不明显,即使是两两群体间FST值差异显著的群体,也未能形成完全独立的分支。     

The Genetic Diversity of mtDNA D-loop and the Origin of Chinese Goats

The complete sequences of mitochondrial DNA D-loop of 128 individuals in nine Chinese goat (Capra hircu) breeds were analyzed by DNA sequencing technology. The results show that the length of mtDNA D-loop in Chinese goats is 1 212-1 213 bp. There are 102 polymorphic sites, accounting for 8.42% of 1 212 bp sequence. Ninety-two mtDNA haplotypes were determined. The haplotype diversity and nucleotide diversity are 0.9333-1 .0000 and 0.7062%-1.8265%, respectively. The results indicate that the genetic diversity of Chinese goats is very abundant. The NJ tree indicates that Chinese goats have two types of maternal origins from lineage A and lineage B. The possibility of lineage B originating from China is also discussed.     

西藏牦牛mtDNA D-loop区的遗传多样性及其遗传分化

通过测定和分析西藏11个牦牛类群114个个体的mtDNA D-loop区全序列,对西藏牦牛的遗传多样性、类群间的亲缘关系及其遗传分化进行了研究。结果表明:①西藏牦牛mtDNA D-loop区全序列长度为890—896 bp,4种核苷酸T、C、A、G的平均比例分别为28.5%、25.3%、32.4%、13.8%,西藏牦牛mtDNA D-loop区富含碱基A+T,表现出一定的碱基偏好性。②共检测到130个变异位点,占分析总位点数的14.33%;其中单一多态位点85个,占多态位点总数的65.38%,简约信息位点45个,占多态位点总数的34.62%。序列变异中碱基缺失、插入和碱基替换等均有,其中碱基替换变异类型中转换114次,颠换12次,在转换变异类型中以A/G、T/C为主,占95.61%,在颠换变异类型中以A/T为主,占75%。③在114个个体中鉴定出90种单倍型,单倍型多样性为0.981±0.008,核苷酸多样性为0.01056±0.00701,均说明西藏牦牛具有丰富的单倍型类型。④90种单倍型分为2个聚类簇(Ⅰ、Ⅱ),聚类簇Ⅰ包含80种单倍型,占全部单倍型的88.89%,涵盖本研究中所有的西藏牦牛类群;聚类簇Ⅱ中有10种单倍型,占单倍型总数的11.11%,涉及的类群有工布江达、帕里、丁青、巴青、江达、类乌齐、桑桑、桑日、斯布,说明西藏牦牛可能有2个母系起源。⑤西藏牦牛类群间核苷酸分歧度(Dxy)在0.503%—1.416%之间,聚类分析和AMOVA分析显示西藏牦牛可分为两大类,康布牦牛、嘉黎牦牛为一类,其余的牦牛类群为另一类。     

环境因子对雉鸡甘肃亚种种群遗传多样性的影响(英文)

采用聚合酶链式反应(PCR)和直接测序的方法,测定了雉鸡甘肃亚种9个种群118个样本的线粒体DNA(mtDNA)控制区(D-loop)1150个碱基长度的基因序列,43个变异位点产生51个单倍型。环境因子与种群遗传变异的相关性研究表明,序列变异与经度(r=0.725,P<0.05)、年平均温度(r=0.833,P<0.05)呈显著正相关,核苷酸多样性与经度(r=0.686,P<0.05)、年平均温度(r=0.844,P<0.05)呈显著正相关。片段化与低温是导致雉鸡甘肃亚种遗传多样性的主要因素。序列变异及核苷酸多样性与温度的变异系数呈显著负相关(r序列=-0.679,P<0.05;r核苷酸=-0.669,P<0.05)。温度越稳定地区雉鸡甘肃亚种的遗传多样性越高。     

Genetic diversity of captive forest musk deer (Moschus berezovskii) inferred from the mitochondrial DNA control region

Forest musk deer ( Moschus berezovskii ) were once distributed widely in China. However, wild populations have declined dramatically because of poaching and habitat loss. Captive breeding populations have been established for several decades, but the genetic backgrounds of most captive populations were unclear and the population sizes increased very slowly. To provide useful information for conservation and management of this species, we investigated the genetic diversity and population structure of forest musk deer by analysing a 582-bp fragment of the mitochondrial DNA (mtDNA) control region (CR) in three captive breeding populations in Sichuan Province, China. Ninety-four variable sites and 27 haplotypes were observed in 109 individuals, and the nucleotide and haplotype diversities were relatively high compared with those of other endangered mammals. Of the three investigated populations, the Maerkang population had the highest nucleotide diversity ( π  = 0.0568), haplotype diversity ( h  =   0.836) and average intra-population genetic distance (0.062). The analysis of molecular variance demonstrated that most variation occurred within samples and that there was significant differentiation of the three populations. Estimates of gene flow indicated that there were few genetic exchanges among the three populations. Building pedigree records and increasing gene flow between populations will be helpful for conserving these populations and this species.