用RAPD和AFLP的方法对中国卤虫（Autemia）种及亲缘关系的研究

利用ＲＡＰＤ（随机扩增多态ＤＮＡ）和ＡＦＬＰ（扩增片段长度多态性）技术对不同种及种群卤虫的关系进行分析。１０１个随机引物对４种卤虫Ａ．ｆｒａｎｃｉｓｃａｎａ、Ａ．ｕｒｍｉａｎａ、Ａ．ｓｉｎｉｃａ和Ａ．ｐａｒｔｈｅｎｏｇｅｎｅｔｉｃａ基因组ＤＮＡ进行扩增,平均每个种获得７５１条带,其中４５８条带为多态性标记,每个引物提供平均７．４个标记信息,聚类结果表明Ａ．ｓｉｎｉｃａ是不同于其他旧大陆两性生殖卤虫     

红花玉兰与玉兰亚属几个种亲缘关系的AFLP分析

应用AFLP分子标记技术对红花玉兰与玉兰亚属几个种之间的亲缘关系,以及红花玉兰的分类地位进行了分析。9对引物对7个玉兰种的36个代表样株进行选择性扩增,共得到扩增谱带874条,其中多态性谱带635条。分析结果表明：各玉兰种间,红花玉兰与白玉兰、武当木兰的遗传相似度较高;玉兰亚属种间基于AFLP分析的聚类结果与形态学对种的划分基本吻合。红花玉兰不仅形态上与其它玉兰种有明显区别,AFLP分子标记也支持红花玉兰为一个独立的新种,多瓣红花玉兰变种与红花玉兰原变种为一个种。     

新疆新陆早系列品种系谱分析与育种方向

通过对新疆新陆早系列品种系谱分析认为,近10年育成品种,产量不断提高,熟性有变晚趋势,抗病性逐步增强,抗枯萎病已基本解决,抗黄萎病有待进一步提高,品质得到改良,但品种类型单一,不能满足我区棉花产业化发展长远要求.因此,需要育种工作者通过拓宽遗传资源、创新种质,结合先进育种方法,并加强抗逆性筛选力度等来选育适合不同要求的棉花新品种.     

21个枣品种（系）的AFLP指纹分析

采用AFLP技术,利用从30对引物中筛选出的10对多态性较好的引物,对21个枣品种(系)的基因组DNA进行了分析,共扩增出条带531条,其中多态性条带216条,多态性位点百分比为40.68%.采用UPGMA法,对AFLP扩增结果进行了聚类分析,将供试品种(系)分为6类,并得到了18个品种(系)的特征性AFLP标记,可为分子水平进行枣种质鉴定提供参考.     

利用ISSR标记分析福云(半)同胞系茶树品种(系)的遗传多样性和亲缘关系

福鼎大白茶和云南大叶茶是茶树育种中的骨干亲本,利用这两个亲本选育了许多优良的品种(系).本研究利用ISSR标记技术分析了40个福云(半)同胞系茶树品种(系)的遗传变异水平和亲缘关系.14个ISSR引物在供试品种(系)间共扩增出251条谱带,多态性条带的比率为96.4%.引物的PIC值平均为0.94,Rp值平均为29.35,表明引物扩增位点的高多态性和对品种的强辨别能力.40份供试品种(系)的基因多样性指数(H)为0.35,Shannon信息指数(1)为0.52.按母本来源和育种机构对供试品种(系)进行分组分析,结果表明不同品种(系)组间的遗传多样性水平比较接近,遗传变异主要存在于组内品种(系)的个体之间,不同组间基因交流明显.供试品种(系)间的相似系数介于0.52～0.75,根据相似系数矩阵按UPGMA法对40个供试品种(系)进行聚类分析,构建了不同品种(系)间的亲缘关系树状图.福鼎大白茶在树状图中形成单独的分支,在树状图的根基处,其它品种(系)根据遗传距离聚类成不同的类群.来源于同一育种单位的部分茶树品种(系)聚类在同一类群中,但未发现按母本来源区分的独立类群.总之,通过ISSR标记分析,可在基因组水平上进一步了解福云(半)同胞系茶树品种(系)间的遗传变异水平,并进一步明确其亲缘关系,为今后福云(半)同胞系在茶树育种上的有效利用提供依据.     

平欧杂种榛主栽品种（系）遗传关系的ISSR分析

采用ISSR分子标记的方法,对达维、辽榛3号等17个平欧杂种榛主栽品种(系)进行了遗传关系研究。试验从60条ISSR引物中筛选出7条进行电泳分析,使用NTSYS pc 2.11F和Popgene 1.32软件进行数据统计分析并作图。结果显示:7条ISSR引物共获得58条谱带,平均每条引物8.3条谱带,引物平均多态性比率84.6%;7条ISSR引物可将所有样品完全分开,当遗传相似性阈值为0.687时可将样品分成3个类群:第Ⅰ类群14个品种(系)可分成4个亚类,第Ⅱ类群1个品种,第Ⅲ类群2个品系。样品间的遗传相似性系数为0.448~0.879(平均0.678)。群体的有效等位基因数、基因多样度、Shannon信息指数分别为1.6751、0.3701和0.5308。上述结果表明,平欧杂种榛是一个具有高度遗传多样性的群体,主栽品种(系)间存在复杂的亲缘关系。该研究结果对于平欧杂种榛的遗传关系研究具有重要意义,也可为其他榛属植物的相关研究提供参考。     

谷子四大名米品种群农艺及品质性状评价与亲缘关系分析

对谷子四大名米（沁州黄、桃花米、龙山小米及金米）原始地方品种及其同名品种共计179份开展为期两年的农艺性状调查并对其进行基于SNP标记的亲缘关系分析,从中选择51份进行营养品质测定。结果表明：从农艺性状来看,四类名米品种在数量性状上具有明显差异,而质量性状在不同类品种间差异不大。相关性分析表明,穗重与穗粒重、草重与穗重呈极显著正相关。主成分分析表明前3个主成分解释了累积变异的89.414%,基于主成分分析结果计算了综合得分F值,菠菜根-30的综合得分最高（F=7.42）,阴天旱-27的综合得分最低（F=-9.17）。亲缘关系结果表明,各同名品种间存在多样的进化关系,不同名品种间可能存在基因交流。基于农艺性状对179份材料进行聚类分析,发现材料划归4个类群,同名品种内聚集相对集中,农艺性状相似度较大。从营养品质上看,四类名米间营养品质差异较小,除粗纤维外其余营养品质指标差异均不显著。相关性分析发现粗蛋白与粗脂肪呈现显著的正相关;淀粉与蛋白质、脂肪之间呈现显著的负相关。主成分分析表明前6个主要成分解释了累积变异的88.414%,能够基本涵盖10个营养品质的信息,基于主成分分析,结合不同品种...     

应用SRAP标记分析金丝瓜（Cucubitapepo L.）种质资源遗传多样性与亲缘关系

本研究应用SRAP分子标记技术对56份金丝瓜和32份南瓜属（包括西葫芦美洲南瓜、中国南瓜、印度南瓜）种质资源遗传多样性与亲缘关系进行分析。结果表明：（1）从285对SRAP引物中共筛选出50对多态性引物对供试品种基因组DNA进行PCR扩增,获得713条清晰可辨的标记,其中多态性条带634条,多态性比率达88.92%,说明出南瓜属种间遗传多样性较丰富;（2）在56份金丝瓜品种中,共扩增出586条清晰可辨条带,多态性条带350条,多态性比率为59.73%,说明金丝瓜品种间的遗传相似性较高;（3）通过分子聚类分析可将供试金丝瓜品种划分为5个亚类群。金丝瓜与西葫芦美洲南瓜的亲缘关系较近,与中国南瓜的亲缘关系较远,而与印度南瓜的亲缘关系最远;根据分子聚类分析结果证实初步鉴定应可以明确将金丝瓜划归为南瓜属中西葫芦美洲南瓜的一个变亚种。     

芝麻核心收集品中育成品种（系）的遗传多样性分析

利用SRAP分子标记技术对中国芝麻核心收集品的育成品种(系)进行遗传多样性分析,结果表明,14对引物组合在18份芝麻育成品种(系)间共扩增出稳定清晰的条带193条,其中多态性带124条,占64.2%.通过聚类分析和主坐标分析,表明育成品种(系)的遗传基础存在一定的多样性,但遗传相似系数较大(0.5342～0.9688),遗传距离较近.该研究结果表明,在芝麻育种的亲本选配中应积极引入地方种质、国外种质等,以拓宽遗传基础.     

小麦品种（系）对麦红吸浆虫抗性指标筛选与抗性评价

【目的】筛选小麦对麦红吸浆虫Sitodiplosis mosellana抗性的准确鉴定方法, 明确生产上栽培小麦品种（系）对吸浆虫的抗性, 为抗虫小麦品种的筛选和利用提供科学依据。【方法】2012-2014年在陕西周至县建立麦红吸浆虫抗性鉴定圃, 调查并分析各参试小麦材料的估计损失率、粒被害率、穗被害率、单穗虫口和实际产量损失率及其相关性, 筛选出较准确的指标; 并以筛选到的指标为依据, 评估参试材料的抗性。【结果】估计损失率连续两年与其他3个抗性指标及实际产量损失率的相关性最强, 且均达到极显著水平。2012-2013年参试的85份和2013-2014年评估的80份材料中, 高抗、中抗和低抗材料合计分别为25份和40份; 重复种植的16份材料中, 14份两年均表现为抗性, 其中科农1006和晋麦47连续表现为高抗。【结论】估计损失率为具代表性且较准确的吸浆虫抗性鉴定指标。筛选出的抗性材料可作为抗吸浆虫的主推品种或后备品种, 也可作为亲本材料进行抗性育种研究。     

不同地区甜菜夜蛾种群的遗传多样性分析

甜菜夜蛾Spodoptera exigua (Hübner)是一种重要的农业害虫,曾给我国农牧业生产造成过重大的经济损失。为了阐明甜菜夜蛾的种群动态规律,改善和提高其预测、防治水平,我们应用扩增片段长度多态性(AFLP)技术对我国7个甜菜夜蛾种群的42头雄蛾的遗传多样性进行了研究分析。结果表明,不同种群个体间遗传相似性指数分布在0.143～0.824之间,同一种群内不同个体间的遗传相似性指数分布在0.250～0.786之间,同一种群内个体间的遗传相似性指数有许多小于不同种群个体间的。江西种群的多态性条带比例最低,为80.7%; 山东种群的多态性条带比例最高,达88.6%。总体而言,北方种群内的遗传多样性高于南方种群。聚类分析结果表明,同一种群的个体并不总能聚在一起,即种群间不存在明显的遗传分化。这些结果为明确我国甜菜夜蛾的迁飞规律及各发生危害区的虫源关系提供了进一步的实验依据。     

羊草种质基因组DNA的AFLP多态性研究

羊草是禾本科牧草之王,在当前我国西部生态建设和草原畜牧业发展中发挥着重要作用.用AFLP方法对27份我国不同地区分布的羊草(Leymus chinensis (Trin.) Tzvel)材料进行了基因组DNA多态性分析,8对AFLP引物组合在27个不同羊草基因型中共扩增出537条带,产生出的DNA片段大小分布在75 bp-530 bp之间.其中单态性带89条,占16.6%,多态性带329条,占61.3%.平均每对引物组合扩增的DNA带数为66.13,总的多态性比率为78.84%.AFLP多态信息含量PIC值分布于0.0-0.5之间,平均PIC值为0.216,出现的PIC最大值(0.5)约占AFLP标记的8.5%,说明羊草基因组DNA的多态性比较丰富.以537个AFLP标记为原始数据,根据Nei和Li的方法对27份羊草材料进行遗传变异和聚类分析的结果表明:羊草种内有高频率的遗传变异发生,且与地理分布和生态环境密切相关;27份羊草不同基因型被划分为四大类群,不同类群相互间的遗传距离相对较大,在树状图中表现为较远的亲缘关系.对羊草种内遗传变异发生的原因和品种的形成进行了初步讨论.     

羊草种质基因组DNA的AFLP多态性研究

羊草是禾本科牧草之王 ,在当前我国西部生态建设和草原畜牧业发展中发挥着重要作用。用AFLP方法对2 7份我国不同地区分布的羊草 (Leymuschinensis (Trin .)Tzvel)材料进行了基因组DNA多态性分析 ,8对AFLP引物组合在 2 7个不同羊草基因型中共扩增出 5 37条带 ,产生出的DNA片段大小分布在 75bp - 5 30bp之间。其中单态性带 89条 ,占 16 .6 % ,多态性带 32 9条 ,占 6 1.3%。平均每对引物组合扩增的DNA带数为 6 6 .13,总的多态性比率为 78.84%。AFLP多态信息含量PIC值分布于 0 .0 - 0 .5之间 ,平均PIC值为 0 .2 16 ,出现的PIC最大值 (0 .5 )约占AFLP标记的 8.5 % ,说明羊草基因组DNA的多态性比较丰富。以 5 37个AFLP标记为原始数据 ,根据Nei和Li的方法对 2 7份羊草材料进行遗传变异和聚类分析的结果表明 :羊草种内有高频率的遗传变异发生 ,且与地理分布和生态环境密切相关 ;2 7份羊草不同基因型被划分为四大类群 ,不同类群相互间的遗传距离相对较大 ,在树状图中表现为较远的亲缘关系。对羊草种内遗传变异发生的原因和品种的形成进行了初步讨论。     

福寿螺3个地理群体遗传多样性的AFLP分析

应用AFLP分子标记技术对我国江苏苏州、福建漳州和广东珠海3个地理群体福寿螺进行了遗传多样性分析.8对选择性引物在3个群体的90个个体中,共扩增出382个位点,多态位点369个.江苏、福建和广东3个福寿螺群体的多态位点比率和Shannon's指数分别为84.82%、85.08%、79.06%,0.4259、0.4308、0.4079;表明3个群体遗传多样性在同一水平上.不同地理来源的福寿螺个体归群分析聚成3类,与地理分布一致,表明3个地理群体间已出现遗传分化,广东群体和福建群体首先聚在一起,再与江苏群体聚类.Shannon's指数和AMOVA分析估算均显示福寿螺的遗传变异主要来自于群体内个体间.综上所述,3个福寿螺群体具有丰富的遗传多样性而且已形成相对独立的遗传结构;并找到了3个群体间遗传特异性AFLP标记,可用于群体间分子鉴定和辅助分类.     

AFLP marker analysis revealing genetic structure of the tree Parapiptadenia rigida (Benth.) Brenan (Leguminosae-Mimosoideae) in the southern Brazilian Tropical Rainforest

Parapiptadenia rigida is a tropical early secondary succession tree characteristic of the Tropical Atlantic Rainforest. This species is of great ecological importance in the recovery of degraded areas. In this study we investigated the variability and population genetic structure of eight populations of P. rigida. Five AFLP primer combinations were used in a sample of 159 individuals representing these eight populations, rendering a total of 126 polymorphic fragments. The averages of percentage of polymorphic loci, gene diversity, and Shannon index were 60.45%, 0.217, and 0.322, respectively. A significant correlation between the population genetic variability and the population sizes was observed. The genetic variability within populations (72.20%) was higher than between these (22.80%). No perfect correlation was observed between geographic and genetic distances, which might be explained by differences in deforestation intensities that occurred in these areas. A dendrogram constructed by the UPGMA method revealed the formation of two clusters, these also confirmed by Bayesian analysis for the number of K cluster. These results show that it is necessary to develop urgent management strategies for the conservation of certain populations of P. rigida, while other populations still preserve reasonably high levels of genetic variability.     

扩增片段长度多态性实验技术及在动物遗传多样性研究中的应用

扩增片段长度多态性(AFLP)是一种有效的分子遗传标记方法,具有经济、简便、模板需要量少、重复性高、结果可靠等优点。目前AFLP在动物方面的应用还不是很多,处于初级阶段,主要用于鉴定分类关系、种群遗传多样性分析、遗传连锁图谱构建等方面。     

光敏核不育水稻等位突变系的APLP分析

通过对NK58s和NK58F这一对光敏核不育水稻等位突变系的AFLP分析,比较了AFLP,RAPD及RFLP检测DINA多态性的相对效率。结果表明,这三种分子标记的DNA多态性检出效率依次为AFLP>RAPD>RFLP;找出了水稻AFLP分析的最适反应条件;通过AFLP和集群混合分析(Bulked segregating analysis,BSA),筛选出了一批与水稻光敏核不育(PGMS)基因连锁的多态性AFLP产物,已完成了对4个多态性AFLP产物的克隆,Southem杂交证明其中2个为单拷贝顺序,另外2个为低拷贝顺序。对上述三种分子标记各自的优缺点及它们在DNA多态性检测中的适用之处进行了分析探讨。     

倍性分析和AFLP标记相结合鉴定金柑新种质

采用倍性分析和AFLP标记相结合,对滑皮金桔和变异单株金柑Ⅱ进行遗传鉴定分析。结果表明:滑皮金桔是2倍体,金柑Ⅱ是4倍体;选用12对AFLP引物组合,就8份金柑资源进行遗传多样性分析及分类研究,共获得清晰可见的标记341,其中多态性标记95,占27.8%,供试材料相似系数在0.867~0.985之间,能将8个品种区分开,滑皮金桔与普通金柑相似性系数为96.8%,金柑Ⅱ与普通金柑相似性系数为95.8%,滑皮金桔与金柑Ⅱ相似性系数为95.7%。表明滑皮金桔和金柑Ⅱ是不同于普通金柑的变异新种质,可以直接作为品种资源加以利用。     

基于ISSR分子标记的褐马鸡亲缘关系分析

褐马鸡(Crossoptilon mantchuricum)是中国特有濒危鸟类,国家一级保护动物。为了保护褐马鸡种质资源,保障驯养繁育种群和再引入种群的遗传基因结构优化,采用ISSR分子标记技术,对山西庞泉沟国家自然保护区和太原动物园两个种群35个褐马鸡进行了亲缘关系分析。从20条ISSR引物中筛选出10条扩增条带清晰稳定、重复性好的引物,共扩增出65条DNA条带,其中77%呈多态性。两个种群各个体之间的Nei's无偏差遗传距离和遗传相似度分析表明:个体间遗传相似性的平均值分别为0.5061与0.7591,遗传距离的平均值分别为0.4939与0.2409。用组平均法对35个褐马鸡个体进行聚类分析,结果显示:大多数同一种群的个体首先聚在一起,显示出生态地理条件相似的种群亲缘关系较近。     

光敏核不育水稻等位突变系的AFLP分析

通过对NK58S和NK58F这一对光敏核不育水稻等位突变系的AFLP分析,比较了AFLP,RAPD及RFLP检测DNA多态性的相对效率。结果表明,这三种分子标记的DNA多态性检出效率依次为AFLP>RAPD>RFLP;找出了水稻AFLP分析的最适反应条件;通过AFLP和集群混合分析(Bulked segregating analysis,BSA),筛选出了一批与水稻光敏核不育(PGMS)基因连锁的多态性AFLP产物,已完成了对4个多态性AFLP产物的克隆,Southern杂交证明其中2个为单拷贝顺序,另外2个为低拷贝顺序。对上述三种分子标记各自的优缺点及它们在DNA多态性检测中的适用之处进行了分析探讨。