大鼠再生肝中hsbp1、hsf1、hsf2、shp70表达水平改变的分析

在克隆了大鼠热休克因子结合蛋白1基因（hsbp1）全长cDNA基础上,进一步分析它在肝再生中作用。用SD纯系大鼠为材料。按Higgens等方法建立大鼠部分肝切除（PH）模型;用原位杂交等方法分析凤6pJ在肝再生中表达变化;用基因表达谱芯片分析凤如1、hsf1、如,2和hsp70在肝再生中表达变化。原位杂交和基因表达谱芯片分析表明。PH后6h和66-144h,hsbp1表达发生了有意义上调;8-16h,nsf1表达发生了有意义上调;2-16h,hsf2表达发生了有意义上调;0．5—24h,hsp70表达发生了有意义上调。假手术（只打开腹腔和翻动肝叶。但不进行部分肝切除）后0．5-2h,hsbp1表达发生了有意义下调;8—16h,hsf1表达发生了有意义上调;0—144h,hsf2未发生有意义表达变化;0．5—30h,hsp70表达发生了有意义上调。根据实验结果推测,PH后hsbp1表达上调可增加细胞内HSBP1量。促进生长、发育、分化相关基因表达和再生肝的组织结构功能重建;（假）手术后hsbp1表达下调可减少细胞内HSBP1量,有利于HSF1上调hsp70表达,提高机体和肝脏抗损伤能力。     

蛋白质代谢、折叠、运输、定位、装配相关基因在大鼠肝再生中表达变化

为在基因转录水平了解蛋白质代谢、折叠、运输、定位、装配相关基因在大鼠肝再生中表达情况和作用,本文用搜集网站资料和查阅相关论文等方法获得上述基因,用Rat Genome 2302.0芯片检测它们在大鼠再生肝中表达情况,用真、假手术比较方法确定肝再生相关基因。初步证实上述基因中1147个基因与肝再生相关。其中,参与蛋白质代谢、折叠、运输、定位和装配的基因以上调表达为主;参与蛋白质代谢的基因主要在部分肝切除（partial hepatectomy,PH）后0.5-1h和16-30h起始表达;0.5-12h表达的促进蛋白降解基因数多于促进蛋白积累基因数,而16-48h表达的促进蛋白质积累基因数显著多于促进蛋白质降解基因数;蛋白质合成相关基因在肝再生的16、24、42和66h表达上调较多,在42h最多;几乎在整个肝再生中蛋白质降解相关基因表达上调,在早、前期较多,在后期较少;蛋白质折叠相关基因在2、16-24、42、66、72和168h表达上调较多,在66h最多;蛋白质运输和定位相关基因在整个肝再生中表达上调,在66h表达上调最多;蛋白质装配相关基因在96h前均表达上调,其中,12h表达上调基因最多。根据上述结果推测,在肝再生中期蛋白质合成旺盛,几乎整个肝再生中蛋白质降解、折叠、运输定位和装配活动活跃。     

细胞外基质相关基因在大鼠肝再生中表达模式分析

细胞外基质具有维持细胞极性、调节细胞粘附、增殖、组织器官形态、发生、分化等功能。为了进一步在基因转录水平了解细胞外基质在大鼠肝再生中变化和作用, 用搜集网站资料和查阅相关论文等方法获得细胞外基质基因, 用Rat Genome 230 2.0芯片检测它们在大鼠再生肝中表达情况, 用真、假手术比较方法确定肝再生相关基因。初步证实上述97个基因与肝再生相关。其中, 肝再生启动(部分肝切除(parital hepatectomy, PH)后0.5~4 h)、G0/G1过渡(PH后4~6 h)、细胞增殖(PH后6~66 h)、细胞分化和组织结构功能重建(PH后72~168 h)等4个阶段起始表达的基因数为49、19、73、5, 基因总表达的次数为84、51、369、144, 表明相关基因主要在肝再生启动阶段起始表达, 在不同阶段发挥作用。它们表达的相似性分为均上调、上调占优势、均下调、下调占优势、上调和下调相近等5类, 涉及38、21、21、10和7个基因, 共上调411次, 下调186次, 分为24种表达模式, 表明肝再生中细胞生理生化活动具有阶段性、多样性和复杂性。根据细胞外基质相关基因在肝再生中表达变化推测, 肝再生前期纤粘连蛋白形成相关基因表达增强, 肝再生中期胶原形成相关基因表达增强。     

细胞连接相关基因在大鼠肝再生中表达模式

细胞连接是组织、器官形成的基础。为在基因转录水平了解紧密连接、粘附连接、粘着斑和间隙连接相关基因在肝再生中作用,本文用搜集网站资料和查阅相关论文等方法获得上述基因,用Rat Genome 230 2.0芯片检测它们在大鼠再生肝中表达情况,将3次检验结果相同或相似、在肝再生中发生有意义表达变化、真手术组和假手术组表达差异显著的基因视为肝再生相关基因。初步证实上述4种细胞连接中79、53、109和53个基因与肝再生相关。其中,肝再生启动(部分肝切除后0.5～4h)、G0/G1过渡(PH后4～6h)、细胞增殖(部分肝切除后6～66h)、细胞分化和组织结构功能重建(部分肝切除后72～168h)等4个阶段起始表达的基因数和基因的总表达次数为124、43、122、10和249、145、957、306。表明相关基因主要在肝再生启动阶段起始表达,在不同阶段发挥作用。它们共上调972次,下调540次,表明肝再生中大多数细胞连接相关基因表达加强,少数基因表达降低。它们表达的相似性分为均上调、上调占优势、均下调、下调占优势、上调和下调相近等5类,涉及102、38、73、27和16个基因,它们表达的时间相关性分为0.5和1h、2h、4和6h、8和12h、16h、18和48h、24h、30和42h、36h、54和60h、66和72h、96h、120h、144和168h等14组,表明肝再生中细胞生理生化活动具有阶段性。它们的表达模式分为41类,表明肝再生中细胞生理生化活动具有多样性和复杂性。根据肝再生中基因表达变化和表达模式推测,肝再生早期和前期间隙连接形成增强,晚中期和后期间隙连接形成减少;早期、前期和后期粘着斑形成增强;紧密连接和粘附连接的形成贯穿于整个肝再生。     

地塞米松对大鼠再生肝细胞亚精胺合成酶基因转录的影响

采用原位杂交技术研究地塞米松对大鼠再生肝细胞亚精胺合成酶(spermidine syathase,SPDS)基因表达的影响.结果显示,部分肝切除(partial hepatectomy,PH)后,再生肝细胞mRNA表达量呈现先升高后降低的变化趋势,峰值均出现在PH后9 h.PH 去肾上腺使mRNA水平升高,主要表现在PH后6～12 h;地塞米松处理组SPDS基因表达量明显下降,并且随着地塞米松剂量升高,mRNA表达水平降低.结果表明,地塞米松对早期再生肝细胞SPDS基因表达具有抑制作用.     

脂肪细胞分化相关基因在大鼠再生肝中表达变化

肝脏由多种细胞构成,肝再生与细胞分化密切相关,细胞分化受基因转录水平调控。为在基因转录水平了解脂肪细胞分化基因在大鼠肝再生中作用,本文用搜集网站资料和查阅相关论文等方法获得上述基因,用Rat Genome2302.0芯片检测它们在大鼠肝再生(liver regeneration,LR)中表达情况,将三次检验结果相同或相似、在肝再生中表达变化2倍以上、真手术组和假手术组相比差异显著的基因视为肝再生相关基因。初步证实上述基因中75个基因与肝再生相关。肝再生启动(PH后0.5-4h)、G0/G1过渡(PH后4-6h)、细胞增殖(PH后6-66h)、细胞分化和组织结构功能重建(PH后72-168h)等四个阶段起始表达的基因数为44、13、30和1;基因的总表达次数为88、58、302和90。表明相关基因主要在肝再生启动阶段起始表达,在不同阶段发挥作用。它们共表达上调313次、下调167次,分为43种表达方式。表明肝再生中脂肪细胞发生和分化相关基因活动多样和复杂。根据本文研究结果推测,上述基因不仅调节脂肪细胞分化,而且参与肝再生的生理生化活动。     

Dig标记探针原位杂交检测MSG-肝再生-大鼠下丘脑弓状核TGF-β1mRNA

目的通过建立MSG-肝再生-大鼠模型,检测MSG-肝再生-大鼠下丘脑弓状核(ARN)TGF-β1 mRNA的表达与神经内分泌免疫网络的关系.方法用肝大部分切除MSG-大鼠的方法建立MSG-肝再生-大鼠模型,原位杂交技术检测MSG-肝再生-大鼠下丘脑弓状核(ARN)TGF-β1 mRNA的表达.结果发现MSG-肝再生-大鼠ARN TGF-β1mRNA的表达显著上调,切除11天达20.9±1.6,与生理盐水组(11.1±1.2)和MSG-大鼠假手术组(15.2±1.1)比较,差异显著(P＜0.01).结论 MSG-肝再生-大鼠神经-内分泌-免疫网络功能紊乱与其ARN TGF-β1 mRNA表达失调密切相关.     

肌细胞分化基因与大鼠肝再生的相关性分析

肌细胞是组织器官的重要组成部分。为在基因转录水平了解肌细胞分化相关基因在大鼠肝再生中的作用,本文用搜集网站资料和查阅相关论文等方法获得上述基因．用Rat Genome2302．0芯片检测它们在大鼠肝再生（liver regeneration,LR）中表达情况,用比较真、假手术基因表达的差异性方法确定肝再生相关基因。初步证实上述基因中52个基因与肝再生相关。根据肝再生中基因表达的时间相关性将上述基因聚合为0．5-1h;2—12h;16、30、42、96h;18—24、36、48—60h;66—72、120-168h等5类,表达上调和下调的基因数分别为8和10,24和8,21和24,53和64,28和36。它们表达的相似性分为均上调、上调占优势、均下调、下调占优势、上调和下调次数相近等5类,涉及15、10、17、7和3个基因,共上调表达143次、下调136次,分为8类表达方式。表明肌细胞分化相关基因表达变化多样和复杂。根据上述结果推测,肝再生中成肌细胞和平滑肌细胞分化增强：骨骼肌和心肌细胞分化相关基因参与肝再生的生理生化活动。     

大规模鉴定大鼠 0, 4, 36, 72, 96 h 短间隔连续部分肝切除中再生肝差异表达的基因

用抑制性消减杂交方法(SSH)构建了短间隔连续部分肝切除(SISPH)再生肝的消减cDNA文库, 从中筛选出了551个与肝再生相关的基因, 把这些基因制成cDNA 微阵列(cDNA芯片), 分析它们在0 h正常肝及 4, 36, 72, 96 h再生肝中的动态变化发现, 185个基因至少在肝再生的一个时间点表达变化达2倍以上; 185个基因中的86个属未报道的基因, 99个为已报道的基因, 但在此之前尚不知道它们与肝再生有关; 185个基因中的103个在肝再生中表现上调表达, 82个表现下调表达. 用GeneMath软件和GeneSpring方法对这些基因在肝再生中的表达轮廓进行聚类分析表明, 基因的表达模式可分为8组, 即早期诱导、中期诱导、晚期诱导、持续诱导、早期抑制、中期抑制、晚期抑制和持续抑制. 与一次性部分肝切除(PH)相比, 41个基因在SISPH中特异性表达, 其他基因在两个模型中的表达趋势相同, 但在各时间点的表达丰度有差异. 综合分析可见, 抑制性消减杂交技术与基因芯片技术相结合是研究再生肝差异表达基因的有效方法; 肝再生中上调表达的基因多于下调表达的基因; 早期诱导的基因多于晚期诱导的基因; 诱导表达幅度大的基因少于诱导表达幅度小的基因.     

Cloning and characterization of a mouse liver-specific gene mfrep-1, up-regulated in liver regeneration

Human fibrinogen-related protein-1/liver fibrinogen-related protein-1 (HFREP-l/LFIRE-1), a liver-specific protein, is a member of fibrinogen superfamily that exerts various biological activities. However, the function of HFREP-l/LFIRE-1 in liver remains unknown. Here we isolated its mouse ortholog gene-mouse fibrinogen-related protein-1 (mfrep-1), which encoded 314 amino acids, exhibiting 80.4% similarity to HFREP-l/LFIRE-1. Northern blot analysis revealed that 1.2-kb mfrep-1 mRNA was detected selectively in mouse liver. To explore the function of MFREP-1, we examined the levels of mfrep-1 mRNA during regeneration after 70% partial hepatectomy (PHx) in mice, mfrep-1 mRNA increased in the regenerating liver and reached the first shoulder peak at 2-4 h after PHx. Cycloheximide pretreatment could suppress the induction of mfrep-1, indicating the up-regulation of this gene need de novo protein synthesis. Its mRNA continued to elevate at 6 h thereafter and reached the second peak at 24 h. The enhanced express