用做标记的两种酵母菌完整染色体DNA的简化制备法

已知分子量大小的染色体ＤＮＡ分子标记是脉冲电泳研究中用以估算样本染色体ＤＮＡ分子大小必不可少的参照物。对用做标记的啤酒酵母（Ｓａｃｈａｒｏｍｙｃｅｓｃｅｒｅｖｉｓｉａｅ）和粟酒裂殖酵母（Ｓｃｈｉｚｏｓａｃｈａｒｏｍｙｃｅｓｐｏｍｂｅ）完整染色体ＤＮＡ几种制备方法的比较研究以及改进研究表明,液氮冷冻研磨法,凝胶包埋法以及凝胶包埋破壁法效果均很好,都得到大量染色体ＤＮＡ,且彼此间无明显差异。表明液氮冷冻研磨法和凝胶包埋法制备上述两种酵母菌染色体ＤＮＡ分子标记是两种理想的方法,可完全取代凝胶包埋破壁法,即缩短处理时间又降低成本。此外,相同的电泳样本块在不同的电泳条件下,所得结果有一定的差异,表明电泳条件是影响电泳结果的一个重要因素     

麦类作物原位杂交影响因素的研究

为了更好地利用原位杂交技术进行麦类作物外源染色体的检测和基因定位,对麦类作物原位杂交的影响因素进行了研究。（１）利用缺口转译法对克隆的ＤＮＡ 片段进行生物素标记,即节省时间,又可以获得较高的标记效率;对麦类作物的基因组ＤＮＡ,宜采用随机寡核苷酸引物标记法进行生物素标记,适当延长标记时间可以提高标记效率。（２）共变性法比较适宜麦类作物的原位杂交,分别变性法如掌握不当易使染色体产生膨胀现象,变性温度过高也会使黑麦（Ｓｅｃａｌｅ ｃｅｒｅａｌ）染色体的轮廓模糊不清。（３）应根据麦类作物亲本之间的亲缘关系决定封阻ＤＮＡ 的使用浓度,并利用生物素标记的簇毛麦（Ｈａｙｎａｌｄｉａ ｖｉｌｌｏｓａ）基因组ＤＮＡ 为探针,从普通小麦（Ｔｒｉｔｉｃｕｍ ａｅｓｔｉｖｕｍ ）－簇毛麦双二倍体的染色体中识别了簇毛麦的染色体。（４）麦类作物的原位杂交受洗脱强度的影响很大,利用甲酰胺进行洗脱可以获得背景清晰的原位杂交带型。随着原位杂交技术分辨率的不断提高,该技术还将用于单拷贝基因的染色体定位     

通过微切—扩增建立植物（蚕豆Vicia faba）染色体区段特异性基…

以蚕豆根尖为材料,采用改良方法制备染色体标本,在光镜下切割分离一段大Ｍ染色体核仁组织区（ＮＯＲ）特定区段,通过单一引物－－聚合酶链式反应法随机扩同切ＤＮＡ后,获得近６０μｇＤＮＡ。经琼脂糖电泳分析测定扩增产物分子片段大小介于２００－９００ｂｐ。以地主新标记蚕豆总体ＤＮＡ。作为探针与扩增产物进行Ｓｏｕｔｈｅｒｎ杂交,证实扩增得到的ＤＮＡ与蚕豆ＤＮＡ同源,来自微切染色体。部分扩增产物经ＥｃｏＲＩ酶切后     

利用水稻成套端三体进行DNA序列快速染色体臂定位

以水稻（Ｏｒｙｚａ ｓａｔｉｖａ Ｌ．ｓｓｐ．ｉｎｄｉｃａ）“中籼３０３７”成套端三体为材料,通过制备不同染色体两个端三体的等量ＤＮＡ膜,并与等定位的分子标记或ＤＮＡ序列杂交,成功地将严重偏分离的零等位标记多拷贝标记０７３的不同片段,以及着丝点相关重复序列ＲＣＳ１定位互相应的染色体臂上。说明在水稻中,不同染色体臂的端三体可以弥补连锁定位方法的一些不足。     

用电镜原位杂交技术对玉米中期染色体中RNA的研究

用生物素标记的玉米１８ＳｒＲＮＡ、小麦５ＳｒＲＮＡ 及ｔＲＮＡ 的ｃＤＮＡ 作为探针,在Ｋ４Ｍ 树脂包埋的玉米（Ｚｅａ ｍ ａｙｓ）根尖超薄切片上进行原位杂交。杂交后,用与１０ ｎｍ 金颗粒相连的亲和素对杂交子在电镜下进行检测。结果发现,在玉米中期染色体中存在有１８ＳｒＲＮＡ、５ＳｒＲＮＡ 和ｔＲＮＡ 分子,这些ＲＮＡ分子在染色体中的分布是随机的,即这些ＲＮＡ 分子在染色体的内部和周边均有分布。５ＳｒＲＮＡ 和ｔＲ－ＮＡ 在染色体中和细胞质中的含量基本相等,而１８ＳｒＲＮＡ 在染色体中的含量则明显高于细胞质。这一结果表明染色体中的ＲＮＡ 一部分来自于核仁,而另一部分则来自于核质     

微卫星DNA和AFLP标记在水稻分子标记连锁图上的分布

以一个栽培稻（ＯｒｙｚａｓａｔｉｖａＬ．ｓｐ．ｉｎｄｉｃａ）和野生稻（Ｏ．ｒｕｆｉｐｏｇｏｎＧｒｉｆ）杂交的Ｆ２作图群体以及由该群体构建的ＲＦＬＰ标记连锁图,分析了微卫星ＤＮＡ和ＡＦＬＰ标记的多态性、遗传行为及其在染色体上的分布。共定位了２８个微卫星ＤＮＡ标记和１７２个ＡＦＬＰ标记。２８个微卫星ＤＮＡ标记中有６个为华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室根据数据库中序列而设计,其余２２个来自美国Ｃｏｒｎｅｌ大学已发表的结果。１７２个ＡＦＬＰ标记出自２５对引物扩增得到的２２８个多态性带的片段。这些标记分布于水稻的１２条染色体。将此２００个ＰＣＲ标记与华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室构建的ＲＦＬＰ连锁图整合,得到一张含６１２个分子标记位点的遗传连锁图。     

应用分子原位杂交技术解析小麦—天兰冰草部分双二倍体——远中2号的…

为分析普通小麦－天兰冰草部分双二倍体－远中２号的染色体构成,用生物素标记天兰冰草染色体组ＤＮＡ俄为探针,,以普通小麦品种中国春染色体组ＤＮＡ为封闭ＤＮＡ,与远中２号的有丝分裂中期染色体ＤＮＡ进行了分子原位杂是明远中２号除具有普通小麦的２１对染色体外,附加了１对小麦－地冰草易位染色体（妈卫兰冰草染色体片段易位到小麦染色体的两臂端部）,５对天兰冰草染色体。说明小麦－天兰冰草部分双二倍体在形成过程中当构     

酿酒酵母染色体DNA样品制备和CHEF分析

采用国产溶壁酶蛊酿酒酵母菌株Ｘ８的原生质体，将４×１０＾８／ｍｌ的原生持体悬浮液与等体积的１％低融点琼脂糖混匀后，凝固的原生质体包埋块在含１ｍｇ／ｍｌ蛋白酶Ｋ的ＮＤＳ缓冲中处理２４ｈ，获得适宜于ＣＨＥＦＪ民泳的染色体ＤＮＡ样品。采用了上述与前人不同的方法制备酿酒酵母染色体ＤＮＡ样品，为广泛研究真菌电泳核型和制备巨型ＤＮＡ分子量标记样品奠定了基础。ＣＨＥＦ电泳结果显示，供试菌株Ｘ８与对照菌７５５之间     

应用原位杂交及RAPD技术标记抗黄矮病小麦—中间偃麦草染色体异附加系

以生物素标记中间偃麦草基因组ＤＮＡ为探针,与抗黄矮病小麦－中间偃麦草染色体异附加系Ｚ６进行原位杂交,鉴定出附加的１对中间偃麦草染色体。对异附加系Ｚ６和Ｌ１及它们的小麦亲本进行了ＲＡＰＤ分析,从１２０个随机引物中,筛选出２个引物可以扩增出附加染色体的特异ＤＮＡ片段,可作为鉴定导入小麦的中间偃麦草染色质的分子标记。     

应用原位杂交及RAPD技术标记抗黄矮病小麦一中间偃麦草染色体异附加系

以生物素（Ｂｉｏｔｉｎ－１６－ｄＵＴＰ）标记中间偃麦草基因组 ＤＮＡ为探针,与抗黄矮病小麦－中间偃麦草染色体异附加系Ｚ６进行原位杂交,鉴定出附加的１对中间偃麦草染色体。对异附加系 Ｚ６和 Ｌ１及它们的小麦亲本进行了 ＲＡＰＤ分析,从 １２０个随机引物中,筛选出 ２个引物可以扩增出附加染色体的特异ＤＮＡ片段,可作为鉴定寻人小麦的中间偃麦草染色质的分子标记。     

在植物粗线期染色体和DNA纤维上的荧光原位杂交技术

介绍了两种荧光原位杂交技术的详细实验步骤。第一种技术是在减数分裂粗线期染色体上的荧光原位杂交,包括从花粉母细胞中制备粗线期染色体和在这种染色体上定位ＤＮＡ序列,其分辨率水平能够达到１００ｋｂ。第二种技术是从植物细胞核中制备ＤＮＡ纤维,并在上面进行原位杂交,能够直接分析ＤＮＡ序列的分子排列关系,其分辨率水平能达到几个ｋｂ。为了说明这两种原位杂交技术在研究基因组和染色体结构、构建高分辨率的ＤＮＡ物理图谱上的能力,将展示用该技术直接分析番茄染色体端粒重复序列和端粒联接重复序列的染色体定位和ＤＮＡ分子排列。     

石蜡包时组织的DNA提取及其在免疫球蛋白基因重排…

基因重排分析在淋巴瘤诊断中具有重要意义。文章应用改良ＤＮＡ提取方法。从３０例淋巴生性病变石蜡包埋组织获得的ＤＮＡ虽有不同程度的降解,但适于ＰＣＲ扩增Ｉｇ重链箕因重排分析;约１／３病例提出高分子量ＤＮＡ,可用于ＤＮＡ印迹杂交。因此,石蜡包埋组织同样可为某些疾患,如淋巴瘤凝难和罕见病例的回顾性分子病理学研究提供基因诊断的ＤＮＡ来源。     

镰孢属几种植物病原真菌分子核型的研究

利用脉冲电场凝胶电泳（ｐｕｌｓｅｄ－ｆｉｅｌｄｇｅｌｅｌｅｃｔｒｏｐｈｏｒｅｓｉｓ,ＰＦＧＥ）,研究了４株串珠镰孢（Ｆｕｓａｒｉｕｍ　ｍｏｎｉｌｉｆｏｒｍｅ）、１株尖镰孢（F．ｏｘｙｓｐｏｒｕｍ）、１株茄镰孢（Ｆ．ｓｏｌａｎｉ）和１株Ｆｕｓａｒｉｕｍｓｐ．的分子核型以及不同地域和寄主来源的串珠镰孢种内菌株间的分子核型差异。以凝胶包埋法（不破除分生孢子细胞壁）制备供试菌株电泳样本,采用３组条件组合进行电泳,分离出供试串珠镰孢完整染色体ＤＮＡ１０～１３条,分子量分布范围０．７Ｍｂ～６．９Ｍｂ,基因组大小为４２．２６Ｍｂ～４７．７５Ｍｂ;尖镰孢８条,分子量分布范围１．２Ｍｂ～６．７Ｍｂ,基因组大小为３２．２５Ｍｂ;茄镰孢６条,分子量分布范围２．４Ｍｂ～６．３Ｍｂ,基因组大小为２５．２Ｍｂ;Ｆｕｓａｒｉｕｍｓｐ．９条,分子量分布范围０．８Ｍｂ～６．８Ｍｂ,基因组大小为３６．４５Ｍｂ。结果表明,供试４种镰孢菌染色体数目、ＤＮＡ分子量及基因组大小都有较大不同,分子核型差异较大。不同来源的串珠镰孢种内菌株间分子核型亦有明显差异。     

镰孢属几种植物病原真菌分子核型的研究*

利用脉冲电场凝胶电泳（ｐｕｌｓｅｄ－ｆｉｅｌｄｇｅｌｅｌｅｃｔｒｏｐｈｏｒｅｓｉｓ,ＰＦＧＥ）,研究了４株串珠镰孢（Ｆｕｓａｒｉｕｍ　ｍｏｎｉｌｉｆｏｒｍｅ）、１株尖镰孢（F．ｏｘｙｓｐｏｒｕｍ）、１株茄镰孢（Ｆ．ｓｏｌａｎｉ）和１株Ｆｕｓａｒｉｕｍｓｐ．的分子核型以及不同地域和寄主来源的串珠镰孢种内菌株间的分子核型差异。以凝胶包埋法（不破除分生孢子细胞壁）制备供试菌株电泳样本,采用３组条件组合进行电泳,分离出供试串珠镰孢完整染色体ＤＮＡ１０～１３条,分子量分布范围０．７Ｍｂ～６．９Ｍｂ,基因组大小为４２．２６Ｍｂ～４７．７５Ｍｂ;尖镰孢８条,分子量分布范围１．２Ｍｂ～６．７Ｍｂ,基因组大小为３２．２５Ｍｂ;茄镰孢６条,分子量分布范围２．４Ｍｂ～６．３Ｍｂ,基因组大小为２５．２Ｍｂ;Ｆｕｓａｒｉｕｍｓｐ．９条,分子量分布范围０．８Ｍｂ～６．８Ｍｂ,基因组大小为３６．４５Ｍｂ。结果表明,供试４种镰孢菌染色体数目、ＤＮＡ分子量及基因组大小都有较大不同,分子核型差异较大。不同来源的串珠镰孢种内菌株间分子核型亦有明显差异。     

分子标记及其在植物遗传育种中的应用

遗传标记可以说是生物群体中可识别的遗传多态性的一种表现形式。随着遗传研究特别是遗传作图的不断深入,遗传标记已从传统的以等位基因的表型识别为基础的形态标记、以染色体的结构和数目为特征的细胞学标记,及具有组织、发育及物种特异性的同工酶标记,拓展到目前已广泛应用的以ＤＮＡ多态性为基础的分子标记技术。现代分子标记技术的出现和发展为植物遗传育种研究的许多领域注入了新的活力。本文着重就目前植物遗传育种中所应用的一些主要分子标记技术及其应用作一概述。１　常用的分子标记技术自８０年代初有人提出用ＲＦＬＰ作为遗传…     

DNA标记和分子育种

ＤＮＡ标记和分子育种钱惠荣郑康乐（中国水稻研究所生物工程系杭州３１０００６）生物技术的发展给作物遗传育种研究带来了巨大的变化,ＤＮＡ分子标记技术的应用是其中最显著的变化之一［９,４８］。由于分子标记相对于经典遗传育种研究中的形态性状具有无可比拟的优越性,它的使用也越来越广泛。许多以前无法进行的研究,比如环境因素的影响,数量性状的多重效应等等,在分子标记的帮助下已经开展。同时分子标记直接应用于...     

番茄OVATE基因调控果实梨形发育

ＰｒｏｃＮａｔｌＡｃａｄＳｃｉＵＳＡ ,2 0 0 2 ,99:1 330 2～ 1 330 6早期研究表明番茄果实的梨形性状由位于第二染色体的一个隐性基因ｏｖａｔｅ所控制 ,ｏｖａｔｅ基因位于分子标记ＴＧ645附近 ,以此标记为探针筛选番茄ＢＡＣ文库将该基因定位于一个长为 1 0 5ｋｂ的ＤＮＡ片段内 ,进一步的分子标记定位表明该基因在含有 8个ＯＲＦ的 55ｋｂＤＮＡ内。通过ＰＣＲ扩增了圆形番茄这一区域ＤＮＡ并进行测序 ,结果表明突变体的ＯＲＦ6中有三处发生了突变。ＯＲＦ6由两个外显子和 1个内含子组成 ,有一个点突变和一个 2ｂｐ的插入或缺失突变…     

应用分子原位杂交技术解析小麦-天兰冰草部分双二倍体──远中2号的染色体构成

为分析普通小麦（Ｔｒｉｔｉｃｕｍａｅｓｔｉｖｕｍ）－天兰冰草（Ａｇｒｏｐｙｒｏｎｉｎｔｅｒｍｅｄｉｕｍ）部分双二倍体──远中２号（２ｎ＝５４）的染色体构成,用生物素（ｂｉｏｔｉｎ－１６－ｄＵＴＰ）标记天兰冰草染色体组ＤＮＡ作为探针,以普通小麦品种中国春染色体组ＤＮＡ为封闭ＤＮＡ（ｂｌｏｃｋｉｎｇＤＮＡ）,与远中２号的有丝分裂中期染色体ＤＮＡ进行了分子原位杂交。证明远中２号除具有普通小麦的２１对染色体外,附加了１对小麦－天兰冰草易位染色体（即天兰冰草染色体片段易位到小麦染色体的两臂端部）、５对天兰冰草染色体。说明小麦－天兰冰草部分双二倍体在形成过程中染色体行为是比较复杂的,不仅可能产生小麦－天兰冰草染色体间易位,而且小麦染色体也可能与天兰冰草染色体的３种染色休组染色体共同参与组建新的染色体组附加到小麦中去。     

抗白粉病小麦染色体组型的分子标记与生化标记分析

应用与小麦第六同源群有关的分子和生化标记,包括ＤＮＡ探针ｐＳｃ５·３Ｈ３和ｐＳＲ１６７以及同工酶Ｅｓｔ－５和ａ－Ａｍｙ－１,对来自六倍体小黑麦Ｂｅａｇｌｅ与普通小麦科冬５８杂交后代Ｆ１花粉植株的抗白粉病株系Ｍ２４．Ｍ０９及Ｍ１７进行了分析。结果表明,Ｍ２４、Ｍ０９及Ｍ１７不同程度地含有黑麦染色体成分,而且电泳谱带差别较大,据此推断,Ｍ０９为６ＲＬ的易位系。因此,生化和分子标记不仅可以用于确定外源片段的存在,而且可以帮助确定染色体组型和外源片段的位置     

用分子原位杂交（GISH）鉴定小麦－簇毛麦双倍体、附加系、代换系和易位系

用生物素标记的簇毛麦（Ｈａｙｎａｌｄｉａｖｉｌｌｏｓａ）染色体组ＤＮＡ（ｔｏｔａｌｇｅｎｏｍｉｃＤＮＡ）作探针,以普通小麦染色体组ＤＮＡ作遮盖（用量１：２００左右）,进行有丝分裂中期和减数分裂中期Ｉ染色体的分子原位杂交（ＧＩＳＨ）,经抗生物素蛋白－辣根过氧化物酶复合物（ｂｉｏ－ｓｔｒｅｐｔａｖｉｄｉｎ－ｈｏｒｓｅｒａｄｉｓｈｐｅｒｏｘｉｄａｓｅ）和联苯胺四盐酸（ＤＡＢ）检测显色后,小麦－簇毛麦双倍体、附加系、代换系和易位系中的簇毛麦染色体及染色体片段显棕色,与显浅蓝色的小麦染色体可明显区分。用ＧＩＳＨ不仅可以检测导入小麦中的簇毛麦染色质,而且可以清楚地显示出易位染色体断裂点的确切位置。将ＧＩＳＨ用于减数分裂期染色体配对分析,还可以清晰形象地显示出同源和非同源染色体之间的配对和分离情况。