基于 DArT 标记的三疣梭子蟹地理种群遗传多样性分析

三疣梭子蟹是中国重要的水产养殖动物。目前,其养殖业的蟹苗主要还是依靠野生资源,但种质（生长速度、肌肉品质和抗病性）退化现象严重,因此迫切需要了解个体、种群和物种遗传多样性。报道了一种检测三疣梭子蟹多样性芯片技术（diversityarraystechnology,DART）。DArT技术采用芯片可同时检测数百个基因座,即使没有基因组DNA序列信息也可以分析遗传多态性。采用了风tL／TaqI复杂性降低方法,多态性效率为12．5％。利用多样性芯片杂交获得313个DArT标记。这些DArT标记用于点制多态性富集芯片,DArT标记具有较高的多态性信息含量（polymorphisminformationcontent,PIC）。最后根据0／1矩阵获得UPGMA系统进化树,结果表明样品间的遗传多样性与文献报道一致。芯片质量检测中包括赋值重复性为99．1％,同一样品不同个体间的差异不显著,其差异介于0．7％～1．6％。研究表明,DArT技术具有高通量和低成本的显著特点,该技术可为三疣梭子蟹资源保护和良种选育提供支持。     

通过微切一扩增建立植物(蚕豆Vicia faba)染色体区段特异性基因文库研究初探

以蚕豆（Viciafaba,2n=12）根尖为材料,采用改良方法制备染色体标本,在光镜下切割分离一段大M染色体核仁组织区（NOR）特定区段（约合0．9pgDNA）,通过单一引物一聚合酶链式反应法（SingleUniquePrimer-PCR）随机扩增微切DNA后,获得近60μgDNA。经琼脂糖电泳分析测定扩增产物分子片段大小介于200-900bp。以地高新（Digoxigenin）标记蚕豆总体DNA,作为探针与扩增产物进行Southern杂交,证实扩增得到的DNA与蚕豆DNA同源,来自做切染色体。部分扩增产物经ECORI酶切后,连人经同酶切割后的pUC18载体质粒,转化大肠杆菌（EcoliJM109）。琼脂糖电泳分析得到的部分克隆,得知插人子长度介于0．25-0．9kb。本文将用于动物材料的单一引物一聚合酶链式反应法应用于植物染色体的微切微扩增,并作了一定程度简化,初步建立起一套包括微切、扩增、检测和克隆的便捷、经济的实验室制备植物染色体区域特异性基因文库的方法。     

美国用4000美元解读个人基因组

第三代人类基因组测序公司——美国Complete Genomics公司，制造出自我装配DNA纳米球列阵（self-assembled DNA nano—bolearray），并将cPAL（C0mbinatorial probe anchor ligation）技术应用到该列阵上，用读取每个独立的碱基（unchained base）的方法，解读了个人的基因组。据说采用这种方法解读人的基因组时，消费品平均成本为4000美元，详细情况在2009年11月5日的Science杂志上有所报道。     

A High-throughput Genomic Tool： Diversity Array Technology Complementary for Rice Genotyping

Diversity array technology （DART^TM） was a genotyping tool characterized gel-independent and high throughput. The main purpose of present study is to validate DArT for rice （Oryza sativa L.）genotyping in a high throughput manner. Technically, the main objective was to generate a rice general purpose gene pool, and optimize this genomic tool in order to evaluate rice germplasm genetic diversity. To achieve this, firstly, a generalpurpose DArT array was developed. Ten representatives from 24 varieties were hybridized with the general-purpose array to determine the informativeness of the clones printed on the array. The informative 1 152 clones were re-arrayed on a slide and used to fingerprint 17 of 24 germplasms. Hybridizing targets prepared from the germplasm to be assayed to the DNA array gave DNA fingerprints of germplasms. Raw data were normalized and transformed into binary data, which were then analyzed by using NTSYSpc （Numerical taxonomy system for cluster and ordination analysis, v. 2.02j） software package. The graphically displayed dendrogram derived from the array experimental data was matched with simple sequence repeats genotyping outline and varieties＇ pedigree deviation of the different varieties. Considering DArT is a sequence-independent genotyping approach, it will be applied in studies of the genetic diversity and the gene mapping of diverse of organisms, especially for those crops with less-developed molecular markers.     

电场驱动微悬臂生物传感器及对DNA 的快速、高灵敏度检测

微悬臂列阵传感器在生物检测方面具有快速、痕量和非标记的特性. 我们以镀金并在其上固定了 DNA 探针的微悬臂为正极,在靶杂交液槽内引入另一电极作为负极,构成电场驱动微悬臂 DNA 生物传感器. 对该传感器系统施加静电场,驱动 DNA 分子朝正极迁移,使溶液中的 DNA 分子富集在微悬臂上,促进 DNA 分子的杂交. 结果表明： a. DNA 在微悬臂上的杂交时间仅需 3 min,加快了微悬臂生物传感器对 DNA 分子的检测速度; b. 提高了微悬臂生物传感器的灵敏度,可以检测到皮克级的 DNA 分子.     

DArT技术的原理及其在植物遗传研究中的应用

DArT是一种依赖于基因芯片杂交基础之上的分子标记技术, 由于其具有省时、高通量、低花费、无需预知研究对象的DNA序列等优点而被应用到植物遗传研究中。文章介绍了DArT技术的原理、特点、具体操作方法及其目前在植物遗传研究中的应用。     

应用改良彗星试验检测杀虫剂对小鼠细胞DNA的损伤

目的：检测杀虫剂（杀灭菊酯乳油）是否对小鼠外周血淋巴细胞DNA有损伤。方法：应用改良彗星试验（单细胞凝胶电泳）分别检测三个剂量组和对照组小鼠外周血淋巴细胞。结果：剂量组的彗星出现率与阴性对照组存在显著差异（P＜0．05）,而与阳性对照组差异不显著（P＞0．05）。结论：该杀虫剂对小鼠外周血淋巴细胞DNA有一定程度的损伤。     

DNA指纹技术在污染土壤生态毒理诊断中的应用

生物标记物能在细咆或分子水平上指示暴露．效应关系,是进行污染土壤生态毒理诊断的主要技术手段之一。随着分子生物学技术的飞速发展,出现了一系列以聚合酶链式反应为基础的、在分子水平上检测污染物质导致的生物体DNA损伤的DNA指纹技术。DNA指纹技术的主要类型有：随机扩增多态性DNA（RAPD）、聚合酶链式反应．单链构象多态性（PCR-SSCP）、扩增片段长度多态性（AFLP）、任意引物聚合酶链式反应（AP—PCR）、差异显示反转录聚合酶链式反应（DDRT）、短DNA重复序列（SSR）及限制片段长度多态性（RFLP）等。这些技术与检测基因突变、染色体畸变和损伤为主的一系列经典研究方法如彗星分析、微核实验等相比具有简便、快速、灵敏等优点。本文着重介绍了随机扩增多态性DNA、聚合酶链式反应．单链构象多态性、扩增片段长度多态性3种重要的DNA指纹技术在污染土壤诊断中的应用。     

从全基因组里寻找基因，以期预测发病可能及治疗效果

以基因组中的SNP为线索,GWAS使人的多样性凸显出来。 制药企业期待GWAS对药物副作用的防止和新靶点的探索做出贡献。 受到研究经费和DNA微列阵的限制,今后的研究将怎么开展。     

三种人全血基因组DNA提取方法的比较

目的：比较改良酚一氯仿抽提法、盐析法、试剂盒法从人全血中提取基因组DNA的效果,以期建立一种快速、经济的提取高质量基因组DNA的方法。方法：分别用上述三种方法从人全血中提取基因组DNA,通过紫外分光光度计、琼脂糖凝胶电泳、聚合酶链式反应（PCR）、限制性内切酶酶切检测提取的基因组DNA的产量、纯度和质量。结果：改良酚一氯仿抽提法与试剂盒法提取的基因组DNA相比,DNA的产量有统计学差异,DNA的纯度无统计学差异,但试剂盒法提取的基因组DNA有较明显的降解现象：盐析法与改良酚．氯仿抽提法、试剂盒法相比,基因组DNA的产量和纯度都存在统计学差异,并且基因组DNA聚合酶链式反应（PCR）扩增的稳定性也明显劣于另外两种方法;三种方法提取基因组DNA均能进行限制性内切核酸消化。结论：改良酚一氯仿抽据取法是一种经济、快速、高效、稳定提取人全血基因组DNA的方法,适用于批量临床标本处理。     

基于RAPD分析用百合DNA的提取

对百合DNA的提取过程进行改良和优化,筛选出较理想的DNA提取方法。结果表明,该方法提取的百合DNA在1％的琼脂糖胶电泳上为清晰的一条带,RNA去除干净,无降解现象,分子量大于23kb,OD200nm/OD280nm值为1．80-2．00。DNA的质量符合百合RAPD（随机扩增多态DNA）分析要求,在百合遗传多态性分析和品种分子鉴定中具有良好的应用前景．     

植物染色体微切割过程中细胞质DNA污染及其控制的研究

染色体微切割和微克隆已成为复杂基因组研究的有效途径。但是操作过程中的核外DNA的污染一直是令人担心的问题,通过研究植物染色体微切割（微分离）和微切割的染色体DNA扩增过程中细胞质DNA的污染问题,表明目前常用的植物染色体微切割过程中,细胞质DNA的污染几乎难以避免,并提出了一个改进的降低细胞质DNA污染的方法。对如何控制细胞质DNA的污染进行了详细的讨论。     

体内电穿孔对载体表达效率和人类免疫缺陷病毒1型DNA疫苗免疫反应效果的研究

本文旨在分析体内电穿孔（EP）技术对DNA载体pDRVIl．0表达效率和人类免疫缺陷病毒1型（HIV-1）DNA疫苗免疫反应的辅助效果,为其在DNA疫苗中的应用提供参考数据。通过构建携带荧光素酶基因的pDRVll．0-Fluc质粒,利用活体成像技术分析EP接种对荧光素酶蛋白的组织分布、表达水平和持续时间的影响;同时,构建携带我国HIV-1CRF07-BC流行毒株env基因的DNA疫苗pDRVll．0-HIV,利用酶联免疫斑点法（ELISPOT）、酶联免疫吸附试验（ELISA）和中和抗体法对EP辅助免疫反应的特点进行分析。结果显示,EP接种后,pDRVll．0-Fluc质粒未改变组织分布特点,但其体内表达效率显著提高,载体的饱和接种量降低。同时,EP技术提高了pDRVll．0-HIV疫苗免疫小鼠后诱导的γ干扰素（IFN-7）分泌型T细胞反应和Env特异性结合抗体效价。结果提示,EP技术可在DNA疫苗应用方面发挥作用。     

利用改良CTAB法快速小量提取微胚乳玉米基因组DNA

为了能快速小量提取微胚乳玉米基因组DNA,以微胚乳玉米幼叶为试材,采用改良CTAB法和传统CTAB法提取微胚乳玉米基因组DNA,并对所提取的DNA通过紫外分光光度计、琼脂糖凝胶电泳和PCR扩增等方法进行检测。两种方法所得基因组DNA的OD260/OD280在1.8~1.9之间,电泳条带清晰,无蛋白质和RNA污染,DNA无明显降解,其浓度和纯度都适合基因工程实验操作的条件。改良CTAB法与传统CTAB法相比更简便快捷,可实现大批量的不同样本基因组DNA的同时提取,提供了一种简便、快捷、有效和实用的微量提取微胚乳玉米基因组DNA方法,可满足以PCR为基础的分子生物学研究。     

紫花含笑（♀）与灰岩含笑（♂）及其杂种F1代叶表皮微形态和叶结构的比较观察

通过比较观察紫花含笑（♀）和灰岩含笑（♂）及其杂种F1代叶表皮微形态和叶结构发现,紫花含笑和灰岩含笑在叶表皮微形态及叶解剖结构方面有很大差异。杂种F1代个体间在叶表皮微形态及叶解剖结构方面变异很大,为连续的数量遗传;其中57．7％以上的杂种F1代气孔密度高于父母本。杂种F1代矮化型植株叶片气孔密度较小,推测其抗寒性较强,可以通过进一步杂交改良,获得矮化型的盆栽含笑新品种。观察结果可为深入探讨含笑属种间杂种F1代的遗传变异,并从这些杂种F1代中选育观赏新品种积累科学资料。     

金黄色葡萄球菌L型和人乳头瘤病毒与宫颈癌关系的研究

应用改良革兰氏染色和免疫组化染色（ＡＢＣ法）,对２７０例宫颈癌和３３例慢性宫颈炎进行了研究。结果发现,宫颈癌革兰氏染色切片中细菌Ｌ型感染率（７５．１％）明显高于慢性宫颈炎（４５．５％）（Ｐ＜０．０５）,金黄色葡萄球菌Ｌ型抗原阳性率（７６．２％）明显高于人乳头瘤病毒（ＨＰＶ）抗原阳性率（５７．１％）。Ｌ型、ＨＰＶ混合感染率为４２．８％。上述结果表明宫颈癌中金葡菌Ｌ型与ＨＰＶ感染均常见,尤其金葡菌Ｌ型感染更为多见;金葡菌Ｌ型与ＨＰＶ感染的致病特征相似,两者均有不同程度的空泡细胞出现。提示金葡菌Ｌ型感染可能也是宫颈癌的致癌重要因素之一。     

抗CD3/抗Pgp微型双功能抗体的构建和表达

构建和表达抗CD3/抗Pgp微型双功能抗体,并测定该微型双功能抗体的生物学活性。 采用PCR和overlap PCR方法构建抗CD3/抗Pgp微型双功能抗体,并用双脱氧终止法测定DNA序列;采用亲和层析法纯化该产物,并用Western blot和分子排阻层析鉴定纯化产物;采用免疫荧光法、放射免疫分析法鉴定纯化产物与靶细胞的结合活性。DNA序列测定结果表明：抗CD3/抗Pgp微型双功能抗体已构建成功,表达可溶性产物的产量达2mg/L以上,纯化产物中二聚体的比例达90%,具有与Jurkat（CD3⁺）和K562/A02细胞（Pgp⁺）结合的活性,与抗CD3 ScFv及抗Pgp ScFv的亲合常数相当。成功地构建了抗CD3/抗Pgp微型双功能抗体,并获得高效表达,表达产物具有与相应二个靶抗原结合的活性。     

恶性淋巴瘤组织切片中结核菌L型的检出及其意义

本文应用Ｉｎｔｅｎｓｉｆｉｅｄｋｉｎｙｏｕｎ（ＩＫ）改良抗酸染色和结核菌抗休免疫组织化学染色检测了５１例恶性淋巴瘤组织功片内结核菌及其Ｌ型感染率。结果发现５１例恶性淋巴瘤组织功片中,ＩＫ染色阳性２５例（４９％）,免疫组化染色阳性２６例（５０．９％）,并发现结核菌Ｌ型感染与恶性淋巴瘤的疗效有关（Ｐ＜０．０１）。故认为恶性淋巴瘤中,结核菌Ｌ型感染是一个值得进一步研究的课题。     

HBV-DNA与乙型肝炎血清标志物的相关性分析

目的：探讨乙型肝炎病毒（HBV）DNA载量与其血清标志物的相关性。方法：运用荧光定量聚合酶链反应（FQ-PCR）、酶联免疫吸附实验（ELISA）分别检测503例患者HBV．DNA载量和HBV血清标志物。根据HBV血清标志物结果分为大三阳组、小三阳组、少见模式组、抗体阳性及全阴组,比较各组间HBV—DNA的阳性率及定量值。结果：在大三阳组、小三阳组、少见模式组、抗体阳性及全阴组HBV—DNA的阳性率分别为90％、65．1％、65．2％、2．0％,HBV—DNA的定量结果（10gHBV—DNA）别为6．32±1．96、2．01±1．68、3．48＋2．52f抗体阳性及全阴组阳性例数过低,不纳入统计）。大三阳组HBV—DNA的阳性率显著高于小三阳组（P〈0．05）。大三阳组、小三阳组HBV—DNA的阳性率与少见模式组比较,差异均无统计学意义（P〉0．05）,但大三阳组、小三阳组、少见模式组HBV．DNA的阳性率均显著高于抗体阳性及全阴组（P〈0．01）。HBsAg、HBeAg阳性组HBV—DNA的阳性率分别显著高于HB—sAg、HBeAg阴性组（P〈0．01）。小三阳组、少见模式组HBV．DNA载量均显著低于大三阳组（P〈0．01）,少见模式组HBV—DNA载量显著高于小三阳组（P〈0．05）。结论：HBV—DNA的阳性率与HBeAg、HBsAg相关;HBV—DNA栽量与HBV血清标志物模式相关。     

基于MegaBACE 1000的荧光(marker)开发

MegaBACETM 1000 DNA测序仪是由美国Pharmacia公司生产的一种高通量的DNA测序仪,利用这套测序仪,可以进行DNA测序、遗传分析等相关研究。但该公司生产的用于遗传分析的DNA标记物（marker）（ET550-R Size Standards）价格不菲,出于节省成本的考虑,自行开发了荧光标记物,经过验证,这个标记完全可以在MegaBACE 1000 DNA测序仪上使用。利用这套标记物和自己开发的标记物识别软件,构建了一套基于MegaBACE 1000 DNA测序仪的改良的、高通量的AFLP操作流程。