树鼠mtDNA限制性内切酶图谱及其与小家鼠褐家鼠的新缘关系

本实验用Ａｐａ Ｉ,ＡＶａ Ｉ,Ｂａｍ ＨＩ＜ＢｃｌＩ,Ｃｌａ Ｉ,Ｅｃｏ ＲＩＥｃｏ ＲＶ,Ｈｐａ Ｉ,Ｐｓｔ Ｉ,Ｐｖｕ Ⅱ,ＳｃａＩ,ＸｂａＩ等１３种限制性内切酶分析树鼠的ｍｔＤＮＡ限制性片段长度多态性,并用双酶解法构建了其中８种酶的限制性内切酶图谱。根据限制性片段差异法和分子钟,计算并讨论树鼠和小家鼠、褐家鼠的ｍｔＤＮＡ遗传距离和亲缘关系。结果表明树鼠与褐家鼠的关系较接近,两者的分歧时间在     

玉米黑粉菌mtDNA的研究 Ⅱ.限制性内切酶酶切图谱

本文报道玉米黑粉菌mtDNA的限制性内切酶酶切图谱。分别将mtDNA的Bam HI各片段制成探针,与mtDNA分别用8种酶酶切后的Southern膜进行杂交,用片段重叠法得出各套片段的排列次序,再将克隆化的Bam HI片段进行第二酶切,按分子量拼排出各酶酶切位点在mtDNA上分布的图谱。此外,片段重叠分析时,还发现玉米黑粉菌mtDNA为环状结构;杂交分析时还发现mtDNA内没有明显的重复序列。DNA总长60.7kb。     

树qumtDNA限制性内切酶图谱及其与小家鼠褐家鼠的新缘关系

本实验用ApaⅠ,AvaⅠ,BamHⅠ,BclⅠ,BglⅠ,ClaⅠ,EcoRⅠ,EcoRⅤ,HpaⅠ,PstⅠ,PvuⅡ,ScaⅠ,XbaⅠ等13种限制性内切酶分析树qu(Chiromyscus chiropus) 的mtDNA限制性片段长度多态性,并用双酶解法构建了其中8种酶的限制性内切酶图谱。根据限制性片段差异法和分子钟,计算并讨论树qu和小家鼠(Mus musculus)、褐家鼠(Rattus norvegicus)的mtDNA遗传距离和亲缘关系。结果表明树qu与褐家鼠的关系较接近,两者的分歧时间在距今1500-2000万年前,即处于中新世早中期。     

胡子鲇mtDNA多态性及限制性酶切图谱

用８种限制性内切酶对胡子鲇（ＣｌａｒｉａｓｆｕｓｃｕｓＬａｃｅｐｅｄｅ）肝脏线粒体ＤＮＡ（ＭｉｔｏｃｈｏｎｄｒｉａｌＤＮＡ,ｍｔＤＮＡ）进行了分析。ＸｈｏⅠ、ＥｃｏＲⅠ、ＰｓｔⅠ、ＢａｍＨⅠ、ＸｂａⅠ、ＨｉｎｄⅢ在ｍｔＤＮＡ分子上分别有２、３、１、１、３和５个切点。胡子鲇种内存在ｍｔＤＮＡ酶切片段长度多态性（Ｒｅｓｔｒｉｃｔｉｏｎｆｒａｇｍｅｎｔｌｅｎｇｔｈｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍｓ,ＲＦＬＰ）。经ＢｇｌⅠ、ＢｇｌⅡ酶解,ｍｔＤＮＡ都出现两种酶切类型,Ⅰ型各具２个片段,Ⅱ型各具１个片段。ｍｔＤＮＡ分子量为１０．２４２×１０６ｕ,长度约为１６．６８ｋｂ。用双酶解法建立了胡子鲇ｍｔＤＮＡ的限制性酶切图谱,并对ＲＦＬＰ现象进行了分析。     

大鳞副泥鳅线粒体DNA九种限制性内切酶酶切图谱

大鳞副泥鳅ｍｔＤＮＡ经１１种限制性内切酶（ＢａｍＨＩ,ＢｇｌＩ,ＢｇｌⅡ,ＥｃｏＲＩ,ＨｐａＩ,ＫｐｎＩ,ＰｓｔＩ,ＳａｃＩ,ＳａｌＩ,ＸｂａＩ和ＸｈｏＩ）单酶完全酶解获得２３个酶切位点,这些酶酶切位点数依次分别是：２、７、０、３、３、０、３、１、１、２和１。通过琼脂糖凝胶电泳测定大鳞副泥鳅ｍｔＤＮＡ平均分子量为１０．３３±０．２２×１０６ｕ（原子质量）;其分子长约１６７２０±３５０碱基对（ｂｐ）。采用双酶完全酶解法构建了大鳞副泥鳅ｍｔＤＮＡ限制性内切酶酶切图谱。     

鸭类mtDNA限制性酶切图谱的比较研究

本文报道了番鸭、建昌鸭、杂交鸭(♀建昌鸭×(?)番鸭)和北京鸭的mtDNA限制性酶切图谱。限制性内切酶HindⅢ、PsiⅠ、BamHⅠ和EcoRⅠ在番鸭mtDNA上分别有(?)、2、2和1个酶切位点。建昌鸭、杂交鸭和北京鸭的mtDNA限制性酶切图谱完全一致。以上4种内切酶在这3种鸭子mtDNA上分别有5、4、2和1个位点。比较研究4种限制性图谱,我们得到三点结论:(1)鸭类mtDN种间差异程度很高;(2)家鸭很可能不存在mtDNA种内异质现象;(3)鸭类mtDNA为母性遗传。     

三种鱼mtDNA的限制性内切酶分析

鱼类线粒体DNA(mtDNA)的限制性酶切图谱分析,对于探讨鱼类的起源和演化等方面均有十分重要的意义。但是目前有关鱼类mtDNA酶切图谱的研究较少,这主要是受方法学的限制。为此我们改良了一种鱼类mtDNA的提取法,对鲤科的草鱼(Ctenopharyngodon idellus)、鲢鱼(Hypophthalmichthys molitrix)和鳙鱼(Aristi-chthys nobilis)的mtDNA进行了限制性内切酶酶切分析。     

蓖麻蚕核糖体核糖核酸基因的限制性内切酶酶切图谱

用Southern转移和分子杂交法研究了蓖麻蚕(Attacus ricini)核糖体核糖核酸(rRNA)的基因(rDNA)的限制性内切酶酶切图谱。发现该rDNA是由分子量大约为7.0×10~6道尔顿的重复单位所组成。PstⅠ可以切出完整的重复单位。EcoRI、BamHI和BgⅢ在重复单位内部都有切口。这与家蚕(Bombyx mori)的rDNA是不同的。     

团头鲂线粒体DNA的限制性内切酶图谱

用ＢａｍＨⅠ,ＢｇｌⅠ,ＢｇｌⅡ,ＥｃｏＲⅠ,ＨｐａⅠ,ＫｐｎⅠ,ＰｓｔⅠ,ＳａｃⅠＳａｌⅠ,ＸｂａⅠ,和ＸｈｏⅠ１１种限制性内切酶对团头鲂（ＭｅｇａｌｏｂｒａｍａａｍｂｌｙｃｅｐｈａｌａＹｉｈ）的线粒体ＤＮＡ（ｍｔＤＮＡ）进行了单酶切,其切点数依次为２,３,２,３,３,１、０,１,０,０和０;经琼脂糖凝胶电泳测算出各酶切片断大小,得出团头鲂ｍｔＤＮＡ分子长约１６０２０±３５６碱基对（ｂｐ）,分子量６．３７×１０１８ｕ（原子质量）,构建了团头鲂ｍｔＤＮＡ的限制酶图。     

鸭瘟病毒核酸限制性内切酶图谱

鸭瘟病毒(DPV)是一种禽疱疹病毒,引起鸭急性致死性传染病。本病毒自1923年报道后,半个多世纪以来,对其生物学特性等虽有某些研究,但有关分子病毒学研究则国内外尚无报道。本研究通过对DPV DNA的限制性内切酶图谱的分析,为进一步开展DPV的分子病毒学研究提供基础资料,并对DPV的分类地位作些探讨。     

猪獾和黄鼬mtDNA物理图谱及位点变异性初探

本实验用ＡｐａⅠ,ＢｇｌⅠ,ＢｇｌⅡ,ＣｌａⅠ,ＥｃｏＲⅠ,ＥｃｏＲⅤ,ＨｉｎｄⅢ,ＨｐｅⅠ,ＰｓｔⅠ,ＰｖｕⅠⅡ,ＳａｃⅠ,ＳａｌⅠ等１２种限制性内切酶分析猪獾和黄鼬的ｍｔＤＮＡ限制性片段,并用双酶解法构建限制性内切酶图谱。结合以往积累的资料,我们对哺乳动物ｍｔＤＮＡ限制性位点在远缘物种间的保守性和变异性进行了初步讨论。     

用识别四个GC对的限制酶研究高等担子菌线粒体DNA

本文报道了用识别四个GC对的限制性内切酶HaeⅢ、CofI、MsPI酶切高等担子菌伞菌目（Agaricales）、非褶菌目（Aphyllophorales）12个菌株的总DNA,在琼脂糖凝胶上显现线粒体DNA带谱的结果。通过对带型、累加分子量、酶切片段数和同源性的分析表明,不同种类高等担子菌的线粒体DNA变化较大．研究还显示,以多种识别四个GC对的限制酶分析高等担子菌的线粒体DNA及其它们的RFLP,比只用HaeⅢ更灵敏有效。     

军曹鱼线粒体DNA全序列与鲹鱼宗系的系统进化

通过长距PCR法测得军曹鱼（Rachycentron canadum）全长16758 bp的mtDNA基因组全序列（GenBank登录号:FJ154956和NC₀11219）,结构组成与其他硬骨鱼类基本一致。Blast获取GenBank数据库的高相似度（score=10055—30213）全序列数据,运用最大简约法、邻位连接法、最大似然法和贝叶斯法重建了军曹鱼与其他鱼类的系统发育关系,并采样用松散分子钟（Uncorrected relaxed lognormal clock）对军曹鱼的起源时间进行了估算,结果表明:（1）军曹鱼与鲯鳅科的亲缘关系较参与分析的其他鱼类更为密切（后验概率为0.997）,推测军曹鱼大约起源于56百万年（Million years ago,Ma）前的古新世塔内特阶（Thanetian）时期;（2）军曹鱼科、鲯鳅科和印鱼科聚为一支,但其置信度较低（后验概率为0.593）,且丝帆鱼科、鲹科分别与鲭科和鲀科鱼类聚为不同分支,因此不支持鲹鱼宗系（Carangoid lineage）为单系群。     

EVOLUTIONARY ASSOCIATIONS OF BROOD PARASITIC FINCHES (VIDUA) AND THEIR HOST SPECIES: ANALYSES OF MITOCHONDRIAL DNA RESTRICTION SITES

The species-specific associations of the African brood parasitic finches Vidua with their estrildid finch host species may have originated by cospeciation with the host species or by later colonizations of new hosts. Predictions of these alternative models were tested in two species groups of brood parasites (indigobirds, paradise whydahs) and their hosts. Phylogenetic analyses suggested that the brood parasites and their hosts did not speciate in parallel. The parasitic indigobirds share mitochondrial haplotypes with each other, and species limits in both indigobirds and paradise whydahs do not correspond with their gene trees. Different parasite species within a region are more closely related to each other than any is to parasites that are associated with its same host species in other regions of Africa. There is little genetic difference between parasite species D?_i,j < 0.001 in the indigobirds, D?_i,j = 0.01 in the whydahs). Genetic distances D?_i,j between the parasite species are less than the genetic distances between their corresponding host species in all parasite-host comparisons, and average only 7.2% as large in the indigobirds as in their hosts and 42% as large in the paradise whydahs as in their hosts. A phylogenetic model that allows ancestral haplotype polymorphisms to be retained in descendant species was compared to a constraint model of species monophyly requiring all but the one ancestral haplotype to be independently derived within each species. The constraint model increases the length of the indigobird tree by 50% over that of the model of retained ancestral polymorphisms; the difference is statistically significant. Both phylogenetic and distance analyses indicate that the brood parasites have become associated with their host species through host switches and independent colonizations of the hosts, rather than through parallel cospeciation with them. The molecular genetic results are supported by recent discoveries of additional host species that are associated with the indigobirds in the field and by variation in the species-specific song behaviors of the brood parasites.     

大鼠肝和肝癌DNA及其限制性酶切图谱分析

大鼠肝和肝癌BERH-2 DNA的EcoR Ⅰ,BamH Ⅰ,HindⅢ和Pst Ⅰ,以及EcoR Ⅰ分别与BamH Ⅰ或HindⅢ或Pst Ⅰ组合双酶合切的电泳图谱间无明显差异;双向凝胶电泳重复顺序图谱也近似。在一定实验条件下,大鼠肝癌BERH-2 DNA在凝胶电泳上,除去显示EB荧光主带外,还有呈现阶梯大小的片段。最小片段为270bp,两电泳相邻片段间的长度差约为160bp,并且能与标记的核RNA起杂交反应。对实验结果进行了讨论。     

大熊猫线粒体DNA的九种限制酶图谱

本文用9种限制性内切酶（BamHⅠ,BglⅠ,BglⅡ,EcoRⅠ,EcoRⅤ,PstⅠ,PvuⅡ,SalⅠ,XhoⅠ）分析大熊猫的线粒体DNA（mtDNA）。构建其中5种酶（BamHⅠ,EcoRⅠ,EcoRⅤ,PstⅠ,PvuⅡ）的mtDNA物理图谱。大熊猫mtDNA的分子大小约为16.4 Kb,酶切位点是随机分布。我们的结果为进一步研究大熊猫mtDNA进化提供了基础资料。     

黑叶猴和灰叶猴的线粒体DNA限制性片段长度多态研究

本文以15种限制性内切酶分析黑叶猴和灰叶猴种内及种间mtDNA多态。从各个样品中分别检出了41—50个酶切位点。综合15种限制内酶的酶切类型,在2只黑叶猴和2只灰叶猴中分别检出了两种限制性类型,并与其4个地理来源相对应。结合恒河猴和红面猴的资料,构建了4种猴科动物的分子系统树。结果表明,黑叶猴和灰叶猴种内的分歧分别始于30和35万年以前,两种叶猴的分离始于190万年以前,猴亚科和疣猴亚科的分离应早于1100万年。叶猴属在中国的扩散不是很晚才发生的。     

银鲴自然群体线粒体DNA的遗传分化

运用２１种限制性内切酶对银鲴自然群体进行了ｍｔＤＮＡ的限制性片断长度多态性（ＲＦＬＰ）分析。发现银鲴自然群体存在丰富的ｍｔＤＮＡ多态性,从４个群体３９个个体中,共检测到１２种单倍型,对这一现象的成成因进行了探讨。依据单倍型和群体的系统发育关系,结合地理分布的资料,对其现今分布区相互间的历史联系及其对银鲴起源和分化的影响进行了分析。     

沙鳅亚科鱼类线粒体DNA控制区结构分析及系统发育关系的研究

对沙鳅亚科鱼类3属14个代表种的线粒体DNA控制区序列的结构进行了分析。通过与鲤形目鱼类的控制区序列进行比较,将沙鳅亚科鱼类的控制区分为终止序列区、中央保守区和保守序列区三个区域。同时识别了沙鳅亚科中一系列保守序列,并给出了它们的一般形式。以胭脂鱼为外类群,对比条鳅亚科、花鳅亚科、以及平鳍鳅科的代表性种类,采用NJ、MP和ML法构建沙鳅亚科的分子系统树。分子系统发育分析表明,沙鳅亚科为一单系,包括3个属:沙鳅属、副沙鳅属和薄鳅属,各属均构成单系。根据分子系统学、形态学的结果及地理分布推断,沙鳅亚科中沙鳅属可能为最为原始的属,副沙鳅属其次,而薄鳅属最特化。