汉江中下游春季浮游植物群落结构特征及其影响因素

针对汉江中下游春季硅藻水华频繁暴发的现状,研究了水华暴发不同时期浮游植物群落结构特征,并结合水体理化因子分析,揭示硅藻水华发生的主要影响因子。结果表明:汉江春季水华暴发期间,共鉴定出浮游植物7门48属64种(含变种),其中硅藻种类所占比例最大(18属23种),不同样点所占比例介于44.13%~51.29%,其次是绿藻类(16属22种),不同样点所占比例介于28.21%~35.14%,蓝藻门和隐藻门种类数在水华期间较少,各样点仅发现2~3种,金藻门和甲藻门种类最少;水华发生期间主要优势种为硅藻门的小环藻,水华暴发初期和中期往往形成单优种,而水华末期随着其优势度的降低,蓝藻门、隐藻门和硅藻门其他种类也会形成优势种;水华暴发期间浮游植物密度最高可达2.34×107cells·L-1,其中小环藻种群数量最高可达2.06×107cells·L-1,占浮游植物群落总数的88%;浮游植物多样性指数中,Margalef物种丰富度指数无显著时空差异,Shannon多样性在水华中期较低,而水华初期和末期相对较高,Berger-Parker指数变化与Simpson指数相反;浮游植物与理化因子的冗余分析(RDA)发现,浮游植物总数量与磷酸盐、溶解氧、总磷呈正相关,与硝酸盐、温度、透明度呈负相关。     

球形棕囊藻囊体形成中光照、营养盐和共存硅藻的影响

在不同光照和营养盐结构条件下半连续培养球形棕囊藻和3种硅藻,研究光照、营养盐限制和硅藻竞争对球形棕囊藻囊体形成的影响。结果表明:高光照显著促进了藻类的生长,球形棕囊藻在低光环境下几乎不形成囊体。球形棕囊藻和3种硅藻对光限制和P限制更加敏感,而在N限制环境中均具有相对较高的生物量。粒径较小的球形棕囊藻游离单细胞和中肋骨条藻在营养盐和光限制条件下比粒径较大的细胞具有更强的竞争能力。硝酸盐是球形棕囊藻囊体形成的营养基础,但是营养盐结构并未改变棕囊藻囊体形态。具有两种生活史状态有利于球形棕囊藻度过资源限制的环境,从而有利于球形棕囊藻在硅藻藻华之后再次形成藻华。     

18SrDNA序列分析鉴定棕囊藻香港株P2为球形棕囊藻

有毒赤潮原因种棕囊藻(Phaeocystis sp.)生活史复杂,且形体微小,缺乏明确可靠的分类标准。1997、1999年中国东南沿海发生两次棕囊藻赤潮,但目前种的鉴定仍存在混乱。本文测定了香港海域一株棕囊藻赤潮原因种P₂的18SrDNA部分核苷酸序列,序列长度为650bp,并对其进行了分子鉴定,结果表明其为球形棕囊藻(P.globosa)。     

围隔藻类水华演替过程中二甲基硫化物的含量动态

于2005年6月至7月,研究了海洋围隔不同藻类水华演替过程中二甲基硫化物的含量动态,并考察了相关环境参数对二甲基硫化物含量的影响。2个围隔实验组均出现未知藻水华-硅藻水华-甲藻水华的演替过程,这3次不同藻类水华分别对应了二甲基硫化物含量的3次高峰,表明藻类水华对二甲基硫化物含量有重要贡献。不同藻类水华的贡献有较大差异,甲藻水华的贡献最大,硅藻次之,未知藻类水华的贡献最小。实验结果还表明PO4^3-、NO2^-和NH4^＋主要通过影响藻类生长状态,进而影响DMSP和DMSO的含量;NO2^-和NH4^＋亦可能通过调节DMSP和DMSO在藻细胞内的生理功能,影响DMSP和DMSO的含量;PO4^3-、NO2^-和NH4^＋与DMS含量无显著相关。     

摄食信息对球形棕囊藻和布氏双尾藻竞争结果的影响

浮游动物的摄食信息能增大棕囊藻囊体体积,囊体形成被认为是棕囊藻的诱导性防御机制。利用桡足类火腿伪镖水蚤和异养甲藻海洋尖尾藻释放的摄食信息,研究了诱导性防御对球形棕囊藻和布氏双尾藻的竞争的影响。结果表明,球形棕囊藻接收了火腿伪镖水蚤和海洋尖尾藻释放的摄食信息之后形成更大的囊体。防御启动后的球形棕囊藻比未接收摄食信息的球形棕囊藻更快地形成囊体,且囊体维持的时间更长。对照组和火腿伪镖水蚤摄食信息诱导的球形棕囊藻的生物体积比布氏双尾藻更高,且球形棕囊藻在竞争中占优势;而海洋尖尾藻摄食信息诱导的球形棕囊藻生物体积低于布氏双尾藻,且球形棕囊藻相对布氏双尾藻的竞争力下降。微型浮游动物海洋尖尾藻摄食信息导致球形棕囊藻相对硅藻布氏双尾藻的竞争力的下降,有利于解释硅藻先于棕囊藻发生藻华。     

棕囊藻北部湾株的18S rDNA分子鉴定

为研究北部湾棕囊藻(Phaeocystis)藻华的成因,采用PCR克隆了棕囊藻北部湾株核糖体18S r DNA序列。结果表明,棕囊藻北部湾株具有游动单细胞与群体结构两种形态;其18S r DNA序列和NCBI基因库中球形棕囊藻(Phaeocystis globosa)的同源性为99%~100%,在系统进化树上与不同海域来源的球形棕囊藻聚在一大分支上,且与球形棕囊藻间的遗传距离均小于其他种。首次从分子生物学上确定棕囊藻北部湾株为球形棕囊藻。     

硅藻中国新记录种——比提基金长篦藻

该研究利用光学和扫描电子显微镜对采自湖南东洞庭湖国家级自然保护区的硅藻标本进行了观察,鉴定出其中一种硅藻为比提基金长篦藻(Neidium beatyi Hamilton et al.).结果 表明,该长篦藻具有以下鉴定特征:(1)线性椭圆至线性披针形的壳瓣外形.(2)壳面两侧具有3～5条纵向线.(3)向相反方向弯曲的两...     

绿色巴夫藻和四列藻种间竞争机制研究

种间竞争是生物普遍存在的一种生命现象 ,可以利用来调控生物的生长和数量变化 ,进行有害生物的防治。藻类植物间也存在明显的竞争现象。Ｈｏｌｍ[8] 报道了硅藻和微囊藻种间的相互作用。Ｈｅｇａｒｔｙ[9] 研究了光强和Ｎ、Ｐ比对棕囊藻和 5种硅藻间竞争的影响。Ｋｕｗａｔａ[10 ] 研究了铵盐对绿藻和蓝藻间竞争作用的影响。Ｄａｖｉｓ[11] 研究了海藻和海草间的竞争。Ｐｉａｚｚｉ[12 ] 研究了两种海洋绿藻生长的竞争情况。刘世枚[1] 研究了两种绿藻种群间的相互作用。陈德辉等[2 ] 对微囊藻和栅藻共培养进行了研究并计算了竞争参数。。绿…     

蓝藻水华——湖面上的“绿油漆”

<正>在我国,许多水体已经或曾经出现过不同程度的水华,如太湖、巢湖、滇池及高州水库等的蓝藻水华,汉江、嘉陵江出口段等河流的硅藻水华,三峡库区部分库湾与支流、云南漫湾水库等的甲藻水华,池塘养殖中常见的隐藻水华,以及河南延津县养殖池塘中的绿藻水华、裸藻水华等,2008年奥运会前的青岛(海洋)浒苔事件则是由绿藻(石莼科)引起的。     

在不同蓄水位下三峡库区春季水华特征及趋势分析

基于2004—2015年三峡库区支流春季水华的监测数据,开展了三峡库区不同蓄水位下春季水华特征及趋势分析。结果表明:总共有26条支流发生春季水华,香溪河为水华发生概率最高的支流。水华藻类优势种主要是硅藻和甲藻,甲藻水华出现的概率随着蓄水位的增加而增加,但是在持续几年175 m蓄水之后,甲藻水华出现的频率下降,硅藻水华出现的频率增加。在175 m蓄水之前,水华发生期藻类密度、叶绿素a含量及水体营养盐水平相对较低,此后都有了较高的提升,但是在持续几年175 m蓄水之后,藻类密度、叶绿素a浓度以及营养盐浓度都有下降趋势。对藻密度及叶绿素a含量与主要环境因子进行主成分分析(Principal components analysis)发现,藻密度和叶绿素a与总磷、总氮、高锰酸盐指数聚类一簇,藻密度、叶绿素a浓度与总磷、溶解氧、高锰酸盐指数显著正相关。在蓄水之后,三峡库区支流营养水平有所增加,随着蓄水位的增加,三峡库区支流断面的平均流速降低,在合适的温度下,三峡库区支流水华易发生。     

一株降解N-酰基高丝氨酸内酯酵母菌菌株的分离鉴定及其降解特性

利用N酰基高丝氨酸内酯(N-acyl-homoserine lactone,简称AHL)为唯一碳源和能源,筛选得到一株能够降解AHL的菌株R1。常规鉴定和18S rDNA序列分析表明,菌株R1属于红冬孢酵母菌(Rhodosporidium toruloides),定名为R.toruloidesR1。结果显示R.toruloidesR1能利用所测试的3种AHL作为唯一碳源和能源生长,具有降解AHL的能力,其对AHL依赖型胡萝卜欧文氏软腐病菌(Erwinia carotovora subsp.carotovora)的致病有一定的抑制作用。     

1株海洋真菌ZH2.1的鉴定及生物学特性初步研究

从南海海域白姑鱼消化道分离到1株海洋真菌ZH2.1,对其进行了系统鉴定和生物学研究。采用传统的形态学鉴定方法,并结合18S rDNA序列分析确定其归属。18S rDNA序列分析表明其与孔状短小茎点霉Phoma exigua var.exigua在进化位置上最为接近,其18S rDNA在GenBank的登录号为FJ450059。结合形态学观察结果,可认为菌株ZH2.1为茎点霉属真菌。对该菌株的部分生物学特性研究表明,ZH2.1为兼性海洋真菌,最适生长盐度为3%。此外,在微氧条件下也可生长。     

棉铃虫18S核糖体RNA基因的序列分析及其分子系统学

克隆并分析了鳞翅目棉铃虫Helicoverpa armigera (Hübner)18S核糖体RNA基因(18S rDNA)的全序列,将该序列与鞘翅目、膜翅目、同翅目、双翅目、捻翅目和弹尾目各一种昆虫的同源保守区进行了比较。序列分析结果显示：鳞翅目和双翅目昆虫在18S rDNA结构上彼此较为相似,捻翅目昆虫的18S rDNA分子结构表现出与其它目昆虫有较大的差异,但相对与弹尾目昆虫的18S rDNA较为接近。该结果支持了有关捻翅目属于一个独立的目级分类阶元的论点。     

甘草内生真菌的分离及鉴定

植物体内普遍存在着内生菌,为了探寻传统药材甘草的质量与其内生菌之间可能存在的关系。对采自新疆的甘草根部进行了内生真菌的分离及鉴定。选用CYM真菌培养基,对其内生真菌进行分离及纯化,选择其中最占优势的两种菌落分别进行了菌落形态观察及菌丝形态(棉兰染色)观察,以及基因组DNA的18S rDNA和ITS rDNA序列鉴定和系统进化分析。本研究结果表明从甘草根部主要分离到两种内生真菌,分别属于Fusarium镰刀菌属和Gibberella赤霉菌属。     

产紫杉醇内生真菌EFY-21的鉴定与生物学特性研究

利用PCR技术克隆了产紫杉醇内生真菌EFY-21的18S rDNA序列,通过同源性分析,初步确定该菌与拟盘多毛孢属(Pestalotiopsis)有较高的同源性,相似性为99%。为了进一步了解EFY-21的有关生物学特性,分别选用PDA、PSA、查氏、玉米粉琼胶、牛肉膏蛋白胨5种培养基,按照常规方法培养,用十字法测量菌落直径;同时选用查氏培养基为基本培养基,分别观察不同碳源葡萄糖、甘露醇、麦芽糖、果糖、可溶性淀粉,不同氮源KNO3、Ca(N03)2、(NH4)2SO4、NH4N03、(NH4)2HPO4、蛋白胨、尿素,不同培养温度10,15,20,25,28,30,37℃,不同pH值4,5,6,7,8,9对内生真菌菌丝的影响。试验结果表明:EFY-21在PDA培养基上生长最快,生长状况最好;供试的碳氮源中,对EFY-21菌丝生长影响的大小顺序为葡萄糖甘露醇果糖麦芽糖可溶性淀粉;蛋白胨KNO3Ca(N03)2NH4N03(NH4)2HPO4(NH4)2SO4尿素;最适培养温度为25～30℃;最适pH为5～7。     

18-26S rDNA在4种重楼属植物中的定位

为探讨rDNA在重楼属Paris L.中的分布规律,利用荧光原位杂交（FISH）对4种重楼属植物 的18-26S rDNA进行了定位。所有植物均为二倍体,基因组由A、B、C、D和 E5条染色体构成。（1）滇重楼P.polyphylla var.yunnanensis:2n=10=6m+4t,C和D染色体的 短臂上各有1个18-26S rDNA位点;（2）长柱重楼P.forrestii:2n=10=6m+4t,B染色体的长臂 、C和D染色体的短臂上各有1个位点;（3）五指莲P.axialis:2n=10=6m（2sat）+4t（2sat） +1-2B,C和D染色体的短臂上各有1个位点;在有1个B染色体的细胞中,B染色体没有信号点, 而有2个B染色体的细胞中,只有1个B染色体上有信号点,表明B染色体上有基因存在且其分裂 不均等;（4）大理重楼P.daliensis:2n=10=4m+2sm+2st+2t,C染色体的短臂上有1个位点。1 8-26S rDNA位点不仅出现在染色体的次缢痕上,也出现在非次缢痕位点。另外,4个种中C染 色体短臂末端均有18-26S rDNA。     

土地利用变化对土壤真菌群落结构的影响

应用PCR-RFLP和测序分析对川西亚高山米亚罗林区不同土地利用类型的土壤真菌18S rDNA基因进行了多样性和系统发育研究,探讨了土地利用变化对土壤真菌群落结构的影响。在20a龄云杉(Picea likiandensis var balfourianan)人工林和菜地两种类型土壤中,共得到238个阳性克隆,限制性内切酶MspI和RsaI进行RFLP分析后得到56个不同的分类操作单元(OTUs),其中20a龄云杉人工林样地获得137个阳性克隆和37个OTUs,而菜地样地获得101个阳性克隆和19个OTUs。在两类样地中具有不同的优势种群,其中20a龄云杉人工林样地有1个明显优势种群,占总克隆数的20.4%;菜地样地有2个明显优势种群,分别占总克隆数的25.7%和21.8%。对14个克隆进行了序列测定,序列的相似性在86%~99%之间,与GenBank数据库中的序列进行比对,与已知序列的相似性在92%~100%之间。系统发育分析表明,所有的18SrDNA基因被分为3个主要的簇,其中20a龄云杉人工林样地的克隆都聚集在第一和第三簇中,而菜地样地的克隆都聚集在第二簇中。结果说明,两类土壤中具有较为丰富的真菌多样性,而土地利用变化引起了土壤真菌群落结构的明显变化。     

Reconstruction of the Doradinae (Siluriformes-Doradidae) ancestral diploid number and NOR pattern reveals new insights about the karyotypic diversification of the Neotropical thorny catfishes

Doradinae (Siluriformes: Doradidae) is the most species-rich subfamily among thorny catfishes, encompassing over 77 valid species, found mainly in Amazon and Platina hydrographic basins. Here, we analyzed seven Doradinae species using combined methods (e.g., cytogenetic tools and Mesquite ancestral reconstruction software) in order to scrutinize the processes that mediated the karyotype diversification in this subfamily. Our ancestral reconstruction recovered that 2n=58 chromosomes and simple nucleolar organizer regions (NOR) are ancestral features only for Wertheimerinae and the most clades of Doradinae. Some exceptions were found in Trachydoras paraguayensis (2n=56), Trachydoras steindachneri (2n=60), Ossancora punctata (2n=66) and Platydoras hancockii whose karyotypes showed a multiple NOR system. The large thorny catfishes, such as Pterodoras granulosus, Oxydoras niger and Centrodoras brachiatus share several karyotype features, with subtle variations only regarding their heterochromatin distribution. On the other hand, a remarkable karyotypic variability has been reported in the fimbriate barbells thorny catfishes. These two contrasting karyoevolution trajectories emerged from a complex interaction between chromosome rearrangements (e.g., inversions and Robertsonian translocations) and mechanisms of heterochromatin dispersion. Moreover, we believe that biological features, such as microhabitats preferences, populational size, low vagility and migratory behavior played a key role during the origin and maintenance of chromosome diversity in Doradinae subfamily.     

Sex chromosome system ZZ/ZW in Apareiodon hasemani Eigenmann, 1916 (Characiformes,Parodontidae) and a derived chromosomal region

Parodontidae fish show few morphological characteristics for the identification of their representatives and chromosomal analyses have provided reliable features for determining the interrelationships in this family. In this study, the chromosomes of Apareiodon hasemani from the São Francisco River basin, Brazil, were analyzed and showed a karyotype with 2n = 54 meta/submetacentric chromosomes, and a ZZ/ZW sex chromosome system. The study revealed active NORs located on pair 11 and additional 18S rDNA sites on pairs 7 and 22. The 5S rDNA locus was found in pair 14. It showed a pericentric inversion regarding the ancestral condition. The satellite DNA pPh2004 was absent in the chromosomes of A. hasemani, a shared condition with most members of Apareiodon. The WAp probe was able to detect the amplification region of the W chromosome, corroborating the common origin of the system within Parodontidae. These chromosomal data corroborate an origin for the ZW system of Parodontidae and aid in the understanding of the differentiation of sex chromosome systems in Neotropical fishes.     

Isolation and identification of herbivorous ciliates from contaminated microalgal cultures

Ciliates are a common but understudied group of grazers that can invade microalgal cultures. To estimate the potential impact of ciliates on microalgal culture productivity, the identification of species that can invade these cultures is essential. Furthermore, isolation of these herbivorous ciliates allows to use them in experiments that investigate the impact of ciliate grazing on the productivity of microalgal cultures. The main aims of this study were to isolate and identify ciliates that invade cultures of the freshwater microalgae Chlorella and Chlamydomonas, and to establish a live collection of these ciliates for usage in future experiments. To this end, we optimized a method for isolating ciliates from contaminated microalgal cultures and we developed a new PCR primer set for amplifying the partial 18S rDNA of ciliates belonging to the classes Spirotrichea, Oligohymenophorea and Colpodea. As a result, we isolated 11 ciliates from microalgal enrichment cultures inoculated with non-sterile dust and various freshwater sources. Of these 11 species, 7 were found to be feeding on Chlamydomonas. Ciliate species that fed on Chlorella could not be isolated in this study. Ciliate species feeding on Chlamydomonas were identified based on a combination of morphological observations and molecular analyses of partial 18S rDNA sequences.