Tat翻译后修饰调控HIV-1的转录

HIV-1病毒感染机体靶细胞后,可通过一系列调控蛋白和辅助蛋白来改变宿主环境,以逃避免疫反应和促进病毒复制。调控蛋白Tat在病毒初始转录阶段与多种转录辅助因子相互作用,控制HIV-1基因组转录和潜伏期病毒的激活等,被称为HIV-1的反式转录激活因子。翻译后修饰是一种可逆过程,在Tat与不同转录辅助蛋白之间扮演了至关重要的角色。磷酸化可以促进Tat与TAR RNA结合,乙酰化能够巩固Tat/P-TEFb/TAR RNA复合体的形成,或增加染色质修饰和重塑,增强HIV-1基因组转录起始。Tat发生泛素化修饰可导致其表达下降并阻断转录,也可表现为其水平的稳定。Tat甲基化后对转录的影响不同,甚至完全相反。因此,这可能成为逆转录病毒复制和传播的潜在靶点。本文就Tat在HIV-1基因组转录和复制中涉及蛋白质磷酸化、乙酰化、泛素化和甲基化修饰方面的研究进展进行总结,以促进人们对Tat翻译后修饰与HIV-1转录机制的理解,并为抗HIV转录的新型药物发掘奠定理论基础。     

基因表达的转录调控的研究进展

基因表达的转录调控的研究进展刘志毅,崔勤,刘耕陶（中国协和医科大学,中国医学科学院药物研究所北京１０００５０）基因表达调控是分子生物学研究的前沿和核心领域。基因表达可在不同水平上进行调控。其中,转录水平的调控是表达调控的关键环节,也是当前研究的重点。...     

HIV-1潜伏感染体外实验模型研究进展

潜伏感染的静息记忆CD4+T细胞是清除HIV-1病毒的一个重要障碍。处于潜伏状态的病毒多以原病毒c DNA的形式整合至宿主基因组中,但是病毒基因表达处于沉默状态,因此潜伏感染的细胞难以受到病毒的致细胞病变效应或机体特异性细胞毒性T细胞的杀伤,也不易受到抗反转录病毒治疗药物的作用。如何减少潜伏感染的细胞储存库是艾滋病治疗中亟需解决的一个问题。体内及体外HIV-1潜伏感染模型有助于深入了解HIV-1潜伏感染的建立、维持或打破机制,评价潜伏感染再激活剂的活性。在此侧重于介绍采用永生化细胞系、原代静息CD4~+T细胞或活化的CD4+T细胞建立的HIV-1潜伏感染体外实验模型。     

真菌次级代谢转录调控研究进展

真菌次级代谢产物具有多样复杂的结构和良好的生物活性,广泛应用于工业、农业、医疗等领域。次级代谢产物的产生受多个层级的调控,尤其是转录水平的调控至关重要。文中首先介绍了在真菌转录调控过程中参与次级代谢的代表性转录因子和蛋白质复合体,进而举例说明了转录调控在挖掘真菌新颖次级代谢产物领域的重要作用;期望相关研究者全面认识真菌次级代谢产物的生物合成及转录调控,为发现新的具有良好生物活性的天然产物提供思路。     

人单核细胞系中HIV-1前病毒转录调节新型研究模型的建立

【目的】抗反转录病毒疗法(ART)能够有效控制人免疫缺陷病毒(Human immunodeficiency virus-1,HIV-1)的复制,但是不能将其完全清除。至2012年底,全球仍有3 500万HIV-1感染者,同年约160万人死于艾滋病(Acquired immune deficiency syndrome,AIDS)及其相关疾病。HIV-1感染难以根治的主要原因之一是机体内HIV-1潜伏储存库(Reservoir)的存在。HIV-1潜伏储存库主要由CD4+T细胞和单核巨噬细胞构成,与CD4+T细胞相比,目前研究者对单核巨噬系细胞中HIV-1病毒复制机制尚不明了,且缺乏适宜的研究体系。因此,为探讨单核细胞活化或分化信号对HIV-1复制的影响,我们建立了旨在研究HIV-1前病毒转录调控机制的人单核巨噬细胞系模型。【方法】构建env区域移码突变和nef区域携带EGFP或Nano Luc报告基因的HIV-1 NLn GFP-Kp或NLn Nano Luc-Kp重组病毒,分别感染2种人单核细胞系THP-1或U937细胞。通过有限稀释法制备单克隆细胞系,利用流式细胞术或Nano Luc荧光素酶活性分析检测报告基因的表达。筛选EGFP或Nano Luc阴性表达的细胞克隆,经激活剂佛波酯(Phorbol-12-myristate-13-acetate,PMA)刺激后鉴定潜伏感染的细胞克隆。【结果】研究中鉴定了4个HIV-1潜伏感染的细胞克隆。其中2个是表达EGFP的THP-1克隆,2个是以Nano Luc为报告基因的U937克隆。这些克隆在PMA刺激处理后皆有报告基因的表达,而在恒态条件下未检测到报告基因的表达。【结论】成功建立了4个HIV-1潜伏感染的人单核细胞系克隆,该模型有助于理解单核巨噬系细胞的HIV-1病毒复制机制,可能成为进一步研究HIV-1前病毒转录调控机制的有力工具。     

精子发生转录调控机制的研究进展

精子发生过程中的转录调控是由一系列基因表达和调控事件组成的复杂过程,影响精子的形成、质量和功能。转录调控过程介导与精子形成密切相关的基因,包括精子特异性基因、组蛋白基因和其他转录因子的基因表达。这些基因的表达和沉默受到转录因子、表观遗传修饰和非编码RNA等多种机制的调控。此外,转录调控在精子发生的不同阶段起着不同的作用,包括精原干细胞的自我更新和分化、精母细胞的减数分裂和精子细胞的变形成熟。深入理解精子发生中的转录调控机制对于研究精子形成的生物学过程、解析生育障碍的病理机制以及开发生育问题相关的治疗方法具有重要的意义。     

以J-Lat 11.1为HIV-1潜伏感染模型再激活效果检测方法的初步探讨

目的:比较3种检测方法的优缺点,探索全面评价人免疫缺陷病毒1型(HIV-1)潜伏感染再激活剂的检测方法。方法:以HIV-1潜伏细胞株J-Lat 11.1为潜伏感染模型、豆蔻酰佛波醇乙酯(PMA)为潜伏再激活剂,用流式细胞术检测绿色荧光蛋白(GFP)阳性细胞所占比例,酶标仪检测GFP表达强度,活细胞成像系统检测GFP的动态表达情况。结果:流式细胞术检测显示PMA再激活出GFP阳性细胞的比例随作用浓度的增加(0~10 nmol/L)而增加,但当PMA浓度高于10 nmol/L后变化不再明显;酶标仪检测显示PMA处理后24 h内,GFP荧光强度逐渐增高,之后可在高水平保持至48 h;活细胞成像系统则可以动态反映PMA处理后的再激活过程。结论:可采用流式细胞术检测GFP阳性细胞比例对HIV-1潜伏感染再激活剂进行初步筛选,再结合酶标仪或活细胞成像系统动态监测GFP的表达情况,综合评价再激活剂的作用强度和起效时间。     

上海地区人类免疫缺陷病毒1型感染/艾滋病患者病毒耐药基因突变及亚型分布

目的 研究上海地区人类免疫缺陷病毒1型(HIV-1)感染／艾滋病(AIDS)患者中HIV-1耐药株出现的情况及亚型分布。方法 对33例HIV-1感染／AIDS患者的血浆HIV-1分离株,进行抗HIV-1药物(核苷类反转录酶抑制剂、非核苷类反转录酶抑制剂和蛋白酶抑制剂)的基因型耐药检测和亚型分析。结果 33例的HIV-1均未检出对PI的耐药突变;10例高效抗反转录病毒疗法(HAART)治疗失败或抑制病毒复制不完全者中,检出的耐药突变为70％,过渡型耐药突变为20％;23例未经抗HIV-1治疗者中,耐药突变为4．3％,过渡型耐药突变为13％。所有过渡型耐药突变均为T215S。15例经血制品传播的HIV- 1均为B亚型;18例经吸毒和性传播的HIV-1中,B和CRF01-AE亚型分别为39％,和33％,此外,还有C、D、G、K和CRF02-AG亚型。结论 上海地区HIV-1感染／AIDS患者中,HAART治疗失败或复制抑制不完全者HIV-1的NRTI和NNRTI耐药突变率高;吸毒和性传播者的HIV-1中,除主要为B和CRF01-AE亚型外,尚有其他少见的亚型。     

Suppression of HIV replication using RNA interference against HIV-1 integrase

RNA interference (RNAi) has become one of the most powerful and popular approach on gene silencing in clinical research study especially in virology due to the gene-specific suppression property of small interfering RNA (siRNA). In this report, we demonstrate that expression of vector-mediated small hairpin RNA (shRNA) against human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) integrase (IN), one of the three important enzymes in HIV infection by controlling the integration of viral RNA to host DNA, could suppress the protein synthesis of EGFP-tagged IN in HeLa cell model efficiently. Furthermore, we show that IN shRNA can successfully reduce the HIV particles production in 293T cells at the level similar to the positive control of HIV-1 tat shRNA. These results provide the therapeutic possibility of HIV replication using RNAi against HIV-1 integrase.     

The Establishment of an In Vivo HIV-1 Infection Model in Humanized B-NSG Mice

Suitable animal models for human immunodeficiency virus type 1(HIV-1) infection are important for elucidating viral pathogenesis and evaluating antiviral strategies in vivo. The B-NSG(NOD-PrkdcscidIl2rgtm1/Bcge) mice that have severe immune defect phenotype are examined for the suitability of such a model in this study. Human peripheral blood mononuclear cells(PBMCs) were engrafted into B-NSG mice via mouse tail vein injection, and the repopulated human T-lymphocytes were observed at as early as 3-weeks post-transplantation in mouse peripheral blood and several tissues.The humanized mice could be infected by HIV-1, and the infection recapitulated features of T-lymphocyte dynamic observed in HIV-1 infected humans, meanwhile the administration of combination antiretroviral therapy(cART) suppressed viral replication and restored T lymphocyte abnormalities. The establishment of HIV-1 infected humanized B-NSG mice not only provides a model to study virus and T cell interplays, but also can be a useful tool to evaluate antiviral strategies.     

Ⅰ型人免疫缺陷病毒(HIV-1)逆转录酶在大肠杆菌中的表达及其初步纯化

Ⅰ型人免疫缺陷病毒(HIV-1)逆转录酶(RT)在抗病毒感染及AIDS治疗药物的设计中是一个重要的靶分子,并且可作为工具酶应用于逆转录PCR等分子生物学研究中。本研究将HIV-1RT基因经PCR扩增并修饰后克隆入大肠杆菌表达载体pBV220,所获重组子所表达的HIV-1RT蛋白占菌体总蛋白的8％左右,且经[~3H]dTTP掺入法证实该重组HIV-1RT具有RT聚合酶活性。用Q-Sepharose层析柱对重组HIV-1RT蛋白进行了初步纯化,所获纯化样品的RT聚合酶比活性(1.7×10~4U/mg)比纯化前的裂解上清提高612倍。     

HIV-1 gp41N端融合肽与脂膜作用的荧光及单分子层膜研究

我们以前的实验证明ＨＩＶ－１ｇｐ４１Ｎ端２３肽即融合肽ＨＩＶｗｔ能促融合,但它的突变体ＨＩＶＧｌｕ（２位Ｖ→Ｅ）却不能诱发融合。为了进一步研究多肽结构与功能的关系,我们用荧光及单分子层膜技术研究ＨＩＶｗｔ及ＨＩＶＧｌｕ与脂的相互作用。荧光淬灭实验表明ＨＩＶｗｔ插入带负电磷脂并插入较深;而ＨＩＶＧｌｕ虽然能与带负电脂结合但并不插膜。单层膜实验进一步证实了上述结果：ＨＩＶｗｔ对带负电磷脂ＰＯＰＧ的临界插膜压达到４３ｍＮ／ｍ,而ＨＩＶＧｌｕ的临界插膜压只有３１ｍＮ／ｍ。这提示ＨＩＶｗｔ与单层膜不仅存在静电作用还有较强的疏水作用。结合上述实验结果推测ＨＩＶｗｔ能插入脂膜的酰基链因而容易促发融合;而ＨＩＶＧｌｕ插膜很浅或根本不能入膜从而不能促融合     

HIV-1 genetic diversity in Western Brittany,France

We describe human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) diversity in Western Brittany, France, and trace the dissemination of HIV-1 non-B subtype infection. The strategy for HIV-1 subtyping used involved subtype specific enzyme immunoassays, heteroduplex mobility assays and phylogenetic analysis of the sequences of env encoding the V3 loop region. Samples were obtained from 567 patients: 465 (82%) were of subtype B and 66 (11.6%) were not (20 were subtype A, 11 subtype C, four subtype D, seven subtype F, five subtype G and 19 others with circulating recombinant forms: 4CRF01_AE, 11CRF02_AG, 1H, 3CRF11_cpx). These findings are consistent with other studies of French populations. There is an epidemiological correlation between subtype B and homosexual or heterosexual contamination in France and between non-B subtype and heterosexual contamination in Africa.     

FasL基因表达调控研究进展

FasL基因的表达由其启动子上不同的蛋白 DNA作用模式所控制 ,许多因子诸如NFAT、NFκ B、Egr、IRF、ICER可通过与其顺式元件的结合或与其它蛋白的协同作用来调节FasL的转录。这些因子的表达或活化又受到其它因子的影响 ,就控制FasL基因表达的相关研究作一简要综述。