Habitat disturbance, severity and patterns of abundance in Kakamega Forest, Western Kenya

Patterns of plant species abundance were studied for five old patches in the Kakamega Forest in Western Kenya. All the five patches had been subjected to disturbances involving removal of top soil. Species diversity, species abundance, damage to individuals in various patches, quality of growth and distribution of life-forms differed among patches. The pattern of species abundance showed the most striking variation in conforming to various species dominance curves. Explanations for these differences in species quality appear to reflect the quality of the patches.

Résumé

On a étudié dans 5 anciennes parcelles de la Kakamega Forest à l'ouest du Kenya les schémas d'abondance en espèes végétales. Les 5 parcelles avaient été soumises a des perturbations comprenant l'évacuation de la couche supérieure du sol. La diversité des espèces, leur abondance, les dommages causés aux plantes indivi-duelles dans les différentes parcelles, le type de croissance et la distribution des espèces différaient selon les parcelles. Le schéma d'abondance des espèces montrait la variation la plus frappante par sa conformité aux courbes de dominance des différentes espèces. Les explications de ces différences de la qualité des espèces semble refléter la qualité des parcelles.     

Etude Ultrastructurale de la Sporulation de Paramarteilia orchestiae gen. n., sp. n., Parasite de l'Amphipode Orchestia gammarellus (Pallas)

RESUME. L'individualisation de 2 spores bicellulaires à partir d'un měme pansporoblaste caractérise la sporulation du parasite de l'Amphipode Orchestia gammarellus (Pallas) précédemment décrit sous le nom de Marteilia sp. Cette sporulation le distingue des espèces du měme genre parasite d'Hutres qui sont toutes caractérisées par la production de spores tricellulaires. Les conditions semblables dans lesquelles les pansporoblastes paraissent se differencier à partir d'une cellule souche dans laquelle ils poursuivent leur évolution vers la sporogenèse ainsi que divers caractères cytologiques communs, nous incitent à maintenir tous ces parasites dans une měme famille mais à placer celui de l'Amphipode dans un genre différent. Nous proposons de le nommer Paramarteilia orchestiae gen. n., sp. n.
Ces parasites ne peuvent ětre maintenus dans les Protozoaires en raison de leur évolution vers la pluricellularité et de l'individualisation de ces éléments somatiques que représentent la cellule souche primaire, les pansporoblastes et cellules sporales (à l'exception des sporoplasmes). Il semble logique de les inclure dans l'embranchement des Myxozoaires créé par Grassé pour les Myxosporidies et Actinomyxidies qui différencient également des spores pluricellulaires et des éléments somatiques. Les centrioles à 9 singlets de P. orchestiae ainsi que les cellules primaires uninucléées, quel que soit le nombre de pansporoblastes qu'elles contiennent, peuvent ětre considérés comme des caractères résiduels d'Unicellulaires.     

REGULAR ARTICLES

Marginal Analysis of Correlated Failure Time Data with Informative Cluster Sizes
Nous nous intéressons à la modélisation de données de survie corrélées quand la connaissance de la taille des strates peut fournir une information sur le critère de jugement. Celle-ci est basée sur une approche de ré-échantillonnage au sein des strates et sur une méthode de fonction de score pondérée. Nous déterminons les propriétés asymptotiques pour les estimateurs de ré-échantillonnage au sein des strates dans le cadre d'un modèle à risques proportionnel de Cox. Nous établissons la convergence et la normalité asymptotique des estimateurs des coefficients de régression et la propriété de convergence faible des estimateurs de la fonction de base du risque cumulé. La méthode de fonction du score pondérée consiste à prendre l'inverse de la taille des strates comme poids dans la fonction de score. Nous procédons à des études de simulations pour déterminer et comparer le comportement des estimateurs pour des échantillons finis et appliquons les méthodes proposées à une étude dentaire.     

Economies of affect

Cet article développe le concept des «économies de l'affect>> pour attirer l'attention des anthropologues sur le rôle de l'affect dans la facilitation des transformations économiques. Il s'appuie sur les résultats de deux projets de terrain ethnographiques, l'un au Mexique et l'autre en Indonésie, pour montrer comment l'affect a été mobilisé pour créer des sujets pouvant être appréhendés selon les normes néolibérales. Les auteurs montrent comment l'étreinte, les pleurs et les discours sur l'amour et le chagrin ont été associés à des transformations impliquant la cessation de prestations de l'État et l'application des lois du marché. En faisant de l'affect et de son articulation avec le changement économique un objet d'étude anthropologique, l'article affirme l'utilité d'une notion d'affect se démarquant d'autres approches qui mettent l'accent sur l'émotion. Les auteurs affirment que l'affect est utile parce qu'il est, par nature, réflexif et intersubjectif. L'affect renvoie aux relations pratiquées entre les individus, à la différence de l'émotion, toujours marquée par le spectre d'un individualisme psychologique.     

Caractéristiques Ultrastructurales du Cortex et des Membranelles du CiliéEspejoia mucicola (Oligohymenophora, Hymenostomata, Tetrahymenina)

RESUME. L' étude détaillée du cortex et des organelles buccaux adoraux d' Espejoia montre que ce Cilié possède une organisation ultrastructurale comparable à celle des Tétrahyméniens. Tout en restant conforme au plan général d'organisation de ces derniers, des variations spécifiques décelées tant au niveau du cortex d'une part, que des membranelles, d'autre part, font ressortir des affinités trés marquées pour le genre Glaucoma et autres Ciliés voisins. En conséquence, en nous appuyant en outre sur les données récentes de la morphogenèse, nous confirmons la position d' E. mucicola parmi les Tetrahymenina, dans la famille des Glaucomidae.     

BIOMETRIC METHODOLOGY

Matching in Studies of Classification Accuracy: Implications for Analysis, Efficiency, and Assessment of Incremental Value
Dans les études cas-témoins qui visent àévaluer une classification effectuée à partir d'un marqueur, il est courant d'apparier les témoins aux cas sur des facteurs liés à la maladie et au marqueur. Dans ce type d'études, par opposition aux études étiologiques, l'appariement n'a pas fait l'objet de travaux rigoureux. Nous étudions les implications de l'appariement sur le choix d'un modèle d'analyse statistique, sur l'efficacité et sur l'évaluation de l'apport supplémentaire du marqueur par rapport aux variables d'appariement. Nous observons que l'ajustement sur les variables d'appariement est essentiel car les mesures non ajustées des qualités du marqueur peuvent être biaisées. Dans de nombreuses situations, l'appariement est la plus efficace des méthodes d'échantillonnage en fonction des covariables et nous donnons une expression du rapport optimal nombre de cas/nombre de témoins. En revanche, nous montrons également que l'appariement complique sérieusement l'évaluation de l'apport supplémentaire du marqueur. Nous recommandons d'envisager l'intérêt d'un appariement à la lumière de ces résultats.     

REGULAR ARTICLES

Marginalized Models for Moderate to Long Series of Longitudinal Binary Response Data
Les modèles marginalisés (Heagerty, 1999) permettent l'inférence basée sur la vraisemblance lorsqu'on s'intéresse à des modèles marginaux de régression pour des données longitudinales binaires. Deux modèles de ce type sont le modèle de transition marginalisée, et le modèle à variable latente marginalisée. Le premier reflète la dépendance sérielle intra-sujet au sein des mesures répétées avec des termes de transition dans le modèle, tandis que le deuxième suppose l'échangeabilité ou la non-décroissance de la dépendance de la réponse avec des intercepts aléatoires. Dans cet article, nous étendons la classe des modèles marginalisés en proposant un modèle simple unifié décrivant à la fois la dépendance sérielle et la dépendance au long terme. Ce modèle est particulièrement utile dans des analyses longitudinales avec un nombre de mesures répétées par sujet modéré ou large, où aussi bien les formes sérielles et échangeables de la corrélation de la réponse peuvent être identifiées. Nous décrivons des approches bayésiennes et au maximum de vraisemblance pour l'estimation des paramètres et pour l'inférence, et nous étudions les caractéristiques opérationnelles pour de grands échantillons, sous deux types de mauvaise spécification du modèle de dépendance. On analyse les données de l'étude longitudinale de schizophrénie de Madras (Thara, 1994).     

QUELQUES OBSERVATIONS SUR LA NIDIFICATION DES STERNES DANS LES EAUX DE MADAGASCAR.

Des observations faites à Madagascar dc 1946 à 1948 sur la présence et la nidification des sternes sont rapportées, avec la saison du début de la ponte:—
Dans un îlot des Glorieusts, Sterna fuscata nidific.
La liste des oiseaux marins observés sur l'île Europa est dressee.
Au Nord de l'îile; trois espèces.
Au Sud de l'îile; quatre espèces.
A l'Est de l'île est signalée un centre de nidification, d'après des déclarations. de pêcheurs.     

The influence of man-made fires on large wild herbivores in Lake Burungi area in northern Tanzania

The effect of fire on the distribution of large wild herbivores during the late dry season was studied in northern Tanzania during October 1987. All species were attracted to burnt-over areas with 1–10 cm regrowth of grass. Recently burnt areas with no regrowth and areas not burnt during the dry season were avoided.
By the end of the dry season the study area was left as a fire mosaic, with different areas burnt at different times during the dry season. Thirty two percent was unburnt. The fires were mainly man-made but for purposes other than wildlife management. Such a fire mosaic has a positive effect on the larger herbivores by supplying protein-rich food during the dry season.

Résumé

On a étudié en octobre 1987, durant la deuxième saison sèche l'effet du feu sur la distribution de grands herbivores dans le nord de la Tanzanie.
Toutes les espèces sont attirées par les surfaces brûlées où les repousses sont de 1 à 10 cm. Les surfaces sans repousses et les zones non brúéees sont évitées. A la fin de la saison sèche, la zone étudiée ressemblait à une mosaïque due au feu, avec des endroits brûlés a des moments différents durant la saison sèche. Trente-deux pour-cents n'avaient pas brûlé. La plupart des feux avaient été allumes par l'homme, mais dans d'autres buts que la gestion de la faune. Une telle mosaïque a un effet positif sur les grands herbivores car elle fournit un complément de nourriture riche en protéines au cours de la saison sèche.     

DISCUSSION PAPER

R. L. Prentice, M. Pettinger, and G. L. Anderson          899
Statistical Issues Arising in the Women's Health Initiative
Nous proposons un bref panorama du plan de l'essai clinique et de l'étude observationnelle de la WHI, ainsi qu'un résumé des résultats obtenus à partir de la partie de l'essai clinique dévolue à la thérapeutique hormonale post-ménopause. Depuis son démarrage en 1992, la WHI a été confrontée à plusieurs questions de nature statistique pour lesquelles de plus amples développements méthodologiques étaient nécessaires. Parmi ceux-ci, la modélisation des erreurs de mesure, et des méthodes d'analyse pour l'évaluation de la diététique et de l'activité physique; des méthodes de surveillance d'essai clinique lorsque les traitements peuvent concerner plusieurs champs cliniques aussi bien en bénéfice qu'en réaction adverse; le plan d'étude et les procédures d'analyse pour des données génomiques et protéiques de dimension élevée; et aussi des procédures d'analyse de données de durée lorsque les rapports de risque dépendent du temps. Ce dernier point apparaît important pour comprendre les différences entre les résultats de l'essai clinique et ceux de l'étude observationnelle en ce qui concerne le traitement hormonal postménopause et la pathologie cardio-vasculaire.     

READER REACTION

A Note on Testing Separability in Spatial-Temporal Marked Point Processes
Dans l'analyse du risqué environnemental, il est usuel de supposer l'indépendance stochastique (ou séparabilité) entre les traces associées aux événements aléatoires d'un processus spatio-temporel. Schoenberg (2004, Biometrics 60, 471–481) a proposé plusieurs tests statistiques de cette hypothèse, et a utilisé des données simulées pour en évaluer la performance. Il a obtenu un test de type Cramer-Von Mises, puissant pour détecter des écarts graduels à la séparabilité, mais non uniformément puissant sur une classe large de modèles alternatifs. Nous présentons une approche semi-paramétrique pour modéliser les hypothèses alternatives de séparabilité, et obtenons une statistique de score test. Nous montrons une relation entre ce score test et certaines des statistiques proposées par Schoenberg. Plus précisément, toutes sont des versions différentes des statistiques pondérées de Cramer-Von Mises. Ceci éclaire les causes des ressemblances et des différences entre les performances des tests. Nous insistons également sur certaines difficultés au contrôle du risque d'erreur de première espèce dans le test des résidus de Schoenberg.     

Rights violations, rumour, and rhetoric: making sense of cannibalism in Mambasa, Ituri (Democratic Republic of Congo)

In January 2003, in the midst of civil war, Mbuti pygmies from Mambasa, Ituri, informed human rights organizations and the media that relatives had been killed, cooked, and eaten by soldiers of the Mouvement pour la Libération du Congo (MLC). Nearly two years later, spectacularly, the accusers withdrew their testimonies. This article tries to make sense of the allegation and subsequent retraction by reviewing how the Congolese print media covered the story. Against the backdrop of turbulent politics and moral crisis, it is argued that 'Cannibalism in Mambasa' needs to be understood first and foremost as a politically driven metaphor of extreme violence and suffering, even though acts of cannibalism cannot be ruled out.  

Résumé

En janvier 2003, en pleine guerre civile dans l'Ituri, des Pygmées Mbuti de Mambasa informèrent les organisations humanitaires et les médias que des membres de leur tribu avaient été tués, cuits et dévorés par les soldats du Mouvement pour la Libération du Congo (MLC). Deux ans plus tard, les accusateurs se rétractaient spectaculairement. Le présent article tente de donner un sens à ces accusations puis aux rétractations, à travers la couverture de cette affaire par la presse congolaise. L'auteur affirme que dans ce contexte de grave crise politique et morale, le « cannibalisme à Mambasa >> doit être d'abord, et avant tout, compris comme une métaphore politique de violence et de souffrance extrêmes, bien que l'on ne puisse pas exclure la possibilité que des actes de cannibalisme aient bien été commis.     

Hunters, ritual, and freedom: dozo sacrifice as a technology of the self in the Benkadi movement of Côte d'Ivoire

L'article affirme que dans les années 1990, les chasseurs dozo de Côte-d'Ivoire ont utilisé le sacrifice pour se constituer en police officieuse au sein d'un groupement de sécurité qu'ils ont appelé Benkadi . Les chercheurs ont noté une évolution similaire par laquelle d'autres chasseurs d'Afrique de l'Ouest devenaient soldats, garde-chasse ou agents de développement, dans le contexte des changements politiques, économiques et écologiques. Bien que ces changements aient créé les conditions dans lesquelles les dozo s se sont chargés de fonctions de sûreté nationale, ces conditions ne suffisent pas à expliquer comment ils en sont venus à constituer une force de l'ordre. L'auteur explore le sacrifice des dozos comme une «technologie de soi>>, selon les termes de Foucault, pour avancer qu'ils ont librement endossé des rôles de sûreté impliquant des responsabilités éthiques proches de celles implicitement contenues dans leurs chasses et leurs pratiques occultes. Il invoque Frankl et Laidlaw pour expliquer les aspects émotionnels et pratiques de cet auto-façonnage. L'analyse culturelle des rituels des dozos éclaircit la manière dont ils ont agi pour donner forme aux effets de l'économie et de l'écologie politiques sur leurs pratiques.     

PRESIDENTIAL ADDRESS

Our Future as History
Nous, membres de l'I.B.S. et plus généralement des sociétés savantes et professionnelles, vivons actuellement des heures exaltantes, face aux défis à relever. Il s'agit pour nous d'organiser et de planifier activement l'avenir, et de considérer celui-ci comme de l'Histoire future. «Notre futur, c'est de l'Histoire>>: ce qui est à venir devient le présent et le présent devient Histoire. A cet effet, je reprendrai et développerai les thèmes déjà identifiés lors de mon discours présidentiel de Montréal: je présenterai brièvement l'état de notre organisation ainsi que ses initiatives récentes, et j'anticiperai à partir de là sur les besoins en termes d'essor de nos activités présentes et de création de nouvelles activités. C'est par ces actions que nous garantirons l'avenir que nous appelons de nos vœux, et par là même que nous laisserons à nos successeurs un héritage dont nous pourrons être fiers.     

REGULAR ARTICLES

Line Transect Methods for Plant Surveys
En raison de la nécessité de bien quantifier la diminution de la biodiversité, on observe actuellement un regain d'intérêt pour les méthodes de suivi de l'abondance des plantes. Les suivis par transects constituent une méthode efficace de suivi pour de nombreuses espèces. Mais dans certaines circonstances, la méthode ne fonctionne pas bien, par exemple quand les sites d'étude sont petits, quand les plantes ont des distributions très agrégées, ou quand les plantes qui se trouvent sur la ligne ne sont pas facilement détectables. Pour résoudre ces problèmes, nous utilisons une stratégie basée sur des transects croisés combinés à des méthodes qui exploitent l'information additionnelle que fournissent de tels plans expérimentaux. Cette méthode est illustrée avec des données provenant d'une colonie de primevères coucou.     

CONSULTANT'S FORUM

A Simple Local Sensitivity Analysis Tool for Nonignorable Coarsening: Application to Dependent Censoring
Les données censurées à droite ou sur certains intervalles de temps sont des cas particuliers fréquents de données dégradées (Heitjan et Rubin, 1991). Comme avec les données manquantes, les méthodes statistiques courantes qui ignorent la nature aléatoire du mécanisme de dégradation peuvent conduire à des inférences incorrectes. Nous généralisons un outil simple d'analyse de sensibilité, l'indice de sensibilité locale à la non-ignorabilité (Troxel et al., 2004), à un modèle général de dégradation. En transformant cet indice en un simple graphique on peut facilement établir la sensibilité des inférences-clés à une dégradation non ignorable. Nous illustrons la validité de la méthode sur un exemple simulé, et l'appliquons à des observations de transplantation cardiaque censurées à droite, et à un essai clinique dans la maladie HIV où le temps nécessaire pour atteindre une charge virale détectable est censuré sur certains intervalles.     

CONSULTANT'S FORUM

Time-Varying Coefficient Models for the Analysis of Air Pollution and Health Outcome Data
Nous présentons un modèle à coefficient dépendant du temps pour étudier la relation entre exposition aiguë (à court terme) à la pollution atmosphérique et altérations de la santé. Ce modèle permet au risque relatif de varier en fonction du temps comme cela peut se produire en cas d'interaction avec la température ou de modification de la composition en polluants, par exemple en particules solides. Le modèle fournit une estimation lissée de ces effets dépendant du temps sans qu'il soit nécessaire de spécifier une forme paramétrique particulière. Cette forme est estimée à partir des données à l'aide de fonctions spline cubiques pénalisées. Nous développons des modèles de régression de Poisson dont les coefficients sont estimés soit en maximisant une quasi-vraisemblance par une procédure itérative de moindres carrés repondérés, soit par une approche bayésienne utilisant une méthode de Monte Carlo par chaîne de Markov (MCMC). L'efficacité de ces approches pour estimer différents effets dépendant du temps est évaluée par simulations et les modèles sont appliqués aux données recueillies dans quatre villes pour l'enquête NMMAPS (Enquête Nationale Morbidité, Mortalité et Pollution Atmosphérique).     

DISTRIBUTION QUANTITATIVE DES DIVERS PHOSPHO-LIPIDES DANS LES NEURONES ET LES CELLULES GLIALES ISOLES DU CORTEX CEREBRAL DE RAT ADULTE

Resumé–— On décrit une méhode de préparation de neurones et de cellules gliales à partir du cortex cérébral, basée sur la dissociation du tissu à travers un tamis en nylon suivie ď une ultracentrifugation différentielle sur gradients de sucrose et de Ficoll.
On a dosé le DNA, ľazote protéque et les divers phospholipides. II ressort que le taux ď DNA par cellule est identique dans les neurones et les cellules gliales. Par contre, la quantité absolue ďazote protéique est 2.8 fois plus élevée dans les cellules gliales, celle des lipides totaux et des divers phospholipides 5-6 fois plus élevée.
La proportion de chacun des phospholipides dérminée par rapport aux phospholipides totaux est similaire dans les deux types cellulaires.     

Hot air and the Colonialist 'Other': the 'German-English-Dutch Airship Expedition' to New Guinea

Il est largement admis en anthropologie que les images de «l'Autre>> exotique font partie de la «technologie intellectuelle>> grâce à laquelle le colonialisme a étendu et maintenu son contrôle sur les frontières impériales. Faute d'analyse, toutefois, un autre type d'Autre se languit encore en anthropologie : le Colon à demeure. Dans les narrations analytiques standard, cette figure et le milieu dans lequel elle agit sont encore dépeints en termes radicalement uniformisés. En réalité, le colonialiste maison était un agent complexe, obligé de naviguer et de négocier entre plusieurs conjonctures culturelles et sociales dans le cadre du développement de projets coloniaux appelés àêtre exportés au loin. Dans le présent article, les auteurs cherchent à mettre en lumière l'Autre colonisateur et sa place dans le colonialisme en s'intéressant à la destinée de l' oberleutnant Paul Graztz, «héros>> colonial allemand de la fin du XIX^e siècle, et à sa tentative (vouée à l'échec) d'expédition topographique en Nouvelle-Guinée dans un aéronef «à air chaud>>.