菜豆重金属胁迫响应基因：cDNA克隆及其表达分析

通过判别筛选ＨｇＣｌ２胁迫下的菜豆叶片ｃＤＮＡ库,分离出７组不同的ｃＤＮＡ克隆（Ｐｈａｓｅｏｌｕｓ ｖｕｌｇａｒｉｓ ｓｔｒｅｓｓ－ｒｅｌａｔｅｄｐｒｏｔｅｉｎ,ＰｖＳＲ１－７）。ｃＤＮＡ序列和同源性分析结果表明：ＰｖＳＲ１编码富含脯氨酸细胞壁蛋白,     

可溶性白细胞介素6受体基因在链霉菌的克隆表达研究

以分离提取的ＨｅＬａ细胞总ＲＮＡ为模板,通过ＲＴ－ＰＣＲ反应扩增得到了１０１７ｂｐ的人可溶性白细胞介素６受体（ｓＩＬ－６Ｒ）ｃＤＮＡ片段,将扩增片段克隆到ｐＵＣ１９质粒中进行序列测定。结果证明该片的序列与文献报道的ｓＩＬ－６ＲｃＤＮＡ的序列完全一致,将ｓＩＬ－６ＲｃＤＮＡ与链霉素信号肽ｍｅｌＣｌ的编码序列融合后得到的融合基因ｍｅｌ／ｓＩＬ－６Ｒ克隆到链霉菌质粒ｐＬＪ４５９中,构建成重组表达质粒ｐＬ     

乳酸克鲁维酵母高拷贝整合载体的构建及应用

用酿酒酵母２６ｓ ｒＤＮＡ作探针克隆乳酸克鲁维酵母Ｋ．ｌａｃｔｉｓ ２．２ｋｂ ｒＤＮＡ片段,对其作限制内切酶图谱分析。以该基因片段为同源整合的靶顺序,酿酒酵 ＵＲＡ３基因为选择标记构载体质粒ｐＩＲＫ并对其在宿主Ｋ．ｌａｃｔｉｓ ＭＷ９８－８ｃ细胞中的整合位点,拷数及稳定性进行测定和分析。     

地中海拟无枝菌酸菌U32中amrC／amkC基因的序列分析及在大肠杆 …

从力复霉素ＳＶ产生菌－－地中海拟无枝菌酸菌（Ａｍｙｃｏｌａｔｏｐｓｉｓ ｍｅｄｉｔｅｒｒａｎｅｉ）Ｕ３２的硝酸盐同化基因簇的上游克隆了一个２．６ｋｂ的ＥｃｏＲＩ－ＸｈｏＩ ＤＮＡ片段并测定其序列。序列分析表明,该ＤＮＡ片段编码两个完整的开放阅读框架（ＯＲＦ）,ＯＲＦ２的起始密码子ＧＴＧ与ＯＲＦ１的终止密码子ＴＧＡ在ＴＧ处重叠。ＯＲＦ１编码一个含２２４个氨基酸的多肽,它同放线菌中典型的应答调节蛋白包     

大鼠脑神经元特异性烯醇化酶基因的cDNA克隆及序列分析

用ＲＴ－ＰＣＲ方法快速克隆了Ｗｉｓｔａｒ大鼠脑神经元特异性烯醇化酶的ｃＤＮＡ,将此包括编码全长ＮＳＥ４３３个氨基酸的ＤＮＡ片段重组入ｐＵＣ质粒,并用ＰＣＲ方法测定了全部顺序,经重复实验,发现Ｗｉｓｔａｒ大鼠与Ｆｏｒｓｓ－Ｐｅｔｔｅｒ报导的ＳＤ大鼠ＮＳＥ基因顺序,有两处单碱基的差别,其中一个涉及氨基酸的改变,同时还对ＲＮＡ的提取及长片段ＤＮＡ的ＲＴ－ＰＣＲ扩增进行了方法学的探讨。     

马铃薯Patatin class—I启动子及信号肽基因的克隆和序列分析

为利用ｐａｔａｔｉｎ ｃｌａｓｓ－Ｉ启动子的块茎表达专一性以达到马苓薯的目的,利用ＰＣＲ技术从马铃薯总ＤＮＡ中扩增出Ｐａｔａｉｔｎ ｃｌａｓｓ－Ｉ启动子及信号肽基因,并将其克隆;序列分析发现该基因片段与已发表ｃＤＮＡ相应片段约９４％同源。     

费氏中华根瘤菌与耐盐有关的DNA片段的亚克隆和测序

将费氏中华根瘤菌（Ｓｉｎｏｒｈｉｚｏｂｉｕｍ ｆｒｅｄｉｉ）ＫＴ１９与耐盐有关的２３ｋｂ ＤＮＡ片段用ＢａｍＨⅠ酶切成大小不同的长度,分别与质粒ｐＭＬ１２２连接,然后转化大肠杆菌（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ ｃｏｌｉ）Ｓ１７－１,筛选出３个转化子。以这些转化子为供体,ＲＴ１９的盐敏感突变株ＲＣ３－３为受体,分别进行二亲本杂交,筛选到接合子ＢＲ２,得到４．４ｋｂ与耐盐有关的ＤＮＡ片段。根据其物理图谱,酶     

大鼠脑神经元特异性烯醇化酶基因的cDNA克隆及序列分析

用ＲＴ－ＰＣＲ方法快速克隆了Ｗｉｓｔａｒ大鼠脑神经元特异性烯醇化酶（ＮＳＥ）的ｃＤＮＡ,将此包括编码全长ＮＳＥ４３３个氨基醚的ＤＮＡ片段重组入ｐＵＣ质粒,并用ＰＣＲ方法测定了全部顺序,经重复实验,发现Ｗｉｓｔａｒ大鼠与Ｆｏｒｓｓ－Ｐｅｔｔｅｒ报导的ＳＤ大鼠ＮＳＥ基因顺序,有两外单碱基的差别,其中一个涉及氨基酸的改变。同时还对ＲＮＡ的提取及长片段ＤＮＡ的ＲＴ－ＰＣＲ扩增进行了方法学的探讨。     

利用DDRT-PCR技术分析神经生长因子低亲和力受体诱导的细胞凋亡过程中基因表达的差异

转染了Ｐ７５ＮＧＦＲ的Ｒ２神经细胞系Ｒ２Ｌ１在去血清的培养时可以诱导细胞凋亡的发生．此凋亡可以被ＲＮＡ合成抑制剂放线菌素Ｄ和蛋白质合成抑制剂环己酰胺所抑制．利用ＤＤＲＴ－ＰＣＲ技术比较了去血清培养的发生凋亡的Ｒ２Ｌ１细胞与有血清培养的不发生凋亡的Ｒ２Ｌ１细胞以及去血清培养的不发生凋亡的Ｒ２Ｐ细胞基因表达的差异．克隆了数个特异或差异表达的短ｃＤＮＡ片段,经Ｎｏｒｔｈｅｒｎ杂交证实其中两个片段ＬＩＡＲＥＳＴ－１和ＬＩＡＲＥＳＴ－２表达量在凋亡细胞中显著高于不发生凋亡的细胞中,ＧｅｎＢａｎｋ检索表明此二片段为新的ｃＤＮＡ序列并给予登录号Ｕ４７３１５和Ｕ４７３１６．另有一个ｃＤＮＡ片段ＬＩＡＲＣＤ－３在凋亡细胞中受到了明显的抑制,经检索为一已知的与前强啡肽原上游调控区结合的ＤＮＡ结合蛋白ｃＤＮＡ编码区的一部分,首次被证实它与Ｐ７５ＮＧＦＲ诱导的神经细胞凋亡调控关联     

应用cDNA文库快速构建法克隆高粱肌动蛋白基因

取生长一周的高粱嫩叶为材料,按照ｃＤＮＡ库快速构建法,用λｇｔ１０为载体成功地获得了含有２×１０＾０６人重组噬菌体的ｃＤＮＡ库。以水稻ＲＡｃｌ ｃＤＮＡ为探针,经噬菌体原位杂交筛选出两个阳性克隆片段,并对其中一个进行了Ｓｏｕｔｈｅｒｎ杂交鉴定。然后将重组体中含有的ｃＤＮＡ片段亚克隆至ｐＢｌｕｅｓｃｒｉｐｔ ＳＫ－载体上测序。     

一个能与水稻未成熟种子核蛋白特异结合的31bp的DNA片段

水稻蜡质基因5'上游序列中有5个能与水稻胚乳核蛋白结合的片段,其中HinfId和RsaIe片段有部分重叠,而重叠部分含AACGT顺序。按重叠区上下游顺序合成了其中含有3次重复的AACGT顺序的31bp寡核苷酸,并以此为探针进行凝胶滞后实验,表明它不仅能与未成熟水稻种子的胚乳核蛋白特异结合,而且也与HinfId和RsaIe片段有强烈的竞争作用。因此31bp顺序中含有与水稻胚乳核蛋白专一结合位点,从而有可能应用此31bp的寡核苷酸作探针来分离编码蜡质基因的调控蛋白基因。     

水稻转录因子OsBP-73靶基因的初步筛选

OsBP-73是用酵母单杂交系统,以水稻蜡质基因(Wx)的顺式作用元件为诱饵,从水稻cDNA表达文库中筛选获得的转录因子。本文以OsBP-73基因为例介绍了用"下拉"(pull-down)方法筛选转录因子靶基因的一般步骤。将含有该基因DNA结合功能域的cDNA片段构建到原核表达载体上,并在大肠杆菌中诱导表达获得其蛋白p73。用纯化后的p73蛋白通过"下拉"实验对OsBP-73靶基因进行初步筛选,获得了22个阳性克隆,为进一步研究转录因子OsBP-73参与的水稻转录调控网络提供依据。     

应用酵母单杂交系统分离水稻蜡质基因5'调控区结合蛋白的基因

在水稻蜡质基因５’上游区中一段３１ｂｐ 核苷酸序列能与水稻未成熟种子核蛋白特异结合。为了克隆这一核蛋白基因,以此３１ ｂｐ 序列构建成“鱼饵”质粒,从水稻ｃＤＮＡ文库中筛选到１３ 个阳性克隆。根据这些阳性克隆中插入ｃＤＮＡ 片段的相互杂交结果,对这些克隆进行了分组。     

水稻cDNA c73片段在大肠杆菌中的表达及其产物的纯化

曾以水稻蜡质基因５’调控区内一段３１ ｂｐ 片段为探针,用酵母单杂交法从水稻ｃＤＮＡ 文库中筛选出若干个其编码的蛋白可能与此３１ ｂｐ 片段结合的ｃＤＮＡ克隆,现将其中的ｐＣ７３ 克隆中的插入片段ｃ７３ 连接到含Ｈｉｓ６ 的表达载体ｐＥＴ２８ｃ（ ＋ ） 上,在大肠杆菌ＢＬ２１（ＤＥ３） 中进行诱导表达,并用ＮｉＮＴＡ 树脂纯化得到预期的融合表达产物。在合适的诱导表达条件下,融合表达产物主要以可溶形式存在于大肠杆菌细胞内;表达量占到大肠杆菌总蛋白的１０ ％ 左右;经ＮｉＮＴＡ 树脂亲和层析纯化得到的产物纯度达９５ ％ ,可供进一步研究之用。     

CS3纤毛抗原表达调控机理的研究

ＣＳ３是某些肠毒素大肠杆菌菌体表面上的多聚物,它能使病原菌粘附于宿主的小肠上皮细胞上,是致病的重要因素．为了探索ＣＳ３菌毛抗原基因的表达调控机制,根据ＣＳ３亚基结构基因的核苷酸序列分析表明,在其翻译起始位点的上游存在着ｒｂｓ位点及原核启动子的－１０区和－３５区ＤＮＡ序列．采用基因重组技术将ＣＳ３结构基因上游１２０ｂｐ的ＤＮＡ片段亚克隆进缺乏启动子而只含报告基因ｌａｃＺ的质粒ｐＣＢ２６７中．凝胶滞留和启动报告基因表达的实验证明了ＣＳ３亚基结构基因具有自身的启动子（Ｐｓ）．将该启动子上游区域不同长度的核苷酸片段克隆进ｐＣＢ２６７中,报告基因表达结果表明ＣＳ３结构基因的表达受其上游区域的抑制．核苷酸序列分析发现,在Ｐｓ－３５区上游５５０ｂｐ和８４０ｂｐ处各存在一个富Ａ－Ｔ簇．结合原核启动子的一般作用规律推知,ＣＳ３的表达可能受ＤＮＡ结合蛋白型的正向调节因子的作用．用ＣＦＡ／１菌毛抗原基因的正向调节基因ｃｆａＤ对ＣＳ３基因进行的互补表达试验表明ｃｆａＤ基因不仅可消除上游区对Ｐｓ的抑制,而且可大幅度地提高Ｐｓ的启动能力．在分析表达调控的基础上获得ＣＳ３重组高效表达．同时提出了其表达调控模型．     

Specific interactions of histone H1 and a 45 kilodalton nuclear protein with a putative matrix attachment site in the distal promoter region of a cell cycle-regulated human histone gene

Protein-DNA interactions within the promoter of a cell cycle-regulated human H4 histone gene were examined by binding of 5'-end-labeled DNA segments to Western blots of nuclear protein fractions. Specific protein interactions were observed with DNA segments located between -500 bp and -1,070 bp upstream of the ATG initiation codon and included a histone H1 binding segment flanked on both sides by binding sites for a 45 kD nuclear protein. This region of the gene contains a DNase I-sensitive site in the center (-720 to -820 bp), and sequence analysis revealed the presence of scaffold attachment sequences in the two flanking segments. Topoisomerase II consensus sequences and in vitro topoisomerase II cleavage sites were also detected in the two flanking segments. Our results suggest that the 45 kd nuclear protein may preferentially interact with these two segments of the H4 histone gene to mediate association with the nuclear matrix. The presence of negative regulatory elements in this putative matrix attachment region provides a basis for the speculation that such nuclear proteins are associated with alterations in gene-matrix interaction that are functionally related to gene expression.