鉴定9个新的RHD基因mRNA可变剪接体

为了研究各种RHD基因mRNA可变剪接体的基因结构, 应用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)检测正常人脐血样本RHD mRNA, 对RHD cDNA进行TA克隆和序列分析, 对各可变剪接体的剪接位点进行DNA序列分析, 并将RHD mRNA进行表达序列标签(ESTs)分析。结果在28个阳性克隆中, 除全长RHD cDNA外, 共检测到12种(包括9种新的)RHD可变剪接体, 发现外显子遗漏、5′和3′剪接位点变异3种剪接形式, 涉及外显子2~9, 其中6种新的剪接体同时存在RHD和RHCE基因同源杂交现象。ESTs分析还检索到内含子保留形式的剪接体。研究表明, RHD基因mRNA存在复杂的可变剪接机制, 除已报道的剪接体外, 检测到9种新的RHD可变剪接体, 并发现了可变剪接和同源杂交并存现象。     

基于氨基酸特征序列对人类Rh血型系统的蛋白质结构分析

利用代数学中同态思想和物理中的“粗粒化”思想,以及HP模型,根据a,t,c,g的化学结构分类,提出了DNA序列的特征序列概念（σ-,τ-,σ∩τ-）并推广到蛋白质序列中,从而给出一种数值刻划,将蛋白质序列简化成一个（0,1）序列,基于上述给出特征序列的方法,根据氨基酸分子量与简并度的关系,提出了另外一种DNA序列的特征序列概念（-）并推广到蛋白质序列中,进而给出了另外一种数值刻划,将蛋白质序列简化成一个（0,1,2）序列,通过比较RHD基因和RHCE基因的特征序列的数值刻划图,得出RHD基因和RHCE基因均偏爱使用低分子量且高简并度的氨基酸。     

人RHD基因的克隆和鉴定

目的克隆人RHD基因,并对其进行鉴定。方法以RhD阳性志愿者骨髓为材料,用TRIzol试剂提取总RNA;设计、合成人RHD基因扩增引物,RT-PCR方法扩增RHD基因片段;T／A克隆后将其亚克隆人pET28a（＋）载体中,经酶切、PCR和测序对重组质粒进行鉴定。结果骨髓总RNA被成功提取;RT-PCR成功扩增出RHD基因片段,其大小与预期约509bp基本一致;T／A克隆后再将其亚克隆,通过酶切和PCR证明RHD基因成功亚克隆入pET28a（＋）载体中;基因测序结果比对显示,与已公布的RHD基因（GenBank登录号为NM016124）序列基本一致,同源性为98％。结论成功克隆了RHD基因,这将为进一步研究奠定基础。     

大菱鲆白化相关基因(DEN-1、DEN-2)的分离鉴定及特征分析

应用mRNA差异显示技术,对比研究正常与白化大菱鲆有眼侧皮肤组织,克隆差异表达基因,经测序,RT-PCR验证,差异表达基因片段DEN-1(GenBank登录号:DQ886390)与DEN-2(GenBank登录号:DQ886391)均在白化大菱鲆有眼侧皮肤组织中下调表达;通过BLAST检索发现,DEN-1与GenBank中的斑马鱼和牛的类似尿苷二磷酸-葡萄糖:糖蛋白葡糖基转移酶(UGGT)基因、与挪威鼠类似尿苷二磷酸-葡萄糖:神经酰氨葡糖基转移酶1(Ugcgl1)基因有较高同源性;DEN-2与原鸡、斑马鱼、人、挪威鼠、家鼠和狗的眼缺乏同源框4(eya4)基因的同源性均较高。采用相对定量RT-PCR对正常鱼有眼侧皮肤(N1)、白化鱼有眼侧皮肤(A1)、正常鱼无眼侧皮肤(N2)、白化鱼无眼侧皮肤(A2)进行表达谱分析,以内参β-actin基因分别对DEN-1和DEN-2表达量进行标准化的光密度扫描显示:DEN-1和DEN-2在4种皮肤组织中有相似的表达模式,即表达量:N1>N2≈A2>A1。电子延伸将DEN-2延伸为497bp的片段,该延伸片段与多种动物的eya4基因在核酸和蛋白水平均有很高同源性。本研究对DEN-1和DEN-2的不同组织器官和不同发育阶段的电子表达谱分析,将对其进一步研究提供有价值参考。     

从自由组合与连锁交换看基因排列的"效率原则"

基因的功能之间是有联系的,而基因之间的排列也有一定的规律性,应与功能相适应。基因间的重组排列主要有自由组合与连锁交换。阐述了基因的自由组合定律和连锁交换定律之间的内在关系,分析了2种极端的连锁情况在自然界中罕见的原因,并以此为基础,推测基因在2种排列方式之间选择的依据和原则。     

一种基于单交换原理的地衣芽孢杆菌基因敲除方法及应用

目的：基于同源单交换原理构建地衣芽孢杆菌基因快速敲除方法,提高基因敲除效率。方法：以地衣芽孢杆菌（Bacillus licheniformis）20085内切纤维素酶基因celb为拟敲除对象,利用重叠PCR技术将celb基因内约500bp片段与氯霉素抗性基因（Cm^r）相连接,经末端单酶切后电转化至B.licheniformis 20085感受态细胞中,仅通过一次同源单交换,将抗性基因Cm^r插入至celb基因内部,实现目的基因的敲除。结果：经过氯霉素抗性筛选和基因组PCR鉴定,成功获得celb基因缺失菌株B.licheniformis 20085Δcelb;发酵验证结果显示,B.licheniformis 20085Δcelb较原始菌株滤纸崩解能力显著降低,其中发酵60h后内切纤维素酶（CMC酶）活力由1.86U/ml降低至0.50U/ml,表明celb基因在地衣芽孢杆菌降解纤维素的过程中起着重要作用。结论：通过重叠PCR技术结合同源单交换原理能够实现地衣芽孢杆菌目的基因的快速敲除,为该菌株甚至其它微生物提供了一种基因功能快速鉴定的手段。     

中国瑶族人群(广西)9个STR基因多态性研究

采用STR基因扫描技术选择D3S1358,vWA,FGA,THO1,TPOX,CSF1P0,D5S818,D13S317 和 D7S820 9种STR基因座,研究我国瑶族人群STR遗传多态性。在瑶族群体中9个STR基因座共检出61个等位基因,其频率分布在0.0054~0.5924,平均杂合度为0.7357,多态信息量为0.6887,累积个体识别率为2.02×10-10,非父排除率为0.9999。结果表明,在人类遗传学、法学科等领域建立本民族本地区遗传学资料是十分重要和必不可少的。Study on 9 STR Loci Polymorphism from Chinese Yao Ethnic Group(Guangxi)GAO Fang1,BI Shi-hua2,LAI Jiang-hua1,LI Sheng-bin1,21.National Laboratory of Forensic Sciences,Xian Jiaotong University,Xi'an 710061;2.Human Genome Genter,Institute of Genetics and Developmental Biology,Chinese Academy of Sciences,Beijing 100101 ChinaAbstract:Genetic polymorphism of nine STR loci was investigated from a Chinese Yao population based on STR Genescan.Sixty one alleles was determined for 9 loci,such as D3S1358,vWA,FGA,THO1,TPOX,CSF1P0,D5S818,D13S317 and D7S820 with their frequencies 0.0054~0.5924.The average heterozygosity(H) was 0.7357,polymorphism information content(PIC) was 0.6887,the accumulative discrimination power(DP) was 2.02×10-10 and the probability of paternity exclusion(PPE) was 0.9999.These results suggested that the nine STR loci are very useful for human identification,such as analyzing forensic casework,establishing DNA databases,processing paternity test and studying gene natural resources.Key words：STR;genescan;Yao ethnic group;individual identification     

抗钠-钙交换体α-1重复序列(117-137)抗体对心肌钠-钙交换电流及钙电流的抑制作用(英文)

本研究旨在探讨抗钠-钙交换体(Na+-Ca2+ exchanger,NCX)α-1重复序列(117-137)抗体对大鼠心肌细胞钠-钙交换电流的影响。实验用合成的α-1重复序列(117-137)肽免疫大鼠制备抗α-1重复序列(117-137)抗体;应用全细胞膜片钳技术,在急性分离的心肌细胞上观察抗α-1重复序列(117-137)抗体对大鼠心肌细胞钠-钙交换电流的影响,同时还观察了其对大鼠心肌细胞L型钙通道、电压门控钠通道和豚鼠心肌延迟整流钾通道电流的影响;最后,采用EMBOSS Pairwise Alignment Algorithms软件对NCXα-1重复序列和L型钙通道(1076～1096)的氨基酸序列进行了比较。结果显示,抗α-1重复序列(117-137)抗体对大鼠心肌细胞Na+-Ca2+交换电流呈现剂量依赖性的抑制作用。在钳制电压为+50和-100mV时,其抑制外向和内向钠-钙交换电流的IC50分别为18.9和22.4nmol/L。此外,该抗体还对L型钙通道电流具有抑制效应(IC50=22.7nmol/L),对电压门控钠通道和延迟整流钾通道电流则无明显影响。通过氨基酸序列比对发现,NCX α-1重复序列(117-137)与L型钙通道IIIS5-S6序列(孔环)之间具有23.8%的相似性。以上结果表明,抗NCX α-1重复序列(117-137)抗体是心肌NCX的一种抑制性抗体,同时也可以抑制L型钙通道。     

叉头框P2(FoxP2)基因与鸟鸣

叉头框P2(FoxP2)基因是与人类语言相关的基因,在鸣禽脑中也存在,不仅参与胚胎时期的关键性发育,对鸣禽鸣曲学习也有影响.实验表明,FoxP2基因对神经回路发育和出生后的鸣唱学习,以及成鸟的鸣曲稳定都有重要作用.FoxP2基因主要在与人类同源的基底神经节--X区表达.本文介绍了FoxP2基因与鸟鸣的新近研究进展.     

植物抗病基因(R)与病原物无毒基因(Avr)相互作用机制的研究进展

PTI和ETI是植物在长期进化过程中形成的两类抵抗病原物的机制。基因对基因假说的抗病方式属于ETI抗性机制的一种,该假说认为具有保守NB-LRR结构域的R蛋白识别病原物非保守的无毒蛋白效应子(Avr),激活防卫反应信号途径,导致过敏性坏死。植物抗病基因(R)与病原菌无毒基因(Avr)产物间的直接或间接相互作用而产生的基因对基因抗性是植物抗病性的重要形式,该文对植物抗病蛋白与无毒蛋白相互作用机制进行了综述。其中,间接相互作用模式是主要方式。     

Relationship Between mRNA Stability and Length: An Old Question with a New Twist

The half-life of individual mRNA plays a central role in controlling the level of gene expression. However, the determinants of mRNA stability have not yet been well defined. Most previous studies suggest that mRNA length does not affect its stability. Here, we show significant negative correlations between mRNA length and stability in human and Escherichia coli, but not in Saccharomyces cerevisiae or Bacillus subtilis. This finding suggests the possibility that endonucleolytic attacks by RNA endonuclease and/or mechanical damage may strongly influence mRNA stability in both prokaryotes and eukaryotes.     

脑益康对D-半乳糖和亚硝酸钠所致Alzheimer病小鼠模型的保护作用

目的:探讨脑益康(中药)对D-半乳糖(D-gal)和亚硝酸钠(NaNO2)所致阿尔茨海默病(AD)小鼠模型的保护作用.方法:采用D-gal和NaNO2腹腔注射建立AD小鼠模型.应用迷宫刺激器检测小鼠学习记忆能力,生化方法检测小鼠脑组织一氧化氮(NO)含量和单胺氧化酶-B(MAO-B)、谷胱甘肽过氧化物酶(GSH-PX)、Na -K -ATP酶及Ca2 -ATP酶活性; RT-PCR检测凋亡调控基因Bax、Bcl-2 mRNA表达情况.结果:脑益康(中药)能改善小鼠学习记忆能力,降低AD小鼠脑组织MAO-B活性,升高Na -K -ATP酶和Ca2 -ATP酶活性,抑制Bax mRNA的表达,上调Bcl-2 mRNA的表达.结论:脑益康(中药)对AD小鼠有一定保护作用,其机制可能与降低脑组织MAO-B活性,提高脑组织Na -K -ATP酶和Ca2 -ATP酶活性,调节Bcl-2 mRNA和Bax mRNA的表达,发挥抗氧化作用,减轻神经细胞损伤有关.     

IGF-Ⅰ及其受体、IGF结合蛋白-2和LH受体mRNA在卵泡中的表达

利用原位杂交和原位DNA－3’末端标记的方法研究了胰岛素样生长因子河（IG－I）、IGF－I受体、IGF结合蛋白－2、和促性腺激素受体的信使核糖核酸（mRNA）在不同生长与闭锁阶段的大鼠卵巢卵泡中表达的变化。结果表明：IGF－I主要在正常生长的初级卵泡、窦前卵泡和小窦状卵泡中表达。在各生长与成熟阶段的卵泡中都检测到IGF－I受体mRNA,闭锁卵泡的IGF－I受体表达降低。窦前与窦状的生长和闭锁卵泡均表达IGFBP－2。促卵泡激素（FSH）受体在窦前和小窦状卵泡的表达水平比其在大卵泡中的高。窦前与小窦状卵泡仅在膜细胞中表达黄体生成素（LH）受体mRNA,大卵泡的膜细胞与颗粒细胞均表达LH受体,在闭锁卵泡中仅在膜细胞中观察到LH受体的信号。综上结果,提示IGF－I,IGF－I受体和FSH受体在窦前和小窦状卵泡中的协同表达对卵泡的早期发育有重要作用。LH受体mRNA特异地在大卵泡的颗粒细胞中表达可能与优势卵泡选择相关。     

慢性束缚应激大鼠海马脑啡肽mRNA和前强啡肽mRNA 表达及中药复方的影响

目的:研究慢性束缚应激时大鼠海马脑啡肽和前强啡肽mRNA基因表达的变化以及逍遥散、四君子汤、金匮肾气丸三种中药复方对其的影响.方法:用特制束缚架连续束缚7 d与21 d,每天3 h的方法制作大鼠束缚应激模型;以RT-PCR反应,扩增脑啡肽和前强啡肽基因,同时以β-actin作为内对照,用凝胶图像分析系统进行扫描并分析,把目的基因的光密度与内参照条带的光密度进行比较后进行半定量分析.结果:7 d模型组大鼠海马前强啡肽mRNA的表达明显增强(P＜0.01),21 d模型组海马脑啡呔mRNA和前强啡肽mRNA的表达明显增强(P＜0.01);三个复方均能降低海马内前强啡肽mRNA的表达(P＜0.01),逍遥散和四君子汤能降低脑啡呔mRNA的表达(P＜0.01).结论:逍遥散对脑啡呔mRNA前强啡肽mRNA的基因表达的改善作用明显优于金匮肾气丸组.     

真核细胞中mRNA的降解机制

细胞中不同的ｍ ＲＮＡ 半寿期差异很大,ｍ ＲＮＡ 的稳定性受到多种因素的影响,现在已经发现了许多对ｍ ＲＮＡ 的稳定性有影响的顺式因子和反式因子。大量的研究证明在真核细胞内存在复杂的机制调节ｍ ＲＮＡ 的稳定与降解及其所引起的基因表达。现在可以肯定在真核细胞中至少存在着三种ｍ ＲＮＡ的降解方式：依赖于脱腺苷酸的降解,无义密码介导的ｍ ＲＮＡ 的降解和核酸内切酶的水解。其中依赖于脱腺苷酸的降解方式是细胞内大多数ｍ ＲＮＡ 降解的主要途径。     

依赖细胞骨架的 mRNA 定位

mRNA定位是产生细胞极性的一种重要机制,在卵母细胞发生、早期胚胎发育及某些细胞特定功能的建立和维持中起重要作用。沿细胞骨架进行mRNA的主动转运是mRNA定位的主要机制之一,在mRNA的运输和锚定过程中,定位元件、特异的RNA结合蛋白、发动蛋白和细胞骨架分别起着重要的作用。     

胰岛素样生长因子-Ⅰ受体和LH受体mRNA在黄体中的表达及调节

研究了大鼠卵巢黄体中胰岛素样生长因子-Ⅰ受体(IGF-ⅠR)与促黄体激素受体(LHR)的表达关系及调节. 在动情周期中, LHR阳性黄体能表达高水平的IGF-ⅠR mRNA. 动情期黄体的LHR表达水平降低, 而IGF-ⅠR表达仍较高. 假孕第1天黄体中LHR表达较低,第8天达最高水平, 第14天表达已降低到检测不到的程度. 与LHR表达不同, 在第1天假孕黄体中IGF-ⅠR的表达已较高, 此后至第14天在黄体中均检测到IGF-ⅠR信号. 孕鼠黄体同时表达LHR 和IGF-ⅠR mRNA. IGF-Ⅰ刺激LHR mRNA在黄体中的表达. 前列腺素(PG)F抑制IGF-ⅠR和LHR的表达. PGE2能消除PGF对IGF-ⅠR和LHR mRNA表达的抑制作用. 上述结果提示:IGF-Ⅰ可能通过其受体的表达变化参与调节黄体功能、维持黄体结构. PGF抑制IGF-ⅠR的表达可能是黄体萎缩的机制之一.     

人基因中密码子前后碱基使用与蛋白质结构

对６２个人基因中编码蛋白质各类二级结构（α－螺旋、β－折叠片、无规卷曲和回折）的密码子前后碱基的使用情况进行统计分析和比较,发现多数密码子前后碱基的使用有一定偏向,而且这些偏向与蛋白质的二级结构有关联。这同时亦提示,同义密码子的选用与蛋白质的二级结构有一些关联。结果对于蛋白质结构预测算法以及基因工程的研究有辅助作用。