幽门螺杆菌的基因分型方法及其应用

近几年,有关幽门螺杆菌（ＨＰ）基因分型方法及其应用的研究取得了很大进展。基因分型方法包括：质粒分型、限制性内切酶分型（ＲＥＡ）、核糖分型、染色体ＤＮＡ脉冲场凝胶电泳（ＰＦＧＥ）分型、多聚酶链反应限制性内切酶消化（ＰＣＲ－ＲＦＬＰ）分型、任意引物ＰＣＲ（ＡＰ－ＰＣＲ）分型、ＰＣＲ单链构型多态性（ＰＣＲ－ＳＳＣＰ）分型和核苷酸序列分析等。基因分型方法广泛用于ＨＰ的研究,如基因图的构建、感染复发、耐药机     

原位聚合酶链式反应

原位聚合酶链式反应黄建生,王昌才（第一军医大学分子生物学研究所,广州５１０５１５）关键词原位ＰＣＲ原位聚合酶链式反应（ＩｎＳｉｔｕＰＣＲ,ＩＳＰＣＲ）是由Ｈａａｓｅ等于１９９０年首创,当时称为“细胞内ＰＣＲ”（ＩｎＣｅｌｌＰＣＲ）。顾名思义,该方法就...     

应用套式PCR选择性卡他热病毒在不同动物体内变异的研究

应用本实验建立的三组套式ＰＣＲ（ＰＣＲ１、２、３）和一组以前报道的套式ＰＣＲ（ＰＣＲ４）,对５９份外周血淋巴细胞（ＰＢＬ）ＤＮＡ样品进行了恶性卡他病毒核酸序列的检测。这些样品来自５１只羊,以及与羊接触而发病的６头牛和２只鹿。除ＰＣＲ４外,其它三组ＰＣＲ都能扩增现有４个角马型ＭＣＦＶ分离株。有６只羊在４组ＰＣＲ中都呈阴性,其余５３份样品经ＰＣＲ４检测均呈阳性。ＰＣＲ１只有从４５只羊体检出ＭＣＦＶＤＮ     

扩增大段靶DNA的PCR方法

扩增大段靶ＤＮＡ的ＰＣＲ方法陈尚武,王章（中山大学生命科学学院,广州）ＰＣＲ和分子克隆是扩增遗传物质的常用技术。热稳定Ｔａｑ（Ｔｈｅｒｍｕｓａｑｕａｔｉｃｕｓ）ＤＮＡ聚合酶的应用以及ＰＣＲ技术所固有的迅速、简便、廉价等优点,使ＤＮＡ片段的ＰＣＲ扩增成...     

原位多聚酶链反应在人巨细胞病毒诊断中的应用

逝年来人巨细胞病毒（ＨＣＭＶ）感染率高,检测方法进展人,有巨细胞包涵体细胞（ＣＣＩＣ）检测、病毒分离、免疫检测、原位杂交（ＩＳＨ）、多聚酶链反应（ＰＣＲ）等法。目前有人把ＩＳＨ与ＰＣＲ结合创立了原位多聚酶链反应法（ＩＳＰＣＲ）,此法更准确、更敏感特异,更有地ＨＣＭＶ感染的早期快速诊断。本文就ＩＳＰＣＲ的原理、程序、特征主临床应用作一综述。     

定量多聚酶链反应及其在医学中的应用

定量多聚酶链反应（ＱＰＣＲ）是一种简便、快速的核酸定量方法,其中竞争性ＰＣＲ（ＣＰＣＲ）是最精确,也是目前研究最多的一种方法。本文概括介绍了ＣＰＣＲ的原理、方法及发展趋势,讨论了ＱＰＣＲ在病毒感染与疾病的发生、发展的关系,抗病毒性治疗监控及疾病传播等方面的应用,对其在免疫学、肿瘤学及其他方面的应用作了简要综述,     

应用套式PCR对恶性卡他热病毒在不同动物体内变异的研究

应用本实验建立的三组套式ＰＣＲ（ＰＣＲ１、２、３）和一组以前报道的套式ＰＣＲ（ＰＣＲ４）,对５９份外周血淋巴细胞（ＰＢＬ）ＤＮＡ样品进行了恶性卡他热病毒（Ｍａｌｉｇｎａｎｔｃａｔａｒｒｈａｌｆｅｖｅｒｖｉｒｕｓ,ＭＣＦＶ）核酸序列的检测。这些样品来自５１只羊,以及与羊接触而发病的６头牛和２只鹿。除ＰＣＲ４外,其它三组ＰＣＲ都能扩增现有４个角马型ＭＣＦＶ分离株。有６只羊在４组ＰＣＲ中都呈阴性,其余５３份样品经ＰＣＲ４检测均呈阳性。ＰＣＲ１只能从４５只羊体检出ＭＣＦＶＤＮＡ,未能从牛和鹿体检出病毒ＤＮＡ。ＰＣＲ２检测的所有样品均呈阴性。在ＰＣＲ３扩增中,除２头牛外,其它５１份样品均呈阳性。通过Ｓｏｕｔｈｅｒｎ杂交和限制性酶切分析,对ＰＣＲ１－４产物的特异性进行了鉴定。此外,敏感性实验表明,四组ＰＣＲ的差异也不明显。因此,本实验结果说明ＭＣＦＶ基因组在不同种动物之间发生了变异,羊体内的变异株可能是导致其它反刍动物发病的病原     

提高SCA2编码区CAG三核苷酸重复的PCR扩增效率

以遗传性脊髓小脑共济失调Ⅱ型基因（ｓｐｉｎｏｃｅｒｅｂｅｌｌａｒ ａｔａｘｉａ ｔｙｐｅⅡｇｅｎｅＳＣＡ２）编码区内的ＣＡＧ三核苷酸重复为研究对象（Ｇ＋Ｃ含量为６９．２％）,比较了热启动ＰＣＲ、碱基替代ＰＣＲ、添加增效剂（１％－１２．５％二甲亚砜、１％－２５％甘油、１％－１２．５％甲酰胺）与常规ＰＣＲ的扩增效率,发现热启动ＰＣＲ、碱基替代ＰＣＲ及添加增效剂（１％－１０％二甲亚砜、５％－２０％甘油、     

应用循环逆转录PCR技术检测丙型肝炎病毒RNA

循环逆转录（ｃｉｒｃｕｌａｔｏｒｙ ｒｅｖｅｒｓｅ ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎ,ＣＲＴ）是线性增长逆转录ｃＤＮＡ产量的一种新技术。为了将该技术用于检测ＨＣＶ ＲＮＡ,通过改变ＣＲＴ的循环次数,结合竞争ＰＣＲ,作出标准曲线。采用１６次ＣＲＴ加３４次循环ＰＣＲ检测了１３６例ＨＣＶ ＥＬＩＳＡ阳性、５４例ＨＣＶ ＥＬＩＳＡ阴性和１０８例临床可疑病人全血标本,并与逆转录ＰＣＲ（ＲＴ－ＰＣＲ）和巢式ＰＣＲ（     

鼻咽癌Epstein—Barr病毒受体（EBVR／CR2）基因的病毒结合区的序列测定

Ｅｐｓｔｅｉｎ－Ｂａｒｒ病毒（ＥＢＶ）进入鼻咽上皮细胞的途径,是人们研究ＥＢＶ与鼻咽癌（ＮＰＣ）的病因关系时所必须回答的一个问题。用抗ＥＢＣ受体（ＥＢＶＲ／ＣＲ２）单抗检测上皮细胞中该受体的表达已有报道,但对上皮细胞中ＥＢＶＲ／ＣＲ２的基因结构仍需研究。我们采用ＰＣＲ扩增和不对称ＰＣＲ直接测序法,首次检测了１０例ＮＰＣ及３例正常人胚鼻咽上皮（Ｈｕｍａｎ ｅｍｂｒｙｏｎｉｃ ｎａｓｏｐｈａｒｙｎｇｅ     

中国人雄激素受体N端转示激活区的测序及突变检测

雄激素受体（ａｎｄｒｏｇｅｎ ｒｅｃｅｐｔｏｒ,ＡＲ）Ｎ端转录激活功能区（ＡＦ１）是ＡＲ发挥转录激活所必需的。用４对引物（Ａ３－Ａ４）ＰＣＲ扩增２０例中国正常男性ＡＲ的ＡＦ１,双链ＤＮＡ循环测序以确定正常中国人ＡＲ的ＡＦ１的核苷酸顺序。在此基础上,用ＰＣＲ－ＳＳＣＰ分析和双链ＤＮＡ循环测序法对２例雄激素抵抗征（ＡＩＳ）患者外周血白细胞和１５例前列腺癌（ＰＣ）患者癌组织中ＡＲ的ＡＦ１区进行突变检测。     

PCR和生物素探针对HFRSV的检测和分型的探讨

分析比较肾综合征出血热病毒（ＨＦＲＳＶ）７６／１１８株和Ｒ＿（２２）株的核苷酸序列,根据引物设计原则及检测分型的目的,设计并合成了３对引物。１对引物取于两毒株间的高同源区段,作为共同引物和外引物;另两对引物取于两毒株间的低同源区段,分别作为野鼠型引物、家鼠型引物和内引物。建立了ＤＮＡ聚合酶链反应（ＰＣＲ）和ＮｅｓｔＰＣＲ方法,并用ＮｃｓｔＰＣＲ合成了两种型特异的生物素探针。ＰＣＲ检测７６／１１８、Ａ＿９、陈、Ｒ＿２、Ｒ＿２２５个毒株,用外引物时均扩增出１条约３００ｂｐ的条带;用内引物的野鼠型引物时,除Ｒ＿（２２）株之外,其余４株均扩增出１条约７０ｂｐ的条带。斑点杂交试验证实了ＰＣＲ检测分型的准确性。ＮｅｓｔＰＣＲ和生物素探针斑点杂交试验可以测出１－１０ｂｇ的目的ｃＤＮＡ。     

多聚酶链反应在细菌性腹泻病诊断中的应用

为了解国外多聚酶链反应（ＰＣＲ）技术在细菌性腹泻病诊断中的应用，本文就ＰＣＲ检测各种腹泻致病菌，一次性ＰＣＲ检测多种腹泻致病菌，ＰＣＲ用于各种腹泻致病菌种属、群及亚群的分类及其检测中所遇到的抑制物处理分别进行综述。     

逆转录——聚合酶链反应技术诊断丙型肝炎病毒感染

本文采用逆转录－聚合酶链反应（ＲＴ－ＰＣＲ）技术对２１２例住院及门诊病人其中肝病患者９８例（慢性肝炎４３例、肝炎后肝硬化４７例、原发性肝细胞癌８例）进行ＨＣＶ－ＲＮＡ检测。结果９８例慢性肝病患者血清中ＨＣＶ－ＲＮＡ－ＰＣＲ阳性２７例（２７．６％）,１１４例非肝病患者血清中ＨＣＶ－ＲＮＡ－ＰＣＲ阳性９例（７．９％）,两组间差异非常显著（Ｐ〈０．０１）,各种肝病患者的ＨＣＶ－ＲＮＡ－ＰＣＲ阳性率均高于     

应用反转录—聚合酶链反应检测口蹄疫病毒

建立了一种适用于检测动物（猪、牛、羊）组织（肌肉、淋巴结、脊髓、扁桃体和蹄冠皮）和牛食道－咽部分泌物（Ｏ－Ｐ液）中的口蹄疫（ＦＭＤ）病毒核酸（ＲＮＡ）的反转录－聚合酶链反应（ＲＴ－ＰＣＲ）技术。引物对是人工合成的两条２０ｍｅｒ寡核苷酸片段,它们的序列相应于ＦＭＤ病毒结构蛋白ＶＰ１基因后２／３区段,在４个血清型之间基本一致（保守）。ＰＣＲ产物经琼脂糖凝胶电泳检测。试验结果表明,ＲＴ－ＰＣＲ具有良好的     

逆转录-聚合酶链反应技术诊断丙型肝炎病毒感染

本文采用逆转录－聚合酶链反应（ＲＴ-ＰＣＲ）技术对２１２例住院及门诊病人其中肝病患者９８例（慢性肝炎４３例、肝炎后肝硬化４７例、原发性肝细胞癌８例）进行ＨＣＶ－ＲＮＡ检测。结果９８例慢性肝病患者血清中ＨＣＶ-ＲＮＡ-ＰＣＲ阳性２７例（２７．６％）,１１４例非肝病患者血清中ＨＣＶ-ＲＮＡ-ＰＣＲ阳性９例（７．９％）,两组间差异非常显著（Ｐ（０．０１）,各种肝病患者的ＨＣＶ-ＲＮＡ-ＰＣＲ阳性率均高于非肝病组。６８例患者同时进行了ＨＣＶ-ＲＮＡ-ＰＣＲ检测和抗－ＨＣＶ检测,２５例抗－ＨＣＶ阳性的患者中ＨＣＶ－ＲＮＡ-ＰＣＲ,２１例阳性（８４％）,４３例抗－ＨＣＶ阴性的患者中ＨＣＶ-ＲＮＡ-ＰＣＲ,９例阳性（２０．１％）、有输血及血制品史者４８例,其中ＨＣＶ-ＲＮＡ-ＰＣＲ阳性１６例（３３．３％）,１６４倒无输血史者中ＨＣＶ-ＲＮＡ-ＰＣＲ阳性２０例（１２．２％）,两组间差异非常显著（Ｐ（０．０１）。结果表明：１．ＨＣＶ感染与慢性肝病有密切联系,说明ＨＣＶ感染是慢性肝炎、肝硬化、肝癌的致病因素;２．ＨＣＶ-ＰＣＲ法具有特异性好、灵敏度高、简便快速等特点,弥补了抗－ＨＣＶ检测的不足之处,是目前确定ＨＣＶ感染的主要手段;３．ＨＣＶ感染与输血关系密切,因此对献血员进行常规ＨＣＶ检测对预防由输血所致ＨＣＶ感染有着极其重要的临床意义。     

套式PCR检测婴幼儿巨细胞病毒感染

本文采用套式ＰＣＲ（Ｎｅｓｔｅｄｐｏｌｙｍｅｒａｓｅｃｈａｉｎｒｅａｃｔｉｏｎ）技术对６１例婴儿肝炎综合征（Ｎｅｏｎａｔａｌｈｅｐａｔｉｔｉｓ）患者进行了ＨＣＭＶ（Ｈｕｍａｎｃｙｔｏｍｅｇａｌｏｖｉｒｕｓ）检测,结果表明,当只用一对引物进行ＰＣＲ时,检出３３例患者为ＨＣＭＶ阳性,阳性检出率为５４．１％;而采用套式ＰＣＲ后,有１７例为ＨＣＭＶ阳性,阳性检出率提高到７７．０％。可见套式ＰＣＲ方法的阳性检出率明显高于单一ＰＣＲ,并远高于目前使用的其它方法。同时也说明ＨＣＭＶ是导致肝炎综合征的主要病原体之一。此外,灵敏性和特异性试验表明,套式ＰＣＲ技术的敏感度高、特异性强、简单快速,在临床检测和诊断中具有很大的潜力。     

黑麦染色体的显微分离与PCR扩增

利用改良的染色体显微分离技术,分离了黑麦（ＳｅｃａｌｅｃｅｒｅａｌｅＬ．）一个完整细胞的１８条染色体（１４Ａ＋４Ｂ）,用人工合成的寡核苷酸为引物,进行单一引物法（ｓｉｎｇｌｅｕｎｉｑｕｅｐｒｉｍｅｒＰＣＲ,ＳＵＰＰＣＲ）扩增,经Ｓｏｕｔｈｅｒｎ杂交证明,ＰＣＲ扩增产物与黑麦基因组ＤＮＡ同源。     

超高忠实性PCR用DNA聚合酶

ＰＣＲ（ＰｏｌｙｍｅｒａｓｅＣｈａｉｎＲｅａｃｔｉｏｎ）法已在生物工程领域得到了广泛的应用,而ＰＣＲ法的推广完全得益于Ｔａｑ耐热性ＤＮＡ聚合酶。近年来,ＰＣＲ法的应用除生物工程领域外,已应用至工业、农业、医学、制药等与人们生活息息相关的各个领域。随着ＰＣＲ法的不断推广,人们对ＤＮＡ聚合酶的忠实性（Ｆｉｄｅｌｉｔｙ）要求越来越高,一般来说,ＴａｑＤＮＡ聚合酶在进行ＰＣＲ延伸反应过程中的错配率为０．５％左右。ＴａＫａＲａ公司独自研制成功的ＰｙｒｏｂｅｓｔＤＮＡ聚合酶是一种来源于Ｐｙｒｏｃｏｃｃｕｓｓ…     

PCR产物克隆方法的新进展

ＰＣＲ产物克隆方法的新进展陈尚武,马涧泉（中山医科大学生化教研室．广州）随着ＰＣＲ技术的发展和普及,克隆ＰＣＲ产物已广泛应用于分子生物学的各个领域。通常ＰＣＲ产物不具有粘端,只能进行平端连接的克隆,由于ＴａｑＤＮＡ聚合酶具有非模板依赖性末端转移酶活性...