TRIM29在肿瘤中的研究进展

TRIM29蛋白属于TRIM蛋白家族,是一种E3泛素连接酶,它在肿瘤的增殖、侵袭转移、耐药及肿瘤免疫中都具有十分重要的作用,且其功能具有细胞和组织特异性.TRIM29蛋白可通过与p53的相互作用促进肿瘤细胞的增殖;通过促进肿瘤细胞上皮-间质转化、激活经典的Wnt信号通路等增强肿瘤细胞的侵袭转移能力.高表达的TRIM29...     

TRIM在肿瘤发生发展中的作用

三结构域(tripartite motif,TRIM)蛋白质家族成员几乎存在于所有多细胞真核生物中,它们在细胞周期、细胞凋亡、分化、代谢以及病毒的免疫应答等过程中均有重要作用,因而被广泛研究。同时,TRIM家族蛋白质在肿瘤中的作用也逐渐引起研究者的重视。该文通过讨论TRIM家族蛋白质作为泛素E3连接酶,调节核受体和p53通路等生物学功能来阐明TRIM与肿瘤发生发展的关系。     

TRIM72蛋白结构及功能研究进展

TRIM72蛋白是一个新发现的三重基序(tripartite motif,TRIM)家族蛋白,它由一个RING finger、一个B-box motif、一个coiled-coil region和羧基端的一个PRY-SPRY结构域构成。TRIM72蛋白在肌肉组织中参与肌细胞损伤后的膜修复过程,在心脏中参与抵抗心脏缺血/再灌注损伤等,并与肌细胞中的胰岛素信号通路之间存在关联性。虽然它仅在骨骼肌和心肌中特异性表达,但人们在一些其他种类的细胞中也观察到它的生理功能。此文从结构和功能的角度介绍TRIM72蛋白的研究进展,并针对TRIM72蛋白未来的研究和应用等方面进行了初步讨论。     

TRIM 9在疾病中的作用研究进展

三基序蛋白9(tripartite motif 9, TRIM 9)是一种大脑特有的E3泛素连接酶,与E2泛素结合酶协同工作。泛素系统是翻译后修饰的系统之一,它不仅是蛋白酶体降解靶蛋白的标志物,也是蛋白质相互作用和酶激活的调节因子。TRIM蛋白在很多生理学过程,包括细胞增殖、细胞凋亡、DNA修复、信号转导、先天免疫和致癌等中发挥重要的作用。目前针对TRIM 9蛋白的研究较少,已知该蛋白体内表达异常与多种疾病密切相关,其失调会导致癌症、免疫性疾病或发育障碍等。该文主要阐述了TRIM 9蛋白在疾病中的作用及其作为疾病诊断的新兴生物标志物之一,为其在临床领域的深入研究奠定理论基础。     

大黄鱼TRIM25基因克隆和表达分析

三重基序蛋白25 (Tripartite motif-containing protein 25, TRIM25)属于E3泛素连接酶家族, 在先天免疫反应中发挥重要作用。为研究TRIM25基因在大黄鱼(Larimichthys crocea)先天抗病毒免疫反应中的作用, 研究鉴定并克隆大黄鱼TRIM25基因(命名为LcTRIM25)。LcTRIM25基因编码序列2097 bp (GenBank登录号: MK327541), 编码698个氨基酸。蛋白结构域预测发现LcTRIM25包括保守的RING结构域、B-box2结构域、Coiled-coil结构域和可变的C末端PRY/SPRY结构域。多序列比对以及系统进化树分析表明LcTRIM25基因与斜带石斑鱼同源性高, 与哺乳动物、爬行动物、两栖动物和鸟类同源性相对低, 这说明不同物种受到来自环境不同的选择压力, 导致进化程度不同。应用实时荧光定量PCR方法分析大黄鱼TRIM25基因的表达水平。结果分析发现LcTRIM25基因在健康大黄鱼的9个组织中均有广泛表达, 且在肝脏中表达量最高, 在心脏中表达量最低。在poly(I:C)刺激后, 在外周血、头肾、脾脏和肝脏中LcTRIM25基因表达量迅速且明显上调, 均出现上升达到峰值后下降的趋势。LcTRIM25基因表达量在头肾和脾脏中6h达到最高表达量, 在肝脏中12h达到峰值, 外周血中在24h达到最高表达量。上述结果表明, 不同组织中LcTRIM25基因表达模式具有差异性。研究结果推测大黄鱼TRIM25基因参与抗病毒免疫反应且发挥十分关键的作用, 为进一步了解大黄鱼抗病毒免疫机制提供理论基础。     

草鱼TRIM32基因克隆表达及功能研究

TRIM (Tripartite-motif protein) 家族是机体先天性免疫的重要成员, 参与细胞增殖分化、细胞凋亡、肿瘤抑制、抗病毒等过程。为了进一步探究TRIM蛋白在鱼类免疫中的作用, 实验利用PCR方法克隆了草鱼TRIM32基因的编码区全长, 共1980 bp, 编码660个氨基酸。草鱼TRIM32具有TRIM家族典型的3个结构域, 与斑马鱼TRIM32的核苷酸序列同源性较高, 遗传进化分析也聚为一支。间接免疫荧光、Western-blotting检测结果显示草鱼TRIM32在EPC细胞中成功表达, 主要以点状分布在细胞质中, 细胞核中表达量较少; 组织分布分析表明TRIM32在被检测的11个组织中均有表达, 其中在头肾组织中的表达量明显高于其他组织; 不同胚胎发育时期的表达分析进一步表明, TRIM32在受精卵时期、卵裂期和囊胚期的表达量显著高于其他时期(P<0.05), 随后表达量下降, 直到出膜后表达量再次显著性升高。此外, 双荧光素酶检测系统显示TRIM32能够激活NF-κB信号通路, 诱导下游的炎症反应。结果显示, 草鱼TRIM32广泛分布于鱼体内, 并参与机体的天然免疫反应, 对于抵抗病原体的入侵具有重要作用。     

Hsp70 Interacts with the Retroviral Restriction Factor TRIM5�� and Assists the Folding of TRIM5��

Tripartite motif (TRIM) protein TRIM5α has been shown to restrict human immunodeficiency virus, type 1 infection in Old World monkey cells at the early post-entry step by poorly understood mechanisms. Currently, the physiological function of TRIM5α is not known. In this study, we showed that transiently overexpressed TRIM5α causes a morphological change in HEK293T cells. A proteomics analysis of the protein complexes that were pulled down with hemagglutinin-tagged TRIM5α suggested that the heat shock protein 70 (Hsp70) may serve as a TRIM5α-binding partner. The interaction between Hsp70 and TRIM5α was confirmed by co-localization and co-immunoprecipitation assays. Co-expression of Hsp70 reversed the TRIM5α-induced morphological change in HEK293T cells. Another heat shock protein Hsc70 also bound to TRIM5α, but unlike Hsp70, Hsc70 was not able to reverse the TRIM5α-induced morphological change, suggesting that Hsp70 specifically reverses the morphological change caused by TRIM5α. Studies using a series of TRIM5α deletion mutants demonstrate that, although the PRYSPRY domain is critical for binding to Hsp70, the entire TRIM5α structure is necessary to induce the morphological change of cells. When the ATPase domain of Hsp70 was mutated, the mutated Hsp70 could not counteract the morphological change induced by TRIM5α, indicating that the catalytic activity of Hsp70 protein is important for this function. Co-expression of Hsp70 elevated the levels of TRIM5α in the detergent-soluble fraction with a concomitant decrease in the detergent-insoluble fraction. Together these results suggest that Hsp70 plays critical roles in the cellular management against the TRIM5α-induced cellular insults.     

恒河猴TRIM5α的组织分布及不同刺激促进PBMC中TRIM5α转录水平的上调

TRIM5α(tripartite motif protein 5-alpha)蛋白是恒河猴体内一种非常重要的限制因子,能抑制人免疫缺陷病毒(HIV-1, human immunodeficiency virus type 1)、马感染性贫血病毒(EIAV, equine infectious anemia virus)和猫免疫缺陷病毒 (FIV, feline immunodeficiencyvirus)等逆转录病毒的复制。恒河猴TRIM5α的组织分布以及在受到外界刺激时TRIM5α mRNA表达量的变化研究还未见报道。本研究从中国恒河猴的各组织中提取总RNA,以β-actin基因作为内参照,通过半定量RT-PCR检测各组织中TRIM5α mRNA的表达。选择HIV-GFP-VSVG假病毒感染外周血单核细胞（peripheral blood mononuclear cell,PBMC）,非特异性刺激剂——佛波脂(Phorbol myfismte acetate,PMA)+离子霉素(ionomycin,Ion)及CD28抗体+CD49d抗体分别共刺激恒河猴PBMC,研究不同刺激对恒河猴TRIM5α mRNA表达水平的影响。结果表明：TRIM5α mRNA表达于所研究的恒河猴21种组织中,免疫系统和泌尿生殖系统组织中表达量最高,而神经系统组织,如大脑、脊髓中表达较少,其他组织中未见明显的表达差异;HIV-GFP-VSVG感染和用PMA+Ion、CD28抗体+CD49d抗体分别共刺激PBMC能促进 PBMC中TRIM5α mRNA的转录水平的上调。     

TRIM家族蛋白在病毒感染中作用的研究进展

三基序蛋白家族(tripartite motif,TRIM)是参与不同细胞功能的一大类具有E3泛素连接酶活性的蛋白质，在宿主抗病毒免疫应答中发挥着重要的作用。TRIM家族蛋白可通过提高宿主固有免疫应答或直接降解病毒蛋白发挥抗病毒活性；部分病毒有时也可利用TRIM家族蛋白调控细胞因子表达促进自身感染。本文综述了TRIM家族蛋白在病毒复制中的作用及相关机制的研究进展，为研究病毒感染机制提供参考。     

人TRIM28基因及蛋白质的生物信息学分析

[目的]通过生物信息学预测分析人TRIM28基因的启动子及蛋白质的理化性质、信号肽、亲疏水性、跨膜区域、蛋白结构、与之相互作用的蛋白质及功能。[方法]使用相应软件分析TRIM28相关信息。[结果]TRIM28的3个启动子中第一个通过甲基化对其表达影响较深;TRIM28蛋白质是由835个氨基酸组成的无信号肽、无跨膜结构的不稳定亲水蛋白质,等电点为5.52,哺乳动物中高度保守;二级结构包括10个α螺旋和12个β折叠片层,三级结构构建需更多可靠的模板;TRIM28主要定位于细胞核,自身及相互作用蛋白质主要参与染色质修饰及DNA损伤修复过程。[结论]TRIM28第一个启动子甲基化影响其表达,蛋白质无信号肽、无跨膜结构、不稳定系数高达46.43,属不稳定亲水蛋白质,定位细胞核,参与染色质修饰和DNA损伤修复。     

熊猴存在TRIM5/TRIMCyp杂合子基因型

缺乏合适的动物模犁是制约艾滋病研究取得重大突破的关键瓶颈之一.细胞内的抗病毒蛋白被称为限制因子.研究不同灵长类动物抗HIV-1宿主限制因子的存在形式及作用机制对建立合适AIDS灵长类动物模型有十分重要的意义.TRIM5α是哺乳动物细胞中一种重要和关键的限制因子,它以物种依赖的方式限制包括HIV-1在内的逆转录病毒的感染.TRIM5-CypA融合基因是存在于新大陆猴与旧大陆猴中的一种独特的TRIM5基因形式.为了研究不同灵长类动物TRIM5基因的存在方式,该文对熊猴、藏婀猴、红面猴及中闰恒河猴4个物种共110只灵长类动物进行了TRIM5-CypA融合模式的研究.首次发现熊猴也存在TRIM5-CypA基因融合现象.熊猴TRIMCyp融合基因形成模式类似于北平顺猴TRIMCyp融合基因模式,即CypA假基因的cDNA序列通过逆转座方式插入到TRIM5基凶的3'-UTR区域.基因序列分析表明,该基因与北平顶猴相应基因序列高度相似;并且其TRIM5内含子6的3'-剪接位点也相应存存G-to-T突变现象(G/T).这提示熊猴也极有可能像北平顶猴一样表达TRIM5-CypA融合蛋白,从而导致熊猴可能跟北平顶猴一样可能被HIV-1感染.因此,熊猴极有希望成为一种新的HIV/AIDS灵长类动物模型.     

TRIM5α Modulates Immunodeficiency Virus Control in Rhesus Monkeys

The cytoplasmic TRIM5α proteins of certain mammalian lineages efficiently recognize the incoming capsids of particular retroviruses and potently restrict infection in a species-specific manner. Successful retroviruses have evolved capsids that are less efficiently recognized by the TRIM5α proteins of the natural hosts. To address whether TRIM5α contributes to the outcome of retroviral infection in a susceptible host species, we investigated the impact of TRIM5 polymorphisms in rhesus monkeys on the course of a simian immunodeficiency virus (SIV) infection. Full-length TRIM5α cDNAs were derived from each of 79 outbred monkeys and sequenced. Associations were explored between the expression of particular TRIM5 alleles and both the permissiveness of cells to SIV infection in vitro and clinical sequelae of SIV infection in vivo. Natural variation in the TRIM5α B30.2(SPRY) domain influenced the efficiency of SIVmac capsid binding and the in vitro susceptibility of cells from the monkeys to SIVmac infection. We also show the importance in vivo of the interaction of SIVmac with different allelic forms of TRIM5, demonstrating that particular alleles are associated with as much as 1.3 median log difference in set-point viral loads in SIVmac-infected rhesus monkeys. Moreover, these allelic forms of TRIM5 were associated with the extent of loss of central memory (CM) CD4+ T cells and the rate of progression to AIDS in the infected monkeys. These findings demonstrate a central role for TRIM5α in limiting the replication of an immunodeficiency virus infection in a primate host.     

Ovine TRIM5α Can Restrict Visna/Maedi Virus

The restrictive properties of tripartite motif-containing 5 alpha (TRIM5α) from small ruminant species have not been explored. Here, we identify highly similar TRIM5α sequences in sheep and goats. Cells transduced with ovine TRIM5α effectively restricted the lentivirus visna/maedi virus DNA synthesis. Proteasome inhibition in cells transduced with ovine TRIM5α restored restricted viral DNA synthesis, suggesting a conserved mechanism of restriction. Identification of TRIM5α active molecular species may open new prophylactic strategies against lentiviral infections.     

Inhibitory effect of human TRIM5α on HIV-1 production

Tripartite motif-containing 5 isoform-α (TRIM5α), a host restriction factor, blocks infection of some retroviruses at a post-entry, pre-integration stage in a species-specific manner. A recent report by Sakuma et al. describes a second antiretroviral activity of rhesus macaque TRIM5α, which blocks HIV-1 production through rapid degradation of HIV-1 Gag polyproteins. Here, we find that human TRIM5α limits HIV-1 production. Transient expression of TRIM5α decreased HIV-1 production, whereas knockdown of TRIM5α in human cells increased virion release. A single amino acid substitution (R437C) in the SPRY domain diminished the restriction effect. Moderate levels of human wild-type TRIM5α and a little amount of R437C mutant were incorporated into HIV-1 virions. The R437C mutant also lost restriction activity against N-tropic murine leukemia virus infection. However, the corresponding R to C mutation in rhesus macaque TRIM5α had no effect on the restriction ability. Our findings suggest human TRIM5α is an intrinsic immunity factor against HIV-1 infection. The importance of arginine at 437 aa in SPRY domain for the late restriction is species-specific.     

利用TALEN技术建立恒河猴TRIM5α基因突变细胞株

利用TALEN技术建立恒河猴TRIM5α基因突变细胞株,为进一步研究TRIM5α基因的功能奠定基础。构建针对TRIM5α打靶基因的TALEN,通过点突变的方法获得包含TRIM5α第7个外显子中打靶位点1 211-1 224的基因序列并构建点突变donor载体。将打靶TRIM5α基因的TALEN质粒和donor质粒电转入恒河猴肾细胞(LLC-MK2)中,无限稀释法获得单克隆细胞系,通过抽提基因组DNA,再利用PCR技术扩增目标序列并测序筛选出TRIM5α碱基缺失(1 215-1 216)和点突变(1 213-1 215,1 217)的细胞系。通过共转TALEN质粒和点突变的donor质粒筛选获得了TRIM5α基因敲除和TRIM5α基因点突变的LLC-MK2细胞系。     

人天然免疫基因TRIM5α的序列及进化分析

目的：克隆人TRIM5α基因,对其编码序列进行分析,并进行分子进化研究。方法：以HeLa细胞cDNA为模板,用RT-PCR方法克隆人TRIM5α基因,与人基因组序列对比分析其结构;用BioEdit、Genedoc和MEGA4.1软件进行蛋白序列联配和进化分析。结果：扩增了长1482bp的人TRIM5α基因片段,序列分析表明其覆盖了完整编码框,编码由493个氨基酸残基组成的人TRIM5α蛋白;人TRIM5α蛋白与黑猩猩、大猩猩、猩猩、猕猴TRIM5α蛋白的相似度分别为98.2%、96.8%、93.7%和87.6%。结论：克隆了人TRIM5α基因,为进一步研究该基因的功能奠定了基础。