四株鸡有益链球菌的分离鉴定

用厌氧菌增菌培养基（ＢＲ）、厌氧菌血琼脂（ＣＤＣ）、选择乳酸杆菌培养基（ＬＢＳ）从鸡直肠内容物中分离出四株革兰氏阳性链球菌,据分离菌的形态、染色和培养特性及生化试验结果,鉴定为牛粪链球菌两株（Ｓｂ１、Ｓｂ２）,尿链球菌两株（Ｓｆ１、Ｓｆ２）。四株菌对雏鸡安全,无致病性和副作用,对头孢三嗪、复方新诺明耐药。     

肺炎链球菌血清型鉴定和分子鉴定方法研究进展

肺炎链球菌(Streptococcuspneumoniae,SP)通常又称为肺炎球菌,是肺炎、脑膜炎和其他侵入性疾病的主要病原菌,同时也是造成5岁以下儿童高发病率和死亡率的最常见的病原菌.准确鉴定出SP的血清型,对于肺炎球菌性疾病的诊治具有重要的意义.在我国,由于实验室检测水平在不同地区、医院及科室间差异较大以及表型检...     

孕妇产道B群链球菌的调查报告

由B群链球菌引起的脑膜炎、肺炎及败血症严重威胁新生儿的生命。其传染源为产妇产道。本文采集143例临产孕妇消毒前的产道拭子及32例新生儿口咽部拭子,经增菌后培养在羊血平板,用生化方法及SPA血清分群法对疑似链球菌体鉴定。孕妇标本B群链球菌的检出率为11.2%,其他链球菌有D群、G群及草绿色链球菌。新生儿标本几乎都无细菌生长。纲菌鉴定方法以SPA法优于生化法。笔者认为由于B群链球菌在临床上的重要性,该菌的分离培养及鉴定应在实验室受到重视。     

PCR-SSP分型检测上海汉族人群HLA-Cw位点血清学和非血清学鉴定的等位基因

应用补体介导的微量淋巴细胞毒实验可检出ＨＬＡＣｗ１～１０,但有２０％～５０％的空白（ｂｌａｎｋ）不能检出。利用ＰＣＲＳＳＰ对７０例上海汉族样本进行ＨＬＡＣｗ等位基因分型,首次在中国汉族人群中检出Ｃｗ１２０１／１２０２、１２０３、１３０１、１４、１６０１、１６０２、１７０１等非血清学鉴定的抗原,并对血清学鉴定抗原的基因进行分型,依次为Ｃｗ０１、０２、０３０２／０３０４、０３０３、０４、０５０１、０６０２、０７０１／０７０２／０７０３及０８。ＰＣＲＳＰ分型使上海汉族人群ＨＬＡＣｗ位点空白基因频率从０．３０７下降到０．０２８。１２例样本检出Ｃｗ０８,与原来认为中国人群中Ｃｗ８罕见的观点不符。结果证明,ＰＣＲＳＳＰ用于ＨＬＡＣｗ基因分型是快速、准确的。     

奶牛瘤胃中牛链球菌的分离鉴定

采用厌氧分离技术从奶牛瘤胃中分离出1株细菌,通过对其形态、培养特性、生理生化特性、16S rRNA基因序列测定与同源性分析等研究,确定分离菌株为牛链球菌（Streptococcus bovis）,为进一步研究其对瘤胃发酵的影响奠定了基础。     

四株昭通乌天麻共生蜜环菌的生理生化特征及其分子鉴定

目的 对4株昭通乌天麻（Gastrodia elata）共生蜜环菌（Armillaria mella）的生理生化活性进行研究,并鉴定其分类地位。方法 通过测定不同碳源和氮源对蜜环菌生长的影响以及胞外酶活性,掌握该蜜环菌生理生化特性,再结合rDNA-IGS序列分析方法进行鉴定。结果 不同蜜环菌需要不同的碳源、氮源;3种胞外酶活性中木聚糖酶活性最大,其次是羧甲基纤维素酶,漆酶活性最小;供试蜜环菌与云南、贵州地区天麻共生蜜环菌以及猪苓共生蜜环菌的亲缘关系比较远。结论 蜜环菌能否作为天麻共生菌与其分类地位无关。     

国外厌氧菌快速生化鉴定系统

本文介绍了四种具有代表性的厌氧菌快速生化鉴定系统,它们是采用药纸底物的 Minitek 系统,采用干粉底物的 API-20A 系统,采用原色物质的Rap~(ID)ANA 系统和完全自动化的 AMS 系统。并对这些方法作了一些评价和比较。     

海南罗非鱼无乳链球菌分离鉴定及其特性研究

从海南省患暴发性疾病的罗非鱼(Tilapia)上分离出1株细菌HNLFYL4,对分离菌株进行了鉴定及致病性和药物敏感性研究.通过形态学观察和生理生化鉴定,结果显示,分离菌株为无乳链球菌(Streptococcus agalactiae).对分离菌株的16S rRNA基因进行PCR扩增和测序,所得序列已登录到GenBank,登录号为HQ645983,与GenBank中收录的链球菌16S rRNA 基因进行比对并构建系统进化树,结果表明,分离菌株的16S rRNA基因序列与无乳链球菌同源性高达100%,进一步确定分离菌株为无乳链球菌.人工感染显示分离菌株对小白鼠和罗非鱼均具有致病性,对小白鼠的LD50为1.0×104 CFU/mL,对体重为500g±20g的罗非鱼的LD50为1.729×109CFU/mL.分离菌株对氯霉素、青霉素G、呋喃妥因等敏感,对丁胺卡那、链霉素、卡那霉素等不敏感.     

红拟石首鱼海豚链球菌分离、鉴定及致病性研究

2001年9月-12月,浙江舟山部分网箱养殖红拟石首鱼发生了陆续死鱼,发病鱼表现为眼球突出、浑浊,失去方向性,皮肤溃疡等症状。从病鱼的肾脏和肝脏中分离到菌株SO-2和SO-3,对两分离株进行了致病性试验,发现两者对红拟石首鱼、罗非鱼及小白鼠均有致病力,SO-2和SO-3对红拟石首鱼、罗非鱼及小白鼠的LD50分别为4.8×108CFU/尾和1.9×107CFU/尾2、.8×108CFU/尾和8.3×107CFU/尾及9.6×106CFU/只和4.2×106CFU/只,试验感染鱼出现眼球突出、浑浊及失去方向性等与自然发病相似症状,确定该两株菌为致病菌。两分离株为革兰氏染色阳性,呈链状球菌,β溶血,10℃生长,45℃不生长;接触酶阴性,水解七叶灵、精氨酸;VP试验、脲酶和马脲酸试验阴性,发酵葡萄糖、水杨苷、蔗糖和淀粉,不发醇阿拉伯糖、菊糖、乳糖、蜜二糖、棉子糖和山梨醇。分离株对氨卞青霉素、万古霉素和先锋Ⅴ等高度敏感,对庆大霉素、复方新诺明、林可霉素、氟哌酸等不敏感。应用16SrRNA基因进行的菌株PCR鉴定,确定该两株菌为海豚链球菌。       

马铃薯X病毒湖南分离物的鉴定与分组研究

从湖南石门采集表现重花叶症状的马铃薯叶片中分离纯化到一株线状病毒HN021。经双链RNA(ds—RNA)抽提、寄主反应测定、病毒粒子和内含体的形状观察,初步确定该病毒为马铃薯X病毒(Potato virus X)。以ds—RNA作为模板,用相应引物对HN021分离物的ORF4-UTR-ORF5片段进行RT—PCRP得到1kb左右的双链cDNA片段。对该片段进行克隆和测序,并将测序所得的核苷酸序列与Genbank(登录的11株不同分离物的相应片段的核苷酸序列进行同源性比较和分析。结果表明,HN021与分离自南美洲的三株分离物(COAT,KPA和HB)的同源性为78．4％—79．4％,与其它8株(分离自亚洲、欧洲、大洋洲和北美洲)分离物的同源性为96．4％—97．8％。从氨基酸水平比较,HN021与COAT,KPA和HB三者CP和8kDa蛋白氨基酸序列同源性分别为86．5％—89．0％和74．3％—75．7％,相应地与其它8株分离物的同源性分别为97．1％—98．7％和97．1％—100％。序列分析的结果证实了HN021分离物为马铃薯X病毒,同时表明PVX明显存在两个组(组Ⅰ和组Ⅱ),HN021和其它来自亚洲、欧洲、大洋洲、北美洲分离物的组Ⅱ,3个南美洲分离物属于组Ⅰ。     

马铃薯X病毒湖南分离物的鉴定与分组研究

从湖南石门采集表现重花叶症状的马铃薯叶片中分离纯化到一株线状病毒HN021.经双链RNA(ds-RNA)抽提、寄主反应测定、病毒粒子和内含体的形状观察, 初步确定该病毒为马铃薯X病毒 (Potato virus X).以ds-RNA作为模板,用相应引物对HN021分离物的ORF4-UTR-ORF5片段进行RT-PCR,得到1kb左右的双链cDNA片段.对该片段进行克隆和测序,并将测序所得的核苷酸序列与Genbank登录的11株不同分离物的相应片段的核苷酸序列进行同源性比较和分析.结果表明,HN021与分离自南美洲的三株分离物(COAT,KPA和HB)的同源性为78.4%~79.4%,与其它8株(分离自亚洲、欧洲、大洋州和北美洲)分离物的同源性为96.4%-97.8%.从氨基酸水平比较,HN021与COAT,KPA和HB三者CP和8kDa蛋白氨基酸序列同源性分别为86.5%~89.0%和74.3%~75.7%,相应地与其它8株分离物的同源性分别为97.1%-98.7% 和97.1%-100%.序列分析的结果证实了HN021分离物为马铃薯X病毒,同时表明PVX明显存在两个组(组Ⅰ和组Ⅱ),HN021和其它来自亚洲、欧洲、大洋州、北美洲分离物的组II,3个南美洲分离物属于组I.     

Biochemical, Genetic, and Serological Characterization of Two Capsule Subtypes among Streptococcus pneumoniae Serotype 20 Strains: DISCOVERY OF A NEW PNEUMOCOCCAL SEROTYPE

The bacterial pathogen Streptococcus pneumoniae expresses one of over 90 structurally distinct polysaccharide (PS) capsule serotypes. Prior PS structural analyses of the vaccine-associated serotype 20 do not agree with reports describing the genes that mediate capsule synthesis. Furthermore, using immunized human sera-based assays, serological differences were recently noted among strains typed as serotype 20. We examined the capsule structures of two serologically dissimilar serotype 20 strains, 20α and 20β, by extensive biochemical analysis. 20α PS was composed of the previously described serotype 20 hexasaccharide repeat unit, whereas the 20β PS was composed of a novel heptasaccharide repeat unit containing an extra branching α-glucose residue. Genetic analysis of the subtypes revealed that 20α may have arisen from a 20β progenitor following loss of function mutation to the glycosyltransferase gene whaF. Conventional serotyping methods using rabbit polyclonal or mouse monoclonal antibodies were unable to distinguish the subtypes. However, genetic analysis of multiple "serotype 20" clinical isolates revealed that all strains contain the 20β genotype. We propose naming bacteria that express the previously described 20α capsule structure 20A and bacteria that express the novel 20β capsule structure 20B, a new pneumococcal serotype.     

溶原性噬菌体在猪链球菌2型分离株中的检出和鉴定

[目的]为了研究噬菌体整合酶基因在猪链球菌2型(Streptococcus suis type 2,SS2)中的分布情况.[方法]根据噬菌体整合酶基因设计引物,建立了PCR方法,并对扩增产物进行测序.[结果]结果显示,25株SS2致病菌株均扩增出目的片段,非毒力株T15、5株其它血清型猪链球菌及兰氏C群猪源链球菌未扩增出目的片段.经丝裂霉素C诱导后,SS2致病菌株出现完全的细胞溶解,而非毒力株T15未出现溶解.SS2致病株HA9801和ZY05719诱导均产生溶原性噬菌体,分别命名为SS2-HA和SS2-ZY,电镜观察,二者均头部呈正六边形,无尾部,其核酸类型为dsDNA,可鉴定为复层噬菌体科(Tectiviridae)的成员.噬菌体SS2-HA和SS2-ZY整合酶基因序列与已报道的SS2噬菌体整合酶基因序列高度同源,显示SS2噬菌体整合酶具有较高的特异性.[结论]从SS2致病株中检出溶原性噬菌体和噬菌体整合酶基因,且噬菌体整合酶基因与SS2溶菌酶释放蛋白(mrp)等7种毒力相关基因有相关性,表明SS2的溶原性噬菌体可能与其致病性有关.     

用RAPD分子标记鉴别黑木耳菌种的研究

运用RAPD技术,选用20个寡核苷酸引物对我所供应的8个黑木耳生产菌株进行了分子鉴别。结果表明:在选用的20个随机引物中,有10个引物能对8个供试黑木耳菌株扩增出清晰、稳定的DNA谱带。用NTSYS软件进行聚类分析,在相似水平为0．70阈值时,可将供试的8个黑木耳菌株归为3个组群。     

Identification and characterization of four proteases produced by Streptococcus suis

Streptococcus suis is an important worldwide swine pathogen. In this study, we investigated the production of proteases by S. suis serotype 2. Proteases were identified and characterized using chromogenic and fluorogenic assays and zymography. An Arg-aminopeptidase with a molecular mass of 55 kDa was found to be both cell-associated and extracellular. Cell-associated chymotrypsin-like and caseinase activities, belonging to the serine- and metalloprotease classes respectively, were also detected. Lastly, a dipeptidyl peptidase IV (DPP IV) with a molecular mass of 70 kDa was detected in both whole cells and culture supernatants of S. suis serotype 2. Arg-aminopeptidase, caseinase and DPP IV activities were detected in all strains of S. suis serotype 2 tested whereas the chymotrypsin-like activity was only detected in European virulent strains of serotype 2. The optimum pH for all four proteases was between 6 and 8, and the optimum temperature ranged from 25 to 42 degrees C. This is the first report on the production of proteases by S. suis. Further investigations will determine the possible contribution of these proteases in the pathogenicity of S. suis serotype 2.     

伏曲酵母菌的分类鉴定及来源分析的研究

目的:统计分析酵母菌的来源,为大曲微生物物种及其来源变化提供基础资料.方法:利用Biolog微生物自动分析系统进行精确鉴定,并通过统计分析得出微生物菌种的来源.结果:从伏曲样品中分离纯化出7株酵母菌J-1,2,3,4,5,6,7,利用Biolog微生物自动鉴定系统进行鉴定,确定其分别为白吉利丝孢酵母A、无名假丝酵母菌、汉逊德巴利酵母C、海隐球酵母菌、东方伊萨酵母菌、解脂耶罗威亚酵母菌、皱落假丝酵母菌.这些物种主要来源于原料本身和空气,原料为了人室大曲提供了J-1,2,3三种酵母菌,其比例为25.45%、19.23%和7.5%.结论:空气巾含有大曲中所有的酵母菌的种类,曲房空气中的酵母菌数量和种类均较多.     

重组肺炎链球菌甘油脱氢酶活性及晶体培养的初步分析

甘油脱氢酶能够氧化胞内甘油为代谢活动提供能量,并参与调控与宿主粘附相关细菌蛋白质的表达,是潜在的抗菌药物靶点. 本文利用大肠杆菌BL21原核表达肺炎链球菌甘油脱氢酶,获得大量上清表达的目的蛋白. 再用Ni-NAT亲和层析、DEAE离子交换层析以及Superdex 200分子筛进行纯化. 经数据拟合,证实该酶在溶液中以同源二聚体形式存在. 光谱实验证实该重组表达甘油脱氢酶仍具有氧化甘油生成1, 3-二羟基丙酮的活性. 用Hampton试剂盒初筛晶体及棋盘法优化晶体,在0.1 mol/L Bicine PH 9.6,13% PEG MME 5000,0.2 mol/L KSCN,4% Dioxone条件下,得到了晶型好且有一定衍射能力的单晶,为解析肺炎链球菌甘油脱氢酶的三维结构及研究结构与酶活之间的关系奠定了基础.     

肺炎链球菌假想的溶菌酶样蛋白的活性分析和鉴定

目的 探索肺炎链球菌中一种假想的溶菌酶样蛋白的活性.方法 生物信息学分析该基因的功能结构域;利用长臂同源PCR对该基因进行敲除,观察D39野生菌和缺陷菌在生物学性状的改变;利用底物PNP-（GIcNAc）和溶壁微球菌,构建过表达载体,绘制生长曲线,对截断和全长蛋白的溶菌酶活性进行鉴定.结果 生物信息学分析结果显示该基因的编码产物为β-1,4-N-乙酰胞壁酸糖苷酶,属于糖基水解酶25家族;野生菌为长链生长,缺陷菌呈短链状;溶菌酶和假想的溶菌酶样蛋白均可使底物释放出游离的对硝基苯酚,A405nm吸光度值分别为1.166和0.792;同时也可使得溶壁微球菌发生溶解;含过表达质粒的肺炎链球菌较之野生菌,溶解较快.结论 假想的溶菌酶样蛋白具有溶菌酶活性,是一种新的溶菌酶.