湖北地区2001年度流感疫情分析

通过流感病毒分离、人群流感抗体水平测定和流行病学调查对2001年度(2001年3月至2002年3月)湖北地区流感疫情进行了分析.结果表明本年度湖北武汉地区出现过两次流感季节性小流行,第一次在2001年8～9月,主要由甲1型流感病毒引起;第二次在2001年12月至2002年1月,以甲3型流感病毒占优势.从病毒分离鉴定和抗体水平测定的情况分析,这次流行的甲3型流感病毒与1999年分离的毒株相比,可能发生了抗原性漂移.     

海口市2013-2019年流行性感冒流行病学特征和病原学构成

海口市2017年至2019年流感暴发疫情呈持续增长,为了解海口市流行性感冒病原构成以及流行特征及趋势,特收集2013-2019年海口市2家国家级流感哨点医院流感样病例(ILI)监测数据,采用实时聚合酶链反应(real-time PCR)方法进行流感病毒核酸检测.研究分析显示海口市2013-2019年平均流感样病例就诊比例(ILI％)为2.97％,在ILI中0～岁组占比最大为49.44％;流感网络实验室共检测ILI标本14764份,检出流感病毒阳性数2 577份,总检出率为17.45％;流感流行呈双峰分布,春夏季3-7月和秋冬流行峰10月-次年1月;流感病毒B型,新甲H1型和季H3型占比分别为35.04％、32.52％和32.21％;各监测年度优势毒株分别为新甲H1型和B型占79.55％、新甲H1型和季H3型占83.15％、季H3型和B型占98.71％、B型和季H3型占71.89％、季H3型和B型占86.38％、BB型和新甲H1型占97.27％、B型和季H3型占76.04％;流感暴发疫情均发生在学校,以季H3型为主,占41.38％,暴发疫情起数呈逐年上升趋势(趋势线分析R2=0.79).结果表明海口市流感流行呈春夏、秋冬双峰分布特征;各年度优势毒株不一,流感病毒亚型毒株呈现混合交替流行态势;流感的活动水平呈逐年上升趋势,疫情形势日趋严峻;学校是海口市流感防控重点场所;应加强学校流感监测和提高学生流感疫苗的接种率,以利于海口市流感疫情的有效防控.     

长春市2005-2006年流感监测情况分析

报告了长春地区人群流感监测结果:2005年10月~2006年4月流感疫情相对平静,无大流行发生。2005年12月~2006年有一短期发病高峰,此期间共采集医院门诊疑似流感病人标本325份,分离出12株流感病毒均为甲1型,分离率3.69%。以往几年长春市流感流行株以甲3型和乙型为主,很少出现甲1型流行株。通过2005年~2006年的流感监测结果分析,甲1型的出现成为长春市2006年流感流行的主要趋势。     

2009－2014年玉溪市流感样病例监测的病原学分析

摘要：目的 了解玉溪市2009－2014 年流感流行特征和流感流行优势毒株的变化规律,为制定预防和控制策略提供依据。方法 采用MDCK细胞进行流感样病例标本的病毒分离培养,最后采用流感分型试剂进行病毒型别鉴定。结果 2009－2014年玉溪市流感实验室共监测流感样病例3 248例,阳性标本489份,阳性率为15.06%,新甲型H1N1、H3N2、B型流感分别占43.97%、28.22%和25.36%,学生和离退人员阳性病例分别占52.15%和14.11%;哨点医院流感样病例标本阳性检出率低于暴发疫情,差异有统计学意义（χ2=301.14,P＜0.01);每年10月到次年3月出现流行高峰,2009年10月至2011年3月以新甲型H1N1流感为主,2011年4月至2012年3月以B型流感为主,2012年4月至2013年3月以A（H3N2）型流感为主;2013年4月至2014年3月以B型流感为主。结论 玉溪市流感病毒优势毒株是甲型H1N1、H3N2、B型流感,优势毒株在2009－2014 年发生了四次转变,其进一步变异的可能性仍然存在,加强流感样病例病原学与重点人群疫情监测有重要意义。     

2013—2018年广州市荔湾区流行性感冒流行特征及病原学分析

目的 掌握广州市荔湾区2013—2018年流行性感冒(influenza,简称流感)病例及病原学的流行特征,为制定流感防控策略提供科学依据。方法 运用描述性流行病学方法对荔湾区2013—2018年流感数据进行分析。结果 2013— 2018年广州市荔湾区共报告流感7 585例,其中2018年最高为2 691例,发病率283.26/10万;2013年最低,仅有528例,发病率57.78/10万。流感流行趋势每年出现1~2次流行高峰,高峰季节为春季和冬季;男女性别比1.23∶1,差异无统计学意义( P >0.05)。年龄以0~<5岁和5~<15岁组为主;职业以散居儿童、学生和幼托儿童为主,年龄和职业差异有统计学意义( P <0.05)。共检测流感样病例(influenza-like cases, ILI)咽拭子标本总数 6 110 份,其中,流感病毒阳性标本总数564份,阳性率9.23%;每年可有1~2次检出高峰,高峰季节为春季和冬季。流感病毒型别呈现新甲H1型、季H3型和B型交替流行趋势。结论 广州市荔湾区流感防控重点人群是15岁以下的散居、托幼儿童和中小学生,防控重点季节为春季和冬季。据此预测,2019年则需重点防控新甲H1型(A型)流感病毒。     

深圳市龙岗区流感监测及健康人群流感抗体水平分析

对深圳市龙岗区近几年流感病原学及人群流感抗体水平的分析,为流感防控提供科学依据。通过流感监测系统对流感进行病原学和血清学监测的结果显示,2007年流感病毒分离率为1.08%(3/277),2009年分离率为6.68%(56/838),两年流感病毒分离率差别具有统计学意义(χ2=13.03,P=0.000)。2007年健康人群血清样本中H1N1、H3N2、BY、BV流感抗体阳性率分别为60.5%、82.1%、59.3%、50.2%,2010年健康人群血清样本中H1N1、H3N2、BY、BV、甲型H1N1流感抗体阳性率分别为36.2%、37.6%、40.2%、21.9%、37.6%,2007年和2009年各亚型流感抗体阳性率具有统计学意义(P<0.05),两年中均表现H3N2亚型抗体阳性率最高,BV抗体阳性率最低。2007年和2010年H1N1、H3N2、BY、BV抗体阳性率均高于2010年,差别均具有统计学意义(P<0.01)。因此应加强流感病毒抗原变异株和人群流感水平的监测,对5岁以下及20岁以上的易感人群加强流感疫苗的接种,预防流感大流行。     

2019年不同类型流感病毒在佛山地区流行特征分析

2017-2018年间,流感病毒在我国流行态势严重,为探讨佛山地区流感病毒的流行特征,为佛山市流感的防控提供科学依据,本研究搜集2019年佛山市流感监测哨点医院采集的流感样病例标本,采用实时荧光RT-PCR检测流感病毒核酸,分析佛山市流感流行病学数据库病人详细信息,分析流行趋势及病毒流行的类型,为制定流感的防控提供科学依据.结果显示:2019年共检测流感样病例咽拭子标本1356例,流感病毒核酸检测阳性率为25.52％,甲型流感病毒阳性率为19.17％,乙型流感病毒阳性率为6.34％.不同职业人群共18个,小学生(7.67％),幼托儿童(3.17％)流感病毒核酸检测阳性率较高.把年龄分成5个年龄段进行分析,流感阳性率最高的是25～59岁组与5～14岁组.2019年佛山地区主要检出新甲H1型、季H3型、BV型三种型别,1月份,12月份为流感活跃的两个高峰,各型别在不同的时间交替或共同流行.不同性别的人群流感阳性率差异无统计学意义.不同型别病毒株在不同性别人群间阳性率差异无统计学意义.本研究结果提示佛山地区主要以甲型流感流行为主,优势亚型为新甲H1型,季H3型,部分乙型流感患者,以BV型为主.流感病毒感染的重点人群是小学生与幼托儿童,不同类型的流感病毒,在不同性别人群间感染无差异.通过对2019年佛山市流感流行特征的分析可以为佛山市流感的防控提供科学依据.     

2009至2015年度辽宁省锦州市流感样病例和病原学特征分析

了解辽宁省锦州市2009至2015年度流感流行特征及优势毒株的分布情况,为流感的预警和防治提供依据。统计锦州市2009至2015年度流感样病例(ILI)监测数据及病原学结果,分析ILI百分比(ILI%)、病毒分离率及各亚型的变化规律。共监测ILI 51 277例,ILI%为2.28%,主要集中于0～15岁年龄段,占56.72%;采集8 254份ILI咽拭子标本,其中阳性467份,病毒分离率为5.66%,其中新甲型H1N1型192份、季节性H3型186份、B型Yamagata系37份、B 型Victoria系52份。2009年和2013年以新甲型H1N1(55.73%,83.33%)为主,2011年以BY (74.42%)为主,其他年份以季节性H3型为流感优势毒株,BV在人群中流行趋势减弱,新甲型H1N1、BY在人群中偶有检出。2010至2015年各月份ILI%均显著低于2009年,提示2009年后流感病毒活动相对稳定;ILI%与病毒分离率呈正相关(r_s＝0.347;P＝0.039),ILI%的变化能够较好地反映当地流感病毒的活动情况。新甲型H1N1型、季节性H3型、B型混合存在,季节性H1型消失。     

南宁市2012—2015年流行性感冒流行特征分析

目的分析南宁市2012—2015年流行性感冒(简称流感)监测结果,为流感防制策略提供依据。方法采用实时荧光RT-PCR方法对采集的流感样病例(Influenza-like Illness,ILI)咽拭子标本进行流感病毒核酸检测,并运用描述性流行病学方法对流感流行特征进行分析。结果 2012—2015年共采集ILI咽拭子标本共6 664份,经流感病毒核酸检测,阳性标本988份,阳性率为14.83%。4年中流感病毒优势株交替变化,2012年和2014年的优势毒株为甲3型,2013年优势毒株为新甲型H1N1,2015年优势毒株是甲3型和B型;0~11岁组和21~31岁组的阳性人数占阳性总数的50.30%。流感暴发疫情61起,其中59起疫情发生在中小学校。结论南宁市2012—2015年流感的流行特征有明显的季节性,主要易感人群为婴幼儿、小学生和青壮年。加强对重点人群的监测及疫苗预防接种工作,对控制流感疫情的暴发具有重要意义。     

20世纪以来流感在人群中的流行特征

自1918年西班牙流感爆发以来,流感病毒已经导致了五次人群中的大规模流行,除西班牙流感外,还有1957年由H2N2病毒引发的亚洲流感、1968年由H3N2病毒引发的香港流感、以及1977年的俄罗斯流感和2009年的墨西哥流感。而西班牙流感、俄罗斯流感和墨西哥流感三次流感的大流行均是由H1N1病毒毒株引起。此外,许多局部人群中的小规模流行与感染也被证实是流感病毒直接经人与人之间传播所导致。本文将主要对五次人流感的大规模爆发以及具有代表性的局部流行事件的流行病学特点以及病毒序列特征作一个小结。     

Epidemic Type A Influenza in Southwestern Ontario in 1963

From February to April 1963 epidemic type A influenza occurred in Southwestern Ontario. Eighty cases were diagnosed virologically, 24 of them by isolation of virus. The epidemic strain of virus proved unusually difficult to adapt to growth in embryonated eggs, and it had low avidity for antisera. Antigenically it differed from A2 strains of earlier years and belonged to the subgroup of A2 influenza viruses characterized by the A2/Japan/170/62 strain. Antisera to A2 strains of earlier years neutralized the present strain, but antisera to the present strain failed to neutralize the earlier viruses. Some patients formed antibodies to the present epidemic strain alone, and others formed antibodies both to this strain and to earlier A2 strains.     

用~(125)I标记肽图估计近年来流行的甲型流感病毒血凝素的变异率

将一种灵敏而简便的~(125)Ⅰ标记肽图分析方法用于估计近年来流行的5株甲1型和S株甲3型流感病毒血凝素(HA)的变异率。经计算这两种亚型病毒HA的年平均氨基酸变异率分别为0.47％和0.44％。但在1986年分离株与1985年分离株之间则有较大的变化,对HA的变异率与流行病学资料的关系进行了讨论。     

Properties of Virus Isolated from an Epidemic of Hand-Foot-and-Mouth Disease in 1973 in the City of Matsue

The virus strains isolated from clinical cases in an epidemic of hand-foot-and-mouth disease in Matsue in 1973 were characterized and its properties were compared with those of the Coxsackievirus group A type 16 (CA 16) prototype strain. The virus isolated in 1973 was similar to CA16 prototype virus with respect to morphology in electron microscopy, resistance to ether and capability to replicate in medium containing fluorodeoxyuridine. Cross neutralization tests using guinea-pig and horse antisera revealed that there was little or no detectable common antigen between the two viruses. The two viruses also differed in heat stability of virion infectivity: the 1973-viruses were much more resistant to heat than the prototype virus. Under one-step growth conditions in Vero cell cultures, growth rate and virus yield of the 1973-viruses were lower than those of CA16, but this property was independent of incubation temperatures, pH of culture medium and other culture conditions. Several other differences in property between the 2 strains are also described. It is concluded that the epidemic in 1973 was caused by a virus whose properties differed greatly from those of the CA16 prototype.     

1992—1994年HIV—1国际流行株和云南株膜蛋白V3区氨基酸共有序列比较

对１９９２～１９９４年间１６个云南ＨＩＶ１株膜蛋白基因Ｖ３区进行了ＤＮＡ序列测定,经计算机ＤＮＡＳＩＳ及ＰＲＯＳＩＳ软件进行同源性分析,得出其相应的氨基酸共有序列ＹＮＶ３和两组共有序列ＹＮＶ３Ａ和ＹＮＶ３Ｂ,计算了ＹＮＶ３中每个氨基酸的保守性。分别将ＹＮＶ３Ａ和ＹＮＶ３Ｂ与世界各地的ＨＩＶ１代表株的相应序列进行了同源性比较。结果表明,ＨＩＶ１云南株膜蛋白Ｖ３区氨基酸共有序列ＹＮＶ３中每个氨基酸的平均变异度为７．６６％。两组共有序列ＹＮＶ３Ａ和ＹＮＶ３Ｂ,分别与ＨＩＶ１美欧株及泰国流行株Ｂ亚群相应序列有较高同源性。这一结果提示,在进化上云南瑞丽ＨＩＶ１流行毒株间有非常密切的关系,在这一时期该地区的流行毒株以ＨＩＶ１美欧株、泰国株Ｂ亚群及其衍生株为主。     

海南省2016-2018年A(H1N1)pdm09亚型流感病毒基因特性分析

2009年A(H1N1)pdm09亚型流感病毒在墨西哥暴发,之后在全世界流行。为了解海南省2016-2018年A(H1N1)pdm09亚型流感病毒流行态势,分析血凝素(HA)与神经氨酸酶(NA)基因遗传进化特征与变异情况,本研究从中国流感监测信息系统获取海南省2016-2018年流感病毒病原学监测数据,选取5家流感监测网络实验室分离鉴定的37株A(H1N1)pdm09亚型流感毒株进行HA与NA基因测序,利用MEGA 10.1.8构建HA与NA基因种系进化树,并分析其氨基酸变异情况。结果显示,2016-2018年共出现3次A(H1N1)pdm09亚型流感病毒活动高峰。2017年10月份以后的分离株(4/8)与2018年大部分分离株(21/22)独立于疫苗株A/Michigan/45/2015聚为一个小支,发生20余处HA与NA氨基酸位点变异。与疫苗株A/California/7/2009(2010-2016)相比,2016-2018年流感病毒分离株在HA基因抗原决定簇上发生7处氨基酸变异并有一个潜在糖基化位点,未发现HA基因受体结合位点变异与NA基因耐药性变异。本研究提示,2016-2018年,A(H1N1)pdm09亚型流感病毒逐步发生规律性进化,氨基酸变异频率有增加趋势,今后应持续加强流感病毒病原学监测,密切追踪A(H1N1)pdm09亚型流感病毒基因变异情况,为科学防控提供理论依据。     

辽宁省2016‒2017年H3N2亚型流感病毒 HA1基因特征分析

摘要：目的 了解2016?2017年辽宁省H3N2亚型流感病毒基因变异情况及流行株与疫苗株的匹配情况。方法 采用逆转录聚合酶链反应（RT-PCR）对分离得到的H3N2亚型流感毒株的HA1基因进行扩增,扩增片段经测序与近年来WHO推荐的北半球疫苗株进行比对和基因特征分析。结果 进化分析表明,2016?2017年H3N2亚型流感病毒与近三年的疫苗株均不在同一分支上;基因特性分析中,所有病毒均在A、B抗原决定簇上发生了两处以上的变异;19株病毒的受体结合位点131位氨基酸发生了新的变异;20株病毒中有1株突变产生了新的半胱氨酸,提示可能有新的二硫键产生;糖基化位点并未检测到新的突变。结论 2016?2017年辽宁省H3N2亚型流感病毒的抗原性及基因特性均发生了一定的变化,但变异程度不大,应密切关注疫苗株对流感病毒的免疫效果及流感毒株的变异情况。     

Mycobacterium tuberculosis Strains Potentially Involved in the TB Epidemic in Sweden a Century Ago

A hundred years ago the prevalence of tuberculosis (TB) in Sweden was one of the highest in the world. In this study we conducted a population-based search for distinct strains of Mycobacterium tuberculosis complex isolated from patients born in Sweden before 1945. Many of these isolates represent the M. tuberculosis complex population that fueled the TB epidemic in Sweden during the first half of the 20^th century.

Methods

Genetic relationships between strains that caused the epidemic and present day strains were studied by spoligotyping and restriction fragment length polymorphism.

Results

The majority of the isolates from the elderly population were evolutionary recent Principal Genetic Group (PGG)2/3 strains (363/409 or 88.8%), and only a low proportion were ancient PGG1 strains (24/409 or 5.9%). Twenty-two were undefined. The isolates demonstrated a population where the Euro-American superlineage dominated; in particular with Haarlem (41.1%) and T (37.7%) spoligotypes and only 21.2% belonged to other spoligotype families. Isolates from the elderly population clustered much less frequently than did isolates from a young control group population.

Conclusions

A closely knit pool of PGG2/3 strains restricted to Sweden and its immediate neighbours appears to have played a role in the epidemic, while PGG1 strains are usually linked to migrants in todaýs Sweden. Further studies of these outbreak strains may give indications of why the epidemic waned.     

广东地区流感H3N2毒株血凝素基因特征、进化和变异分析

为揭示广东地区2007～2010年甲型H3N2毒株血凝素(HA)基因特征和变异,采用时空抽样方法抽样,检测广东2007～2010年甲型H3N2毒株HA基因核苷酸序列,同时检索全球HA基因序列作为对照,采用Lasergene 7.1和Mega 5.05软件对HA基因核苷酸序列进行比对和分析;并结合流行病学资料,对变异毒株进行进化速度分析;同时进行抗原分析。结果发现,广东2007～2010年H3N2毒株HA基因同义进化(Ks)和错义进化(Ka)速度分别为2.06×1E-3～2.23×1E-3核苷酸/年和1.05×1E-3～1.21×1E-3核苷酸/年,HA1较HA2的错义突变速率要高3.13倍。与疫苗株A/Perth/16/2009的HA基因比较,2009年广东毒株同源性达到98.8%～99.7%、2010年同源性达到98.0%～98.4%。在广东2007～2010年毒株中,HA1五个抗原表位均有氨基酸位点变异,尤其是2010年毒株B区(N160K)和D区(K174R/N)的变异;此外,广东2010年毒株受体结合部位(RBS)还发生K189E/N/Q和T228A置换变异;两个糖基化位点变异影响到抗原性;目前使用的H3N2疫苗株与目前流行毒株的抗原性有差异。广东地区2007～2010年的毒株中,血凝抑制抗体的抗原分析结果有差异。结果提示,目前广东乃至全球甲型H3N2毒株HA1B区和D区均有氨基酸位点变异,RBS的两个位点发生置换,糖基化位点变异影响到表位A区和B区抗原性;与WHO推荐2011年流感H3N2毒株疫苗株比较,目前流行毒株HA基因有抗原位点变异。