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人类免疫球蛋白超家族一个新成员:a—1B糖蛋白前体基因的克隆和分析 总被引:1,自引:0,他引:1
应用RACE方法,从人肝Marathon cDNA中克隆一1694bp的cDNA,其中开放阅读框架在43-1530bp,编码495个氨基酸,1~17氨基酸为信号肽,有4个IGc2结构域,与从人血浆分离的a-1B糖蛋白高度同源,是一个尚未克隆的a-1B糖蛋白前体基因,属于免疫球蛋白超家族的一个新成员,可能在细胞识别和细胞行为的调节方面起作用。 相似文献
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富亮氨酸重复超家族新成员LRRC4基因是新克隆的脑瘤相关基因,采用多聚酶链式反应(PCR)方法获得长约500bp含IgC2结构域的DNA序列,扩增产物克隆至pGEX-4T-2质粒中,构建GST融合表达质粒,在大肠杆菌中诱导表达融合蛋白,经包涵体沉淀,溶解,Glutathione-Sepharose亲和层析纯化获得融合蛋白,并以Western blot鉴定证实,通过IgC2结构域蛋白的纯化分离该结构域,为进一步研究该结构域及LRRC4基因的结构和功能奠定了基础。 相似文献
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球毛壳菌60S核糖体蛋白L10a基因克隆与特性分析 总被引:6,自引:0,他引:6
用粗糙脉孢菌(Neurospora crassa)XP_322380和赤霉菌(Gibberella zeag)PH-1(EAA76971)的60S核糖体蛋白L10a基因(60S ribosomal protein L10a,RPL10a)蛋白序列对球毛壳菌(Chaetomium globosum)ESTs序列数据库进行tBlastn检索,获得了球毛壳菌RPL10a cDNA序列。cDNA序列长765bp,开放阅读框654bp,编码217个氨基酸组成的多肽,蛋白分了量为23.9kD。BlastP分析表明该基因氨基酸序列与粗糙脉胞菌相似最高为89%;与玉蜀黍黑粉菌(Ustilago maydis)相似性最低为78%。cDNA序列及推测的氨基酸序列在GenBank登录(登录号分别为AY669070,AAT74578)。 相似文献
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旨在克隆内蒙古白绒山羊翻译控制肿瘤蛋白(Translationally controlled tumor protein,TCTP)基因并分析其表达模式。采用RT-PCR技术扩增TCTP基因编码区cDNA序列,将得到的基因cDNA序列及其编码的氨基酸序列进行生物信息学分析,利用定量RT-PCR方法检测TCTP基因在绒山羊不同组织中的表达特异性。获得的内蒙古白绒山羊TCTP基因编码区cDNA序列全长519 bp,包含了完整的ORF,编码172个氨基酸残基组成的蛋白质。核苷酸序列与绵羊、牛、猪、人、猴及大鼠的同源性在99%-95%之间。生物信息学分析表明,编码的蛋白质理论分子质量19.6 kD,等电点(pI)4.673,含有一个N端糖基化位点,一个蛋白激酶C磷酸化位点,3个酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点,定位于细胞质中。定量RT-PCR方法检测表明,TCTP基因在绒山羊肾脏、肌肉、胰腺、肝脏、睾丸和脑组织中均有表达,其中在肝脏中的表达量较高,在脑中表达量较低。 相似文献
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黄瓜花叶病毒香蕉株系的衣壳蛋白基因克隆和序列分析 总被引:6,自引:2,他引:4
对侵染香蕉的黄瓜花叶病毒广东3个株系的衣壳蛋白(CP)基因,进行了克隆和序列分析,以提纯病毒RNA为模板,应用RNA反转录酶(AMV)合成CP基因cDNA再用TaqDNA聚合酶进行PCR扩增,通过常规基因克隆法扩增的CP基因克隆入载体,选取每一株系的CP基因与载体表面方向相同和相反的各一个克隆,进行插入片段的全序列分析,结果表明,每一重组克隆测序长约750个核苷酸,任一株系其插入方向相反的两个重组 相似文献
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目的:构建人类新基因LACE1,同时对该基因进行初步的特性和功能研究.方法:通过生物信息学EST拼接技术,RT-PCR等技术,克隆出30个人类未知功能基因.利用RT-PCR技术对该基因的表达谱进行研究,同时结合绿色荧光蛋白与荧光显微镜对该蛋白的定位进行初步分析,并利用MTT初步分析该基因的功能.结果:成功克隆出30个未知功能的人类新基因,其中LACEI(Homo sapiens lactation elevated 1)是一个没有任何功能文献报道的新基因,通过生物信息学分析该基因NCBI:NM一145315.3,其cDNA全长为2 262bp,有13个外显子和12个内含子组成,主要定位于人6号染色体,该基因定位于细胞质中,MTT结果显示该基因能明显抑制细胞增值.结论:人类新基因LACEI是一个抑制细胞增值的相对保守的人类新基因. 相似文献
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一种新的蛋白酪氨酸磷酸酶基因的克隆、定位和组织表达谱研究 总被引:3,自引:0,他引:3
从人胎肝cDNA库分离出一长度为5248bp的cDNA克隆,该基因包含26个外显子和25个内含子,染色体定位于在某些肿瘤细胞中易缺失的3p21.1-21.33。其可读框编码1636个氨基酸,该蛋白属于蛋白酪氨酸磷酸酶(PTP)家族,其C端有一个典型的PTP结构域,N端含有约800氨基酸残基的BRO1样结构域及随后2个可能的SH3结构域结合位点,在这两个结构域之间及C末端还各有一个脯氨酸富集区。Northern杂交和点杂交分析显示,该基因以大约5.4kb的单一转录物广泛表达于人体各种组织,而且在人部分肿瘤细胞中高表达。结果提示,人源PTP-TD14是一个新的蛋白酪氨酸磷酸酶。 相似文献
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Zou X Wang D Qiu G Ji C Jin F Wu M Zheng H Li X Sun L Wang Y Tang R Zhao RC Mao Y 《Biochemical genetics》2005,43(3-4):165-173
By large-scale sequencing analysis of a human fetal brain cDNA library, we isolated a novel human cDNA (C4orf13). This cDNA is 2706 bp in length, encoding a 340-amino-acid polypeptide that contains a typical SBF (sodium bile acid cotransporter family) domain and ten possible transmembrane segments. The putative protein C4orf13 shows high similarity with its orthologs in Mus musculus and Xenopus laevis. Human C4orf13 is mapped to chromosome 4q31.2 and contains 12 exons. RT-PCR analysis shows that human C4orf13 is widely expressed in human tissues, and the expression levels in liver and lung are relatively high, expression levels in placenta, kidney, spleen, and thymus are moderate, low levels of expression are detected in heart, prostate, and testis.The nucleotide sequence reported in this paper has been deposited to GenBank under accession number AY346324. 相似文献