用激光拉曼探讨不同相对湿度下聚赖氨酸分子的二级结构

本文报导了聚赖氨酸分子的二级结构因其含水量变化而变化.用T.L Lippert等人提出的方法对不同含水量下的聚赖氨酸分子的激光拉曼光谱进行了定量计算.结果表明分子二级结构中的x螺旋、β折叠及无规卷曲成份有明显差异.当分子中相对湿度在0～33%时它的二级结构主要为无规卷曲成份;当湿度在90%-75%时分子的主键盘方式以α螺旋为主;而当湿度小于75%大于40%范围时分子的二级结构改变以β折叠和无规卷曲的肽链构象.     

聚赖氨酸溴化氢结合物的表面增强拉曼光谱

银溶胶对聚赖氨酸溴化氢结合物(PLys—HBr)表现出极大表面增强拉曼(SER)效应。同PLyS—HBr的普通拉曼光谱相比,表面增强因子提高达6个数量级。实验表明,NH_3~+基是银表面增强效应的强活性基团。但是在相同条件下,聚谷氨酸钠(PGA—Na)在银溶胶中不能获得SER光谱,这可能是由于空间障碍或者COO~-基的活性不如NH_3~+基。     

FTIR法定量研究水对聚赖氨酸溴化氢结合物二级结构的影响

付里叶变换红外光谱定量法研究表明,在０～１００％相对湿度（ＲＨ）范围内,聚赖氨酸溴化氢结合物（ＰＬＫ－ＨＢｒ）干膜的水合原则上分为无规卷曲、β－折叠和α－螺旋三个构象稳定阶段,其水合行为远较文献报导的复杂。在任一水合度下都不是纯单一结构,其红外谱均由多个吸收组分组成,而且,β－折叠的类型还可能发生变化。     

一个RNA分子二级结构自动绘图系统

本文介绍一个核糖核酸(RNA)二级结构自动绘图系统。它可以把以碱基匹配对表示的RNA分子的二级结构自动转化为直观的图形显示。RNA分子结构图形可以显示在计算机图形终端上,并可进行放大,缩小,平移,旋转等操作;也可以在绘图纸上画出图形。该系统用BASIC语言书写,在IBM PC／XT和IBM 5550微型机上实现。     

用模式识别方法预测蛋白质的二级结构

本文建立了用模式识别理论和技术在计算机上预测蛋白质二级结构的方法.特征的抽取和样本的选择是使用该方法的关键.这一方法与其他方法相比各有特色,预测精度也比较高,鉴于目前国内外将此方法用于蛋白结构预测的研究的还不多,我们拟进一步发展、完善这一方法.     

用模式识别方法预测蛋白质的二级结构

本文建立了用模式识别理论和技术在计算机上预测蛋白质二级结构的方法.特征的抽取和样本的选择是使用该方法的关键.这一方法与其他方法相比各有特色,预测精度也比较高,鉴于目前国内外将此方法用于蛋白结构预测的研究的还不多,我们拟进一步发展、完善这一方法.     

一种快速计算RNA分子二级结构的方法

 <正> 计算机在生命科学中的应用已日益深入广泛。在核酸研究方面,提出了各种预测单链RNA分子二级结构的算法。虽然尚未有一种理想的算法能完全正确地预测出一个RNA分子链的二级结构,并且费机时费内存,但是已经开辟了一条道路。本文介绍的算法具有方法简单,内存开销小和运算时间短的优点,在微机上就可以实现对较大的RNA分子二级结构的预测。根据现有的研究文献作以下几个约定:     

激光照射对角膜蛋白质二级结构影响的光谱分析

为了研究激光照射后角膜蛋白质化学组成的改变,探讨激光角膜损伤的发生机制,将日本大耳白兔随机分为正常对照组和激光损伤组,选取角膜上皮层和基质层作为研究对象,通过傅里叶变换红外光谱技术(Fou-rier transform infrared spectroscopy,FT-IR)对角膜组织酰胺I带中蛋白质二级结构各吸收峰进行定量分析,观察激光照射后蛋白质分子结构的改变情况。结果显示,激光照射后出现蛋白质二级结构吸收峰的位移和积分百分比的改变。激光照射可使角膜上皮层和基质层蛋白质构象发生改变,从而导致蛋白质结构稳定性下降和蛋白质生物功能的破坏。     

激光拉曼光谱技术在生物分子DNA研究中的应用和进展

激光技术的兴起使拉曼光谱成为激光分析中最活跃的研究领域之一,已被广泛地用于物质成分的分析和分子结构的鉴定。本文综述了拉曼技术在DNA研究中近年来的最新进展,包括：DNA的常规拉曼光谱分析;DNA的激光共振拉曼光谱分析;DNA在金属表面或电极上吸附行为的表面增强拉曼光谱研究;DNA的傅立叶变换拉曼光谱研究等。并对拉曼光谱技术在DNA等生物大分子领域中的研究前景做了进一步的展望。     

用人工神经网络方法预测蛋白质超二级结构

蛋白质超二级结构,即由α－螺旋和β－折叠等二级结构单元和连接短肽组成的超二级结构,是蛋白质结构研究中的一个重要层次。目前蛋白质超二级结构的预测工作尚属摸索阶段,还没有成熟的方法。人工神经网络预测方法是近年来在二级结构预测中发展起来的新方法。本文成功的将人工神经网络引入蛋白质超二级结构的预测工作中,结果表明蛋白质的超二级结构的发生与其局域的氨基酸的序列模式有重要联系,可以由蛋白质的一级结构序列预测该     

一种预测单链RNA分子二级结构的计算机算法

本文给出了一个利用已知能量数据构成具有最小自由能的单链RNA分子二级结构的计算机算法,并给出了此算法的可行性证明和应用实例。     

RNA的二级结构在动物分子系统学研究中的应用

作为一类重要的信息和功能分子,RNA在分子系统学研究中有着特殊的重要作用。RNA除了其一级结构以外,其二级结构亦可用于同源性比较。由于高级结构与功能的关系更为密切,比较的结果可以揭示一些在一级结构比较中难以发现的现象。     

用FTIR研究SDS对肌酸激酶二级结构的影响

用去卷积付里叶红外光谱（ＦＴＩＲ）研究结果表明在低浓度的ＳＤＳ溶液中,二级结构各组份发生了明显可测的变化,表明酶的活性部位及其附近区域有较多的二级结构。     

耐热甜味蛋白brazzein的溶液NMR结构研究——二级结构和分子骨架

brazzein是从非洲西部野生植物PentadiplandrabrazzeanaBaillon的果实中提取的一种甜味蛋白 .在所有已知的甜味蛋白质中 ,brazzein的分子量最小 ,水溶性最好 ,并且具有很好的热稳定性 .利用二维核磁共振 ( 2DNMR)技术研究brazzein的溶液三维结构 ,完成了包括主链和侧链在内的所有质子共振峰的序列归属 .brazzein的二级结构包含一段α螺旋 ( 2 1～ 2 9) ,一段较短的 310 螺旋 ( 1 4～ 1 7)和两股反平行 β折叠 ( 34～ 39,44～ 5 0 ) ,分子N端可能形成了第 3股 β链 ( 5～ 7) .比较研究发现 ,该甜味分子骨架CSαβ与蝎毒、昆虫防卫素和植物抗菌蛋白γ 硫素的分子支架基本相同 .以此为基础 ,讨论了这种多功能分子支架的意义 ,可能的甜味活性中心及其热稳定性的结构基础 .     

用离散量的方法识别蛋白质的超二级结构

用离散量的方法,对2208个分辨率在2.5I以上的高精度的蛋白质结构中四类超二级结构进行了识别。从蛋白质一级序列出发,以氨基酸(20种氨基酸加一个空位)和其紧邻关联共同为参数,当序列模式固定长取8个氨基酸残基时,对“822”序列模式3交叉检验的平均预测精度达到78.1%,jack-knife检验的平均预测精度达到76.7%;当序列模式固定长取10个氨基酸残基时,对“1041”序列模式3交叉检验的平均预测精度达到83.1%,jack-knife检验的平均预测精度达到79.8%。     

几种生物大分子的激光拉曼光谱

第一个生物大分子——溶菌酶的激光拉曼光谱发表于1968年。两年后R.C.Lord等用浓溶菌酶水溶液实验,对其大部分拉曼谱带作了指认。1970年Rimai等人发表了胡萝卜素、番茄红素、番茄组织和视网膜中视蛋白的共振拉曼光谱。随后十年,拉曼光谱在生物学领域中应用发展极其迅速,     

不同pH条件下细菌视紫红质的共振拉曼光谱研究

本实验测定了不同pH条件下嗜盐菌紫膜中细菌视紫红质(bR)的共振拉曼光谱.13-顺式视黄醛生色团的特征峰1187cm~(-1)和全反式、13-顺式共有的特征峰1200cm~(-1)带强度之比I_(1187)/I_(1200)在pH1.0-8.9之间约为0.76,而pH高于8.9为0.97.pH3.0-9.0时C=NH~ 振动峰为1640-1642cm~(-1),pH9.4以上为1642-1644cm~(-1),pH9.2附近变化最大,pH3.0以下低于1640cm~(-1).酸性和弱碱性范围时,19-CH_3和20-CH_3的面内变形振动与面外变形振动相互重叠,碱性范围分为双峰.并讨论了对结构及其稳定性的影响.     

用神经网络法预测膜蛋白RH和BR的二级结构

膜蛋白的结构预测目前还十分困难.本文以两个典型的膜蛋白为选材,用神经网络方法对其二级结构做了预测.预测结果与实验资料的符合率与该方法用于球蛋白时的结果一致,因此是较好的.鉴于目前还没有人将此方法用于膜蛋白的结构预测.我们拟进一步发展此方法.     

胆绿素的激光表面增强拉曼光谱研究

本文中 ,SERS被用来测定胆绿素 ,并对溶液中的 p H和 Na Cl浓度对谱图的影响进行了研究。测定下限可达 1 .2 8× 1 0 -7M,且摄谱时间只需 1 5分钟。另外 ,讨论了胆绿素在银胶表面的吸附状态及质子化状态。研究表明胆绿素在银胶表面是呈近乎平面的环状结构吸附 ,其内酰胺环 A上氧原子和吡咯环上的氮原子可能发生了质子化。