一种核不均一核糖核蛋白M4缺失突变体的克隆

利用减法杂交技术筛选人树突状细胞(DC)经抗原刺激后特异表达的基因, 成功地获得了十多个特异表达基因, 其中包括一种核不均一核糖核蛋白(heterogeneous nuclear ribonucleoprotein, hnRNP)M4第159～197位氨基酸缺失的新基因. 对部分肿瘤细胞系及原代培养细胞进行RT-PCR检测发现, 它的表达与hnRNP M4基因是一致的, 同时证实了该基因表达于经KLH刺激后的DC而非正常的DC. 组织分布分析显示, 该基因高表达于脾脏、外周血淋巴细胞、肺和肝脏. 另外, 通过多种细胞因子刺激的骨髓基质细胞(bone marrow-derived stromal cells, BMSC)也表达这两种分子, 但TNF-a 处理后mRNA的表达消失. 这一发现增加了对DC在抗原提呈过程中基因表达变化的认识, 为hnRNP家族增添了新成员.     

核内不均一核糖核蛋白在前体mRNA加工中的功能

核内不均一核糖核蛋白(hnRNP)是一类存在于真核生物体内具有类似结构特征的高丰度RNA结合蛋白,一般均匀分布在核内。多种hnRNP具有多样的功能,参与从转录调节,前体mRNA剪接,mRNA输出到mRNA降解等多种生物过程,从而进行基因表达调控。现着重介绍hnRNP在前体mRNA加工过程(加帽,剪接,加尾,输出,选择性降解)中的功能及研究进展。     

肿瘤相关成纤维细胞对非小细胞肺癌恶性生物学行为影响

目的:探讨肿瘤相关成纤维细胞(Tancer Associated Fibroblast,TAF)对非小细胞肺癌(Non-small Cell Lung Cancer,NSCLC)恶性生物学行为的影响。方法:选取在本院肿瘤科住院手术的非小细胞肺癌患者,收集术后肺癌标本,马松三色染色(Masson Trichrome Stain)和天狼星红染色(Sirius Red Stain)观察肺癌组织(Lung Cancer Tissue,LCT)、癌旁组织(Pericarcinomatous Tissue,PCT)和正常组织(Normal Tissue,NT)中TAF的表达情况;体外将非小细胞肺癌细胞A549与非小细胞肺癌成纤维细胞P-gp共培养,CCK-8检测共培养前后A549细胞增殖能力;细胞划痕和Trans-well实验分别检测A549细胞迁移和侵袭能力;q RT-PCR和Western blot检测A549细胞上皮间质转化(Epithelial Mesenchymal Transition,EMT)标志蛋白E-cadherin、N-cadherin和Vimentin的表达。结果:Masson和Sirius染色结果显示:肺癌组织中纤维的表达明显高于癌旁组织;与P-gp共培养的A549细胞的增殖、迁移和侵袭能力及上皮间质转化相关蛋白N-cadherin和Vimentin表达均明显高于阴性对照组(P0.05),而E-cadherin的表达明显降低(P0.05)。结论:TAF可能通过诱导非小细胞肺癌细胞EMT的发生从而促进非小细胞肺癌的增殖、迁移和侵袭等恶性生物学行为。     

Egfl7 与非小细胞肺癌上皮间质转化关系的研究

目的:研究Egfl7与非小细胞肺癌(NSCLC)上皮间质转化标志物E-cadherin,Vimentin的相关性,探讨Egfl7是否参与NSCLC的上皮间质转化(EMT)。方法:分别采用免疫组化法和RT-PCR法检测40例NSCLC组织和20例肺癌旁正常肺组织中Egfl7,E-cadherin和Vimentin蛋白和mRNA的表达情况。结果:1).NSCLC组织中的Egfl7蛋白和mRNA的表达水平明显高于癌旁正常肺组织;其差异有统计学意义(P<0.05)。Egfl7的表达水平与肺癌的临床分期、及淋巴结转移密切相关(p0.05)。结论:NSCLC组织中Egfl7高表达,Egfl7可能与NSCLC的侵袭性相关;Egfl7与E-cadherin呈负相关,与Vimentin表达成正相关,Egfl7可能参与了NSCLC患者的上皮间质转化(EMT)过程,阻断Egfl7信号可能会抑制NSCLC患者的ENT。     

五味子乙素联合紫杉醇对非小细胞肺癌细胞上皮-间充质转化的作用

[目的]探讨五味子乙素联合紫杉醇是否通过调控PI3K/Akt/mTOR信号通路抑制非小细胞肺癌细胞上皮-间充质转化。[方法]选择人肺癌A549细胞,设PBS对照组、紫杉醇、五味子乙素、紫杉醇+五味子乙素组、紫杉醇+五味子乙素+PI3K抑制剂LY294002组。采用CCK-8检测细胞增殖;流式细胞术分析细胞凋亡及细胞周期;划痕实验检测细胞迁移能力;Transwell小室实验检测细胞侵袭能力;免疫荧光染色检测N-cadherin、Vimentin分布;qRT-PCR检测细胞E-Cadherin、N-Cadherin、Vimentin、Snail、Slug mRNA表达;Western Blotting检测E-Cadherin、N-Cadherin、Vimentin、Snail、Slug、p-PI3K、p-Akt、p-mTOR蛋白表达。[结果]与PBS对照组比较,紫杉醇+五味子乙素组细胞增殖率明显降低、细胞凋亡率明显增加(P<0.05),E-Cadherin mRNA和蛋白表达量明显增加,N-Cadherin、Vimentin、Snail、Slug mRNA和蛋白表达量明显降低(P&l...     

核内不均一核糖核蛋白A2B1功能及其在病毒感染中的作用研究进展

核内不均一核糖核蛋白A2B1(hnRNPA2B1)是核不均一核糖核蛋白家族（hnRNPs）成员，在各种组织中广泛表达，具有识别和结合RNA和DNA模体的功能，其在细胞生命活动，如新生转录物的包装、选择性剪接和翻译调控中起重要作用。研究发现，hnRNPA2B1在病毒感染和抗病毒免疫方面扮演重要的角色，具有识别胞内病毒核酸，激发抗病毒免疫通路，调控病毒感染、复制及病毒释放等功能。本文就hnRNPA2B1的结构、功能，尤其是在DNA和RNA病毒感染中所涉及的作用机制作一综述。     

MiRNA调控非小细胞肺癌转移的研究进展

微小RNA是内源性的非编码小RNA分子,通过与靶mRNA的结合在转录后水平调控基因的表达,从而参与众多生命活动的调控。NSCLC是严重威胁人类健康的恶性肿瘤,侵袭转移是其主要特征,也是其治疗失败和死亡的主要原因。miRNA可以通过促进上皮-间质转化、金属基质蛋白酶表达,以及血管生成来促进NSCLC转移,而且miRNA在调节肺癌干细胞特性中也发挥着重要作用。转移相关的miRNA已成为肺癌靶向治疗的新靶点。     

Kin17在非小细胞肺癌侵袭转移中的作用及其机制研究

目的:探究核蛋白17(Kin17)在非小细胞肺癌侵袭转移中的作用及其机制研究。方法:采用核糖核苷酸测序(RNA-seq)技术比较A549-KD组细胞与A549-NC组细胞中的信使RNA(mRNA)表达谱,从中筛选出表达差异较大的基因。采用蛋白免疫印迹(Western blot)方法对A549-NC组、A549-KD组和A549-KD+信号转导与转录激活因子3(STAT3)组细胞中Kin17、STAT3、磷酸甘油醛脱氢酶(GAPDH)、E-钙黏蛋白(E-cadherin)、波形蛋白(Vimentin)、碱性螺旋-环-螺旋转录因子(Twist)和转录因子(Snail)表达水平进行检测,采用划痕实验检测细胞侵袭能力,采用Transwell实验检测细胞迁移能力,采用免疫荧光实验检测Kin17和STAT3蛋白在细胞中的定位情况。结果:与A549-NC组相比,A549-KD组的STAT3表达水平下降(P0.05)。A549-KD组E-cadherin表达水平高于A549-NC组和A549-KD+STAT3组,而Vimentin、Twist和Snail表达水平低于A549-NC组和A549-KD+STAT3组(P0.05)。A549-KD组划痕愈合率、细胞迁移率低于A549-NC组和A549-KD+STAT3组(P0.05)。Kin17和STAT3蛋白共定位于细胞核中。结论:在非小细胞肺癌中Kin17可能通过促进STAT3表达水平以促进非小细胞肺癌细胞上皮-间质转化(EMT)、侵袭和转移,Kin17及STAT3在非小细胞肺癌患者诊断和治疗中具有一定临床价值。     

miR-1204表达对非小细胞肺癌细胞增殖凋亡、上皮间质转化和MAPKs信号通路的影响

摘要 目的：探究微小RNA-1204（miR-1204）表达对非小细胞肺癌细胞增殖凋亡、上皮间质转化（EMT）和丝裂原活化蛋白激酶（MAPKs）信号通路的影响。方法：将人非小细胞肺癌细胞A549随机分为miR-1204组（转染miR-1204mimic质粒）、NC组（转染空载质粒）和对照组（仅加转染试剂）。采用四甲基偶氮唑盐（MTT）法检测细胞增殖情况,采用流式细胞仪检测细胞凋亡情况,采用实时荧光定量聚合酶链式反应（RT-qPCR）检测细胞E-钙黏蛋白（E-cad）、N-钙黏蛋白（N-cad）和波形蛋白（Vim）mRNA的表达水平。采用RT-qPCR和蛋白免疫印迹（WB）法检测细胞p-P38、P38、p-ERK、ERK、p-JNK、JNK mRNA和蛋白的表达水平。结果：培养12、24、48 h,miR-1204组细胞增殖抑制率均高于对照组和NC组同期（P＜0.05）,对照组与NC组同期的细胞增殖抑制率比较差异无统计学意义（P＞0.05）。但三组细胞随着培养时间延长,细胞增殖抑制率均增加,两两时间点组内比较均有差异（P＜0.05）。miR-1204组细胞凋亡率高于对照组和NC组（P＜0.05）。miR-1204组E-cad mRNA的表达水平高于对照组和NC组（P＜0.05）,N-cad、Vim mRNA的表达水平低于对照组和NC组（P＜0.05）。miR-1204组p-P38、p-ERK、p-JNK mRNA和蛋白的表达水平均低于对照组和NC组（P＜0.05）。结论：上调miR-1204的表达可以抑制非小细胞肺癌细胞的增殖,促进其凋亡,还可以抑制其EMT,该作用可能是通过抑制MAPKs信号通路实现的。     

IscU2对非小细胞肺癌增殖、迁移、侵袭能力的影响及其作用机制的研究

该文通过shRNA干扰技术敲低IscU2干扰细胞IscU2的表达,研究了干扰IscU2对非小细胞肺癌(NSCLC)细胞NCI-H520增殖、迁移及侵袭能力的影响。构建了稳定低表达IscU2的非小细胞肺癌细胞系NCI-H520;采用CCK-8和平板克隆实验检测细胞的增殖能力;流式细胞仪检测细胞周期、凋亡、ROS、线粒体膜电位变化情况;Transwell实验检测细胞迁移及侵袭能力;Western blot检测相关蛋白的表达。结果表明,干扰IscU2后,非小细胞肺癌细胞的增殖及克隆形成能力降低;细胞周期停滞在G1/G0期,同时伴随有p-AKT和Cyclin D1蛋白含量的下降;细胞晚期凋亡率明显增加,凋亡蛋白Cleaved-caspase3和Cleaved-PARP表达上调;细胞迁移和侵袭能力降低,上皮标志物E-Cadherin表达上调,间质标志物N-Cadherin和Snail表达下调;细胞ROS积累和线粒体膜电位下降。该研究结果表明,干扰IscU2显著抑制非小细胞肺癌的增殖、迁移、侵袭能力和上皮–间质转化,这为非小细胞肺癌的诊断和治疗提供了新的潜在靶点和视角。     

ITGB1 enhances the Radioresistance of human Non-small Cell Lung Cancer Cells by modulating the DNA damage response and YAP1-induced Epithelial-mesenchymal Transition

Objectives: Radiotherapy has played a limited role in the treatment of non-small cell lung cancer (NSCLC) due to the risk of tumour radioresistance. We previously established the radioresistant non-small cell lung cancer (NSCLC) cell line H460R. In this study, we identified differentially expressed genes between these radioresistant H460R cells and their radiosensitive parent line. We further evaluated the role of a differentially expressed gene, ITGB1, in NSCLC cell radioresistance and as a potential target for improving radiosensitivity.Materials and Methods: The radiosensitivity of NSCLC cells was evaluated by flow cytometry, colony formation assays, immunofluorescence, and Western blotting. Bioinformatics assay was used to identify the effect of ITGB1 and YAP1 expression in NSCLC tissues.Results: ITGB1 mRNA and protein expression levels were higher in H460R than in the parental H460 cells. We observed lower clonogenic survival and cell viability and a higher rate of apoptosis of ITGB1-knockdown A549 and H460R cells than of wild type cells post-irradiation. Transfection with an ITGB1 short hairpin (sh) RNA enhanced radiation-induced DNA damage and G2/M phase arrest. Moreover, ITGB1 induced epithelial-mesenchymal transition (EMT) of NSCLC cells. Silencing ITGB1 suppressed the expression and intracellular translocation of Yes-associated protein 1 (YAP1), a downstream effector of ITGB1.Conclusions: ITGB1 may induce radioresistance via affecting DNA repair and YAP1-induced EMT. Taken together, our data suggest that ITGB1 is an attractive therapeutic target to overcome NSCLC cell radioresistance.     

RNAi干扰Ska2对H1299细胞增殖、迁移及侵袭能力的影响

Ska2（spindle and kinetochore associated complex subunit2）,又称FAM33A（family with sequence similarity33,member A）,是新近发现的一个与细胞周期调控和肿瘤发生发展紧密相关的基瓯且与该团队前期发现的新基NPRR11（proline rich 11）共享一个双向启动子。但是,Ska2在肺癌中的具体作用和分子机制仍不清楚。该研究选用肺癌细胞系H1299,采用RNAi技术构建Ska2基因沉默的稳定细胞株,并进行了细胞表型和潜在分子机制分析。RT-PCR和Western blot结果表明,Ska2在mRNA和蛋白质水平上的表达均被有效抑制。细胞增殖、细胞迁移和侵袭实验结果表明,与对照细胞相比,Ska2基因沉默稳定细胞株的细胞增殖能力、细胞迁移和侵袭能力均显著降低。此外,Ska2基因被沉默后,CCNA1基因的表达显著下调。该研究的结果提示,Ska2与其对侧基因PRR11的功能高度相关,可能与PRR11共同参与肺癌细胞增殖、迁移和侵袭行为的调节。     

沉默FOXQ1可逆转SW480细胞的上皮-间质转化

FOXQ1是FOX家族的的重要成员之一,其参与了多种人类肿瘤的上皮间质转化(epithelial- mesenchymal transition,EMT).本研究设计合成了FOXQ1基因的shRNA（short hairpin RNA）,用此转染SW480细胞,通过显微镜观察细胞形态,Transwell小室、细胞黏附试验检测转移能力及黏附能力,以探索FOXQ1与结直肠癌细胞EMT的关系.结果显示,沉默FOXQ1后,SW480细胞顶底极性及细胞间紧密连接增加,侵袭、迁移的细胞数目减少,同种黏附能力增加,异种黏附能力降低.进一步的机制研究表明,沉默FOXQ1基因可以导致SW480细胞的上皮标志因子E-cadherin表达显著增高,而间质细胞标志因子N-cadherin、Vimentin及MMP2表达均降低.以上结果表明,沉默FOXQ1基因可以逆转SW480细胞EMT,其机制可能与E-cadherin的上调和N cadherin、Vimentin、MMP2的下调有关,这为进一步研究FOXQ1在结直肠癌发生发展中的作用提供实验基础.     

Solution Structure of the HIV-1 Intron Splicing Silencer and Its Interactions with the UP1 Domain of Heterogeneous Nuclear Ribonucleoprotein (hnRNP) A1

Splicing patterns in human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) are maintained through cis regulatory elements that recruit antagonistic host RNA-binding proteins. The activity of the 3′ acceptor site A7 is tightly regulated through a complex network of an intronic splicing silencer (ISS), a bipartite exonic splicing silencer (ESS3a/b), and an exonic splicing enhancer (ESE3). Because HIV-1 splicing depends on protein-RNA interactions, it is important to know the tertiary structures surrounding the splice sites. Herein, we present the NMR solution structure of the phylogenetically conserved ISS stem loop. ISS adopts a stable structure consisting of conserved UG wobble pairs, a folded 2X2 (GU/UA) internal loop, a UU bulge, and a flexible AGUGA apical loop. Calorimetric and biochemical titrations indicate that the UP1 domain of heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1 binds the ISS apical loop site-specifically and with nanomolar affinity. Collectively, this work provides additional insights into how HIV-1 uses a conserved RNA structure to commandeer a host RNA-binding protein.     

B-Myb稳定过表达H1299细胞株的构建与分析

B—Myb是Myb家族的成员之一,在细胞周期和癌变过程中具有重要作用。但其在肺癌中的作用及其分子机制仍不清楚。为了研究B—Myb在肺癌中的作用,构建了B-Myb稳定过表达的H1299肺癌细胞株。流式细胞术和MTT检测的结果表明,B—Myb稳定过表达导致G1期细胞减少,S期细胞增加进而促进细胞增殖：克隆形成实验及Transwell的结果表明,B—Myb稳定过表达显著增强H1299细胞的克隆形成、侵袭及迁移能力。定量RT-PCR检测结果表明,B—Myb稳定过表达显著提高了细胞周期基因CCNA1的表达水平;对CD97和MTSS1等细胞运动相关下游基因的表达则无明显影响。该研究成功构建了B-Myb稳定过表达细胞株,发现了B-Myb过表达可促进肺癌细胞的增殖、侵袭迁移及克隆形成能力,为进一步研究奠定了基础。     

miR-490-3p通过靶向调控TGFBR1抑制非小细胞肺癌细胞的增殖和侵袭

目的:以非小细胞肺癌A549细胞为模型,探讨miR-490-3p在肺癌发生发展过程中的作用及其调控机制。方法:通过miRBase数据库获得miR-490-3p序列,设计miR-490-3pmimics并转染A549细胞,CCK8、细胞划痕及Transwell实验分别检测miR-490-3p过表达对A549细胞增殖、迁移和侵袭能力的影响;使用miRwalk在线工具预测miR-490-3p可能的调控基因,通过实时荧光定量PCR及Western印迹对候选调控基因进行筛选,最后通过双萤光素酶报告基因实验验证miR-490-3p与调控基因之间的靶向关系。结果:过表达miR-490-3p可显著抑制A549细胞的增殖、侵袭和迁移能力;在预测的miR-490-3p候选靶基因中,选择与细胞增殖、迁移等表型相关的RASAL2、TGFBR1、PAPPA、HMGA2、TGFA靶基因进行实时荧光定量PCR及Western印迹筛选,结果仅TGFBR1基因在mRNA和蛋白水平的表达与miR-490-3p水平呈负相关,且双萤光素酶报告实验证实miR-490-3p可直接与TGFBR1的3'-UTR结合并抑制其表达。结论:miR-490-3p通过靶向调控TGFBR1的表达抑制非小细胞肺癌A549细胞的增殖和侵袭。     

沉默PRR14基因抑制结肠癌HCT116细胞增殖

已有报道显示,富脯氨酸蛋白 14（proline-rich protein 14,PRR14）促进肿瘤的发生发展,但具体作用机制仍不清楚。本文以结肠癌细胞为模型,探索其对细胞增殖和细胞周期进程的影响。qPCR和Western 印迹检测发现,PRR14在4个结肠癌细胞系中呈现高水平表达。合成特异靶向PRR14基因的siRNA,转染结肠癌HCT116细胞。检测发现,PRR14基因表达下调约70%。CCK8结果显示,沉默PRR14后各时间点细胞增殖能力均显著降低,克隆形成实验细胞克隆数减少约40%;流式细胞仪结果显示,沉默PRR14后,G1期细胞比例升高约10%,S期细胞比例降低约14%;BrdU标记免疫荧光检测结果显示,BrdU阳性细胞比例减少约50%,表明细胞DNA合成速率显著降低。机制分析表明：促G1/S期转换基因周期蛋白依赖性激酶2（cyclin dependent kinase 2, CDK2）mRNA水平降低约85%,对应的蛋白质水平也明显降低,G1/S期转换抑制因子周期蛋白依赖性激酶抑制因子1A（cyclin dependent kinase inhibitor 1A,CDKN1A/P21）和周期蛋白依赖性激酶抑制因子1B（cyclin dependent kinase inhibitor 1B,CDKN1B/P27）mRNA水平分别升高约1.8倍和5倍,对应的蛋白质水平也明显升高。沉默PRR14表达,G1/S期相关基因表达紊乱,导致细胞G1期阻滞并抑制细胞增殖。结肠癌细胞中PRR14高表达可促进癌细胞恶性增殖。     

沉默PRR14基因抑制结肠癌HCT116细胞增殖

已有报道显示,富脯氨酸蛋白 14（proline-rich protein 14,PRR14）促进肿瘤的发生发展,但具体作用机制仍不清楚。本文以结肠癌细胞为模型,探索其对细胞增殖和细胞周期进程的影响。qPCR和Western 印迹检测发现,PRR14在4个结肠癌细胞系中呈现高水平表达。合成特异靶向PRR14基因的siRNA,转染结肠癌HCT116细胞。检测发现,PRR14基因表达下调约70%。CCK8结果显示,沉默PRR14后各时间点细胞增殖能力均显著降低,克隆形成实验细胞克隆数减少约40%;流式细胞仪结果显示,沉默PRR14后,G1期细胞比例升高约10%,S期细胞比例降低约14%;BrdU标记免疫荧光检测结果显示,BrdU阳性细胞比例减少约50%,表明细胞DNA合成速率显著降低。机制分析表明：促G1/S期转换基因周期蛋白依赖性激酶2（cyclin dependent kinase 2, CDK2）mRNA水平降低约85%,对应的蛋白质水平也明显降低,G1/S期转换抑制因子周期蛋白依赖性激酶抑制因子1A（cyclin dependent kinase inhibitor 1A,CDKN1A/P21）和周期蛋白依赖性激酶抑制因子1B（cyclin dependent kinase inhibitor 1B,CDKN1B/P27）mRNA水平分别升高约1.8倍和5倍,对应的蛋白质水平也明显升高。沉默PRR14表达,G1/S期相关基因表达紊乱,导致细胞G1期阻滞并抑制细胞增殖。结肠癌细胞中PRR14高表达可促进癌细胞恶性增殖。     

SIK1作为miR-93新的靶基因抑制前列腺癌细胞增殖、侵袭和迁移

该文探讨了SIK1作为miR-93新的靶基因对前列腺癌细胞增殖、侵袭和迁移的抑制作用.采用重组质粒pcDNA3.1-SIK1上调前列腺癌细胞中SIK1的表达后,利用CCK8和克隆形成实验检测细胞增殖;利用细胞划痕和Transwell实验检测细胞侵袭和迁移;利用West-ern blot检测E-cadherin和Vime...