报春花属藏报春组、毛莨叶报春组的界定和系统发育关系：核糖体DNAITS序列证据

报春花属（PrimulaL.)藏报春组（sect.Auganthus Pax ex Balf.f.)和毛莨叶报春组（sect.Ranunculoides Chen et C.M.Hu)的界定一直是没有解决的问题,应用核糖体DNAITS序列数据探讨其系统发育关系。取样包括藏报春组和毛莨叶报春组的全部5个种以及其他一些相关组的代表种,ITS系统树表明,陕西羽叶报春（P.filchnerae Knuth)应与藏报春（P.sinensis Sabine ex Lindl.)和野藏报春耕（P.rupestris Balf.f.et Farrer)一起置于藏报春组;毛莨叶报春组只含两种;毛莨叶报春（P.cicutariifoliaPax)和安徽羽叶报春（P.merrilliana Schltr.)。这两组并不具密切亲缘关系,它们在报春花属中与其他组的关系还需进一步研究。研究也表明ITS序列可以为报春花属的系统发育重建提供大量可靠资料。     

基于matK基因和ITS序列探讨大叶藻科的系统发育关系

比较分析了15种大叶藻的matK基因和ITS片段的核苷酸序列, 结果发现胞嘧啶(C)在两个目的片段上含量均较低。ITS基因片段检测到228处核苷酸替换, 表现出丰富的遗传多态性; matK基因片段上有249处核苷酸替换, 且大部分替换来自于第三密码子的同义替换, 种间在氨基酸水平上产生了一定的分化。基于matK基因和ITS片段, 利用邻接法、最大简约法、最大似然法和贝叶斯法构建的系统发育树结果基本一致, 明显分为4大支, 大叶藻亚属、异叶藻属、拟大叶藻亚属和虾形藻属分别构成一支。大叶藻亚属和拟大叶藻亚属的核苷酸差异值在29.09%-35.51%, 超过了屈良鹄等提出的大部分被子植物ITS属间核苷酸差异值(9.60%-28.80%), 在分子数据上两亚属都达到了属的水平。研究结果支持Tomlinson和Posluszny对大叶藻科的划分结果, 建议将大叶藻科分为4个属。       

基于ITS序列探讨杜鹃花属马银花组的系统发育

以杜鹃花属叶状苞亚属Rhododendron　subg. Therorhodion (Maxim.) Gray 的叶状苞杜鹃R. redowskianum Maxim.为外类群,使用PAUP4.0b8软件对马银花亚属sub g. Azaleastrum Planch.的马银花组sect. Azaleastrum (Planch.) Maxim. 7种1 变种和长蕊杜鹃组sect. Choniastrum Planch. 2种及2个相关的单型亚属（异蕊杜鹃 亚属subg. Mumeazalea Max     

栝楼属基于核糖体ITS序列的系统发育分析

栝楼属（Trichosanthes）是葫芦科(Cucurbitaceae)中一个种类较多、药用价值较大的属。本文基于ITS序列分析了栝楼属16个种的系统发育关系。聚类分析表明：在组的划分上,具有分类争议的截叶组(sect. Truncata)与大苞组(sect. Involucraria)形成一大支,处于一亚分枝位置,不支持独立成组。在属内分类地位上,在核酸水平不支持贵州栝楼(T.guizhouensis)为一独立种,结合形态特征建议并入双边栝楼(T.rosthornii)。大方油栝楼(T.dafangensis)与小苞组(sect. Trichosanthes)成为姊妹群,处于一个向叶苞组(sect. Foliobracteola)过渡位置,结合其形态特征,建议作为小苞组(sect. Trichosanthes)成员。     

基于ITS序列探讨忍冬属的系统发育关系

以七子花(Heptacodium miconioides)为外类群,运用MEGA软件对20种忍冬属植物进行系统发育分析,采用邻接法(NJ)和最大简约法(MP)构建系统发育树,从分子系统学角度探讨忍冬属下的亲缘关系.结果表明:(1)在NJ和MP系统树中,没有形成系统树的基部分支,忍冬亚属(Subg.Chamaecerasus)和轮花亚属(Subg.Lonicera)没有形成姐妹群关系.(2)在各系统树中,囊管组内的各种没有聚为一支,故认为对囊管组的划分应进一步探讨.(3)忍冬属ITS区(ITS1+ITS2)的信息位点达到11.0%,信息位点比较丰富,证明ITS序列可以为解决忍冬属植物的系统发育问题提供较强的证据.     

报春花属藏报春组、毛茛叶报春组的界定和系统发育关系 :核糖体DNAITS序列证据(英文)

报春花属 (PrimulaL .)藏报春组 (sect.AuganthusPaxexBalf.f.)和毛茛叶报春组 (sect.RanunculoidesChenetC .M .Hu)的界定一直是没有解决的问题。应用核糖体DNAITS序列数据探讨其系统发育关系。取样包括藏报春组和毛茛叶报春组的全部 5个种以及其他一些相关组的代表种。ITS系统树表明 ,陕西羽叶报春 (P .filchneraeKnuth)应与藏报春 (P .sinensisSabineexLindl.)和野藏报春 (P .rupestrisBalf.f.etFarrer)一起置于藏报春组 ;毛茛叶报春组只含两种 :毛茛叶报春 (P .cicutariifoliaPax)和安徽羽叶报春 (P .merrillianaSchltr.)。这两组并不具密切亲缘关系 ,它们在报春花属中与其他组的关系还需进一步研究。研究也表明ITS序列可以为报春花属的系统发育重建提供大量可靠资料     

基于ITS序列探讨山茶属金花茶组的系统发育关系

测定了分布于我国的 2 2个山茶属金花茶组的种或变种的nrDNAITS区序列 ,它们的序列长度在 476～ 496之间。GC含量都超过了 70 % ,应用Kimura2 模型计算了序列间的分化程度 ,构建了最大简约树、邻接树和最大似然树 ,分析结果表明 :( 1 )淡黄金花茶、毛籽金花茶、陇瑞金花茶、弄岗金花茶、大样金花茶和凹脉金花茶的关系较近 ;( 2 )小瓣金花茶、小花金花茶、薄叶金花茶、多瓣金花茶、夏石金花茶和龙州金花茶的关系较近。ITS区序列分析结果与AFLP分析结果相近     

基于ITS序列分析探讨杜鹃属映山红亚属的组间关系

以叶状苞亚属的叶状苞杜鹃为外类群,以杜鹃属映山红亚属（subg.Tsutsusi)2组12种杜鹃和羊踯躅亚属（subg.Pentanthera）3种4种杜鹃的ITS区（包括5.8S rDNA)的序列了系统学分析。3个亚属的ITS区序长度范围为642－645bp。排序后ITS区的序列长度为653个位点,gap做缺失处理时,变异位点和信息位点分别占6．58％和3．68％。运用PAUP4．0软件分析,获得15个最简树,步长为75,一致性指数（CI）和维持性指数（RI）值分别为0．9333和0．9515,利用15个最简约树获取严格一致树,结果表明：1）映山红亚属为一单系类群,其内部支持率为81％;2）不支持将R.ashiroi独立成假映山红组,也不支持将R.tashiroi并入映山红组,而支持将R.tashiroi并入轮生叶组中的观点;3）支持将R.tsusiophyllum并入映山红组中的观点;4）大字杜鹃的系统位置还需进一步的研究。     

Phylogenetic Analysis of the Sonneratiaceae and its Relationship to Lythraceae Based on ITS Sequences of nrDNA

Lagerstroemia nested within the Sonneratiaceae. The Sonneratiaceae occurred within the Lythraceae with high bootstrap value support (96%). The two traditional genera constituting Sonneratiaceae were in different well-supported clades. Duabanga (Sonneratiaceae) is sister to the clade of Lagerstroemia (Lythraceae) (82%). The mangrove genus Sonneratia (100%) formed the other monophyletic group. It was located terminally within the Lythraceae clade and comprised two clades: one consisting of S. apetala, S. alba, S. ovata, and S. hainanensis; the other including S. caseolaris and S. paracaseolaris. The results indicated that species previously placed in two different sections (Sect. Sonneratia and Sect. Pseudosonneratia) of Sonneratia occurred within the same clade, and the taxonomic classification was not supported by the molecular analysis of the ITS region sequences. Based on the phylogenetic analyses of the ITS regions, the Sonneratiaceae were shown to be nested within the family Lythraceae. Therefore, the sequence data presented here do not support the recognition of the Sonneratiaceae as a distinct family, but instead support the inclusion of Sonneratiaceae in the Lythraceae proposed by other authors. Received 27 December 1999/ Accepted in revised form 25 June 2000     

基于叶绿体 psbA-trnH 序列和 trnL-F序列的牡丹野生种间关系

对牡丹组全部9个野生种15个居群及凤丹的叶绿体psb A-trn H和trn L-F序列进行测序,并采用邻位相连法分别构建了psb A-trn H序列和trn L-F序列的系统发育树。结果显示:1)两段序列的基因树均支持牡丹组划分为两个亚组的分类方法,与前人的研究结果一致。2)psb A-trn H序列基因树表明大花黄牡丹与黄牡丹的亲缘关系最近,这与大花黄牡丹曾被确定为黄牡丹的一个变种的历史一致。3)革质花盘亚组内,基于psb A-trn H和trn L-F序列的研究结果大体一致,分歧主要在四川牡丹的地位问题。4)psb A-trn H序列和trn L-F序列基因树分别表明杨山牡丹与凤丹具有最近或较近的亲缘关系。     

基于核糖体DNA内转录间隔区ITS序列的广义蓼属及近缘属分子系统学研究

通过对广义蓼属及近缘属共32个代表种内转录间隔区ITS序列的分子系统学分析,尝试研究备受争议的广义蓼属及近缘属的物种族、属、组级的划分问题,结果显示,广义蓼属在系统发育树上并不能形成一个单系类群,这些物种共聚为3大支,分别对应春蓼族、蓼族及荞麦族,其中荞麦属与翅果蓼属形成了一支独立于春蓼族及蓼族之外的类群。在春蓼族中,冰岛蓼属与分叉蓼组形成一个单系类群。     

报春花属藏报春组、毛茛叶报春组的界定和系统发育关系:核糖体DNA ITS序列证据

报春花属(Primula L.)藏报春组(sect. Auganthus Pax ex Balf. f.)和毛茛叶报春组(sect. Ranunculoides Chen et C. M. Hu)的界定一直是没有解决的问题.应用核糖体DNA ITS序列数据探讨其系统发育关系.取样包括藏报春组和毛茛叶报春组的全部5个种以及其他一些相关组的代表种.ITS系统树表明,陕西羽叶报春(P.filchnerae Knuth)应与藏报春(P. sinensis Sabine ex Lindl.)和野藏报春(P. rupestris Balf. f. et Farrer)一起置于藏报春组;毛茛叶报春组只含两种:毛茛叶报春(P. cicutariifolia Pax)和安徽羽叶报春(P. merrilliana Schltr.).这两组并不具密切亲缘关系,它们在报春花属中与其他组的关系还需进一步研究.研究也表明ITS序列可以为报春花属的系统发育重建提供大量可靠资料.     

基于cpDNA和ITS序列对庭藤复合群的居群遗传学研究

采用2个叶绿体基因组片段(ndh J-trn F和trn D-trn T)和核基因组ITS序列对分布于中国东部和相邻地区的庭藤复合群(Indigofera decora complex)的24个居群进行分析,探讨该复合群的遗传多样性、单倍型分布、遗传结构和居群历史动态。cp DNA和ITS序列分析表明,庭藤复合群的单倍型多样性较高,而总体遗传多样性偏低(cp DNA片段:Hd=0.778,π=0.00123;ITS:Hd=0.909,π=0.01290);皖浙地区居群的遗传多样性相对较高,推测其可能是该复合群遗传多样性的分布中心。遗传变异主要存在于复合群居群间,种内居群间遗传分化较大(cp DNA片段:FST=0.848;ITS:FST=0.787);基因流较小(cp DNA片段:Nm=0.228;ITS:Nm=0.241),主要是地理隔离(遗传漂变)或生境片段化促进了物种形成;复合群的不同物种间存在由基因渐渗引起的单倍型共享现象,可能是种间不完全的生殖隔离所致。花木蓝的居群单独聚为一枝,且与其他种无共享单倍型,因此应保留花木蓝种的分类地位,而其他种的分类地位有待进一步研究。     

利用TrnL-F序列探讨苎麻属植物的系统发育关系

目的:探讨苎麻属植物的系统发育关系。方法:对10个种和8个变种苎麻属植物的TrnL-F序列进行PCR扩增和T/A克隆产物序列测定;选取雾水葛属的植物作为参考外类群,同样也测定其TrnL-F全序列;根据TrnL-F区碱基序列的差异计算种间的遗传距离,采用UPGMA法进行系统发育分析并得到系统发育树。结果:野线麻、福州苎麻、赤麻、悬铃叶苎麻、序叶苎麻、白面苎麻、束序苎麻、密球苎麻、疏毛水苎麻、圆叶水苎麻、灰绿水苎麻和糙叶水苎麻聚成一支;帚序苎麻、黔桂苎麻、苎麻、微绿苎麻、贴毛苎麻和青叶苎麻聚为另一支;雾水葛单独聚成一类,与苎麻属的其他种在一级分支中即分开,与其他种的亲缘关系较远。结论:帚序苎麻组和苎麻组植物具有较近的亲缘关系。