INT6: A Link Between the Proteasome and Tumorigenesis

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TXNIP基因与肿瘤发生及转移

硫氧还蛋白结合蛋白（thioredoxin interacting protein, TXNIP）在细胞增殖、凋亡、分化的过程以及肿瘤、应激性疾病的发生中具有重要功能. 作为一个氧还反应的调节子,TXNIP能与硫氧还蛋白(thioredoxin, Trx)相结合,下调Trx的表达,而Trx则在DNA的损伤及细胞凋亡机制中有着关键的作用. 本文阐述了TXNIP基因的特征及其蛋白的生物学功能, 并简要总结TXNIP在人类肿瘤中低表达的研究成果. TXNIP基因是一个新的抑癌基因,它在人类乳腺癌、肝癌、肺癌等癌组织细胞中均表达下降, 并且与肿瘤的转移相关. TXNIP的缺失可以促使肿瘤细胞的增殖和抑制细胞凋亡的进程. 而在抗肿瘤机制中, TXNIP可通过参与细胞周期阻滞、低氧调节、影响NK细胞(natural killer cell, NK cell)发育等过程介导肿瘤的发生发展.     

细胞自噬与肿瘤发生的关系

细胞自噬(autophagy)是将细胞内受损、变性或衰老的蛋白质以及细胞器运输到溶酶体进行消化降解的过程.正常生理情况下,细胞自噬利于细胞保持自稳状态;在发生应激时,细胞自噬防止有毒或致癌的损伤蛋白质和细胞器的累积,抑制细胞癌变;然而肿瘤一旦形成,细胞自噬为癌细胞提供更丰富的营养,促进肿瘤生长.因此,在肿瘤发生发展的过程中,细胞自噬的作用具有两面性.尽管大多数抑癌蛋白可以激活细胞自噬这一结论被广泛接受,但p53作为重要的抑癌蛋白,在细胞核和细胞浆不同的亚细胞定位中对细胞自噬有着截然相反的调控.对于细胞自噬和癌症发生之间关系亟待深入的研究,这将会有助于人类更好地认识并最终攻克癌症.本文将针对细胞自噬与肿瘤发生过程中主要的信号调节通路展开介绍.     

p53 Activates the Long Noncoding RNA Pvt1b to Inhibit Myc and Suppress Tumorigenesis

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A Functional Link Between SIRT1 Deacetylase and NBS1 in DNA Damage Response

In mammalian cells, DNA is often subjected to stresses such as ionizing radiation (IR) and ultraviolet light that can induce DNA double strand breaks (DSBs). In response to DNA DSBs, mammalian cells activate a rapid phosphorylation signaling cascade through the protein kinases, Ataxia-Telangiectasia Mutated (ATM) and ATM- and Rad3-Related (ATR).1 Many well-characterized DNA repair factors are phosphorylated by ATM in response to DSBs, and the sequential phosphorylation of some of these factors, including NBS1, delay cell cycle progression (checkpoint arrest) to allow time for DNA damage repair.2 Results from a new study suggest that phosphorylation of NBS1 is regulated by the acetylation status of the protein, which is modulated by SIRT1 deacetylase.     

细胞周期检验点与肿瘤发生之间关系的研究进展

DNA损伤反应引起的基因组不稳定性并不足以导致肿瘤发生,还需要一些协同突变促进肿瘤的生长或存活,因此,基因组结构不稳定和周期检验点突变失活是肿瘤发生的重要因素。与正常细胞不同,肿瘤细胞中细胞周期检验点反应缺陷,当肿瘤细胞遭受基因毒药物损伤时,可通过激活周期检验点反应阻滞细胞周期进程,加强损伤修复,导致耐药表型的产生。因此,寻找特异性的检验点抑制剂来加强化疗药物或辐射对肿瘤细胞的杀伤效应,已成为肿瘤治疗的一个研究方向。     

Functional role of the Werner syndrome RecQ helicase in human fibroblasts

Werner syndrome is an autosomal recessive human genetic instability and cancer predisposition syndrome that also has features of premature aging. We focused on two questions related to Werner syndrome protein (WRN) function in human fibroblasts: Do WRN‐deficient fibroblasts have a consistent cellular phenotype? What role does WRN play in the recovery from replication arrest? We identified consistent cell proliferation and DNA damage sensitivity defects in both primary and SV40‐transformed fibroblasts from different Werner syndrome patients, and showed that these defects could be revealed by acute depletion of WRN protein. Mechanistic analysis of the role of WRN in recovery from replication arrest indicated that WRN acts to repair damage resulting from replication arrest, rather than to prevent the disruption or breakage of stalled replication forks. These results identify readily quantified cell phenotypes that result from WRN loss in human fibroblasts; delineate the impact of cell transformation on the expression of these phenotypes; and define a mechanistic role for WRN in the recovery from replication arrest.     

MADS-box基因家族基因重复及其功能的多样性

基因的重复(duplication)及其功能的多样性(diversification)为生物体新的形态进化提供了原材料。MADS-box基因在植物(特别是被子植物)的进化过程中发生了大规模的基因重复事件而形成一个多基因家族。MADS-box基因家族的不同成员在植物生长发育过程中起着非常重要的作用,在调控开花时间、决定花分生组织和花器官特征以及调控根、叶、胚珠及果实的发育中起着广泛的作用。探讨MADS-box基因家族的进化历史有助于深入了解基因重复及随后其功能分化的过程和机制。本文综述了MADS-box基因家族基因重复及其功能分化式样的研究进展。     

MADS-box 基因家族基因重复及其功能的多样性

基因的重复(duplication)及其功能的多样性(diversification)为生物体新的形态进化提供了原材料。MADS-box基因在植物(特别是被子植物)的进化过程中发生了大规模的基因重复事件而形成一个多基因家族。MADS-box基因家族的不同成员在植物生长发育过程中起着非常重要的作用, 在调控开花时间、决定花分生组织和花器官特征以及调控根、叶、胚珠及果实的发育中起着广泛的作用。探讨MADS-box基因家族的进化历史有助于深入了解基因重复及随后其功能分化的过程和机制。本文综述了MADS-box基因家族基因重复及其功能分化式样的研究进展。     

泛函连接网络计算软件及其在生物多样性研究中的应用

针对农田生物多样性分析的需要,研制出泛函连接网络（FLANN）计算软件。该软件由7个Java类和1个HTML文件组成,是一种Internet在线计算工具,可运行于多种操作系统和Web浏览器上,并在各种类型的PC及工作站上使用,可读取多种类型的数据库文件。对水稻田昆虫生物多样性的两组取样调查数据Zmar18和Zapr15,用生物多样性工具软件LUMP和非监督分类－离差平方和聚类法进行统计归纳及分类,分别划分为21个和20个功能群,各包含60个样本。以FLANN计算软件对昆虫生物多样性进行了模式分类分析。结果表明,泛函连接网络的模式分类及预测与实际测查结果吻合良好。泛函连接网络Internet在线计算软件的应用可促进生物多样性数据采集和分析的规范化,有利于数据和信息共享,也为形成高度的生物多样性智能分析系统提供了一种工具。     

抑癌基因DAPK在肿瘤的发生、转移、复发、预后中的作用

肿瘤对人类生命危害极大,关于肿瘤的形成、发展等方面的研究,已越来越受到人们的关注.现在已认识到,肿瘤的形成是一个多因素、多基因、多阶段的过程,是促细胞生长和抑制细胞生长两大类调节基因失衡的结果.对于这两大类调节基因失衡的原因及导致肿瘤的发生还不明确.另外,关于肿瘤的预防和治疗等方面研究还不清楚.DAPK基因从发现后,科学家们就认识到其与肿瘤的形成、发展有重要关系.本文就DAPK与肿瘤的关系作一概述.     

Z-DNA的形成及其与基因转录的关系

Z-DNA是一种非常独特的DNA二级结构.与B-DNA相比,Z-DNA最显著的结构特征是左手螺旋和磷酸-核糖骨架呈“zigzag”状. 虽然目前对Z-DNA功能的了解还不确切,但毫无疑问,Z-DNA与基因的转录和调控密切相关. 一方面,在体内Z-DNA在基因转录过程中产生;另一方面,分布于启动子等不同区域的Z-DNA又可以反过来调控基因的转录, 即Z-DNA能够增强一些基因转录,也能抑制某些基因的表达,但其调控机制还不清楚.这种调控似乎与Z-DNA在启动子中的位置、基因和细胞类型有关.研究Z-DNA的形成及其与基因转录的关系对理解基因转录调控理论具有十分重要的意义.