中国拟缺齿藓属Haplodontium Hampe(真藓科)的分类学研究

报道了中国新记录属--拟缺齿藓属（Haplodontium Hampe）分类学的研究进展。目前本属在中国分布有3种,其中包括1新种：臧氏拟缺齿藓（Haplodontium zangii X.R.Wang&J.C.Zhao）,2个新组合：喜马拉雅拟缺齿藓[H.himalayanum（Mitt.）X.R.Wang&J.C.Zhao]和中华拟缺齿藓[H.sinensis（Dix.）X.R.Wang&J.C.Zhao]。笔者对中国拟缺齿藓属3种植物的形态学特征绘制了墨线图,在光学显微镜和电子显微镜下拍摄显微形态照片,并对每种的主要识别特征、生境和地理分布以及与相似种的形态学比较进行了讨论。     

国产丝瓜藓属（真藓科）两新种

报道了我国丝瓜藓属Pohlia两新种,即产自云南的明齿丝瓜藓 P．hyaloperistoma Zhang,Li &; Higuchi和产自西藏的疏叶丝瓜藓P．macrocarpa Zhang,Li&;Higuchi。前者主要特征为蒴齿透明无疣,后者孢子体大型且雌雄异株。     

基于核核糖体DNA ITS序列的真藓科系统发育新证据

主要是利用核基因组的核糖体DNA内转录间隔区（nrDNA ITS）序列数据探讨了Buck和Goffinet（2000）限定的真藓科内各属间及属内种间的系统发育关系。ITS序列的最大简约法（MP）及贝叶斯推论（BI）分析结果显示：不支持Cox（1999）利用rps4/trnL-trnF数据分析将丝瓜藓属移至提灯藓科的结论。ITS数据分析与Holyoak（2007）利用trnL-F,trnG和atpB-rbcL序列数据分析将Bryum algovicum、B.caespiticium、B.capillare、B.pseudotriquetrum和Plagiobryum zierii划归Ptychostomum的结论一致,同时,为Spence(2005)依据形态学特征将B.pallescen、B.pallens、B.uliginosum、B.amblyodon和B.lonchocaulon划归Ptychostomum提供ITS分子证据支持。基于以上研究,建议将以上提到的真藓属种和平蒴藓移至Ptychostomum。     

缺齿藓(真藓科)的形态特征和地理新分布

通过对内蒙古自治区与宁夏回族自治区交界处——贺兰山苔藓植物的调查采集和室内鉴定,发现了缺齿藓(Mielichhoferia mielichhoferiana)的一个新的地理分布记录。该文讨论了缺齿藓的形态特征和地理分布,将其与喜马拉雅缺齿藓、日本缺齿藓和中华缺齿藓进行了比较分析,并提供了该种的图版和中国缺齿藓属的分种检索表。该种的发现不仅丰富了中国缺齿藓属的研究资料,同时也说明了贺兰山的植物区系成分与喜马拉雅成分具有一定的关联。     

中国缺齿藓科新记录种——冻原丝瓜藓(新拟,Pohlia tundrae A. J. Shaw)

冻原丝瓜藓(Pohlia tundrae)在北美被首次描述,随后在欧洲中部、俄罗斯远东地区和西伯利亚西北部也相继报道。最近,作者在西藏林芝也发现了冻原丝瓜藓的分布。该文详细描述了冻原丝瓜藓的形态结构特征,提供了显微形态学照片,并对其生境、地理分布以及与相似种的形态学进行了比较讨论。凭证标本存放于中国农业大学标本馆(BAU)。     

基于形态学特征和分子数据的中国缺齿藓科初步研究

为探讨缺齿藓类与真藓科、提灯藓科的系统关系,理清缺齿藓科的系统位置和中国缺齿藓科分类问题,该研究以中国分布的缺齿藓科植物和相关类群4 000余份标本为材料,进行详细的形态学研究,并选用其中35种、40份样品的4个DNA片段(rps4、trnG、trnL-trnF、atpB-rbcL)联合数据用于分子系统分析,采用邻接法(NJ)和最大似然法(ML)构建分子树。结果表明:(1)在分子树中,缺齿藓类与真藓科植物分别聚在具有高支持率的不同分支上,叶形、叶细胞等形态学特征也有较大差异,缺齿藓类应从广义的真藓科分出。(2)在分子树中,虽然缺齿藓类与提灯藓科植物聚在同一分支中,但无形态学的共源性状,二者不应视为一个单系类群。(3)缺齿藓科是一个自然类群,缺齿藓科内属间存在着密切的系统关系,缺齿藓科的主要识别特征为:植物体小型,茎常分枝;叶形和叶细胞为丝瓜藓型(Pohlia-like),披针形至长椭圆形,中上部细胞狭长,线状菱形或蠕虫形;生殖苞多生于新生枝顶;蒴齿为互生双齿层,常有不同程度的退化或一层蒴齿缺失,稀双层蒴齿缺失。(4)中国缺齿藓科包含有5属,即缺齿藓属(Mielichhoferia)、丝瓜藓属(Pohlia)、拟丝瓜藓属(Pseudopohlia)、合齿藓属(Synthetodontium)和小叶藓属(Epipterygium),目前为止共计34种(含种下分类单位)。     

念珠丝瓜藓(缺齿藓科)形态特征及其在中国的新分布

通过对中国产丝瓜藓属Pohlia(缺齿藓科Mielichhoferiaceae)植物系统地分类学研究,对本属一具有假根生念珠状排列的芽胞的种——念珠丝瓜藓的形态解剖学特征和地理分布进行了修订,并讨论了念珠丝瓜藓的生境,以及与其相近种泛生丝瓜藓、明齿丝瓜藓和黄丝瓜藓等进行了比较分析。根据标本信息,确定念珠丝瓜藓在中国的分布由原来的5省区扩大到10省区,并绘制了该种在中国的分布图。     

云南真藓和细叶真藓的核糖体DNA ITS序列分析

从形态特征和地理分布特征比较分析云南真藓和细叶真藓的区别,通过对核糖体DNA的内转录间隔区序列分析研究,对二者进行分子水平鉴定.对包括真藓属及相关属的6种植物的ITS序列进行扩增和测序,使用DNAMAN和MEGA3.0软件对获得的ITS序列数据进行分析.结果表明,云南真藓和细叶真藓的ITS-1和ITS-2区在序列长度,...     

基于ITS序列分析探讨杜鹃属映山红亚属的组间关系

以叶状苞亚属的叶状苞杜鹃为外类群,以杜鹃属映山红亚属（subg.Tsutsusi)2组12种杜鹃和羊踯躅亚属（subg.Pentanthera）3种4种杜鹃的ITS区（包括5.8S rDNA)的序列了系统学分析。3个亚属的ITS区序长度范围为642－645bp。排序后ITS区的序列长度为653个位点,gap做缺失处理时,变异位点和信息位点分别占6．58％和3．68％。运用PAUP4．0软件分析,获得15个最简树,步长为75,一致性指数（CI）和维持性指数（RI）值分别为0．9333和0．9515,利用15个最简约树获取严格一致树,结果表明：1）映山红亚属为一单系类群,其内部支持率为81％;2）不支持将R.ashiroi独立成假映山红组,也不支持将R.tashiroi并入映山红组,而支持将R.tashiroi并入轮生叶组中的观点;3）支持将R.tsusiophyllum并入映山红组中的观点;4）大字杜鹃的系统位置还需进一步的研究。     

新疆18种木灵藓属(Orthotrichum Hedw.)植物解剖结构研究

采用徒手切片法对新疆木灵藓属(Orthotrichum Hedw.)18种植物孢蒴上的气孔、茎和叶进行了比较解剖学观察。研究结果表明,木灵藓属植物茎横切结构形状稳定,由表皮和皮层组成,无中轴细胞分化;除半裸木灵藓(Orthotrichum hallii Sull.et Lesq.)外,其它种叶上部均为单层细胞;叶中部边缘外卷,叶细胞具有高度不同的分叉疣或单疣。在确定气孔显、隐型的基础上,茎和叶横切面的颜色、茎表皮和皮层细胞组成及细胞壁加厚程度、叶细胞疣的高度、叶中肋横切面的形状、中肋的宽度、细胞组成以及芽孢形态等特征可作为该属种间分类的依据。还根据18种木灵藓属植物孢蒴上的气孔显、隐型,及茎、叶的比较解剖学特征,编制了新疆木灵藓属植物的分种检索表。     

山羊草属二倍体物种核rDNA ITS区序列及其系统发育关系分析

测定了山羊草属（Ａｅｇｉｌｏｐｓ）二倍物种核ｒＤＮＡ ＩＴＳ区序列,发现其碱基粉介于６０１－６０７之间,比报道的小ｒｉｕｃｅａｅ）其他属的ＩＴＳ区我略长,Ｇ＋Ｃ含量达６１．１％～６２．９％,序列间的分化距离为０．００５０～０．０４６８。用ＰＨＹＬＩＰ３．５ｅ软件包对所测得的ＤＮＡ数据进行聚类分析,结果显示：１．Ａｅ．ｓｐｅｌｔｏｉｄｅｓ与该组其他种相距很远,支持将其从Ｓｉｔｏｐｓｉｓ组中独立出来,     

基于ITS序列探讨法落海的系统分类学地位

为研究法落海的系统分类地位,检测了法落海以及当归属和独活属共12种代表植物的核糖体DNA ITS序列,并结合GenBank中独活属4种代表植物的ITS序列,以羌活属的羌活(Notopterygium incisum)作为外类群,应用序列特征、遗传距离与系统树分析等方法对法落海的系统分类地位进行了分析。结果表明,依据不同的ITS区序列会得出不同甚至截然相反的结论:若依据ITS1序列,法落海应该归属到当归属;若依据ITS2序列,法落海应该归属到独活属。进一步分析法落海与当归属、独活属植物ITS区序列的碱基组成时发现,法落海在ITS1区拥有当归属植物的序列特征,而其ITS2区拥有独活属植物的序列特征。综上分析,支持法落海是介于当归属与独活属之间的一个分类群的系统分类观点。     

新疆石竹属野生种核糖体DNA的ITS序列与亲缘关系

新疆是我国石竹属植物分布和分化中心,种质资源丰富。通过采用PCR直接测序法,对新疆石竹属（Dianthus)植物野生种共8个种及外类群（Lychnis coronata Thunb)rDNA的ITS区（包括ITS－1,5.8S,rDNA和ITS－2）进行序列测定。研究结果说明,新疆石生属植物的ITS序列总长度为617－621bp,长度变异较小,仅相差4bp,种间序列同源性很高,达97．6％－99．8％,外类群的序列同源性为80％左右。ITS区序列在石竹属内是相当保守的,石竹属物种间序列变异位点基本上是转移多于颠换,且转移率较高,转换／颠换率为1．0－3．0。系统地位和亲缘关系分析表明分布于中国的石竹属植物3个组即齿瓣组（sect.Barbulatum Williams)和石竹组（sect.Dianthus),遂瓣组（sect.Fimbriatum Williams)的亲缘关系较远,而sect.Dianthus与sect.Fimbriatum Williams的亲缘关系较近。ITS系统发育树揭示了石竹组起源早于遂瓣组和齿瓣组,其结果与传统形态学论述存在很大差异。     

Phylogenetic inferences in Antennaria (Asteraceae: Gnaphalieae: Cassiniinae) based on sequences from Nuclear Ribosomal DNA internal transcribed spacers (ITS)

The phylogenetic relationships among sexually reproducing species of Antennaria (Asteraceae) are poorly understood. An earlier cladistic analysis based on morphology did not fully resolve the phylogeny of these taxa and therefore a different approach using molecular data was explored. The internal transcribed spacer regions (ITS-1 and ITS-2) of nuclear ribosomal DNA were sequenced for 30 species of Antennaria and one species from each of the outgroup genera Anaphalis, Ewartia, Leontopodium, and Pseudognaphalium. The ITS-1 sequence in Antennaria ranged from 253 to 260 base pairs (bp) in length, and the proportion of nucleotide differences between pairs of species of Antennaria ranged from 1 to 14%. For ITS-2, the divergence between pairs of species of Antennaria ranged from 0 to 8%. ITS-2 is shorter than ITS-1, ranging from 213 to 219 bp. Phylogenetic analysis indicates that, relative to the outgroups included, Antennaria is a well-supported monophyletic group. Based on the genera surveyed, Leontopodium appears to be the sister genus of Antennaria. The general topology of the molecular trees agrees with that based on previous morphological analyses and indicates that Antennaria is composed of six clades of equal rank, corresponding to the traditionally recognized informal groups, the Geyeriae, Argenteae, Arcuatae, Dimorphae, Pulcherrimae, and Catipes. Sequence and morphological data indicate that the Alpinae and Dioicae are unnatural, polyphyletic units that should be abandoned and redefined as the monophyletic Catipes group. Phylogenetic analysis of ITS sequences also suggests the dissociation of A. stenophylla from the Dimorphae, where it is traditionally placed, and its affiliation with the Argenteae, as well as the placement of A. arcuata in its own group.     

Sequence Analysis of the ITS Region of Nuclear Ribosomal DNA (nrDNA) in Chinese Amaranthus and Its Systematic Utility

The sequences of the ITS region (including ITS-1, 5.8S rDNA and ITS-2) of nuclear ribosomal DNA from 15 species of the genus Amaranthus L. and outgroup Celosia cristata L. were determined. The result shows that the size of the ITS region of Amaranthus is from 629 to 632 bp, and the length variation is only found in ITS-1 (250-253 bp). On the basis of phylogenetic analysis of nucleotide sequences, the Amaranthus species in China may be devided into three sections, viz., sect. Spinosus, sect. Amaranthus and sect. Paucestamen; the cultivated species, viz., Amaranthus paniculatus L., A. cruentus L., A. caudatus L. and A. hypochondriacus L. can be treated as the subsp. of A. hybridus L.; A. taishanensis F.Z.Li and A. tenuifolius Willd are both closely related to species in the sect. Paucestamen. The study also indicated that the number of stamens has more phylogenetic information than other characters, such as the number of sepals and dehiscence/indehiscence of fruits in Amaranthus.     

中国苋属nrDNA的ITS序列分析及其系统学意义

运用ＰＣＲ直接测序法,对苋属（Ａｍａｒａｎｒｈｕｓ Ｌ．）１５个种及外类群鸡冠花（Ｃｅｌｏｓｉａ ｃｒｉｓｔａｔａ Ｌ．）ｎｒＤＮＡ的ＩＴＳ区（包括ＩＴＳ－１,５．８５ｒＤＮＡ和ＩＴＳ－２）进行序列测定。结果表明苋属植物的ＩＴＳ序列总长度为６２９－６３２ｂｐ,长度变异仅发生在ＩＴＳ－１区（２５０－２５３ｂｐ）。采用ＰＡＵＰ软件进行系统发育分析表明：分布于中国的苋属植物可分为３组,即刺苋组（ｓｅｃｇ     

应用ITS区序列对秋海棠属无翅组分类学问题的探讨

以侧膜组（Sect.Coeloecentrum)的Begonia cirrosa和单裂组（Sect.Reichenheimia)的B.henryi为外类群,对秋海棠属（Begonia L.)无翅组（Sect.Sphenanthera)9种2变种及秋海棠组（Sect.Begonia)4种进行了ITS区（包括5.8s rDNA)序列的测定。发现该属的ITS序列较一般类群要长一些,所测的序列长度变化范围为648－743bp。这些序列经Clustal X软件排序后序列总长为756个位点,gap做缺失处理时,变异位点和信息位点分别占26.41%和10.11%。运用PAUP4.0b8软件分析,获得6棵最大简约树,步长为286,一致性指数（CI）和维持性指数（RI）分别为0.8287和0.7841,利用6棵最简约树获取严格一致树,并作Bootstrap检测。结果表明：1.支持将原无翅组内子房3室的种类移入秋海棠组,而将子房4室的种保留,成立四室组（Sect.Sphenanthera);2.将B.tetragona作为B.acetosella的异名处理得到一定的支持;3.B.crassirostris的系统位置有待进一步的研究。     

由5个DNA片段推断极度濒危植物五针白皮松的系统位置

五针白皮松(Pinus squamata X. W. Li)是上世纪90年代描述的一种中国特有松树,目前野外只有立木32株,处于极度濒危状态.前人认为这个种可能是白松亚属(subgen. Strobus)的白皮松(P. bungeana Zucc. ex Endl.)与松亚属(subgen. Pinus)的云南松(P. yunnanensis Franch.)的过渡类型,并将其归入白皮松组狐尾松亚组(subsect. Balfourianae).本文试图在前人分子系统学工作的基础上,检测五针白皮松5个DNA片段,叶绿体基因rbcL、matK、rpl20-rps18间隔区和trnV 内含子以及核糖体ITS,将五针白皮松放在整个松属中探讨其系统位置.4个叶绿体基因单独分析结果和它们的联合数据分析结果以及根据ITS得到的系统树均表明,五针白皮松是白皮松亚组(subsect. Gerardianae)的一个稳定成员,其可能的姐妹群是西藏白皮松(P. gerardiana Wall.).对白皮松亚组的地理分布作了初步探讨.     

基于ITS序列探讨忍冬属的系统发育关系

以七子花(Heptacodium miconioides)为外类群,运用MEGA软件对20种忍冬属植物进行系统发育分析,采用邻接法(NJ)和最大简约法(MP)构建系统发育树,从分子系统学角度探讨忍冬属下的亲缘关系.结果表明:(1)在NJ和MP系统树中,没有形成系统树的基部分支,忍冬亚属(Subg.Chamaecerasus)和轮花亚属(Subg.Lonicera)没有形成姐妹群关系.(2)在各系统树中,囊管组内的各种没有聚为一支,故认为对囊管组的划分应进一步探讨.(3)忍冬属ITS区(ITS1+ITS2)的信息位点达到11.0%,信息位点比较丰富,证明ITS序列可以为解决忍冬属植物的系统发育问题提供较强的证据.