交互分类信息系统和电子植物志的设计与实现──Ⅱ.分类排列和"系统学处理"软件系统

在前文中[1,2]，我们综述了分类信息系统的研究现状及存在的问题，介绍了新近建立的专门用于描述多个交互分类的数据模型--UNIC结构和OMES模型[3]，利用该数据模型和关系数据库建立了交互分类数据库中的数据文件。在此基础上，我们初步研制了一套分类排列"系统学处理"软件系统[4]，主要内容如下。1软件系统本软件系统包括两个组成部分：分类排列软件和"系统学处理"软件。图1示出了该软件系统与交互分类数据库间的关系，其中各方框间的带箭头直线表示数据查询或检索输出的过程与方向。两个软件生成的结果均为现阶段植物志中必不可少的部…     

中国植物分类编目的过去、现在和将来

至少上溯至《神农本草经》,我国已具备了有据可查的较为系统的植物分类编目,惟古代的植物分类编目及发展主要依循本草学传统,偏重于药用、饮食、园林布景等现实用途,终未形成现代意义上的系统科学分类,以致在近代落后于西方.文中较全面地回顾了我国植物分类编目的历史,综合比较了现在省级行政区的地方植物志和国家植物志等情况,并结合现在已完成的植物志编研过程中的问题,对我国未来的植物分类编目提出了展望.同时在文中指出了现在国内许多自然保护区以及其他建设项目的环境评价中涉及的植物调查编目缺乏标本凭证的现象,强调了植物分类编目过程中凭证标本的重要性.     

中国柽柳属植物的分支分类研究

选取生长习性、植物形态、解剖结构、花粉特征以及种子微形态特征等共66个性状,采用简约法对国产柽柳属16种植物及外类群红砂Hololachne songarica进行分支分析,并用靴带检验法(Bootstrap)计算内部分支的支持率。分支图表明,国产柽柳属植物分为4个分支,分别属于Baum(1978)所划分的组Ⅰ及组Ⅱ中不同的系,从一个侧面说明基于经典分类所划分的组是比较自然的,同意Baum的属下分类系统。同时,基于分支分类结果并结合分子证据,对国产柽柳属属间亲缘关系及有争议种的分类学地位进行了探讨,认为甘蒙柽柳是独立于中国柽柳的种,多花柽柳是独立于多枝柽柳的种,盐地柽柳是刚毛柽柳的变种,而叶抱茎呈鞘状的沙生柽柳和莎车柽柳系统学关系很近,是较为原始的一类柽柳。     

中国高等植物编目信息系统进展

Biodiversity research increasingly relies on distribution networks for dealing with large-scale primary data.Up-to-date information on biodiversity is critical for the proper management and conservation of any area. The first step towards conservation should be to compile an authoritative species inventory or checklist. Catalogue of Life:Higher Plants in China (CNPC) is an ongoing biodiversity informatics project with the aim to integrate existing higher plants inventory data, and provide access via an internet based web service to public user and the scientific com-munity. The CNPC, for the first time, provides integrated and authoritative taxonomic information on higher plant species found in China, and this database will be permanent, free and continously updated. Presently, a total of 34377 species have been included in the database. Among of them, 16 620 species are only found in China. Taxa are classified into 432 families and 3 941 genera. The CNPC will be an important source for scientists working on Chinese flora, and will play an important role in helping to achieve the targets set under the Global Strategy for Plant Conservation in the future.     

中国楠属(Phoebe Nees)植物分类补志

本文为《中国植物志》楠属(Phoebe Nees)编著后对疑难标本的继续研究,现报导2个新种并归并1个种。文中所引标本,除Poilane 1285外,均存本所标本室。     

植物分类研究室的十年

植物分类研究室的十年广西植物研究所分类研究室光阴似箭,日月如梭,１９８５年建所５０周年纪念活动,至今还记忆犹新,历历在目,转眼间又迎来了６０周年所庆。植物分类研究室作为一个与所同龄的基础性研究部门,经老一辈科学家的培植和经营,也随着所的发展而从小到大...     

iFlora与植物志修订的若干思考——以杜鹃花科白珠树属为例

结合现代植物学、DNA测序与信息等关键技术而产生的新一代智能植物志（iFlora）,其研发中最首要和迫切的任务之一就是如何将前沿、准确和完善的植物数据信息进行特色整合及智能化处理,为用户提供一个客观而科学的,具理论和实际应用为一体的植物学知识共享平台,并有效地为国民经济发展提供有价值的植物资源信息渠道。本文简要介绍了与传统植物志和目前常用的电子植物志数据库相区别的iFlora数据信息的分级内容、特点和功能,并强调了作为iFlora的核心数据信息,即用于物种鉴定的植物DNA条形码、关键形态学分类特征、植物图像等识别数据,以及分子系统发育数据等。以杜鹃花科（Ericaceae）白珠树属（Gaultheria）和其属下红粉白珠（G.hookeri）为例,介绍了iFlora采用的三类数据（核心数据、基础数据和拓展数据）构成的三级信息及其功能,同时探讨了信息整合时可能遇到的问题。     

植物分类学的历史回顾与展望

对植物分类学的研究历史进行了简要的回顾.讨论了不同历史时期植物分类学研究的特点以及该时期代表的分类学家和他们的专著,分析了植物分类学的发展趋势以及我国植物分类学工作者所面临的挑战.     

中国柿科植物志资料

<正> 笔者在编写《中国植物志》柿科过程中,发现了一些未经描述的分类群,现发表如下: 梵净山柿 新种     

秦岭种子植物数据库信息系统的结构和功能简介

秦岭种子植物数据库已经建成,本文简介了建库目标,系统结构和功能,本库对秦岭种子植物１６９科１０１０属３０２８种按基本信息,名称,分布和用途等设计了方便的检索查询系统,对它在秦岭植物资源开发,利用和保护以及生物多样性,区系研究等方面的应用也做了讨论。     

广西主要经济植物的多媒体信息系统

介绍了广西主要经济植物资源多媒体信息系统的研制及其功能 ,为开展生物信息系统的研究提供了可借鉴的范例     

新一代植物志:机遇与挑战

植物多样性是地球生态系统和人类赖以生存的基础,植物资源是我国经济社会可持续发展不可或缺的条件。植物志(Flora)是植物多样性保护和可持续利用最为基础的植物典籍,它为物种的准确鉴定提供了必要的前提和保证,为合理利用植物资源提供了重要的信息和科学依据,在服务于我国国民经济和社会发展,提高公众对生物多样性的认识等方面发挥着重要作用。     

XML—实现DELTA在INTERNET分布和跨平台操作的新途径

许多专家把DELTA格式和DELTA系统应用于各种生物类群的分类学研究中。随着的更新和新需求的不断出现,DELTA不适用于Internet发布和跨平台操作等缺点也逐渐暴露出来。可扩展置标语言XML（eXtensible Markup Language)是一门新兴的面向Internet的置标语言,具有巨大的发展前景,应用XML正好可以弥补DELTA的这一不足。本文着重介绍了XML语言的技术优势,探讨了根据DELTA数据格式,将XML应用于DELTA系统的方法,并以小蜂总科为例给出了相应的XML描述文件。     

《广西植物志》秋海棠属(Begonia L.)增订

秋海棠属(Begonia L.)隶属于葫芦目(Cucurbitales)秋海棠科(Begoniaceae),有1 800余种,是世界第六大属,主要分布于美洲、非洲和亚洲的热带和亚热带地区,具有极高的观赏价值,亦可作为药用、食用、饮料和饲料等。我国有秋海棠属植物近300种,主要分布于我国的云南和广西等长江以南地区,其中云南有秋海棠属植物100余种。近年来,随着广西地区秋海棠属植物野外调查的不断深入,陆续发现并发表了大量秋海棠属新类群,使得广西产秋海棠属植物数目已超出1991年《广西植物志》(第一卷)收录的19种,因此亟需对发表于不同期刊中的类群进行系统地整理和汇总。鉴于此,该文通过查阅文献资料和考证标本信息,整理并汇总了广西产秋海棠属植物共84种,包括2个变种、11个亚种和46个特有种,新增的65种为《广西植物志》(第一卷)中未收录的类群,并补充了这些类群的特征集要、凭证标本信息和属下分组概况,为今后开展秋海棠属植物的分类修订以及系统学、进化生物学和保护生物学等研究提供了参考依据。     

经典植物分类学的发展与iFlora

简要介绍了经典植物分类的基础工作,即鉴定、描述、命名和分类,以及发展动向。作者认为计算机辅助鉴定（如delta intkey）将成为形态鉴定的常规手段;模式识别技术是植物图像鉴定的发展方向;突出物种遗传本质的分子鉴定将成为植物物种鉴定的核心。DELTA系统或类似的符合计算机逻辑的分类学描述语言将成为新一代植物志（iFlora）的基本语言。近20年来,一些学者逐渐表现出对现行植物命名法规的质疑和修改意愿,特别是生物法规草案（Draft BioCode）和谱系法规（PhyloCode）两个试行法规的诞生。它们促进对法规的革新与完善,并在iFlora中得以体现。以APG系统为代表的分子系统发育研究已经成为植物系统分类研究的主流,但在物种层面,物种的界定仅仅依靠分子信息显然是不够的,而必须运用综合的特征性状信息进行分析解读,真正实现物种在形态、遗传信息等综合性状的融合统一。了解和掌握这些新的技术和研究成果,无疑对于iFlora设计和编研有着重要的参考意义,而基于新技术和新理念的iFlora也将成为植物分类最新发展成果的集中体现。     

中国植物志、Flora of China和维管植物新系统中科的比较

《中国植物志》和“Flora of China”是目前世界上最大型、记录植物种类最多的植物志,它为有效保护和合理利用我国的植物资源提供了极为重要的基础信息和科学依据。近年来,基于分子系统学研究提出的APG系统被广泛接受,相应方法得到的系统也相继应用于整个维管植物中。以APG系统为代表的维管植物新系统为全面和系统地修订植物志提供了新的系统框架。本文依据最新的分子系统学“线性排列”成果与《中国植物志》和“Flora of China”在科级水平上进行对比,确定了以APG系统为代表的分子系统框架下中国维管植物为309科,其中石松类和蕨类植物38科,裸子植物10科和被子植物261科。尽管中国维管植物不少科的界限发生了较大的变化,其总数却变化不大,在《中国植物志》中为300科,“Flora of China”为309科。此外,还重点介绍了一些主要科的变动情况。