REGULAR ARTICLES

Marginal Analysis of Correlated Failure Time Data with Informative Cluster Sizes
Nous nous intéressons à la modélisation de données de survie corrélées quand la connaissance de la taille des strates peut fournir une information sur le critère de jugement. Celle-ci est basée sur une approche de ré-échantillonnage au sein des strates et sur une méthode de fonction de score pondérée. Nous déterminons les propriétés asymptotiques pour les estimateurs de ré-échantillonnage au sein des strates dans le cadre d'un modèle à risques proportionnel de Cox. Nous établissons la convergence et la normalité asymptotique des estimateurs des coefficients de régression et la propriété de convergence faible des estimateurs de la fonction de base du risque cumulé. La méthode de fonction du score pondérée consiste à prendre l'inverse de la taille des strates comme poids dans la fonction de score. Nous procédons à des études de simulations pour déterminer et comparer le comportement des estimateurs pour des échantillons finis et appliquons les méthodes proposées à une étude dentaire.     

DISTRIBUTION QUANTITATIVE DES DIVERS PHOSPHO-LIPIDES DANS LES NEURONES ET LES CELLULES GLIALES ISOLES DU CORTEX CEREBRAL DE RAT ADULTE

Resumé–— On décrit une méhode de préparation de neurones et de cellules gliales à partir du cortex cérébral, basée sur la dissociation du tissu à travers un tamis en nylon suivie ď une ultracentrifugation différentielle sur gradients de sucrose et de Ficoll.
On a dosé le DNA, ľazote protéque et les divers phospholipides. II ressort que le taux ď DNA par cellule est identique dans les neurones et les cellules gliales. Par contre, la quantité absolue ďazote protéique est 2.8 fois plus élevée dans les cellules gliales, celle des lipides totaux et des divers phospholipides 5-6 fois plus élevée.
La proportion de chacun des phospholipides dérminée par rapport aux phospholipides totaux est similaire dans les deux types cellulaires.     

CONSULTANT'S FORUM

Random Effects Modeling Approaches for Estimating ROC Curves from Repeated Ordinal Tests without a Gold Standard
Estimer la pertinence d'un diagnostic médical constitue une difficulté majeure en l'absence d'un test de référence (gold standard). Quoique la littérature scientifique abonde en la matière pour les tests diagnostiques répétés binaires, elle s'avère beaucoup plus pauvre en travaux applicables aux tests ordinaux. A cela fait exception le travail de Zhou et al. (2005), proposant une méthodologie pour estimer des courbes ROC sans gold standard, à partir des données répétées issues de tests diagnostiques ordinaux. Mais cette méthodologie repose sur l'hypothèse d'indépendance des résultats aux tests, conditionnellement au vrai diagnostic. Je propose donc ici des approches de modélisation à effets aléatoires intégrant la dépendance des tests ordinaux entre eux, et je montre, au travers de résultats asymptotiques et de simulations, toute l'importance de bien prendre en compte cette dépendance. Ces modélisations, ainsi que l'importance de la dépendance entre les tests, sont illustrées par une réanalyse des données présentées par Zhou et al. (2005) sur le cancer utérin.     

Estimating larger carnivore numbers from track counts and measurements

Résumé Avoir conscience de l'abondance des grands carnivores est très important pour la gestion de leur conservation. Cependant, l'évaluation directe des nombres de carnivores est souvent difficile, nècessitant beaucoup d'argent et de temps, ce qui importe que l'échantillonnage indirect est une alternative fiable et valable. Les techniques de recensement à distance se sont montrèes économiques, renouvelables, et objectives. Nous avons donc estimé le nombre de grands carnivores de six espèces dans une superficie assez petite au nord de l'Afrique du Sud, en comparant trois méthodes d'échantillonnage basèes sur des décomptes des traces et mesures: (i) une approche qualitative, où les individus furent identifiés de manière subjective en étudiant les différences dans les mesures des traces; (ii) une approche quantitative qui se sert de la forte corrélation linéaire de la densité des traces à la densité des carnivores démontrée dans d'autres études; et (iii) une approche quantitative qui impliquent des analyses répétées de la variance et des post-enquêtes sur les mesures des traces afin de disposer des données statistiques pour identifier les différences entre des services des traces. Les trois méthodes fournirent des résultats comparables qui semblent raisonnables et qui peuvent être une bonne indication du vrai nombre de grands carnivores dans la zone de l'étude. Les rèsultats étayent la fiabilité des estimations indirectes de l'abondance de grands carnivores basés sur les données des traces, et sont prometteurs pour des futures recherches et pour la conservation de ces animaux.     

Etude Ultrastructurale de la Sporulation de Paramarteilia orchestiae gen. n., sp. n., Parasite de l'Amphipode Orchestia gammarellus (Pallas)

RESUME. L'individualisation de 2 spores bicellulaires à partir d'un měme pansporoblaste caractérise la sporulation du parasite de l'Amphipode Orchestia gammarellus (Pallas) précédemment décrit sous le nom de Marteilia sp. Cette sporulation le distingue des espèces du měme genre parasite d'Hutres qui sont toutes caractérisées par la production de spores tricellulaires. Les conditions semblables dans lesquelles les pansporoblastes paraissent se differencier à partir d'une cellule souche dans laquelle ils poursuivent leur évolution vers la sporogenèse ainsi que divers caractères cytologiques communs, nous incitent à maintenir tous ces parasites dans une měme famille mais à placer celui de l'Amphipode dans un genre différent. Nous proposons de le nommer Paramarteilia orchestiae gen. n., sp. n.
Ces parasites ne peuvent ětre maintenus dans les Protozoaires en raison de leur évolution vers la pluricellularité et de l'individualisation de ces éléments somatiques que représentent la cellule souche primaire, les pansporoblastes et cellules sporales (à l'exception des sporoplasmes). Il semble logique de les inclure dans l'embranchement des Myxozoaires créé par Grassé pour les Myxosporidies et Actinomyxidies qui différencient également des spores pluricellulaires et des éléments somatiques. Les centrioles à 9 singlets de P. orchestiae ainsi que les cellules primaires uninucléées, quel que soit le nombre de pansporoblastes qu'elles contiennent, peuvent ětre considérés comme des caractères résiduels d'Unicellulaires.     

DISCUSSION PAPER

R. L. Prentice, M. Pettinger, and G. L. Anderson          899
Statistical Issues Arising in the Women's Health Initiative
Nous proposons un bref panorama du plan de l'essai clinique et de l'étude observationnelle de la WHI, ainsi qu'un résumé des résultats obtenus à partir de la partie de l'essai clinique dévolue à la thérapeutique hormonale post-ménopause. Depuis son démarrage en 1992, la WHI a été confrontée à plusieurs questions de nature statistique pour lesquelles de plus amples développements méthodologiques étaient nécessaires. Parmi ceux-ci, la modélisation des erreurs de mesure, et des méthodes d'analyse pour l'évaluation de la diététique et de l'activité physique; des méthodes de surveillance d'essai clinique lorsque les traitements peuvent concerner plusieurs champs cliniques aussi bien en bénéfice qu'en réaction adverse; le plan d'étude et les procédures d'analyse pour des données génomiques et protéiques de dimension élevée; et aussi des procédures d'analyse de données de durée lorsque les rapports de risque dépendent du temps. Ce dernier point apparaît important pour comprendre les différences entre les résultats de l'essai clinique et ceux de l'étude observationnelle en ce qui concerne le traitement hormonal postménopause et la pathologie cardio-vasculaire.     

Ormieresia carcini gen. n., sp. n., Microsporidie du Crabe Méditerranéan, Carcinus mediterraneus Czerniavsky, 1884: Cycle Évolutif et Étude Ultrastructurale

RÉSUMÉ. Une nouvelle microsporidie, Ormieresia carcini gen. n., sp. n., est trouvée dans Carcinus mediterraneus Czerniavsky, 1884. Son évolution et ses ultrastructures sont étudiees.
Le cycle débute par un méronte limité par une membrane unitaire et possédant un diplocaryon. Toute la sporogonie se déroule dans la musculature de l'höte. Les stades sporogoniaux sont enveloppés dans une membrane pansporoblastique persistante. Dans chaque pansporoblaste, la sporoblastogenése (donnant naissance à 8 sporoblastes) est particulière; un plasmode sporogonial octonucléé manque. Au cours des divisions schizogoniques et sporogoniques, chaque centre cinétique est formé de 2 plaques, une incluse dans l'enveloppe nucléaire, l'autre occupant une position extranucléaire. Les sporontes en division et les sporoblastes sécrètent des substances métaboliques (granules, tubes) qui sont déposées dans l'espace pansporoblastique.
La spore uninucléée est longue et cylindrique (19,1 × 2,4 μm). Un manubrium rectiligne traverse la spore. Son extrémité postérieure se rétrécit brusquement en un filament polaire décrlvant 4 ou 5 tours de spire. L'extrémité antérieure du manubrium est attachée au capuchon polaire lui-même comprimé par un double anneau. La partie antérieure du manubrium est entourée par un polaroplaste formé d'une zone spongieuse et d'une zone lamellaire.     

On vegetable love: gardening, plants, and people in the north of England

La comparaison du corps humain à une machine est une métaphore dominante dans la pensée occidentale depuis le Siècle des Lumières au moins. À partir de recherches menées dans le Nord de l'Angleterre auprès de jardiniers, l'auteure explore un autre ensemble d'associations. Elle examine les implications des pratiques et connaissances du jardinage en Angleterre qui mettent l'accent sur des parallèles réciproques entre le corps et l'intentionnalité des humains et ceux des plantes. Bien que les humains ne soient pas assimilés aux végétaux, les plantes sont intégrées dans une vision du monde qui n'est pas rigoureusement mécaniste. L'auteure examine les implications qu'aurait une approche «simplement>> métaphorique de ces liens entre plantes et personnes et avance qu'il faut, pour les décrire, un cadre théorique dont l'espace analytique irait au-delà de la métaphore.     

Rights violations, rumour, and rhetoric: making sense of cannibalism in Mambasa, Ituri (Democratic Republic of Congo)

In January 2003, in the midst of civil war, Mbuti pygmies from Mambasa, Ituri, informed human rights organizations and the media that relatives had been killed, cooked, and eaten by soldiers of the Mouvement pour la Libération du Congo (MLC). Nearly two years later, spectacularly, the accusers withdrew their testimonies. This article tries to make sense of the allegation and subsequent retraction by reviewing how the Congolese print media covered the story. Against the backdrop of turbulent politics and moral crisis, it is argued that 'Cannibalism in Mambasa' needs to be understood first and foremost as a politically driven metaphor of extreme violence and suffering, even though acts of cannibalism cannot be ruled out.  

Résumé

En janvier 2003, en pleine guerre civile dans l'Ituri, des Pygmées Mbuti de Mambasa informèrent les organisations humanitaires et les médias que des membres de leur tribu avaient été tués, cuits et dévorés par les soldats du Mouvement pour la Libération du Congo (MLC). Deux ans plus tard, les accusateurs se rétractaient spectaculairement. Le présent article tente de donner un sens à ces accusations puis aux rétractations, à travers la couverture de cette affaire par la presse congolaise. L'auteur affirme que dans ce contexte de grave crise politique et morale, le « cannibalisme à Mambasa >> doit être d'abord, et avant tout, compris comme une métaphore politique de violence et de souffrance extrêmes, bien que l'on ne puisse pas exclure la possibilité que des actes de cannibalisme aient bien été commis.     

REGULAR ARTICLES

Line Transect Methods for Plant Surveys
En raison de la nécessité de bien quantifier la diminution de la biodiversité, on observe actuellement un regain d'intérêt pour les méthodes de suivi de l'abondance des plantes. Les suivis par transects constituent une méthode efficace de suivi pour de nombreuses espèces. Mais dans certaines circonstances, la méthode ne fonctionne pas bien, par exemple quand les sites d'étude sont petits, quand les plantes ont des distributions très agrégées, ou quand les plantes qui se trouvent sur la ligne ne sont pas facilement détectables. Pour résoudre ces problèmes, nous utilisons une stratégie basée sur des transects croisés combinés à des méthodes qui exploitent l'information additionnelle que fournissent de tels plans expérimentaux. Cette méthode est illustrée avec des données provenant d'une colonie de primevères coucou.     

DISCUSSION PAPER

C.-F. Burman and C. Sonesson              664
Les plans adaptatifs permettent, en cours d'étude, de modifier le plan d'expérience initial de façon importante. La taille de l'échantillon, en particulier, peut être réévaluée au vu de données intermédiaires ou d'informations extérieures à l'essai. Dans les plans adaptatifs standard, on associe ces modifications à un test pondéré qui garantit le contrôle de l'erreur de première espèce. Cette méthode, cependant, viole des principes de base de la statistique inférentielle. C'est ainsi que, dans un exemple portant sur des données indépendantes issues de la loi normale N (μ, 1), un test adaptatif peut rejeter l'hypothèse nulle μ≤ 0, alors même que la moyenne des observations est négative. Nous en concluons que les plans adaptatifs, au moins dans leur forme la plus générale où l'on recourt à un test pondéré, ne sont pas valides. Nous discutons plusieurs modifications possibles de cette méthodologie des plans adaptatifs, en nous concentrant sur la recherche de solutions satisfaisantes quant aux tests d'hypothèses.     

The Virgin of Guadalupe: a nexus of affect

Par le biais d'une analyse des célébrations actuelles de la Vierge de Guadalupe à Rome, l'auteure discute de la manière dont la Vierge fait écho aux inquiétudes pour «la patrie et la foi>> ( patria y fe ) ainsi que sur la mobilisation de la foi catholique en réaction aux sécularisme. Les célébrations performatives de la Vierge révèlent une unité fantasmatique de la nation et de la famille par le biais de l'affect et de tensions raciales subtiles au sein, d'une part, de la migration transnationale religieuse liée à la politique diocésaine et missionnaire, et d'autre part à la diffusion à l'étranger de narrations culturelles et indigènes d'une identité mexicaine. En s'intéressant aux traces de la guerre des Cristeros au Mexique (1926-1929), remises en récit sous un angle affectif dans la Rome du XXI^e siècle, l'auteure affirme que la célébration de la Vierge de Guadalupe ne manifeste pas une religiosité liée au retour des dépossédés et à un symbole de libération (comme cela semble faire être le cas à la frontière entre le Mexique et les États-Unis) mais elle devient plutôt, dans ce contexte, un point de fusion des affects qui signale la montée en puissance d'une Église catholique transnationale empreinte d'orthodoxie ultramontaine.     

A checklist of the termites of Ethiopia with a review of their biology, distribution and pest status

Records of termites from Ethiopia, including those obtained during recent visits, indicate 61 species belonging to 25 genera and four families. The fauna includes Pan-African, East African, and West African or sub-Sahelian species, a single Palaearctic species and ten species endemic to Ethiopia and the neighbouring region. The distributions within Ethiopia of at least some of the species correlate with their overall African distributions; altitude plays an important part. The biology and pest status of each species are discussed. Macrotermitinae, especially Macrotermes sp. and Microtermes spp. constitute the greatest threat to agriculture, while a range of species are potentially damaging to wooden structures.

Résumé

Les relevés de termites d'Ethiopie, y compris ceux obtenus lors de visites récentes rapportent 61 espkces appartenant à 25 genres et à 4 familles. La faune inclut des espèces pan-africaines, est-africaines, ouest-africaines ou sub-sahéliennes, une seule espèce paléarctique et dix espèces endémiques à 1'Ethiopie et aux régions voisines. La distribution à I'intérieur de 1'Ethiopie d'au moins quelques espèces s'accorde avec leur distribution dans toute I'Afrique, l'altitude joue un rôle important. La biologie et le caractère de nuisance de chaque espèce sont discutés. Les Macroterminae, et spécialement Macrotermes spp. et Microtermes spp. représentent la plus grande menace pour l'agriculture, alors qu'une série d'espèces pourraient causer des dommages aux structures en bois.     

Composition du liquide seminal de Sparus aurata au cours d'une saison de spermiation

Résumé Du sperme de daurade Sparus aurata est prélevéà diffkrentes dates de la saison de spermiation. La composition biochimique du plasma séminal est analyské.
La concentration des éléments dosés est généralement plus importante que chez les espèces d'eau douce. La teneur en protéines reste constante au cours du temps. La quantité de glucose accuse une diminution à partir de la mi-décembre. Les triglycérides et le cholesterol atteignent des valeurs relativement elevees aux dates limites de la période d'échantillonnage, tandis que le taux de calcium est minimal à la fin de la saison de spermiation.     

CONSULTANT'S FORUM

Time-Varying Coefficient Models for the Analysis of Air Pollution and Health Outcome Data
Nous présentons un modèle à coefficient dépendant du temps pour étudier la relation entre exposition aiguë (à court terme) à la pollution atmosphérique et altérations de la santé. Ce modèle permet au risque relatif de varier en fonction du temps comme cela peut se produire en cas d'interaction avec la température ou de modification de la composition en polluants, par exemple en particules solides. Le modèle fournit une estimation lissée de ces effets dépendant du temps sans qu'il soit nécessaire de spécifier une forme paramétrique particulière. Cette forme est estimée à partir des données à l'aide de fonctions spline cubiques pénalisées. Nous développons des modèles de régression de Poisson dont les coefficients sont estimés soit en maximisant une quasi-vraisemblance par une procédure itérative de moindres carrés repondérés, soit par une approche bayésienne utilisant une méthode de Monte Carlo par chaîne de Markov (MCMC). L'efficacité de ces approches pour estimer différents effets dépendant du temps est évaluée par simulations et les modèles sont appliqués aux données recueillies dans quatre villes pour l'enquête NMMAPS (Enquête Nationale Morbidité, Mortalité et Pollution Atmosphérique).     

READER REACTION

Sensitivity Analysis: Distributional Assumptions and Confounding Assumptions
Dans la présentation de diverses méthodes pour évaluer la sensibilité des résultats de la régression à une variable de confusion non mesurée, Lin et al. (1998) utilisent une hypothèse d'indépendance conditionnelle pour en déduire des relations algébriques entre l'effet de la véritable exposition et l'effet de l'exposition apparente dans un modèle réduit qui ne contrôle pas la variable de confusion non mesurée. Néanmoins, Hernán et Robbins (1999) ont noté que si les covariables mesurées et la confusion non mesurée affectent ensemble l'exposition d'intérêt, alors la principale supposition d'indépendance conditionnelle qui est utilisée pour en déduire les relations algébriques ne peut pas se produire. Un résultat particulier de Lin et al. n'est pas reliéà la supposition d'indépendance conditionnelle mais seulement à des suppositions concernant l'additivité. Il peut être montré que cette dernière supposition est satisfaite pour une famille entière de distributions même si les covariables mesurées et la variable de confusion non mesurée affectent ensemble l'exposition d'intérêt. Ces considérations clarifient le contexte approprié dans lequel des techniques d'analyse de sensibilité pertinentes peuvent être appliquées.     

L'ACÉTYLCHOLINE ET L'ADRÉNALINE CHEZ LES INVERTÉBRÉS

1^o. Le tableau 2 résume ce que l'on sait sur la présence ďacétylcholine et de cholinestérase chez les Invertébrés, ainsi que sur la sensibilityé. des tissus àľacétylcholine et aux poisons qui paralysent ľaction de cette substance.
2^o. La présence de nerfs cholinergiques est démontrée chez les Annélides ( Armicolu, Aphrodite, Lumbricus, Hirudo ), et les Siponculiens ( Sipuncuh ), chez les 1 Iolot huries, chez un seul mollusque ( Venus mercenaria ).
3^o. Ľexistence de nerfs cholinergiques est inconcevable chez les Cœntérés.
4^o. Chez les Arthropodes (Crustacés, Insectes et Arachnomorphes) tout porte à croire que les nerfs ne transmettent pas ľ'excitation par ľintermédiaire ľacétykholine.
5^o. Chez leo Mollusques, àľexception de Venus mercenaria , tous, les essais de démonstration de nerfs cholinergiques ont échoué.
6^o. Ľexistence de nerfs adrénergiques chez les Annélides est très probable, mais non encore certaine; de tels nerfs existent vraisemblablement chez les Céphalopodes et chez ľaplysie.
7^o. Le cmur et les tissus des Invertébrés manifestent pour ľadrénaline et les amines syrnpathicomimétiques une sensibilityé non spécifique, le plus souvent faibie.     

READER REACTION

B. C . Jung , M . Jhun , and J. W . Lee              626
Ridout, Hinde et Demétrio (2001, Biometrics 57, 219–223) ont construit un test du score pour tester un modèle de régression de Poisson à inflation de zéro (ZIP) contre des alternatives binomiales négatives à inflation de zéro (ZINB). Ils précisent que le test du score utilisant l'approximation normale peut sous estimer le niveau de signification nominal notamment pour des petits échantillons. Pour y remédier, une méthode de bootstrap paramétrique est proposée. On montre que la méthode du bootstrap garde un niveau de signification proche du nominal et a une puissance uniformément plus grande que l'approximation normale existante pour tester cette hypothèse.     

Economies of affect

Cet article développe le concept des «économies de l'affect>> pour attirer l'attention des anthropologues sur le rôle de l'affect dans la facilitation des transformations économiques. Il s'appuie sur les résultats de deux projets de terrain ethnographiques, l'un au Mexique et l'autre en Indonésie, pour montrer comment l'affect a été mobilisé pour créer des sujets pouvant être appréhendés selon les normes néolibérales. Les auteurs montrent comment l'étreinte, les pleurs et les discours sur l'amour et le chagrin ont été associés à des transformations impliquant la cessation de prestations de l'État et l'application des lois du marché. En faisant de l'affect et de son articulation avec le changement économique un objet d'étude anthropologique, l'article affirme l'utilité d'une notion d'affect se démarquant d'autres approches qui mettent l'accent sur l'émotion. Les auteurs affirment que l'affect est utile parce qu'il est, par nature, réflexif et intersubjectif. L'affect renvoie aux relations pratiquées entre les individus, à la différence de l'émotion, toujours marquée par le spectre d'un individualisme psychologique.     

BIOMETRIC METHODOLOGY

Matching in Studies of Classification Accuracy: Implications for Analysis, Efficiency, and Assessment of Incremental Value
Dans les études cas-témoins qui visent àévaluer une classification effectuée à partir d'un marqueur, il est courant d'apparier les témoins aux cas sur des facteurs liés à la maladie et au marqueur. Dans ce type d'études, par opposition aux études étiologiques, l'appariement n'a pas fait l'objet de travaux rigoureux. Nous étudions les implications de l'appariement sur le choix d'un modèle d'analyse statistique, sur l'efficacité et sur l'évaluation de l'apport supplémentaire du marqueur par rapport aux variables d'appariement. Nous observons que l'ajustement sur les variables d'appariement est essentiel car les mesures non ajustées des qualités du marqueur peuvent être biaisées. Dans de nombreuses situations, l'appariement est la plus efficace des méthodes d'échantillonnage en fonction des covariables et nous donnons une expression du rapport optimal nombre de cas/nombre de témoins. En revanche, nous montrons également que l'appariement complique sérieusement l'évaluation de l'apport supplémentaire du marqueur. Nous recommandons d'envisager l'intérêt d'un appariement à la lumière de ces résultats.