急性髓系白血病铁死亡相关基因筛选及预后模型的建立

基于急性髓系白血病(Acute Myeloid Leukemia,AML)临床大数据及多组学数据库探讨铁死亡相关基因在AML中的作用,并建立铁死亡基因表达相关预后模型。整合TCGA数据库中151例AML患者和GTEx数据库中337例正常人外周血的临床和转录组数据。将Wilcoxon检验和单因素Cox分析结果取交集,筛选出预后相关差异表达基因(Differential Expression Genes, DEGs),使用Lasso回归建立基因标志物预后模型,利用受试者工作特征曲线(Receiver Operating Characteristic Curve,ROC曲线)评价预测价值,Kaplan-Meier法进行生存分析,对AML患者临床数据进行单因素和多因素Cox回归分析,使用差异基因表达分析等方法比较高、低风险患者间的组学差异,最后,利用BeatAML数据库对基因标志物进行验证。将差异基因表达分析和单因素分析结果取交集,得到13个预后相关DEGs。构建了8个基因标志物的预后评分模型,并将患者分为高、低风险两组;ROC曲线分析证实了模型良好的预测性能;生存分析提示高、低风险组患者的生存率具有显著差异;单因素分析显示年龄和风险评分与患者整体生存显著相关,多因素分析显示,年龄和风险评分是独立预后指标。在2个风险组之间筛选出384个DEGs,GO富集分析结果显示,富集的基因大多与中性粒细胞和白细胞的趋化与迁移等免疫相关分子和通路显著相关,KEGG富集通路主要与TNF信号通路、细胞因子与细胞因子受体相互作用相关。BeatAML数据库验证结果显示,5个基因与预后显著相关。铁死亡相关基因在AML中显著表达,且高风险患者预后较差,该研究对AML铁死亡相关潜在生物标志物的发现和应用奠定了一定的基础。     

免疫相关基因FGF13、GZMB、FLT3、CRLF3可能与急性髓系白血病患者预后密切相关

为了构建急性髓系白血病（AML）患者的预后风险模型,本研究通过IMMPORT数据库提取免疫基因,通过基因表达综合（GEO）数据库和AML相关转录组RNA测序数据集筛选差异表达的免疫基因,基于癌症基因组图谱（TCGA）数据库下载AML相关的表达谱数据集（TCGA-LAML）及临床数据,对差异表达的免疫基因进一步进行单因素COX回归分析和多因素COX回归分析,最终确定了关键免疫基因,随后根据免疫基因进行单基因预后分析以及免疫浸润分析。结果显示：与正常对照组相比,在AML患者的骨髓样本中,有55个免疫基因显著上调或下调,其中由4个免疫基因（FGF13、GZMB、FLT3、CRLF3）构建的风险模型能预测AML患者的预后[曲线下面积（AUC）=0.741];高风险组和低风险组之间免疫细胞的含量存在显著差异,其中FGF13、CRLF3为低风险基因,GZMB、FLT3为高风险基因。这为4个免疫基因FGF13、GZMB、FLT3、CRLF3及其构建的风险模型用于监测AML患者的预后和免疫浸润情况提供了理论基础。     

急性髓系白血病ERG、MDR1及BAALC基因的表达水平及临床意义

目的:探讨急性髓系白血病(acutemyeloidleukemia,AML)患者骨髓单个核细胞的ETS相关基因(ETS related gene,ERG)、多药耐药基因1(Multidrug resistance gene 1,MDR1)、脑和急性白血病胞质(Brain and acute leukemia cytoplasmic,BAALC)基因的表达水平及临床意义。方法:选取90例成人AML患者为研究对象,均接受蒽环类药物诱导化疗联合阿糖胞苷等进行初步治疗,采用实时荧光定量检测PCR技术检测治疗后的骨髓单个核细胞ERG、MDR1、BAALC基因表达,并分析其与患者临床特征、危险度分层、治疗疗效、生存率的关系。结果:AML患者ERG、MDR1、BAALC基因均有强表达,三因子表达强弱同白细胞、血小板等临床指标无明显相关性(P0.05),不同危险度分层对应的ERG、MDR1、BAALC表达之间有明显差异,中危组、高危组患者表达强度均高于低危组(P0.05)。ERG、MDR1低表达组对应的疗效CR(93.1%%,89.6%)、OS(56.5%, 66.7%)较高表达组CR(61.4%, 81.3%)、OS(56.5%,66.7%)值更高(P0.05),不同BAALC表达者疗效CR及生存率OS比较差异无统计学意义(P0.05)。结论:AML患者单个核细胞的ERG、MDR1基因表达水平与其危险度分层、疗效和生存率呈负相关,以REG和MDR1同AML关系敏感,BAALC敏感度较低,联合检测REG、MDR1、BAALC基因表达可能提高AML患者危险度分层、疗效及预后判读的准确度。     

Nestin基因在髓系白血病的表达及意义

Nestin蛋白是一种神经干细胞标志物,参与组织修复,并且在一些肿瘤细胞中表达。最近研究报道称nestin可能参与肿瘤细胞恶性增殖及细胞侵袭。在急性淋巴细胞白血病(acute lymphoid leukemia,ALL)小鼠模型中,白血病增殖细胞(leukemia-propagating cells,LPCs)可形成一个抗药性niche,其中nestin阳性细胞参与该niche形成。为探索nestin基因在白血病患者的临床表达情况,通过RT-PCR和Western-blot实验方法 ,检测了50位髓系白血病患者的nestin基因的临床表达情况。结果发现,在50位髓系白血病患者(38位AML,12位CML)中,42位患者表达nestin基因mRNA,6位患者表达nestin蛋白,并且nestin基因表达水平和患者血红蛋白、血小板、细胞因子和T淋巴细胞数并不存在相关性,但是高白细胞白血病患者表现出nestin基因mRNA水平高表达。虽然nestin基因和患者完全缓解率(complete remission,CR)并不存在联系,但是nestin基因在髓系白血病异常表达,说明其可能作为一种诊断AML或CML的生物标记物。     

急性髓系白血病相关基因的DNA甲基化

急性髓系白血病(acute myeloid leukemia,AML)是异质性造血干细胞恶性克隆性疾病,主要表现为外周血、骨髓以及其他组织中的原始细胞克隆性扩增。近年来,AML发病率呈逐年增加的趋势,对人类健康产生巨大的威胁。在不同种族及不同性别中,AML发病率及死亡率存在显著差异。AML是一种复杂疾病,与遗传突变及异常表观遗传修饰密切相关。DNA甲基化是重要的表观遗传修饰,AML相关基因的异常DNA甲基化修饰对疾病的发生发展极其重要。该文对AML相关基因的异常甲基化修饰进行了系统的作用机制分析,并对重要基因进行了功能分类。该文总结的具有异常DNA甲基化修饰的基因,有望辅助预测AML的治疗及预后效果,并为设计个体化AML治疗方案提供全新的思路。     

急性髓系白血病患者HtrA2基因、Set基因表达与疗效和预后的关系研究

摘要 目的：探讨急性髓系白血病（AML）患者HtrA2基因、Set基因表达与疗效和预后的关系。方法：选择2017年6月~2019年6月来我院进行治疗的90例病历资料完整的初诊为AML患者作为本次研究对象,作为AML组,另选取同时期来我院进行健康体检的90例志愿者作为对照组。检测HtrA2基因、Set基因在两组受试者外周血中的表达;分析HtrA2基因、Set基因的表达与AML患者年龄、性别、白细胞计数、NCCN预后分型和疗效的关系。结果：HtrA2基因在AML组中表达水平低于对照组,Set基因在AML组中表达水平高于对照组（P<0.05）。HtrA2基因的表达和年龄、性别、白细胞计数无关（P>0.05）;Set基因的表达和年龄、性别无关（P>0.05）,与白细胞计数有关（P<0.05）。HtrA2基因在NCCN不同的预后分组中的表达差异无统计学意义（P>0.05）;Set基因在NCCN不同的预后分组中的表达差异有统计学意义（P<0.05）。HtrA2基因和Set基因在不同疗效患者中的表达差异有统计学意义（P<0.05）。结论：AML患者HtrA2基因表达下降,Set基因表达升高,Set基因和HtrA2基因具有评估AML疗效的潜力,Set基因可辅助评估AML患者的预后。     

基于生物信息学分析SCHIP1在急性髓系白血病中的表达及其临床意义

通过数据挖掘和生物信息学分析手段,探讨施旺膜蛋白相互作用因子1(schwannomin interacting protein 1,SCHIP1)基因在急性髓系白血病患者中的表达情况及其临床意义。首先,对Oncomine数据库中收录的所有急性髓系白血病(acute myloid leukaemia,AML)数据集进行荟萃分析,筛选出目标基因SCHIP1并进一步分析其在AML病人中的表达变化。随后,从GEO数据库中下载含生存信息的AML数据集源文件,分析SCHIP1表达对疾病的预后作用。另外,利用TCGA数据库对SCHIP1的表达情况进行亚组分析及与FLT3基因突变、PML/RARα融合基因和RAS活化等高危因素进行相关性分析。最后,利用GEPIA2工具验证SCHIP1的表达情况、预后意义及与FLT3、PML基因表达的相关性。结果发现Oncomine数据库中收录了44个AML数据集,总计共3534个样本数据。其中5个数据集共1188个样本包含“Cancer vs.Normal”的mRNA表达数据,对其进行荟萃分析显示SCHIP1位于显著高表达分子的第17位。生存分析显示,SCHIP1表达量与AML患者总体生存率呈负相关。亚组分析显示SCHIP1在M0/M1/M2中较M3/M6中表达更高,但与年龄、性别和种族无关。另外,相关性研究分析显示SCHIP1与FLT3基因突变弱相关,但与PML/RARα融合基因和RAS活化等高危因素无显著相关性。这些结果表明SCHIP1在急性髓系白血病中高表达,且其高表达与患者的生存预后呈显著负相关。因此,SCHIP1可作为疾病的预后生物标志物,并有望成为AML的精准治疗靶点。     

急性髓系白血病患者外周血FOXO1、PBX3的表达及对预后的预测价值

摘要 目的：探讨急性髓系白血病（AML）患者外周血叉头框转录因子O1（FOXO1）、B细胞白血病同源盒基因3（PBX3）的表达及对预后的预测价值。方法：前瞻性选取2017年8月至2021年8月收治的60例急性髓系白血病患者作为研究对象。所有患者均随访1年并按照随访结果分为预后良好组（36例）和预后不良组（24例）。采用Pearson检验进行相关性分析;采用logistics回归模型分析AML患者预后的独立危险因素;采用ROC曲线分析FOXO1、PBX3对AML患者预后的预测价值。结果：预后良好组和预后不良组年龄、性别、BMI比较无显著差异（P＞0.05）,而在血小板、中性粒细胞比值、FOXO1、PBX3、白细胞计数存在显著差异（P<0.05）;FOXO1、PBX3与血小板、中性粒细胞比值、白细胞计显著正相关（P<0.05）;多因素分析结果显示,血小板、中性粒细胞比值、FOXO1、PBX3、白细胞计数是影响急性髓系白血病患者预后的独立危险因素（P<0.05）;血清FOXO1、PBX3预测AML患者预后的灵敏度和特异性达到91.31 %和92.31 %。结论：急性髓系白血病患者外周血FOXO1、PBX3的表达上调可作为预测评估其预后发展的可靠血清标志物。     

血清miR-203、miR-217表达与急性髓系白血病患者预后的关系

摘要 目的：探究血清miR-203、miR-217表达与急性髓系白血病(AML)患者预后的关系。方法：选择2010年4月至2014年4月我院诊治的101例AML患者作为AML组,AML组根据治疗效果进一步分为完全缓解组和复发组,选择同期在我院体检的101例健康者作为健康组。采用荧光定量PCR检测各组的血清miR-203、miR-217表达水平,分析血清miR-203、miR-217表达水平与患者临床病理特征的关系,采用Kaplan-Meier法分析不同血清miR-203、miR-217表达水平AML患者的预后。结果：与健康组相比,AML组的血清miR-203、miR-217表达水平明显更低（P<0.05）。与完全缓解组相比,复发组的血清miR-203、miR-217表达水平明显更低（P<0.05）。血清miR-203表达水平与AML患者白细胞计数相关（P<0.05）,而血清miR-217表达水平与AML患者血小板计数相关（P<0.05）。血清miR-203相对高表达和miR-217相对高表达的AML患者5年生存率分别高于血清miR-203相对低表达和miR-217相对低表达患者（Log Rank ^miR-203 =17.870,Log Rank ^miR-217 =28.926,均P=0.000）。结论：血清miR-203、miR-217的表达水平与AML密切相关,检测血清miR-203、miR-217表达水平可能有助于评估AML患者的预后。     

急性髓系白血病免疫表型特征及遗传学特征分析

目的:研究急性髓系白血病免疫表型特征以及遗传学特征。方法:选取2011年1月到2014年5月我院收治的急性髓系白血病患者169例,采用流式细胞术和相关的单克隆抗体来分析所有患者的骨髓免疫表型,采用染G染色体显带技术分析患者的核型,根据淋系抗原(lym Ag)的表达将患者分为lym Ag+组和lym Ag-组。结果:抗原CD13、CD33、CD117以及MPO等髓系抗原最常在急性髓系白血病患者中表达,其中CD117在M3型病例中表达为85.7%(24/28),而CD34、HLA-DR双阴性、较强的自发荧光、CD13、CD33和MPO对M3型的诊断也具有一定的价值;其中47.9%(81/169)的患者伴随着淋系抗原表达,以CD7和CD56为主;60.4%(102/169)的患者伴随着核型异常;而伴随着t(8:21)的M2患者中的CD15、CD19和CD56的表达显著增强,而t(15:17)均发生于M3型患者中;而lym Ag+组患者CD34的阳性患者为77.8%(63/81)显著高于lym Ag-组的47.7%(42/88),两组比较差异具有统计学意义(P0.05)。结论:免疫表型对急性髓系白血病的诊断具有重要的意义,且免疫表型和异常核型存在密切的联系。     

RUNX1 mutation and elevated FLT3 gene expression cooperates to induce inferior prognosis in cytogenetically normal acute myeloid leukemia patients

BackgroundAcute myeloid leukemia (AML) is a bone marrow malignancy having multiple molecular pathways driving its progress. In recent years, the main causes of AML considered all over the world are genetic variations in cancerous cells. The RUNX1 and FLT3 genes are necessary for the normal hematopoiesis and differentiation process of hematopoietic stem cells into mature blood cells, therefore they are the most common targets for point mutations resulting in AML.MethodsWe screened 32 CN-AML patients for FLT3-ITD (by Allele-specific PCR) and RUNX1 mutations (by Sanger sequencing). The FLT3 mRNA expression was assessed in all AML patients and its subgroups.ResultsEight patients (25%) carried RUNX1 mutation (K83E) while three patients (9.37%) were found to have internal tandem duplications in FLT3 gene. The RUNX1 mutation data were correlated with clinical parameters and FLT3 gene expression profile. The RUNX1 mutations were observed to be significantly prevalent in older males. Moreover, RUNX1 and FLT3-mutated patients had lower complete remission rate, event-free survival rate, and lower overall survival rate than patients with wild-type RUNX1 and FLT3 gene. The RUNX1 and FLT3 mutant patients with up-regulated FLT3 gene expression showed even worse prognosis. Bradford Assay showed that protein concentration was down-regulated in RUNX1 and FLT3 mutants in comparison to RUNX1 and FLT3 wild-type groups.ConclusionThis study constitutes the first report from Pakistan reporting significant molecular mutation analysis of RUNX1 and FLT3 genes including FLT3 expression evaluation with follow-up. This provides an insight that aforementioned mutations are markers of poor prognosis but the study with a large AML cohort will be useful to further investigate their role in disease biology of AML.     

急性髓系白血病患者血小板输注疗效不佳及短期死亡的危险因素分析

摘要 目的：分析急性髓系白血病（AML）患者血小板输注疗效不佳及短期死亡的危险因素。方法：将2019年4月至2021年1月期间南部战区总医院收治的97例AML患者作为研究对象,在常规化疗的基础上,所有患者均进行血小板输注治疗。将血小板输注24 h后血小板计数增加指数<4.5视为输注疗效不佳,反之则为输注疗效良好。随访1年,根据短期预后的不同将患者分为死亡组和生存组。采用单因素和多因素Logistic分析AML患者血小板输注疗效不佳及短期死亡的危险因素。结果：97例AML患者中,疗效良好的患者65例,疗效不佳的患者32例,根据血液输注疗效将患者分为疗效不佳组（n=32）和疗效良好组（n=65）。随访结束时,97例AML患者中,有21例患者病死,病死率为21.65%。将病死的患者纳为死亡组（n=21）,存活的患者纳为生存组（n=76）。AML患者血小板输注疗效不佳与白细胞计数（WBC）、输注次数、出血量、脾脏大小、感染发热、血小板种类有关（P<0.05）,而与性别、年龄、血型、疾病类型、降钙素原（PCT）、血红蛋白（Hb）、乙肝表面抗原无关（P>0.05）。AML患者血小板输注疗效不佳的多因素Logistic分析结果表明：WBC＞50×10⁹/L、输注次数≥7次、出血量≥400 mL、脾大、感染发热、血小板种类为冰冻是AML患者血小板输注疗效不佳的危险因素（P<0.05）。AML患者短期死亡与弥散性血管内凝血、感染发热、血小板抗体、应用烷化剂化疗药物、脾脏大小有关（P<0.05）,AML患者短期死亡的多因素Logistic分析结果表明：血小板抗体阳性、感染发热、脾大、弥散性血管内凝血是AML患者短期死亡的危险因素（P<0.05）。结论：AML患者血小板输注疗效不佳受到WBC、输注次数、出血量、脾脏大小、感染发热、血小板种类等因素的影响。此外,感染发热、弥散性血管内凝血、血小板抗体、脾脏大小等是AML患者血小板输注后短期预后的影响因素。     

SHIP1在急性髓细胞白血病患者中的表达及对人白血病细胞凋亡的影响研究

目的:探讨含SH2结构域的肌醇1(SHIP1)在急性髓细胞白血病患者中的表达及对人白血病细胞凋亡的影响。方法:采用Western blot检测收集的急性髓细胞白血病患者骨髓中SHIP1的表达。人白血病细胞U937转染SHIP1过表达载体(pEGFP-SHIP1组)及对照空载体(pEGFP组),同时设置对照组,对照组细胞不转染载体,其他步骤同pEGFP-SHIP1组和pEGFP组。流式细胞仪检测48 h的细胞凋亡情况,Western blot检测48 h细胞中SHIP1、Bcl-2、Bax、Akt、p-Akt的表达。结果:急性髓细胞白血病患者骨髓中SHIP1表达明显低于正常人(P0.05)。pEGFP-SHIP1组细胞中SHIP1、Bax表达和凋亡率均明显高于pEGFP组及对照组(P0.01),Bcl-2、p-Akt表达均明显低于对照组(P0.01)。结论:SHIP1在急性髓细胞白血病患者骨髓中表达下调,其可能通过Akt信号促进人白血病细胞凋亡。     

地西他滨单药及联合半程和全程HA方案治疗骨髓增生异常综合征和急性髓系白血病的效果

目的:研究骨髓增生异常综合征和急性髓系白血病治疗中地西他滨单药及联合半程和全程HA方案的效果.方法:采用回顾性分析方法,选择2016年6月至2019年6月入院的80例骨髓增生异常综合征与急性髓系白血病患者,参考不同治疗方式分为研究组(40例)与对照组(40例),研究组选用地西他滨联合全程HA方案治疗,对照组选用地西他滨...     

髓细胞性白血病患儿PTEN蛋白表达及其与免疫表型的关系

目的:探讨髓细胞性白血病(AML)患儿PTEN蛋白表达及其与免疫表型的关系。方法:选择AML患儿143例,根据免疫表型的不同分为两组:免疫分型为LY+AML型59例,LY-AML84例。所有患儿都给予免疫表型分析,检测PTEN蛋白表达情况并进行相关性分析。结果:LY+AML患儿CD34+阳性、CD117+阳性比例显著高于LY-AML患儿(P 0.05),染色体核型异常比例显著低于LY-AML患儿(P 0.05)。LY+AML患儿的PTEN蛋白表达量为(65.33±2.34)%,阳性表达率为94.9%;而LY-AML分别为(20.11±4.11)%和13.1%,与LY+AML患儿对比差异都有统计学意义(P 0.05)。在AML患儿中,Spearman相关分析显示PTEN蛋白表达水平与免疫分型呈现显著相关性(r=0.653,P=0.000)。多因素logistic回归方法显示PTEN蛋白表达、CD34+阳性、CD117+阳性、染色体核型异常为影响AML患儿免疫表型的主要独立危险因素(OR=1.098、1.045、1.092、0.294,P 0.05)。结论:AML患儿骨髓单个核细胞的PTEN蛋白表达上调使得LY+AML型发生风险显著增加,可作为AML患儿病情判断与预后预测的参考指标之一。     

MA诱导方案与DA诱导方案对老年急性髓系白血病患者血清炎症因子及复发率的影响

目的:探讨米托蒽醌联合阿糖胞苷(MA方案)与柔红霉素联合阿糖胞苷(DA方案)对老年急性髄系白血病(AML)患者血清炎症因子及复发率的影响.方法:选取2015年1月～2018年1月期间深圳市人民医院收治的老年AML患者129例,根据治疗方案的不同将患者分为DA组(n=64,DA方案治疗)和MA组(n=65,MA方案治疗)...