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糖生物信息学是在糖生物学和糖组学发展的基础上,结合计算机技术,对生命活动过程中,参与糖链及与其相互作用的蛋白质等分子研究所产生的数据进行获取、储存、解析、模拟以及预测等内容的综合学科.糖生物信息学数据库是糖生物信息学发展到一定阶段,对糖组学等研究中产生的数据进行专门储藏与查询的应用工具.目前国际互联网中存在近百个糖生物信息学相关数据库,涉及内容包括糖链结构、参与糖链合成的基因或者蛋白质、糖结合蛋白、代谢通路、糖链或相互作用蛋白质等分子三维结构,或糖组学实验结果等领域.本文将归纳总结糖生物信息学数据库,为现有研究提供帮助. 相似文献
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糖组学:破解生命信息的第3种途径 总被引:6,自引:0,他引:6
糖组学是随着糖生物学而兴起的研究糖链的表达、调控和生理功能的科学。糖链由于结构的多样性和复杂性而成为细胞的信息分子,是生物体基因组信息的延续,因此糖组学研究是后基因组时代阐明基因功能的必由之路。糖组学的内容主要包括对糖链的结构研究和在细胞信号传递、细胞识别方面的功能分析,以及通过糖蛋白组建糖组学数据库,从而建立起一套从基因组蛋白组到糖组的研究体系,对糖链的生物学功能的认识将有助于基因组学和蛋白质组学的研究。 相似文献
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日本东洋纺公司和Summit glycro research公司通过将糖链固定在金表面的糖链阵列,成功地利用表面等离子共振(SPR)法检测出糖链结合蛋白质和糖链的相互作用。[第一段] 相似文献
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【目的】在阿卡波糖发酵过程中,C组分的存在严重影响阿卡波糖产品的质量,研究拟通过基因改造降低阿卡波糖C组分。【方法】通过构建treY同框敲除质粒pUAmT-YUD,以接合转移方法将其转入阿卡波糖工业菌株8-22,经同源重组将treY基因内部编码182个氨基酸的序列敲除,从而得到treY基因失活的突变株Y810。【结果】发酵结果显示突变菌株中C组分较出发菌株下降了约10倍,而阿卡波糖本身的效价末受影响。【结论】敲除treY基因可大幅降低阿卡波糖C组分的含量。研究的实施将大大简化阿卡波糖的纯化步骤,提升产品品质,降低生产成本,从而提高工业化生产的市场竞争力。研究同时还对游动放线菌的接合转移条件进行了优化,大大提高了转化效率。 相似文献
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《小哥白尼(野生动物画报)》2010,(2)
<正>刚刚从咕噜博士那里回来,经历了惊险的鲨鱼实验,糖妹惊魂未定,可是淘气的糖兄似乎要将恐怖进行到底。他神秘兮兮地告诉糖妹,有一位凶猛的客人等会儿还要来他们家中做客呢。糖妹听后吓得呆站在原地…… 相似文献
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根号 《小哥白尼(野生动物画报)》2011,(6)
上一回,糖兄糖妹吞下咕噜博士的缩小药丸。将身体变小后,在蜜罐蚂蚁的巢穴经历了一场惊险的争夺故。这回,他们将跟随埋葬虫,去体验它们最另类的生活……呼呼的风从糖兄耳旁不断吹过,眼前的景物迅速退向他的身后,此时,糖妹紧紧揪着糖兄的衣服,吓得闭上眼睛,不敢向下看。因为,兄妹俩正骑在一只埋葬 相似文献
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麦芽四糖淀粉酶是一种新型外切淀粉酶,从淀粉的非还原末端特异地顺序切割第4个α-1,4糖苷键,产物为麦芽四糖,广泛应用于食品、医疗保健等领域.对来自嗜糖假单胞菌(Pseudomonas saccharophila)的麦芽四糖淀粉酶基因序列进行优化,优化前后基因序列同源性达75%.将优化合成的成熟肽基因克隆至原核表达载体pET32a(+)上,转化大肠杆菌BL21(DE3),经IPTG诱导,重组蛋白主要以包涵体形式存在.包涵体经变性、复性、多步纯化,获得有活性的麦芽四糖淀粉酶.将麦芽四糖淀粉酶与不同来源的淀粉水解反应,结果表明,该酶能与7种不同来源的淀粉反应产生单一的麦芽四糖.经SDS-PAGE电泳,DNS法和硅胶板薄层色谱分析法(TLC)进行酶学性质分析,结果表明麦芽四糖淀粉酶的分子量约为57kDa,纯化后的酶液最适反应温度为45℃,最适反应pH为8.0.研究结果为麦芽四糖淀粉酶的研究和开发提供依据和参考. 相似文献
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蜜环菌糖复合物的糖链降解及其对α-葡萄糖苷酶的抑制作用 总被引:1,自引:0,他引:1
目的:对蜜环菌菌索中提取出的水溶性糖复合物糖链进行部分酸降解,从中筛选出对α-葡萄糖苷酶具有抑制活性的片断。方法:通过柱层析等方法对蜜环菌糖复合物进行纯化;按正交表设计酸水解条件,将糖链降解成适宜的片断,从中筛选出最佳水解条件;再进行α-葡萄糖苷酶抑制活性的研究。结果:降解后的糖复合物片断具有α-葡萄糖苷酶抑制活性。结论:结构改造对糖复合物的生物活性有一定的影响。 相似文献
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目的为了在糖多孢红霉菌(Sac.erythraea)中表达透明颤菌(Vitreoscilla)血红蛋白基因(vgb),发挥其在贫氧环境下与氧结合形成氧合态,而改变限氧时细胞原有的代谢方式,将vgb克隆于糖多孢红霉菌表达载体中。方法利用PCR技术克隆vgb,利用基因重组技术构建含有vgb的重组糖多孢红霉菌表达质粒,电穿孔法将vgb转化置糖多孢红霉菌中,鉴定采用SDS-PAGE电泳。vgb在重组糖多孢红霉菌表达产物的生物活性检测用Western blotting分析表示。结果克隆了含有vgb的重组糖多孢红霉菌表达质粒(pBlueV),分子量6.033 kb,筛选了重组糖多孢红霉菌株,重组菌株表达的血红蛋白能与1∶300的VHb抗体呈显色反应。结论vgb在糖多孢红霉菌中获得了表达,这对继续研究生产红霉素的工程菌改造,解决工业发酵工程菌高密度培养具有良好的应用前景。 相似文献
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波动性高糖对乳鼠心肌细胞肥大的影响 总被引:1,自引:0,他引:1
目的 探讨波动性糖环境对体外培养的乳鼠心肌细胞肥大的影响.方法 取出生后2天SD大鼠乳鼠心脏,采用胶原酶消化法获取心肌细胞,进行心肌细胞原代培养.常规培养心肌细胞72h,待细胞搏动良好,将其随机分为3组:①对照组:给予稳定的糖浓度(5.5mmol/L);②高糖组:给予稳定高糖浓度(25.5mmol/L);③波动性糖组:波动性糖浓度为5.5mmol/L和25.5mmol/L,每12h交替,其他培养条件保持一致.Bradford法检测各组细胞总蛋白质含量;计算机细胞图像分析系统测量单个细胞的体积;采用3H-亮氨酸掺入法,用液闪仪测定心肌细胞蛋白质合成速率.结果 1.高糖组和波动性糖组与对照组相比心肌细胞蛋白含量均增加,波动性糖组与高糖组相比二者增加的数值相近.2.高糖组和波动性糖组与对照组相比心肌细胞体积均有明显增加.3.高糖组与波动性糖组与对照组相比均有蛋白合成的增加.波动性糖组与高糖组相比没有显著性差异.结论 波动性糖有促进心肌细胞肥大的作用,其作用强度与单纯性高糖相仿.在糖尿病心肌病中,波动性糖也是引起心肌细胞肥大、心肌顺应性下降的原因之一.提示临床治疗糖尿病患者时,除了要控制血糖防止血糖过高,而且还要保持血糖的稳定,减少血糖波动所导致的心肌损害. 相似文献
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糖源是真菌一级培养基的主要营养成分之一,选择得当与否,将直接影响培养基的质量,这不仅关系到真菌当代的生长情况,而且关系到它的种质保持。为了选择最佳糖源,我们搜集了常用的5种糖源,配成一级培养基,并以工农业生产广泛应用的三种真菌,即啤酒酵母、 相似文献