DNA序列分析新进展

自从生物学家发现DNA是生命的遗传物质之后,便迫切地想知道它是如何携带信息及控制遗传的.这取决于对DNA分子中的碱基序列的分析.序列分析对于发现旧的基因,促进基因工程的发展有着重大意义.本世纪七十年代,世界上许多生物实验室相继进行这方面的研究.1977年,英国的Sanger序列测定的末端终止法,随后,Maxam和Gilbert等人提出     

DNA序列分析技术的发展

测定DNA的核苷酸序列,对于了解基因及其产物的结构、基因表达、及其表达的调控机制,乃至对于基因改造和分子进化研究等方面,均具有重要的意义。本文将就DNA序列分析技术的产生、应用和发展作一简单综述。一、DNA序列间接测定技术在分子生物学研究的早期,DNA序列信息只能由获得的氨基酸序列或RNA序列推测而来。在Waston和Crick的DNA双螺旋模型建立(1953年)不久,Sanger发明了氨基酸序列测     

DNA序列分析技术及其现状

ＤＮＡ序列分析技术一直是分子生物学领域的一个重要研究课题。“人类基因组计划”的实施有力地推动了高速ＤＮＡ测序技术的发展。本文主要介绍国内外目前流行的经典的测序方法———各种改良的双脱氧链末端终止法,及近年来发展起来的一些全新的ＤＮＡ测序方法     

高速DNA序列分析

高速DNA序列分析是人类基因组研究的关键技术．文章对高速DNA序列分析方法如阵列毛细管电泳、超薄层凝胶板电泳、质谱、杂交法、原子探针法、流动单分子荧光检测法等新进展进行了评论．     

DNA序列分析中的信息熵应用现状

信息熵理论是生物信息学研究的一个重要工具,它在DNA序列分析中有着广泛的应用。本文详细介绍了近年来诸多DNA序列分析问题中信息熵应用的研究进展,并分析了未来该问题的研究方向。     

谱分析在DNA序列分析中的应用

目的：谱分析是信号处理的常用方法,其中的统计相关分析、傅里叶变换、小波变换和数字滤波等手段已逐渐应用到DNA序列的分析中,这些应用包括DNA序列的周期性分析、基因识别和同源性分析等方面。本文对谱分析方法在DNA序列分析中的应用情况进行简单的综述。     

高效毛细管电泳在DNA序列分析中的应用

高效毛细管电泳在ＤＮＡ序列分析中的应用种康（兰州大学化学系,兰州７３００００）ＡＰＰＬＩＣＡＴＩＯＮＯＦＨＩＧＨ－ＰＥＲＦＯＲＭＡＮＣＥＣＡＰＩＬＬＡＲＹＥＬＥＣＴＣＴＯＲＨＯＲＥＳＩＳＯＮＤＮＡＳＥＱＵＥＮＣＩＮＧ￥ＣｈｏｎｇＫａｎｇ（Ｄｅｐａｒｔ...     

高重复序列DNA的分离与分析方法

本文介绍了一种简便快速分离动物重复序列ＤＮＡ的技术，以及与之相关的Ｃ０ｔ值的测定方法。     

大熊猫气味标记DNA的制备和序列分析

大熊猫气味标记在其个体间的通讯中具有重要意义。用不同方法收集了７只大熊猫个体的９个气味标记样品,运用Ｉｎｓｔａｇｅｎｅ Ｋｉｔ制备出了ＤＮＡ。采用ＰＣＲ扩增线粒体Ｄ－环区和细胞色素ｂ基因、Ｔｈｒ－ｔＲＮＡ基因片段并作序列分析。结果提示,不同收集方式所得气味标记样品均有ＤＮＡ,但用干棉花收集样品的方法最佳。该方法为大熊猫的遗传多样性研究提供了新的简捷有效的ＤＮＡ来源。     

DNA分析与基因组序列和植物系统学研究

从DNA杂交、RFLP分析、DNA的限制酶图谱分析等方面描述DNA分析技术在植物学研究中的应用,讨论了DNA分析技术与植物系统学的关系及分子数据的分析方法。并以高等植物为对象,从核DNA、叶绿体DNA和线粒体DNA三方面对植物分子系统学进行了论述。     

秦岭羚牛高度重复序列DNA片段的分子克隆和序列分析

羚牛（Budorcas taxicolor)属偶蹄目（Artiodactyla)、牛科（Bovidae),为我国一类大型珍贵保护动物。我们从其基因组中克隆得到若干约800bp的BamHI高度重复序列并对部分克隆进行了序列测定,发现它们显示了很高的同源性。利用其中一个单元为探针,对限制酶消化后的羚牛基因组DNA作杂交分析,发现其杂交谱带不具有个体及亚种间特异性,说明该重复序列在羚牛基因组中具有保守的分布和排列。在牛科动物中,羚牛BamHI片段与绵羊属和山羊属的相关序列具有高度同源性,而与水牛和家牛序列差异较大。这些结果为羚牛与羊亚科物种亲源关系较近的分类学观点提供了分子生物学证据。有证据表明,这些片段可能代表羚牛染色体着丝点的卫星DNA单体。     

7种方法提取质粒DNA用于序列分析的比较

对取自同一摇瓶内的菌体,采用7种不同提取质粒的方法分离DNA,将分离的DNA做电泳观察、紫外吸收及序列分析,结果表明CTAB法具有快速、方便、可行的特点。     

一组DNA序列分析的微机程序

本文介绍了作者编制的一组用于分析DNA序列资料的计算机程序。程序用BASIC语言写成,在IBM微型机伤调试运行,包括序列打入、核苷酸频率统计、转译及限制酶切点查找等级部分。     

天花粉胰蛋白酶抑制剂基因的克隆及DNA序列分析

从天花粉块茎中分离纯化的天花粉胰蛋白酶抑制剂ＴＴＩ是目前已知的最小的蛋白酶抑制剂,它属于南瓜族蛋白酶抑制剂家族;由２７个氨基酸残基组成,含三对二硫键。本文用ＰＣＲ方法扩增一特异探针;结合传统的筛库方法,从天花粉ｃＤＮＡ基因库中筛选到含ＴＴＩ基因的克隆,经序列测定,得到了ＴＴＩ的ｃＤＮＡ全序列。其读框编码区编码的是一个由６５个氨基酸组成的Ｐｒｅ－Ｐｒｏ－ＴＴＩ,Ｐｒｅ与Ｐｒｏ分别含有２４个和１４个氨基酸。由ｃＤＮＡ序列推论的氨基酸序列和已测定的氨基酸序列完全相同。     

基于非线性方法的DNA序列分析

以人类DNA序列为原始数据,对其进行数字编码。在利用功率谱分析编码DNA序列的基础上,利用Hurst指数进一步分析序列的自相似性。从分析结果看出,DNA序列中的确存在长程相关现象,而且这种长程相关现象与DNA的组成结构有关,表现为它的结构基团的Hurst指数大于其功能基团的Hurst指数。同时,从内含子含量的角度分析序列的长程相关程度,结果表明,同一序列中,内含子含量与不同的化学基团具有不同的关系。这表明不同的化学结构对DNA序列特征具有不同的贡献。这些结论从非线性方法的角度对DNA序列的分析提供了新的思路。     

古代DNA序列的分析与甄别──兼评恐龙DNA研究

从古代生物中获取的古代ＤＮＡ序列为进一步从分子水平上认识古代生命及其演化提供了新的证据。分析和甄别古代ＤＮＡ序列是古代ＤＮＡ研究的关键步骤之一。本文着重讨论甄别古代ＤＮＡ序列的主要标准如：野外取样与实验室控制,ＤＮＡ“行为”分析、系统发育验证和实验结果的可重要性,并在此基础上评述近期发表的有关恐龙ＤＮＡ的研究。     

DNA序列分析用于常见致病真菌鉴定和分型

随着真菌感染的增多,仅用表型方法鉴定环境中或临床上的致病真菌不足以快速准确地诊断真菌感染疾病,近年来,分子生物学方法因快速、准确而逐步得到应用,其中DNA序列分析已成为鉴定致病真菌到种水平的重要方法。现就DNA序列分析在常见致病真菌分类鉴定及基因分型的应用加以综述。     

基于DTW距离的DNA序列相似性分析

在DNA序列相似性的研究中,通常采用的动态规划算法对空位罚分函数缺乏理论依据而带有主观性,从而取得不同的结果,本文提出了一种基于DTW（Dynamic Time Warping,动态时间弯曲）距离的DNA序列相似性度量方法可以解决这一问题．通过DNA序列的图形表示把DNA序列转化为时间序列,然后计算DTW距离来度量序列相似度以表征DNA序列属性,得到能够比较DNA序列相似性度量方法,并用这个方法比较分析了七种东亚钳蝎神经毒素（Buthusmartensi Karsch neurotoxin）基因序列的相似性,验证了该度量方法的有效性和准确性．     

绵羊线粒体DNA控制区5‘端序列PCR—SSCP与序列分析

通过绵羊线粒体DNA控制区功能域（5‘端序列）PCR－SSCP和序列分析,发现小尾羊、乌珠穆沁羊、湖羊、萨福克羊和夏洛来羊以及多赛特公羊与尾寒羊杂交家系共202只绵羊可归纳为两种类型,突变型和野生型,提示现代绵羊品种在起源上存在两种主要的进化途径。