红足壮异蝽Urochela quadrinotata Reuter线粒体基因组的测定与分析

研究测定并分析了红足壮异蝽Urochela quadrinotata Reuter的线粒体基因组全序列。该线粒体基因组全长16585bp(GenBank登录号为JQ743678),A+T含量为75.4%,共编码35个基因,包括13个蛋白质基因、20个tRNA基因(两个tRNA基因,即tRNAIle和tRNAGln未被检测到)、2个rRNA基因及一段较长的非编码区(控制区,亦称A+T富含区)。基因排序与大部分昆虫的线粒体基因排列方式相同,没有发生基因重排。除tRNASer(AGN)的DHU臂无法形成典型的茎环结构,其余tRNA基因均能稳定形成典型的三叶草二级结构。预测了红足壮异蝽16S和12S rRNA的二级结果,分别包括6个结构域43个茎环和3个结构域27茎环。控制区含一个长1652bp的串联重复区域,由16个串联重复单元组成。     

小长蝽线粒体基因组全序列测定与长蝽总科系统发育分析

为了解小长蝽Nysius ericae(Schilling)线粒体基因组结构及长蝽总科的分子系统发育关系。本试验采用Illumina MiSeq测序平台对小长蝽线粒体基因进行测序,对基因组序列进行拼装、注释和特征分析,利用最大似然法和贝叶斯法构建基于12种长蝽总科昆虫线粒体全基因组核苷酸序列的系统发育树。小长蝽线粒体基因组全长为16 330 bp(GenBank登录号：MW465654),基因组包括13个蛋白编码基因(PCGs),22个tRNA基因,2个rRNA基因和1段非编码控制区。11个蛋白质编码基因的起始密码子为典型的ATN;cox1,nad4l的起始密码子为TTG。cob的终止密码子为TAG,其余蛋白编码基因的终止密码子为TAA。只有trnS1缺少DHU臂,其余tRNA基因均能形成典型的三叶草结构。12种长蝽总科昆虫线粒体全基因组序列构建的昆虫系统发育树结果显示,小长蝽与Nysius plebeius具有更近的亲缘关系,且与传统形态学分类基本一致。小长蝽线粒体基因组符合长蝽总科线粒体基因组的一般特征。结果表明小长蝽与N.plebeius的亲缘关系更近。     

红角辉蝽和紫翅果蝽线粒体完整基因组测序及蝽亚科系统发育分析(半翅目: 蝽科)(英文)

【目的】本研究对红角辉蝽Carbula crassiventris和紫翅果蝽Carpocoris purpureipennis完整线粒体基因组测序,以探究蝽亚科(Pentatominae)线粒体基因组特征并重建其系统发育关系。【方法】使用Illumina MiSeq测序平台测定红角辉蝽和紫翅果蝽线粒体基因组全序列,并进行组装和注释。基于这2个种和其他30个蝽亚科分类单元线粒体基因组的13个蛋白质编码基因的第1和2位密码子以及2个rRNA基因的核苷酸序列,利用贝叶斯和最大似然法重建蝽亚科系统发育树。【结果】红角辉蝽和紫翅果蝽的线粒体基因组全长分别为15 824 和16 575 bp, 包含13个蛋白质编码基因、2个rRNA基因、22个tRNA基因和1个控制区。蝽亚科内线粒体基因组基因排列顺序保守且没有发现基因重排。此外,蝽亚科内的碱基组成、密码子使用和RNA结构均较为保守; 控制区重复序列拥有不同的长度、类型和拷贝数。基于贝叶斯法和最大似然法重建的系统发育树显示二星蝽族(Eysarcorini)、果蝽族(Carpocorini)、稻绿蝽族(Nezarini)和Antestiini构成一个稳定分枝。【结论】系统发育分析支持辉蝽属Carbula应属于二星蝽族,而果蝽属Carpocoris、斑须蝽属Dolycoris和珠蝽属Rubiconia同属于果蝽族。     

圆臀大黾蝽(昆虫纲,半翅目,黾蝽科)线粒体全基因组注释(英文)

昆虫纲半翅目异翅亚目黾蝽科圆臀大黾蝽 Aquarius paludum ( Fabricius,1794) 已成为生物学研究的理想生物材料之一,为更全面了解其分子生物学特征,本研究测定了圆臀大黾蝽 Aquarius paludum线粒体基因组全序列。该基因组全长15 380 bp,为双链环状 D N A 分子,包含 13 个蛋白编码基因、22 个 tRNA 基因、2 个 rRNA 基因及一个控制区。其基因排序与已报道的其它大部分异翅亚目类群排列方式相同。该基因组基因排列紧密,共观察到 64 bp 基因间隔 ( 除控制区 781 bp 外) 与 33 bp 基因重叠。全基因组 AT 含量为75. 7 % ,而控制区 AT 含量仅为 66. 2 % ,密码子使用也显示出 AT 使用偏好。13 个蛋白编码基因中,除 COⅠ、ND5 使用 TTG 作为起始密码子外,其余使用 ATV。此外,7 个蛋白编码基因使用常规三联终止密码子 TAA,TAG 作为终止密码子,其余以 T 作为终止密码子,下游为同链编码的tRN A 基因。在 tRN A-Ser ( G C T ) 二级结构中,D HU 臂缺失,未形成典型的三叶草结构。     

黑条小车蝗线粒体基因组特征及其系统发育分析

为解析黑条小车蝗（Oedaleus decorus decorus）线粒体基因组特征及其在小车蝗属的系统发育地位,本研究利用长距离PCR技术和引物步移法测序对黑条小车蝗线粒体全基因组进行扩增和组装。结果表明,黑条小车蝗线粒体基因为典型双链环状DNA,全长15 914 bp,A+T含量为75.07%,包含13个蛋白编码基因、22个t RNA编码基因、2个rRNA编码基因和1个位于小核糖体RNA(small rRNA, srRNA)和tRNAIle之间的非编码控制区（D-loop区）。黑条小车蝗线粒体基因组中编码基因的数量及位置排序与小车蝗属其他近源种一致。黑条小车蝗线粒体13个蛋白编码基因的起始密码子均为ATN模式,除ND5使用不完整的T为终止密码子外,其他基因均使用完整的TAA作为终止密码子。22个tRNA编码基因中,21个能形成三叶草结构,只有tRNASer缺少DHU环。预测大核糖体RNA(large rRNA, lrRNA)二级结构共有6个结构域（结构域Ⅲ缺失）和47个茎环结构,预测srRNA二级结构包含3个结构域和31个茎环结构。基因间隔序列共计16处94 bp,间隔序列1～21...     

麻竖毛天牛线粒体基因组测定及天牛科线粒体基因组比较分析

【目的】线粒体基因组分析是研究昆虫系统发育的重要手段。本研究通过测定麻竖毛天牛Thyestilla gebleri(Faldermann,1835)线粒体基因组,比较分析天牛科Cerambycidae线粒体基因组的特征,进而初步探讨麻竖毛天牛系统发育地位和天牛科部分类群之间的系统进化关系。【方法】采用引物步移法测定麻竖毛天牛线粒体基因组全序列。参照Gen Bank收录的16种天牛线粒体基因组序列进行基因注释;采用在线软件t RNAscan-SE Search Server对转运RNA(t RNA)的二级结构进行了预测。通过对16种天牛的线粒体基因组进行重新注释,结合本研究获得的麻竖毛天牛线粒体基因组进行序列特征比较分析。基于11个蛋白编码基因的核苷酸序列,利用最大似然法构建了天牛科17种天牛的系统发育树。【结果】麻竖毛天牛线粒体基因组全长15 505 bp,A+T含量为74.07%,包含13个蛋白编码基因(PCGs),2个核糖体RNA(r RNA)基因,22个t RNA基因和一个长度为872 bp的控制区,未发现基因重排。通过比对17种天牛的线粒体基因组,发现长翅暗天牛Vesperus conicicollis一个t RNA(trn P)基因的移位。17种天牛的t RNA中,trn S1(AGN)的D臂均缺失,其余t RNA都具有典型的三叶草结构。大部分种类的蛋白编码基因起始密码子为典型的ATN(ATA、ATT、ATC、ATG),只有部分种类的Nad1、COI、ATP8基因存在特殊的起始密码子(TTG、AAC、AAT、GTG),终止密码子均为常见的TAR(TAA、TAG)或不完全的T和TA。系统发育树中,6个亚科分别单独分支,其中,麻竖毛天牛与云斑白条天牛Batocera lineolata聚为一支。【结论】麻竖毛天牛线粒体基因组符合天牛线粒体基因组的一般特征;除少数t RNA基因存在重排外,天牛科线粒体基因排列相对稳定;基于线粒体基因组的系统发育分析支持天牛科6个亚科的单系性,麻竖毛天牛和云斑白条天牛亲缘关系较近。     

大头隆胸长蝽线粒体基因组测序及分析(半翅目:地长蝽科)

地长蝽科隶属于半翅目异翅亚目蝽次目长蝽总科,该科包括15个族,缢胸族是其中包含属最多的族,而目前该族物种尚无线粒体基因组报道.该族中的隆胸长蝽属昆虫是一个仅在东洋界分布的类群,其中大头隆胸长蝽Eucosmetus incisus(Walker,1872)在中国水稻种植地区广泛发生,是重要的水稻害虫.因此,对大头隆胸长蝽...     

黑尾地鸦线粒体基因组序列测定与分析

采用长PCR扩增的线粒体DNA和引物步移法, 测定并注释了中国特有鸟类-黑尾地鸦(Podoces hendersoni)的线粒体基因组全序列。黑尾地鸦的mtDNA序列全长16 867 bp, GenBank登录号GU592504。基因含量和排列次序与原鸡的一致, 包含13个蛋白编码基因、22个tRNA、2个rRNA和1个控制区(D-loop)。除COI基因以GTG作为起始密码子外, 其余12个蛋白质编码基因均以典型ATG密码子起始。11个蛋白编码基因以完全终止密码子TAA、AGG或AGA终止, COIII和ND4基因终止密码子为不完整的T。tRNA^Ser(AGY)的DHU臂缺失, tRNA^Leu(CUN)的反密码子环由9个碱基构成, 而不是标准的7个碱基。其余的20个tRNA基因的二级结构均属典型的三叶草结构。预测了rRNA的二级结构, 其中, 12S rRNA二级结构包含4个结构域, 43个茎环结构; 16S rRNA的二级结构包含6个结构域, 55个茎环结构。此外, 在其他鸟类控制区中所发现的F-box、D-box、C-box、B-box、Bird similarity-box和CSB1-box也同样存在于黑尾地鸦中。     

烟蚜线粒体基因组全序列及系统发育分析（英文）

【目的】蚜虫是杂食性农业害虫。本研究旨在通过线粒体基因组分析更好地了解蚜科昆虫的系统发育关系。【方法】结合第二代测序和PCR扩增技术获得了烟蚜Myzus persicae线粒体基因组全序列,与蚜科其他昆虫进行了对比分析;以贝叶斯法和最大似然法基于13个蛋白编码基因对蚜科进行了系统发育分析。【结果】烟蚜线粒体基因组(Gen Bank登录号:KU_236024)序列全长17 832 bp,A+T含量84.1%,AT偏斜为0.094,GC偏斜为-0.296。包含13个蛋白编码基因(cox1-3,nad1-6,nad4L,atp6,atp8和cytb),22个tRNA,2个rRNA基因(rrn L和rrn S)和2个长的非编码区,其基因排列顺序与已知的蚜科昆虫相似,除了nad4以单独的T结尾,所有的蛋白编码基因均以ATN作为起始密码子,TAA作为终止密码子。在烟蚜线粒体基因组中,tRNAGlu和tRNAPhe中间有一段307 bp的非编码区,该编码区包含2个重复单元,烟蚜的控制区长2 531 bp,是所有测序蚜虫线粒体基因组中最长的。rrn L的二级结构包含6个结构域,44个茎环结构;rrn S的二级结构有3个结构域,24个茎环结构。基于烟粉虱和其他20种昆虫的13个蛋白编码基因重建的BI和ML系统发育树,与传统形态学分类结果一致。【结论】蚜亚科和长管蚜亚科的单系性得到了很好的支持;在长管蚜亚科的分支中,M.persicae与D.noxia聚成一支,并且C.salicicola位于进化枝的底部。本研究结果为蚜科系统发生关系重建积累了有价值的数据资料。     

中华攀雀线粒体基因组全序列测定与分析

该研究使用长PCR扩增和引物步移法测定了中华攀雀(Remiz consobrinus)线粒体基因组全序列,在对序列进行拼接和注释的基础上,分析了其结构、序列组成及蛋白编码基因密码子使用情况等,并对22个tRNA和2个rRNA的二级结构以及控制区结构进行了预测及系统发育分析,为雀形目鸟类的系统发育研究提供了新信息。中华攀雀线粒体基因组全长16737bp,GenBank登录号KC463856,碱基A、T、C、G的含量分别为27.8%、21.5%、35.4%及15.3%,37个基因排列顺序与已报道的其他鸟类基本一致,包含13个蛋白编码基因、22个tRNA基因、2个rRNA基因及1个非编码的控制区(D-loop),有18对基因间共存在77bp的间隔,7对基因间共存在30bp的重叠。除ND3基因的起始密码子为ATT外,其余均为标准的ATG,11个蛋白编码基因的终止密码子为TAA、TAG、AGA或AGG,2个为不完全终止密码子T(COⅢ、ND4)。除tRNASer-AGNDHU臂缺失外,其余21个tRNA均可形成典型的三叶草结构,在出现的27处碱基错配中有19处为常见的G-U错配。SrRNA和LrRNA二级结构分别包含3个结构域47个茎环结构和6个结构域60个茎环结构,与所发表的其他鸟类rRNA二级结构大体一致。中华攀雀控制区发现了同样存在于其他鸟类控制区的保守框F-box、D-box、C-box、B-box、Bird similarity-box和CSB1-box。该研究支持将攀雀科作为独立的科,同时,支持莺总科与攀雀科的单系性。     

New Records of Rhyparochromidae (Hemiptera: Heteroptera: Lygaeoidea) from Colombia

Five species in the tribes Lethaeini, Cistalia neotropicalis Slater & Baranowski and Paragonatas divergens Distant, and Ozophorini, Balboa variabilis Distant, Lygofuscanellus ozophoroides Slater, and Pamozophora englemani Ashlock & Slater, are recorded for the first time from Colombia. They are also the first generic record for this country. Photographs of all five species are included.     

红足点胸长蝽Acompus rufipes (Wolff) 新异名（异翅亚目：长蝽总科：地长蝽科）

研究欧洲和中国的标本后发现,室翅长蝽科Heterogastridae的小异腹长蝽Heterogaster minimusZou&Zheng,1981是地长蝽科Rhyparochromidae的红足点胸长蝽Acompus rufipes(Wolff,1804)的新异名。文中还提供了红足点胸长蝽Acompus rufipes的整体图和雄性生殖器特征图。     

A phylogenetic revision of the true bug genus Heraeus (Hemiptera: Rhyparochromidae: Myodochini), with the description of two new genera and 30 new species

Prior to this study, the genus Heraeus Stål, 1862 included 14 species, all of which are restricted to the Western Hemisphere. Three species are known from the Nearctic Region, nine from the Neotropical Region, and two mainly tropical elements are distributed in both regions. In this contribution, we consider Heraeus cincticornis Stål, 1874 a junior synonym of Heraeus elegans (Walker, 1873), select a lectotype for Heraeus coquilletti Barber, 1914, and neotype for Lygaeus triguttatus Guérin‐Méneville, 1857, and describe 28 new species. In addition, the two new genera, Baranowskiobius gen. nov., to include H. elegans (Baranowskiobius elegans comb. nov.) and two new species, and Paraheraeus gen. nov., to include Heraeus eximius Distant, 1882 (Paraheraeus eximius comb. nov.), are described. Previously described species and new taxa are (re)described and illustrated, including male genitalia. Scanning electron micrographs, general habitus photographs, and distribution maps are included for all species studied. A phylogenetic analysis comprising 46 terminal taxa and 50 morphological characters was performed, and five species groups were hypothesized, including the coquilletti, caliginosus, guttatus, illitus, and plebejus groups. All known species of Heraeus and the new genera are included in the phylogenetic analysis. The type species of the genera Myodocha Latreille, 1807, Orthaea Dallas, 1852, and Paisana Dellapé, 2008 are used as out‐groups.     

New substitute name for the genus Poliocoris Slater, 1994 (Hemiptera,Heteroptera, Rhyparochromidae)

Neopoliocoris nom. n., a new substitute name is proposed for Poliocoris Slater, 1994 (Hemiptera: Heteroptera: Rhyparochromidae), preoccupied by Poliocoris Kirkaldy, 1910 (Hemiptera: Heteroptera: Pentatomidae). A new combination, Neopoliocoris umbrosus (Slater, 1994), comb. n. is proposed for Poliocoris umbrosus Slater, 1994.     

Taxonomic changes in some predominantly Palaearctic distributed genera of Drymini (Heteroptera,Rhyparochromidae)

The history of the taxonomic research of Rhyparochromidae and especially Drymini is briefly reviewed. Two new species level synonyms are proposed: Taphropeltus javanus Bergroth, 1916, syn. n. = Taphropeltus australis Bergroth, 1916, syn. n. = Brentiscerus putoni (Buchanan White, 1878). A monotypic new genus, Malipatilius gen. n. (type species: Scolopostethus forticornis Gross, 1965 from Australia) is established.     

A revision of the genus Orthaea Dallas (Heteroptera: Rhyparochromidae), with the description of two new species and a new genus: Neomyocoris,to accommodate O. arnaudi Brailovsky

We redefine the genus Orthaea Dallas and redescribe O. consuta and O. procincta. Two new species are described, O. meloae from Colombia and O. montana from Peru. A new genus, Neomyocoris, is created to accommodate O. arnaudi Brailovsky. A key to the species of Orthaea and illustrations of male genitalia of O. consuta, O. procincta, O. montana and N. arnaudi n. comb. are provided. Photographs of scanning microscope and habitus are given.     

Two new species of Vertomannus Distant, 1903 (Heteroptera,Rhyparochromidae, Ozophorini), with?proposal of a new subgenus

Two new Vertomannus species, Vertomannus flavus sp. n. (south Vietnam) and Vertomannus borneensis sp. n. (Borneo) are described. Vertomannus (Elongatomannus), subgen. n. (type species: Vertomannus flavus) is proposed.     

First report on C-banding,fluorochrome staining and NOR location in holocentric chromosomes of Elasmolomus (Aphanus) sordidus Fabricius, 1787 (Heteroptera,Rhyparochromidae)

In spite of various cytogenetic works on suborder Heteroptera, the chromosome organization, function and its evolution in this group is far from being fully understood. Cytologically, the family Rhyparochromidae constitutes a heterogeneous group differing in chromosome numbers. This family possesses XY sex mechanism in the majority of the species with few exceptions. In the present work, multiple banding techniques viz., C-banding, base-specific fluorochromes (DAPI/CMA₃) and silver nitrate staining have been used to cytologically characterize the chromosomes of the seed plant pest Elasmolomus (Aphanus) sordidus Fabricius, 1787 having 2n=12=8A+2m+XY. One pair of the autosomes was large while three others were of almost equal size. At diplotene, C-banding technique revealed, that three autosomal bivalents show terminal constitutive heterochromatic bands while one medium sized bivalent was euchromatic. Microchromosomes (m-chromosomes) were positively heteropycnotic. After DAPI and CMA₃ staining, all the autosomal bivalents showed equal fluorescence, except CMA₃ positive signals, observed at both telomeric heterochromatic regions of one medium sized autosomal bivalent. Silver nitrate staining further revealed that this chromosome pair carries Nucleolar Organizer Regions (NORs) at the location of CMA₃ positive signals. The X chromosome showed a thick C-band, positive to both DAPI /CMA₃ while Y, otherwise C-negative, was weakly positive to DAPI and negative to CMA₃, m-chromosomes were DAPI bright and CMA₃ dull.