DNA水平上检测正选择方法的研究进展

达尔文的自然选择学说指出, 自然选择作用是物种进化的主要因素。而1968年Kimura提出的中性进化学说认为中性突变和随机漂变才是进化的主要动力。在接下来的30多年时间中, 人们尝试从各种角度来检测自然选择是否存在。随着DNA测序技术的发展, 大量的DNA序列信息为检验自然选择提供了丰富的数据。因为自然选择会影响DNA变异模式, 所以可以通过分析现有的DNA样本来推断过去是否发生了自然选择。另一方面, 种群历史等因素也会影响到DNA变异模式, 因此会对自然选择的检测产生干扰。文章主要介绍了中性检验基本的概念, 全面回顾了一些经典的检验方法, 并着重介绍了近几年新发展出的研究方向。     

生物进化论的发展

介绍了表型进化的达尔文学说,突变学说和综合进化学以及分子进中性学说的产生背景和主要内容,阐述了这两类进化相互关系的两假说,讨论了这两类进化学说间的共同点和主要分歧。     

实事求是地对待达尔文的学说——“天地生人”系列讲座（39）

1859年英国伟大的科学家达尔文（1809--1882）根据他在环球航行中所收集到的大量有关当代生物以及地质历史上的古生物资料,发表了《物种起源》一书,提出了生物进化的学说。从那个时代起,进化的观念被人们普遍地接受了。达尔文的历史功绩是应当得到肯定的,值得纪念的。但是达尔文学说的核心和灵魂是生存竞争和自然选择等等原则。     

异源多倍体植物核rDNA序列的同步进化

同步进化是异源多倍体植物核rDNA序列进化的重要方式,同步进化的程度在不同植物类群中存在较大差异,有些类群中同步进化力量较强,核rDNA重复序列间已经纯合或接近纯合,有些类群中同步进化的力量较弱,可观察到序列的杂合性。同步进化的机制主要是不等交换和基因转换,并受异源多倍体形成年代、生殖方式、基因突变率等因素的影响。     

关于优生学

自从上世纪中叶（1859年）达尔文提出“物 竞天择，适者生存”的进化学说后，人们很快就 意识到，人类本身作为生物之一，同样是受大自 然的选择而进化的。     

修正非齐次马尔可夫模型应用的研究

修正非齐次模型是在齐次模型和非齐次模型基础上提出的适用于蛋白质编码区的马尔可夫模型。此模型可以用来分析生物物种进化和基因突变,模型中的马尔可夫度与序列进化水平相关联,转移矩阵与基因突变相关联。本文通过比较7类不同物种-1度马尔可夫链的含量,验证了生物物种进化反映在密码子使用上的特征;通过密码子位点间转移矩阵的计算,分析了基因突变在密码子不同位点上发生的可能性。     

法国用诱变育种技术替代转基因农作物

为改良传统农作物的品种和性能,法国采用植物诱发突变技术育种已有近80年的历史。据世界粮农组织估计,2007年全球共种植2550种诱变育种农作物,其中近一半为粮食作物,生态农田也采用诱变育种的农作物品种。诱变育种农作物与转基因农作物不同,主要利用物理或化学的因素处理作物,使其发生基因突变。基因突变是作物变异进化的根本来源,为作物进化提供了最初的原材料。     

關於達尔文学说中的生存鬥争學說

在十九世纪的自然科学中三种具有决定重要性的发现,其中之一就是达尔文学说。这学说满意地解答和证实了自然界中形形色色动植物有机体,乃是有机界长期历史发展的产物;从而建立了生物学科学的唯物论的基础,摧毁了目的论的、宗教的与形而上学的自然观,实现了生物科学中的革命。马克思主义经典学者们对於达尔文的伟大功绩予以很高的评价,同时也指出达尔文学说中局限性及其所犯的错误,因而指示了达尔文学说发展的正确道路。达尔文在探讨动植物进化发展的动力和根源时,曾     

基因突变的分子检测技术

基因突变的分子检测是确定生物性状与某种遗传变异的关系、探讨生物物种内基因的差异、了解生物种间亲缘和进化的关键技术,对群体遗传学和生物分类学研究、遗传病诊断等都有着重要的理论意义和实用价值。因此,对于基因突变的检测方法的研究目前受到广泛关注。对基因突变的形式及其分子检测技术作了全面综述。     

植物分子群体遗传学研究动态

分子群体遗传学是当代进化生物学研究的支柱学科, 也是遗传育种和关于遗传关联作图和连锁分析的基础理论学科。分子群体遗传学是在经典群体遗传的基础上发展起来的, 它利用大分子主要是DNA序列的变异式样来研究群体的遗传结构及引起群体遗传变化的因素与群体遗传结构的关系, 从而使得遗传学家能够从数量上精确地推知群体的进化演变, 不仅克服了经典的群体遗传学通常只能研究群体遗传结构短期变化的局限性, 而且可检验以往关于长期进化或遗传系统稳定性推论的可靠程度。同时, 对群体中分子序列变异式样的研究也使人们开始重新审视达尔文的以“自然选择”为核心的进化学说。到目前为止, 分子群体遗传学已经取得长足的发展, 阐明了许多重要的科学问题, 如一些重要农作物的DNA多态性式样、连锁不平衡水平及其影响因素、种群的变迁历史、基因进化的遗传学动力等, 更为重要的是, 在分子群体遗传学基础上建立起来的新兴的学科如分子系统地理学等也得到了迅速的发展。文中综述了植物分子群体遗传研究的内容及最新成果。     

横向基因传递:生物进化的重要机制——获得性可能遗传

一向以来,人们倾向于认为基因从父母代向子代的纵向传递是表型遗传的唯一方式,后天获得的性状和特性是不能遗传的;而且基因突变是进化的主要途径。但是自然界的许多现象并不能用这些观点解释。近年来,在多种生物中已发现了基因从一个个体向另一个个体传递的现象,即横向的基因传递,并且发现横向基因传递是生物进化的一个重要机制,甚至比基因突变更重要。本文综述了生物体之间的各种横向基因传递现象,并提出了获得性可能在符合孟德尔定律的条件下遗传的假说。     

细胞的起源和进化(二)

（续１９９８年第３３卷第６期第１４页）３内共生学说真核细胞除了有细胞核外,细胞质中还有多种细胞器,这些细胞器的起源和进化同样是细胞进化的重要事件。其中研究得最多,争论也最大的是线粒体和叶绿体的起源和进化。作为经典的学说,一直有人认为线粒体和叶绿体是原...     

环境微生物的抗生素抗性和抗性组

环境和医疗实践中广泛存在的细菌抗生素抗性已经成为食品安全和人类健康领域的主要威胁。近年来的研究表明,病原菌主要通过水平基因转移而不是基因突变获得抗性,大量的研究支持病原微生物抗生素抗性基因的环境来源。系统论述了环境微生物抗生素抗性起源、进化及病原菌抗性基因与环境抗生素抗性组相互之间的交叉传播和水平转移机制,介绍了近年来环境微生物抗生素抗性组生态和进化生物学研究的最新进展和方法学应用。     

试论达尔文进化论与协同进化论

进化在本质上是一种生态过程,达尔文进化论是人类对生物界进化认识的巨大成就,但它不恰当地把生存斗争当作进化的主要动力和普遍的原则,当代基于生态多样性的协同进化论认为生物进化包括相互受益的相互制约机制,优胜劣汰的生存斗争只是制机制中的一种机制,人类必须维护生物多样性和生物圈的协同进化,同自然界和谐、协同发展。     

古菌——原核生物到真核生物的过渡？

生命进化一直是人们所关注的热点,也是整个生命科学的中心。但自达尔文的进化论至本世纪７０年代,科学家们一直为细菌进化研究这个“黑洞”所困惑,由于缺少这个生物学多样性极为丰富的群体而使得进化研究不能成为一门完整的学科。直到１９７７年Ｗｏｅｓｅ的ｒＲＮＡ生命树才使得细菌进化研究看到曙光,更重要的是第三生命──古菌的发现首次在进化研究中包括了所有的生命。本文从Ｗｏｅｓｅ通过ｓｓｕｒＲＮＡ分子序列同源性发现古菌到最近基因组序列的比较,综述了近年来对生命进化研究的深入和发展。１古菌的发现导致了生命三域学说的…     

生物进化的性质——三评莫诺的《偶然性与必然性》

莫诺在其《偶然性与必然性》一书里,站在唯心的形而上学的立场上,对进化问题提出了若干奇谈怪论。他对生命属性和基因突变问题所提出的一些似是而非的论点,我们已经作了一些分析批判。本文着重讨论他的进化观。 莫诺对生物进化的基本论点如下:由于生殖的不变性是生命的基本属性,进化并不是     

植物基因组大小进化的研究进展

不同的真核生物之间基因组大小差异很大, 并与生物体复杂性不相关, 在基因组中存在大量的非编码DNA序列是造成这种差异的主要原因, 特别是转座子序列。文章综述了植物基因组大小差异以及引起这种差异的主要进化动力的最新研究进展。植物基因组多倍化和转座子积累是导致基因组增大的主要动力, 而同源不平等重组和非正规重组则是驱动基因组DNA丢失的潜在动力, 以制约基因组无限制地增大。文中还讨论了植物基因组大小进化方向, 即总体趋势是朝着增大的方向进化, 某些删除机制主要是削弱这种增大作用但不能逆转。     

向进化论提出挑战(上)

也许除了哥白尼的学说以外,没有任何一个科学理论能够象达尔文的进化论那样给人们留下如此深刻的影响。当查尔斯·达尔文发表《物种起源》的时候,他就把人当作了自地球诞生之日起就开始的进化链的最后一个环节,即在自然选择,适者生存的自然规律支配下的进化过程的最后产物。如果说哥白尼的学说只引起了几番挣扎性的抵抗的话,那么达尔文的学说一百三十年以来却遭到了不少人的反对。最近的一次攻击可以说是相当严厉的,并抓住了要害。它来自一个澳大利亚生物学家——迈克尔·登顿(Mchcal Denton)。他的《进化论:危机中的一个学说》一书,如今在英美科学界引起了很大的轰动。要想了解这些批评的独到和精辟之处,我们应该     

中国人类化石的主要发现和理论探索(1922-2009)

文中简要回顾和总结近90年来中国古人类学的发展历程与脉络,重在梳理中国人类化石的发现、解剖特征、年代测定,以及建立在这些研究基础上所提出的主要理论学说,收尾于中国现代人类起源之论争.对中国古人类化石的形态学特征的比较研究导致为中国的人类进化提出新的假说-连续进化附带杂交说.这个假说同样获得古文化和古环境丰富信息的支持.     

一种新的分子进化学说—中性学说

生物进化已是确凿无疑的事实,在自成体系的进化学说中首推达尔文进化学说。这个学说的精髓是自然选择,并被恩格斯推崇为十九世纪自然科学的三大成就之一。但是由于时代的局限性,达尔文进化学说不足之处主要在于他无法回答变异的问题。遗传学的建立与发展开拓了进化论发展的道路。本世纪初,哈代(Hardy,1908)、温伯格(Weinberg,1909)提出了遗传平衡定律,成功地将自然选择学说和孟德尔遗传