一种水稻酰基辅酶A结合蛋白cDNA的鉴定

对一水稻ｃＤＮＡ克隆（Ｒ１９０８）的分析表明,其可能编码水稻酰基辅酶Ａ结合蛋白（ａｃｙｌ－ＣｏＡ－ｂｉｎｄｉｎｇ ｐｒｏｔｅｉｎ,ＡＣＢＰ）。Ｓｏｕｔｈ－ｅｒｎ杂交显示水稻（Ｏｒｙｚａ ｓａｔｉｖａ Ｌ）基因组中仅有一个该基因的拷贝。Ｎｏｒｔｈｅｒｎ分析表明水稻的ＡＣＢＰ基因在水稻的根、茎、叶、叶鞘、黄化苗和幼穗中皆表达,而以黄化苗的绿苗叶鞘中的表达高于绿苗叶片。     

一种水稻酰基辅酶A结合蛋白cDNA的鉴定(英文)

对一水稻ｃＤＮＡ 克隆（Ｒ１９０８） 的分析表明, 其可能编码水稻酰基辅酶Ａ 结合蛋白（ａｃｙｌＣｏＡｂｉｎｄｉｎｇ ｐｒｏｔｅｉｎ,ＡＣＢＰ）。Ｓｏｕｔｈｅｒｎ 杂交显示水稻（ Ｏｒｙｚａ ｓａｔｉｖａ Ｌ．） 基因组中仅有一个该基因的拷贝。Ｎｏｒｔｈｅｒｎ 分析表明水稻的ＡＣＢＰ基因在水稻的根、茎、叶、叶鞘、黄化苗和幼穗中皆表达,而以黄化苗的绿苗叶鞘中的表达强度高于绿苗叶片。     

鲈鱼CPT I基因cDNA克隆及表达分析

肉毒碱棕榈酰转移酶(carnitine palmitoyltransferases,CPT,EC.2.3.1.2)在脂肪酸的β-氧化中起重要作用.线粒体内膜外侧的脂酰CoA经CPTⅠ催化与肉毒碱结合形成脂酰肉毒碱而得以穿过线粒体内膜,进入线粒体.在线粒体内膜内侧的CPTⅡ催化下,脂酰肉毒碱上的脂酰基又转移到CoA上,重新形成脂酰CoA,成为β-氧化的底物.利用RT-PCR和SMART RACE的方法从鲈鱼(Lateolabrax japonicus)肝脏中克隆了CPT I全长cDNA.该序列全长3007 bp,5′非翻译区166 bp、3′非翻译区477 bp、开放阅读框2364 bp,编码一个由787个氨基酸组成的蛋白质,分子量为89.60 kDa,等电点为8.85.氨基酸序列分析表明,鲈鱼CPT I具有较高的保守性,与金头鲷(Sparus aurata)、虹鳟(Oncorhynchus mykiss)、斑马鱼(Danio rerio)、人(Homo sapiens)、小鼠(Mus musculus)等 7个物种的同源性为93%～66%,其中与金头鲷同源性最高,为93%.用RT-PCR分析CPT I基因在10个组织中的表达,结果表明在肌、肾中有较高的表达,心、脑、鳃、肝、肠次之,眼、脂肪、脾表达最低.     

海洋链霉菌酰基辅酶A硫酯酶基因的克隆及分析

酰基辅酶A硫酯酶(ACOT)是催化脂酰辅酶A水解成自由脂肪酸和辅酶A的一类酶,而II型ACOT对底物具有较高的特异性,在脂肪酸合成途径中起着重要的作用,II型ACOT的缺乏或失调会导致机体脂肪酸代谢的紊乱,从而引起一系列疾病。从海洋链霉菌L1基因组DNA中克隆到786碱基的ACOT II基因,生物信息学分析表明其拟编码262个氨基酸,与Acyl-CoA thioesterase II (sequence ID:WP 069742521.1)相似性达到100%。BLAST比对发现,其属于热狗超家族成员,并包含一个II型硫酯酶催化反应的特有结构域。并构建了表达载体pET32a-ACOT II,0.5 mmol/L IPTG诱导目的基因表达,SDS-PAGE显示其分子量约为37.0 kD。通过对链霉菌中II型ACOT基因的研究,可为进一步深入研究II型硫酯酶的分子结构和生物学功能,进而指导药物研发提供参考。     

酰基辅酶A结合结构域蛋白3在病原微生物复制中的作用

病毒及细菌等病原微生物侵入细胞后,复制过程离不开宿主细胞内的宿主蛋白.近年来研究表明,酰基辅酶A结合结构域蛋白3(ACBD3)可以与一些病原体的蛋白质相互作用,影响病原体微生物在宿主细胞的复制.本文通过总结爱知病毒、柯萨奇病毒、脊髓灰质炎病毒、丙肝病毒、人类鼻病毒以及沙门氏菌侵染宿主细胞时,病毒蛋白质与ACBD3及磷脂酰肌醇4-激酶B(PI4KB)相互作用的研究进展,探讨ACBD3在病原微生物中的作用.     

鲈鱼钙蛋白酶基因cDNA克隆及表达分析

钙蛋白酶超家族（Calpain,CAPN,EC3.4.22.17）是由一类钙依赖性半胱氨酸蛋白酶组成.其在细胞周期、细胞迁移、信号转导以及细胞凋亡中都有着广泛的作用.研究了鲈鱼催化亚基CAPN2的基因结构.鲈鱼（Lateolabrax japonicus） CAPN2 cDNA全长2373 bp,5′非翻译区74 bp、3′非翻译区205 bp、开放阅读框2094 bp,编码一个由697个氨基酸组成的蛋白质,分子量为77.94kDa,等电点为5.02.氨基酸序列分析表明,鲈鱼CAPN2具有较高的保守性,与大西洋鲑（Hippoglossus hippoglossus）、虹鳟（Oncorhynchus mykiss）、斑马鱼（Danio rerio）、斑点叉尾鮰（Ictalurus punctatus）、猪（Sus scrofa）、人（Homo sapiens）、大鼠（Mus musculus）等 7个物种的同源性分别为89%、81%、77%、75%、63%、62%、62%.用RT-PCR分析CAPN2基因在10个组织中均有表达,肌、心、肾表达较高,脑、鳃、肠次之,肝、眼、脂肪、脾表达最低.     

热带假丝酵母酰基辅酶A氧化酶的活性测定方法

酰基辅酶A氧化酶（ACO）是热带假丝酵母内二元酸β氧化的限速酶,工业上利用烷烃生产二元酸时,使用ACO低活性的菌株,将有利地提高二元酸的产量和纯度,本以热带假丝酵母为材料,在Allain方法基础上加以改进,可简便,准确地测定ACO酶活性,为二元酸生产菌株的筛选方法提供了量化标准,并为进一步研究此酶的酶学性质奠定了基础,对本实验室所保存的一系列具有不同产酸能力的热带假丝酵母菌种进行酶活性测定,发现酶活性与产酸能力有明显的相关性。     

巴西橡胶树的脂酰辅酶A还原酶cDNA克隆及其序列分析

从巴西橡胶树差减cDNA文库中筛选到一个与脂酰辅酶A还原酶同源性较高的基因片段,根据该基因片段序列信息,设计特异引物,采用RACE进行差异片段的5’和3’端的扩增,获得长度为1365bp的cDNA克隆R28（GenBank登陆号：AY461413）。序列分析表明,该基因包含1149bp的开放阅读框,5＇-UTR为96bp,3＇-UTR为128bp,编码382个氨基酸,推测其蛋白质的分子量为43．5kDa,等电点为8．97,有一个跨膜螺旋N（187至215位氨基酸）和1个由17个氨基酸组成的信号肽（1至17位氨基酸）。R28含有脂酰辅酶A还原酶的保守（NADP结合蛋白保守区）,推测该基因是一个脂酰辅酶A还原酶基因。     

鲈鱼IgM重链基因cDNA的克隆及其原核表达

采用同源克隆和RACE技术扩增到鲈鱼 (Lateolabrax japonicus) 免疫球蛋白M (Immunoglobulin M,IgM) 重链 (Heavy chain,H) 基因全长cDNA序列。鲈鱼IgM cDNA全长为1 901 bp,开放阅读框包含1 749 bp,编码582个氨基酸。根据鲈鱼IgM和其他硬骨鱼免疫球蛋白重链恒定区的氨基酸序列构建的系统发育树表明IgM、IgZ和IgD分别聚为一枝,其中IgM与IgZ分支的进化关系较近,而与IgD分支的进化关系较远。RT-PCR检测IgM在鲈鱼各组织器官的表达情况,其中在头肾及脾脏中表达量最高,心脏、肌肉及脑中几乎不表达。利用已获得的鲈鱼IgM cDNA序列,构建原核表达载体pQE30-IgM,并在M15大肠杆菌中成功诱导表达了分子量为63kD的重组蛋白His-IgM,Western-blotting显示鲈鱼IgM重组蛋白能与鼠源抗6×His的单克隆抗体特异性结合,说明已经获得了基因工程表达IgM重链蛋白。     

低盐度可诱导鲈鱼胞浆型PEPCK基因表达

磷酸烯醇式丙酮酸羧激酶(PEPCK)催化草酰乙酸生成磷酸烯醇式丙酮酸,是糖异生途径的第1个限速酶.本研究用SMARTRACE技术从鲈鱼肝脏中分离克隆了PEPCK基因的全长cDNA序列.该基因全长2215bp,包含1个123bp的5′非翻译区和217bp的3′非翻译区,开放阅读框为1875bp,编码1个由624个氨基酸组成的蛋白质,该蛋白理论分子量为69.1kD,等电点为5.87.氨基酸序列分析表明,与其它动物的胞浆型PEPCK相似性很高,与黑鲷为94.2%,与大西洋鲑为86.4%,与人为75.9%,而与该鱼线粒体型PEPCK氨基酸同源性只有70.6%.系统发育分析显示,该蛋白首先与其它动物的cPEPCK聚成一支,然后再与鱼类的mPEPCK成簇,认为该PEPCK属于胞浆型.同时用RT-PCR分析了PEPCK基因在10个组织中的表达,结果表明只有在肝脏、消化道和肾脏有较高的表达.将鲈鱼从盐度为25的海水转入盐度为12的海水48h后,肝脏和肾脏的PEPCK基因表达有增加.实验结果表明,本实验克隆的为鲈鱼胞浆型PEPCK,低盐度可诱导其表达.     

鲈鱼胚胎的玻璃化冷冻保存

本文对鲈鱼(Lateolabrax japonicus)胚胎进行了玻璃化冷冻保存研究,筛选出了浓度较低、玻璃化程度较稳定的5种玻璃化液,冷冻时形成玻璃化的概率在48．1％～100％,在35～43℃的水浴中解冻时保持玻璃化的概率在44．4％～63．0％;玻璃化液VSD2在解冻时保持玻璃化的概率最高。对鲈鱼神经胚、20对肌节胚、尾芽胚、心跳胚、出膜前胚在玻璃化液VSD2中的适应能力及适合于玻璃化冷冻的胚胎时期进行了比较,结果显示：不同时期胚胎对玻璃化液的耐受能力不同,鲈鱼神经胚耐受能力最低,心跳胚耐受能力最强,出膜前期胚次之,心跳胚和出膜前胚适合于进行玻璃化冷冻。对0．5mol/L蔗糖的洗脱时间进行了选择,结果显示,洗脱10～20min效果较好。利用玻璃化程度较好的VSD2对鲈鱼不同时期胚胎进行超低温(-196℃)冷冻,获得了2．1％～27．9％的透明胚。将鲈鱼心跳胚冷冻解冻后获2粒复活胚,培养至出膜期,成活42～50h;出膜前期胚在冷冻解冻后有1粒胚复活,并且孵化出鱼苗[动物学报49(6)：843～850,2003]。     

Molecular Cloning and Expression Analysis of the Myostatin Gene in Sea Perch (<Emphasis Type="Italic">Lateolabrax japonicus</Emphasis>)

Myostatin (MSTN) is a member of the transforming growth factor-β (TGF-β) superfamily that functions as a negative regulator of skeletal muscle development and growth in mammals. However, few reports are available about the structure and function of MSTN in teleost. Here, the MSTN gene was cloned from sea perch (Lateolabrax japonicus) by homology cloning and genomic walking. In the 4873-bp genomic sequence, three exons, two introns, and 5′ and 3′ flanking sequences were identified. The sea perch MSTN gene encodes a 374-amino acid protein, including a signal peptide, conserved cysteine residues, and a RXXR proteolytic cleavage domain. Expression analysis of MSTN revealed that MSTN was highly expressed in eyes, brain, and muscle; intermediately in intestine; and weakly in gill, spleen, liver, and heart. It was demonstrated that MSTN mRNA was highly expressed in embryonic stem cell line (LJES1), but it was undetectable in several types of somatic cell lines from sea perch, including fibroblast-like cell, epithelioid cell, and lymphocyte-like cell. Further, it was demonstrated that the 5′ flanking region of the MSTN gene can drive the expression of green fluorescent protein (GFP) reporter gene in LJES1 cells and transgenic zebrafish (Danio rerio). This is the first report on the expression profile of MSTN gene in various types of cell cultures.     

Development and characterization of cell lines from heart, liver, spleen and head kidney of sea perch Lateolabrax japonicus

Five cell lines (LJHK, LJS, LJL, LJH-1 and LJH-2) were established from the head kidney, spleen, liver and heart of sea perch Lateolabrax japonicus . The cell lines LJHK, LJS, LJL, LJH-1 and LJH-2 were subcultured 46, 32, 32, 36 and 34 times in minimum essential medium (MEM) supplemented with foetal bovine serum (FBS), sea perch serum and 10 ng ml⁻¹ basic fibroblast growth factor (bFGF). Morphology of primary cultures and subcultures of the five cell lines were observed continuously by microscopy. The suitable temperature for growth was 18 to 30° C for all of these cell lines with the optimum growth at 24° C and a reduced growth rate <18° C. The optimum concentration of FBS was found to be 10% and addition of bFGF to the medium significantly increased the growth rate of the cells. The doubling time of LJS, LJH-1, LJL, LJH-2 and LJHK cells was determined to be 52·7, 54·9, 57, 58·7 and 66 h at a plating density of 1 × 10⁵ cells ml⁻¹ at 24° C, respectively. Chromosome analysis revealed that 42, 48, 38, 43 and 45% cells maintained normal diploid chromosome number (48) in the LJH-1, LJH-2, LJHK, LJL and LJS cell lines, respectively. The LJHK cells were successfully transfected with green fluorescent protein (GFP) reporter plasmids and the expression of GFP gene in the cells indicated the possible utility of the cells in gene expression studies. Furthermore, treatment of the LJHK cells with lipopolysaccharide led to increased expression of IL-1β, demonstrating that LJHK cells might be a valuable tool for studying the expression and function of immunomodulatory gene in fishes.     

海鲈核糖体蛋白L8cDNA的克隆与进化分析

本文构建了海鲈(Lateolabrax japonicus)头肾全长eDNA文库.PCR方法扩增得到海鲈的核糖体蛋白L8基因,全长848bp,编码257个氨基酸,含有L2及L2-C两个保守区.进化分析结果表明,以L8为参照的进化鉴定结果同经典的分子生物学标准18s鉴定结果十分相似,因此核糖体蛋白L8基因L8可以作为鉴定物种进化程度的新标准.     

人钙周期蛋白结合蛋白（hCacyBP）基因的克隆与表达

筛选cDNA文库得到了人的钙周期蛋白结合蛋白基因 ,将此基因的全编码区克隆到原核表达载体pET2 8上 ,诱导目的蛋白质表达以后将重组蛋白质用亲和层析的方法进行纯化 ,得到了纯度很好的重组的目的蛋白质 ,以此作为抗原免疫动物 ,得到抗钙周期蛋白结合蛋白的特异多克隆抗体。Western印迹的结果表明 ,该基因在小鼠多种组织中广泛表达 ;免疫组化的结果表明 ,BT32 5细胞诱导分化后钙周期蛋白结合蛋白分布有变化 ,由分布于胞质中转向分布于胞核和核周胞质     

鲈血清免疫球蛋白分离纯化及部分特性分析

采用硫酸铵盐析、透析和Sephadex G-200凝胶过滤的方法纯化出鲈(Lateolabrax japonicus)血清免疫球蛋白,利用高效液相色谱(HPLC)结合SDS-PAGE的方法分析其性质。HPLC结果表明：纯化得到的IgM在经巯基乙醇处理后解离形成轻链和重链两个亚单位,SDS-PAGE确定其分子量分别为72ku和28ku。实验说明,HPLC的检测方法具有广阔的应用前景;而对鲈IgM的分析为鱼类免疫球蛋白的比较研究提供了基础资料。     

油茶脂酰辅酶A脱氢酶基因的克隆与表达分析

以国审油茶(Camellia oleifera)良种‘华硕’种子为材料,在已构建的转录组和表达谱数据库基础之上,采用RACE技术,克隆获得油茶脂酰辅酶A脱氢酶基因的全长c DNA序列,命名为Co ACAD(基因登录号KJ910338)。该基因c DNA全长为2702 bp,含有2487 bp的开放读码框,编码828个氨基酸,分子量为92.4113 k D,理论等电点p I为8.47,具有2个比较明显的跨膜区和酪氨酸蛋白激酶活性位点LVHGDFRIDNLVF,存在5个亚结构域;在Co ACAD基因c DNA全长序列的基础上构建表达载体,其中原核表达载体在宿主细胞BL21(DE3)中成功诱导表达,获得表观分子量约为93 k D的目的蛋白;实时荧光定量PCR分析表明,Co ACAD基因在果实膨大期和成熟期上调表达,预示着Co ACAD基因可能在种子发育过程中参与能量供应过程的调控。