哈尔滨地区假丝酵母菌DNA异质性及药物敏感性分析

研究假丝酵母菌的DNA异质性及药物敏感性,为预防和监控院内假丝酵母菌感染奠定基础。将临床分离的假丝酵母菌菌株,用科玛嘉显色培养基鉴定菌种,经纸片扩散法进行药敏试验,应用随机扩增多态性DNA（RAPD）技术对这些菌株进行基因分型。结果显示：93株假丝酵母菌中白假丝酵母菌68株,非白假丝酵母菌25株,所有菌株对制霉菌素,两性霉素B两种药物的敏感率最高（100％）,酮康唑其次（70．9％）,氟康唑的敏感率最低（50．5％）,引物1和引物2将来源不同的68株白假丝酵母菌分别分成4型（A1、B1、C1、D1）和6型（A2、B2、C2、D2、E2、F2）。哈尔滨地区的假丝酵母菌感染以白假丝酵母菌为主,且主要为A1、B1型（引物1）或A2、B2型（引物2）;基因型与药敏谱无明显相关性。     

48株临床分离假丝酵母菌DNA异质性分析

应用随机扩增多态性DNA技术(RAPD)对48株假丝酵母菌临床菌株进行PCR扩增,并对扩增产物的指纹图谱进行分析,结果显示:48株假丝酵母菌中白假丝酵母菌35株,非白假丝酵母菌13株,引物1和引物2将来源不同的35株白假丝酵母菌分成4型和6型,且RAPD技术可将白假丝酵母菌鉴定至种,并可分辩同种菌的不同型别,是假丝酵母菌致感染、追踪病原的分子流行病学研究有效方法。     

PCR技术在鼠肺支原体检测中应用的初步研究

目的　探讨PCR技术在鼠肺支原体检测中的应用,希望能建立一种可行、快速、敏感的检测方法。方法　使用支原体通用引物及鼠肺支原体特异性引物对14 份大鼠喉气管拭子洗液和拭子支原体培养液进行PCR扩增,2 % 琼脂糖电泳鉴定。另设M53 和ATCC19612 二株标准鼠肺支原体菌株作阳性对照。结果　通用引物对大鼠喉气管拭子洗液检出率8/14 ,拭子支原体培养液检出率14/14,鼠肺支原体特异引物PCR扩增对大鼠喉气管拭子洗液检出率0/14 ,拭子支原体培养液3/14。通用引物扩增M53 和ATCC19612 二株标准株均呈现阳性,而鼠肺支原体特异引物扩增M53 和ATCC19612,只有M53 呈现阳性。结论　PCR通用引物检测比普通分离培养省时省力,而我们采用国外某学者认为对鼠肺支原体有特异性的引物,是否可用于鼠肺支原体的特异性PCR 检查仍需进一步探讨。     

男性患者解脲脲原体三种不同检测方法评价及药敏分析

目的 对男性患者解脲脲原体进行三种检测方法的对比研究及药敏分析。方法 选取桂林医学院附属医院自2015年1月至2015年12月收治的406例男性解脲脲原体感染患者作为临床研究对象,分别同时用培养鉴定法、DNA实时荧光定量法（RT-PCR）及RNA实时荧光恒温扩增检测（SAT）法三种方法对标本进行检测。以培养鉴定法作为对照组,对比RT-PCR及SAT方法对解脲脲原体的阳性检出率。结果 培养鉴定法、RT-PCR、SAT法阳性检出率分别为41.7%、35.5%、43.6%,培养鉴定法与SAT法阳性检出率明显高于RT-PCR,具有显著差异(χ2=4.35,P=0.0362);培养鉴定法与SAT法阳性率无明显差异（χ2=2.89,P=0.0982）,有较好的一致性（K=0.890,P＜0.05）;药敏结果显示,解脲脲原体对强力霉素、美满霉素敏感性较高,敏感率为97.6%。结论 对男性疑似解脲脲原体感染患者建议选择不同检测方法诊断以保证阳性检出率,可以更好指导临床抗生素合理使用。     

2型糖尿病患者真菌性泌尿系感染的真菌菌群分布及耐药性分析

目的探讨2型糖尿病患者真菌性泌尿系感染的真菌菌群分布及耐药性。方法回顾性分析在台州市恩泽医疗中心(集团)路桥医院就诊的1 000例2型糖尿病患者,所有患者均送检清洁中段尿进行检查,对判断为真菌性泌尿系感染患者的尿液进行真菌培养,观察菌群分布及耐药性。结果 2型糖尿病患者泌尿系真菌感染率达8.70%,共培养出103株真菌,其中排名前六的真菌分别是白假丝酵母菌、光滑假丝酵母菌、热带假丝酵母菌、克柔假丝酵母菌、法氏假丝酵母菌和近平滑假丝酵母菌;对主要致病菌耐药性较低的药物是5-氟胞嘧啶(2.91%)和两性霉素B(0.97%)。两性霉素B和5-氟胞嘧啶的耐药率均明显低于氟康唑、伊曲康唑与伏立康唑(χ~2=21.58、31.93;17.94、16.43;26.30、13.03,P0.01)。结论 2型糖尿病患者真菌性泌尿系感染的发生率较高,以白假丝酵母菌、光滑假丝酵母菌和热带假丝酵母菌最为多见,临床医师应根据病原学、耐药性检查及安全性选择合适的抗生素,对无法进行耐药性检查的患者可首选两性霉素B。     

G试验联合真菌培养在假丝酵母菌血流感染诊治中的价值

目的 了解假丝酵母菌血流感染患者常见病原菌分布及药物敏感性情况,评估 (1,3)βD葡聚糖检测(G试验)联合真菌培养在假丝酵母菌血流感染诊治中的应用价值。 方法 回顾性分析浙江省人民医院2014年1月至2018年12月假丝酵母菌血流感染患者的病原菌分布及药物敏感状况,同步分析G试验检测结果。 结果 假丝酵母菌血流感染病原菌以白假丝酵母菌为主。所检出的90株假丝酵母菌对两性霉素B最为敏感,敏感率为100.00%;对5氟胞嘧啶、伏立康唑、氟康唑和伊曲康唑的敏感率分别为98.89%、90.00%、87.78%和77.78%。热带假丝酵母菌对伏立康唑、氟康唑和伊曲康唑的敏感率分别为56.25%、50.00%和43.75%,光滑假丝酵母菌对伊曲康唑敏感率仅为58.33%。假丝酵母菌血流感染患者、局部假丝酵母菌感染患者血清(1,3)βD葡聚糖水平高于对照组,差异有统计学意义(t=6.576、P结论 G试验可作为假丝酵母菌血流感染的诊断参考依据,血清(1,3)βD葡聚糖水平与假丝酵母菌感染的严重程度有关。G试验联合真菌培养在假丝酵母菌血流感染诊治中具有重要作用,有助于临床早期诊断和监测治疗。     

穿心莲内酯联合氟康唑抗耐药白假丝酵母菌作用机制研究

目的探讨穿心莲内酯联合氟康唑抗耐药白假丝酵母菌作用及其机制。方法采用微量稀释法检测穿心莲内酯（AG）及联合氟康唑（FLC）对耐药白假丝酵母菌的MIC;采用罗丹明6G（Rh6G）检测AG对耐药白假丝酵母菌CDR外排功能的影响;利用罗丹明123评估AG对耐药白假丝酵母菌MDR外排功能的影响：采用二氢罗丹明检测AG单用及联合FLC对耐药白假丝酵母菌活性氧（ROS）的影响;采用实时荧光定量PCR（qRT—PCR）检测AG联合FLC对耐药白假丝酵母菌外排泵相关基因CDR1、CDR2和MDR1表达的影响。结果AG联合FLC抗耐药白假丝酵母菌呈相加作用;AG对CDR外排功能无影响;AG可抑制MDR外排功能;AG联合FLC能显著提高耐药白假丝酵母菌细胞ROS水平;AG与FLC联合作用于耐药白假丝酵母菌可下调CDR1和MDR1的表达量,上调CDR2的表达量。结论AG联合FLC抗耐药白假丝酵母菌具有相加作用,其机制可能与抑制外排泵及相关基因表达,提高胞内ROS水平有关。     

穿心莲内酯对白假丝酵母菌菌丝的影响

目的探讨中药有效成分穿心莲内酯（Andrographolide,AG）对白假丝酵母菌菌丝的影响。方法利用稀释涂布法观察AG对固体培养基上白假丝酵母菌菌落形态的影响;倒置显微镜观察AG对白假丝酵母菌芽管及菌丝形态的影响;采用xTT还原法评价AG对白假丝酵母菌菌丝活性的影响;采用实时荧光定量PCR（qRT—PCR）检测白假丝酵母菌菌丝形成相关基因SUN41、CSHl以及CaPDE2表达量变化。结果AG能影响白假丝酵母菌菌落的形态;倒置显微镜观察表明AG能够抑制白假丝酵母菌菌丝及芽管的形成;qRT-PCR检测显示AG能使SUN41和CSHl基因表达下调和使CaPDE2上调。结论穿心莲内酯可能通过影响SUN41、CSHl与CaPDE2基因的表达而抑制白假丝酵母菌菌丝的形成。     

乳杆菌活菌胶囊辅助治疗妊娠期外阴阴道假丝酵母菌病疗效观察

目的探讨乳杆菌活菌胶囊辅助治疗妊娠期外阴阴道假丝酵母菌病疗效观察。方法选取妊娠期外阴阴道假丝酵母菌病患者70例,采用随机数字表将纳入患者分为观察组35例和对照组35例。观察组患者予以乳杆菌活菌胶囊联合制菌素阴道栓治疗,对照组予以单纯的制菌素阴道栓治疗,均连用10d。两组患者停药2周后进行临床疗效观察,并比较治疗后随访3个月的复发率。结果治疗后停药2周,观察组患者的临床总有效率（91．43％）明显优于对照组（71．43％）（χ2=4．63,P〈0．05）;治疗后随访观察3个月,对照组复发11例（44．00％）,观察组复发5例（15．63％）,观察组患者复发率明显低于对照组（χ2=5．60,P〈0．05）。结论乳杆菌活菌胶囊辅助治疗妊娠期外阴阴道假丝酵母菌病疗效好,复发率低,对外阴阴道假丝酵母菌病具有治疗和预防复发的双重功效。     

用PCR法快速半定量阴道分泌物中的乳酸杆菌

目的 通过对PCR引物、反应条件及样本处理条件的摸索,建立一种不经过分离培养和DNA提取纯化步骤,直接用乳酸杆菌特异性引物快速定性、半定量妇女阴道分泌物标本中乳酸杆菌的方法.方法 设计乳酸杆菌属特异性引物;对样本处理方法和PCR反应条件进行摸索;比较用PCR法定量阴道分泌物中乳酸杆菌的结果和稀释滴种法定量结果的相关性.结果 （1）用浓度为2%的Tritonx-100处理阴道标本后可在220 bp的位置得到最佳的特异性扩增区带;（2）将MgCl2在PCR反应体系中的终浓度调节至2.5 mmol/L时,可以产生最强的特异性反应扩增带;（3）用PCR法分析阴道分泌物所得菌数与培养所得菌数之间明显相关（P＜0.05）;用PCR法分析阴道分泌物所得灰度值与培养所得菌数之间明显相关（P＜0.05）.结论 将阴道分泌物标本经过简单的离心、洗涤处理后,直接应用PCR法,就可以快速地定性和半定量妇女阴道分泌物标本中的乳酸杆菌.     

痘病毒科不同病毒属特异的PCR检测方法的建立

目的:建立可准确、快速地鉴别诊断可感染人的不同属痘病毒的特异PCR方法。方法:设计针对正痘病毒属、副痘病毒属和传染性软疣病毒属的多对特异引物,并制备相应的DNA模板,针对不同的模板优化引物与反应条件,分别进行检测筛选,建立病毒属特异的单独与多重PCR方法。结果:单一模板的PCR扩增反应中,正痘病毒的检测敏感性可达101拷贝/μL(引物为OPEaL-F1880/OPEaL-R2057),副痘病毒的检测敏感性可达101拷贝/μL(引物为PP2/PP3),传染性软疣病毒的检测敏感性为100 pg/μL体系(引物为MCV1/MCV2);混合模板的PCR扩增反应中,各属特异的引物均可获得预期大小的特异片段。结论:我们建立的PCR诊断方法,可用于痘病毒科不同病毒属感染的实验室特异快速鉴别诊断。     

用反向斑点杂交方法检测猪常见致病菌

目的:建立检测猪常见致病菌的反向斑点杂交方法。方法:将23S rRNA基因芯片用的针对12种细菌的25～30 mer探针加长到30～38 mer,2对通用引物序列不变。用地高辛标记下游引物,以尼龙膜为载体制备膜芯片,检验探针/膜杂交的特异性和敏感性;另外设计1条大肠杆菌K88基因探针、一段带K88探针的报告基因和1对报告基因的反向PCR引物,在PCR体系中增加封口的K88报告基因和反向引物对,被检样品扩增后进行膜杂交。结果:修改的13条探针与参考目标菌株在膜上成特异性杂交,对52个参考菌株和野外分离株的检测准确率为92%;膜杂交的敏感性与玻片芯片接近,最小检出量为100 fg DNA;在尼龙膜上增加K88探针,与3重PCR产物杂交,可以检测到大肠杆菌K88毒力基因。结论:建立的反向斑点杂交方法简便快速,检测成本低,可用于仪器设备不足的实验室,同时可以加入检测如大肠杆菌K88等致病基因,提高基于保守基因的芯片的诊断能力。     

金黄色葡萄球菌反向线性杂交探针检测方法的建立

目的建立一种检测金黄色葡萄球菌的简单、快速、灵敏、准确的方法。方法根据金黄色葡萄球菌的耐热核酸酶nuc基因,设计一对通用引物及两条特异性探针,用生物素标记通用引物的5＇端,将两条特异性探针固定于硝酸纤维膜上,使PCR产物与探针杂交。结果建立的反向线性杂交探针方法,其检测限为2 ng/μL,检测特异性和准确性均为100%。结论建立的反向线性杂交检测方法具有较高的敏感性和特异性,可用于实验动物金黄色葡萄球菌的快速检测。     

产肠毒素大肠杆菌快速检测方法的建立和评价

目的利用环介导等温扩增(LAMP)技术,建立产肠毒素大肠杆菌(ETEC)的快速、便捷、敏感、特异的检测方法,并对该方法的特异性和敏感性进行评价,为实验动物检测和细菌性腹泻的诊断提供技术支持。方法根据GenBank公布的产肠毒素大肠杆菌的LT毒素基因序列(S60731.1)设计外引物和内引物进行LAMP扩增,对LAMP特异性和敏感性与PCR方法做比较。结果建立的LAMP方法检测最低浓度为100 pg/μL,灵敏度是PCR的10倍以上并具有较高的特异性,利用该方法对27份猴腹泻样品进行LAMP和PCR方法检测,发现PCR检出率为33.3%,LAMP(60 min内)结果与PCR相同,而LAMP(90 min内)检出率为92.6%,约是PCR检出率的3倍。结论建立了一种用于检测肠毒性大肠杆菌(ETEC)的LAMP检测方法,该方法特异性强,灵敏度高,方便快捷,适合于ETEC临床快速检测。     

PCR结合反向斑点杂交法检测石蜡包埋组织中的曲霉感染

目的评价PCR结合反向斑点杂交法检测福尔马林固定、石蜡包埋组织中曲霉感染的可行性。方法选取39例病理证实曲霉感染的患者活检标本（21例为鼻窦感染标本、18例为尸检标本）,以1对真菌特有的28SrRNA保守序列结构作为真菌通用引物,以临床常见的4个曲霉菌种：烟曲霉、黄曲霉、黑曲霉、土曲霉的种特异性序列为种特异性探针,与扩增产物进行反向斑点杂交。结果尸检标本阳性率为55．6％（10／18）,鼻窦标本阳性率为76．2％（16／21）,特异性均为100％。在这些曲霉所致的系统性感染中,烟曲霉是主要的致病真菌。结论该方法能对临床无法培养的石蜡组织块进行回顾性病原学研究,并可以鉴定常见的曲霉菌种,有良好的特异性和敏感性,适用于临床曲霉感染的检测。     

色拉油中转基因成分的PCR检测

本文介绍了色拉油中DNA的快速提取法和PCR检测的方法。通过针对转基因大豆不同目的基因序列设计的两对引物来检测DNA。结果显示PCR方法简捷有效、灵敏且专一性强。本研究采用了一种稳定有效、重复性好、操作简便的DNA提取方法,可以促进食用油脂检测工作的进一步开展。     

Development of a PCR Assay for the Molecular Detection of Phytophthora boehmeriae in Infected Cotton

Cotton blight, caused by the oomycete Phytophthora boehmeriae, is a serious disease of cotton in China. In wet weather conditions, P. boehmeriae is usually the primary pathogen, followed by many saprophytic fungi and pathogens such as Pythium spp., Fusarium spp., Rhizoctonia and others. As P. boehmeriae grows much slower than other pathogens, it is difficult to isolate and identify. A rapid and accurate method for its specific identification is necessary for the detection of blight in infected cotton tissue. The internal transcribed spacer (ITS) regions of ribosomal DNA (rDNA) from three isolates of P. boehmeriae were amplified using the polymerase chain reaction (PCR) with the universal primers DC6 and ITS4. PCR products were cloned and sequenced. The sequences were aligned with those published of 50 other Phytophthora species, and a region specific to P. boehmeriae was used to construct the specific PCR primers PB1 and PB2. Over 106 isolates of 14 Phytophthora species and at least 20 other fungal species were used to check the specificity of the primers. PCR amplification with primers PB1 and PB2 resulted in the amplification of a product of approximately 750 bp only from isolates of P. boehmeriae. Using primers PB1 and PB2, detection sensitivity was approximately 10 fg DNA/μl. In inoculated plant material, P. boehmeriae could be detected in tissue 1 day after inoculation, prior to the appearance of symptoms. The PB primer‐based PCR assay provides an accurate and sensitive method for detecting P. boehmeriae in cotton tissue.     

Rapid detection of human fecal Eubacterium species and related genera by nested PCR method

PCR procedures based on 16S rDNA gene sequence specific for seven Eubacterium spp. and Eggerthella lenta that predominate in the human intestinal tract were developed, and used for direct detection of these species in seven human feces samples. Three species of Eggerthella lenta, Eubacterium rectale, and Eubacterium eligens were detected from seven fecal samples. Eubacterium biforme was detected from six samples. It was reported that E. rectale, E. eligens, and E. biforme were difficult to detect by traditional culture method, but the nested PCR method is available for the detection of these species. This result shows that the nested PCR method utilizing a universal primer pair, followed by amplification with species-specific primers, would allow rapid detection of Eubacterium species in human feces.     

高保真酶特异性检测大鼠SNP基因型新方法

目的应用高保真酶（Pfu）和3’末端修饰引物在单管双向等位基因特异性扩增（SB-ASA）中区分SNP基因型,建立高保真酶特异性检测SNP基因型的新方法。方法选取近交系大鼠SNP位点,以RS8149053为例,设计两个外部引物和两个等位基因特异性引物,四引物3’末端进行硫代磷酸化修饰,应用高保真聚合酶（Pfu）进行特异性扩增,扩增结果测序验证其可靠性。结果在RS8149053 SNP位点（C/T）上,等位基因型CC扩增出179 bp目的片段,基因型TT扩增出597 bp目的片段,基因型不同则扩增出分子量不同的片段,目的条带测序结果与Rat Genome Database数据库基因型结果一致,高保真酶扩增结果稳定且特异性强。结论高保真酶等位基因特异性扩增技术能有效降低假阳性率,是一种快速、特异的SNP基因分型新方法。     

Transmission and detection of Flavobacterium columnare in channel catfish Ictalurus punctatus

A specific and rapid PCR detection method for Flavobacterium columnare based on the 16S-23S rDNA intergenic spacer region (ISR) of the ribosomal RNA operon has been developed. The ISR of 30 F. columnare strains and other Flavobacterium species was amplified using universal primers and sequenced. Once F. columnare specific sequences within the ISR were recognized, specific PCR primers were designed against them (FCISRFL and FCISRR1). The primers were sensitive and able to detect as low as 7 colony forming units from pure culture by PCR. The new PCR detection method was applied to experimentally infected channel catfish. Two different experiments in which channel catfish fingerlings were infected by intramuscular injection or by immersion bath showed the advantage of the PCR method over standard culture techniques. F. columnare was detected by PCR in both tank water and catfish tissue samples with a higher frequency and in less time than standard microbiological methods. Furthermore, PCR detection confirmed that F. columnare can be transmitted horizontally indirectly through the water column without fish-to-fish contact. The newly developed PCR detection method for F. columnare was more sensitive and rapid than standard culture on bacteriological media for detection of F. columnare in channel catfish tissues and in tank water.