中国种子植物区系定量化研究 V．区系相似性

本文总结了应用相似系数即关联系数进行植物区系相似性分析的现状,指出了存在的问题．然后,从集合论角度讨论了区系相似性、相似关系及其相似系数的实质．作者以为在区系相似性分析中应用Ｒ．Ｒ．Ｓｏｋａｌ和Ｃ．Ｄ．Ｍｉｃｈｅｎｅｒ（１９５８）提出的简单匹配系数比较适宜,同时亦能避免以往区系相似性分析中缺乏可比性及某些“表相”相似等问题．最后,还提出了总体相似系数和类型相似系数二个新概念,以便按照吴征镒教授关于中国植物区系研究的学术思想统一研究各个不同地区植物区系的相似性．对此,作者用了６个区系实例进行了演算说明．     

运用数学方法研究植物区系地理

本文对植物区系地理学中区系丰富性、区系相似性、区系成分划分及其区系区划等几个基本问题,在应用数学方法研究的现状进行了评述.本文指出了应用数学方法研究植物区系地理学中存在且亟待解决的几个重要的理论与实际问题.     

运用数学方法研究植物区系地理

本文对植物区系地理学中区系丰富性、区系相似性、区系成分划分及其区系区划等几个基本问题,在应用数学方法研究的现状进行了评述.本文指出了应用数学方法研究植物区系地理学中存在且亟待解决的几个重要的理论与实际问题.     

中国种子植物区系定量化研究 Ⅱ.多地区种子植物区系研究实用程序工作原理(DDBJ-系列程序)

本文介绍了定量化研究多个种子植物区系的电子计算机程序（DDAI）工作原理,简要讨论以共有属构建的区系间相似关系问题。应用本文提出的程序,可一次性完成所有被研究区系种子植物分布区类型的统计及有关的计算工作,同时也可根据各分布区类型及总体共有属,构建各个区系间的相似性系数及其他有关的参数。本文以中国若干种子植物区系原始资料统计计算为例提供的CAR（Computer Aided Research）方法,可对全面深入地研究中国种子植物区系,提供强有力的工具。     

湘黔桂交界地区种子植物区系与邻近区系关系的定量研究

湘黔桂地区与邻近地区种子植物区系各分类等级相似系数为：科的相似系数由大到小依次是南岭、华中、华东、滇黔桂、岭南;属的相似系数依次是华东、南岭、滇黔桂、岭南、华中;种的相似系数依次是岭南、滇黔桂、华中、华东、南岭。科、属、种的相似系数次序不一致的原因可能有三个方面：（1）各比较地区的面积大小不一,在计算相似系数时又没有进行等效面积转换;（2）对各个地区植物资源调查的深浅程度不一;（3）不同分类等级的相似系数在说明区系关系时,其重要性不一样,这可能是重要的原因。在一定范围内的区系比较研究中,种的相似系数能够较好地说明植物区系之间的关系。湘黔桂交界地区与邻近地区种子植物属的地理成分的定量关系是：华中与华东区系以及岭南与滇黔桂区系有密切的关系,而湘黔桂与南岭区系亦密切相关、属的地理成分的树状图表明：湘黔桂与南岭区系有密切的关系,而月,岭南和滇黔桂区系与湘黔桂区系的关系比华巾和华东区系与湘黔桂区系的关系要密切得多,达2倍以上。这些结果与上述各分类等级的相似系数,尤其是种的相似系数的结果相差较大,主要是因为这里指的是属的地理成分之间的定量关系,而非其他等级的相似性。     

随机扩增多态DNA（RAPD）标记用于丁香品种遗传分析及品种分类

采用随机扩增多态ＤＮＡ（ＲＡＰＤ）标记分析了１５个丁香品种的ＤＮＡ扩增产物。研究选用了１６个随机引物,共扩增出９６条带,其中５５条带为可重复性条带,有价值条带大小多在５１７ｂｐ至１６３６ｂｐ之间。这些标记足以区分这些丁香品种。欧丁香（Ｓｙｒｉｎｇａｖｕｌｇａｒｉｓ）与Ｓ．×ｈｙａｃｉｎｔｈｉｆｌｏｒａ间的相似系数为６１．５％,欧丁香与Ｓ．×ｐｒｅｓｔｏｎｉａｅ间的相似系数为４７．２％,Ｓ．×ｈｙａｃｉｎｔｈｉｆｌｏｒａ与Ｓ．×ｐｒｅｓｔｏｎｉａｅ间的相似系数为４３．６％。结果表明,欧丁香与Ｓ．×ｈｙａｃｉｎｔｈｉｆｌｏｒａ亲缘关系最近。应用ＲＡＰＤ资料分析讨论了一些品种的起源。ＲＡＰＤ技术为丁香品种分类鉴定提供了可靠方法。     

中国淡水与土壤有壳肉足虫最新分类名录及其区系分析

在回顾中国淡水与土壤有壳肉足虫研究历史的基础上,根据最新分类系统修订了已报道淡水与土壤有壳肉足虫的分类,共计3纲3目20科3属244种(包括52亚种).其中淡水种类37属233种及亚种,土壤种类1属64种及亚种,淡水与土壤共有17属53种及亚种.首次对中国淡水有壳肉足虫进行区系分析,用Jaccard共同系数分析西藏、贵州梵净山、湖南索溪峪、湖北东湖、江苏南京等5个地区的淡水有壳肉足虫区系相似性,区系相似性系数在0-0.25或0.25-0.5范围内,表明各地区间的区系为极不相似或中等不相似.采用模糊等价矩阵聚类法分析5个地区间的区系远近关系,结果表明其他4个地区与西藏的相似程度和地区间距离呈反比:西藏-贵州梵净山(0.35)>西藏-湖南索溪峪(0.324)>西藏-湖北东湖(0.22)>西藏-江苏南京(0.094).       

利用RAPD技术检测香菇双—单杂交后代

利用ＲＡＰＤ技术对香菇６个双单杂交菌株及其两个双核体基因组ＤＮＡ进行了检测,结果显示：１－３号杂交菌株之间的相似系数为０．８９３－０．９６２,它们与其亲本Ｓ之间的相似系数为０．８４２－０．８５９;４－６号杂交菌株之间的相似系数０．８５７－０．９２５,与其亲本ＳＳＯ１之间相似系数为０．７０８－０．９０２;表明杂交菌株与其双核体亲本基因组具有较大差异,杂交菌株之间存在着不同程度差异,６个杂交菌株是真正     

阿尔泰山温泉沟森林公园地衣区系的比较研究

为了查明阿尔泰山温泉沟森林公园地衣物种组成及区系特征, 对不同海拔采集的地衣进行了种类鉴定和区系分析, 同时对其他11 个地区的地衣区系进行了比较。不同地区间的地衣种属相似性采用Czehanowski 系数; 地衣的区系丰富性采用左家哺综合系数; 地衣区系地理成分的相关性采用主成分分析和聚类分析法进行了比较。结果表明, 阿尔泰山温泉沟森林公园地衣区系中, 单种科和单种属的比例在该地区地衣种类组成中较高, 分别占该地区地衣总科属数的40%和56.52%。属的相似性与额尔齐斯河大峡谷最高为64.15%, 种的相似性与哈纳斯国家级自然保护区最高为33.96%, 与武夷山地衣的属种相似性最低分别为27.12% 和2.27%。地衣科、属、种的丰富度指数, 还是综合性丰富性指数较低, 所比较的12 个地区中排在我国第9 位。地衣区系地理成分中, 环北极成分占优势, 其次为温带成分和世界广布成分, 与高等植物区系特征相符。     

内蒙古白音敖包国家自然保护区种子植物多样性及区系研究

通过野外实地调查,结合标本鉴定和文献研究,对内蒙古白音敖包国家级自然保护区种子植物多样性和区系特征进行了统计分析,并对白音敖包自然保护区与周边4个地区(章古台、木兰围场、达里诺尔、乌斯吐)种子植物区系的相似性进行比较分析。结果表明:(1)白音敖包自然保护区植物物种多样性较为丰富,共有野生种子植物72科261属526种,但多样性却表现出一定的脆弱性。(2)在植物区系科的组成上,主要有8个优势科;属的组成则主要为单种属和寡种属,共计246属,占本区系总属数的94.26%;在生活型方面草本植物占绝对优势,而在水分生态类型的分布上中生植物最多。(3)在科、属的地理分布类型中,温带成分占绝对优势,区系温带性质明显;而且区系成分具有一定的古老性,但特有程度较低。(4)该研究区与邻近4个植物区系的属相似性分析发现,白音敖包自然保护区与达里诺尔的属相似系数最高,与乌斯吐相似性较低。     

泡桐属植物种类的ＲＦＬＰ分析

对我国泡桐属１５个植物种类作了叶绿体ＤＮＡ的ＲＦＬＰ分析,根据估算的相似系系,用平均链锁聚类方法构建权 图,结果可将研究材料分为南方泡桐组、毛泡桐组和白花泡桐组,种间相似系数多在０．７０以上,说明各种类间亲缘关系较近,尤其是台湾泡桐和海岛泡桐,相似系数接近１．００,最后讲座了一些泡桐种类分类问题。     

利用RAPD技术检测香菇双-单杂交后代

利用ＲＡＰＤ技术对香菇６个双单杂交菌株及其两个双核体基因组ＤＮＡ进行了检测,结果显示：１～３号杂交菌株之间的相似系数为０．８９３～０．９６２,它们与其亲本Ｓ之间的相似系数为０．８４２～０．８５９;４～６号杂交菌株之间的相似系数０．８５７～０．９２５,与其亲本ＳＳＯ１之间相似系数为０．７０８～０．９０２表明杂交菌株与其双核体亲本基因组具有较大差异,杂交菌株之间存在着不同程度差异,６个杂交菌株是真正的杂交后代,聚类分析树状图直观地表明了菌株间的遗传相关性,认为菌株间ＤＮＡ的相似系数值可以作为杂交育种选择亲本的     

应用RAPD技术分析奥利亚罗非鱼和尼罗罗非鱼的基因多态性(英文)

以随机扩增多态ＤＮＡ技术（ＲＡＰＤ）分析了奥利亚罗非鱼和尼罗罗非鱼两个养殖群体的群体内及群体间遗传关系,并探讨了该技术在种群鉴定中的应用。ＲＡＰＤ引物筛选结果表明,所测试的２０个随机引物中（Ｔａｂｌｅ　１）,除一个引物未扩增出任何片段外,其余１９个引物均扩增出１～１１个大小不等的片段,长度大部分在５００～３０００ｂｐ之间,共扩增出２２０个片段,平均每个引物产生５．５个片段。两群体间共有片段７０条,大部分引物的扩增产物具有种间多态性,种群间相似系数为０．７２７。以筛选的引物对两种群不同个体（Ｆｉｇ．１,Ｔａｂｌｅ２）及种群混合样品（Ｆｉｇ．２,Ｔａｂｌｅ３）进行ＲＡＰＤ分析。结果表明,不同引物在扩增图谱上表现很大差异。奥利亚罗非鱼不同个体间表现为一致的扩增图谱,种内相似系数达１０００,显示了其种群内遗传变异的缺乏;尼罗罗非鱼种内相似系数为０．８２７,个体间存在不同程度的多态性;两个种群间的相似系数分别为０．７６７和０．７４２,表明种间有较高的同源性,遗传距离为０．２３５,略低于国外的报道、此外,两个养殖群体间的扩增图谱比较也暗示了遗传渐渗现象的存在。实验表明,ＲＡＰＤ标记可以作为一种可靠的遗传标记,用于不同鱼     

巴马小型猪群体遗传结构的随机扩增多态DNA分析

目的分析巴马小型猪的群体遗传结构。方法应用经过筛选的 ３１条引物对巴马小型猪个体基因组ＤＮＡ进行ＲＡＰＤ扩增,利用从ｉｎｔｅｒｎｅｔ网上下载的软件ＲＡＰＤ ｉｓｔａｎｃｅ Ｐａｃｋａｇｅ ｖｅｒ－ｓｉｏｎ１．０４软件对实验结果进行分析,计算不同个体间的相似系数。结果经ＲＡＰＤ反应,共扩增出２７５条带,其中多态性带８５条,多态性带频率在０～６６．７％之间,平均为２７．７％。不同个体猪拥有的ＲＡＰＤ条带具有差异,但拥有相同条带个体猪比率较高。该群体猪的相似系数（Ｆ）为０．９２８（０．７８～０．９７）,平均等位基因频率（ｑ）为０．７３２,最低平均杂合率（Ｈ）为０．２８６。结论巴马小型猪个体具有较好的遗传一致性和遗传稳定性。     

新疆山地苔藓植物区系相似性的数量分析

应用相似性系数分析方法,对新疆阿尔泰山、天山和昆仑山苔藓植物区系间的相似性进行了定量研究。结果表明：阿尔泰山与天山苔藓植物区系之间的相似性最大,其科、属、种的相似性系数分别为86．11％,64．45％和50．45％,表明阿尔泰山与天山苔藓植物区系有较近的亲缘关系;昆仑山与天山苔藓植物区系间的相似性大于它与阿尔泰山间的相似性。上述结果与对三大山地气候条件的分析结果相一致。     

重庆武隆天生桥种子植物区系研究

重庆武隆天生桥是国家4A级风景名胜区,处于云贵高原大娄山褶皱带与武陵山系的过渡地带。对该区植物从科、属和种的分布区类型进行了统计分析,另外将该区区系特征与其他几个地区进行了对比分析。结果表明：①该区内有种子植物115科、475属、1292种。②大、中属共有37属,仅占总属数的7．79％,但所含种数达389种,占总种数的30．11％。说明本植物区系中优势属较为明显。③从种子植物科属分布区类型所占比例来看,该地区区系性质以热带成分占优势,其中热带分布属214属,占总属数的50．71％,这一特点与当地的环境特点是密切相关的。④区系分析表明,温带分布类型也占相当优势,有温带分布属203属,占总属数的48．10％,说明该地区区系性质具有热带到温带过渡的性质。⑤中国特有种丰富,共有881种,占总种数的68．83％。⑨经对比分析和聚类分析表明：该区与相距较远地区属的相似性系数较低,表明区系上联系较为疏远;而与邻近的几个地区属的相似性系数较高,特别与西南地区植物区系联系紧密。     

广东蕨类植物区系的特点

广东蕨类植物区系共有５６科１３９属４６４种,其中含有很多原始的类型及孑遗种．区系分析表明：①广东有３个单型科．９个单型属及４个木本属;②以热带至亚热带分布科为主,占３９．３％,另泛热带科占３３．９％,广布科占２１．４％．温带科仅占７．１％;③单种属和少种属占绝对优势．共占７７．０％．又以泛热带属（４１属）和热带至亚热带（４１属）占优势．共占５９．０％,此外亚热带属（３６属）亦占２５．９％,而温带属（１２属）和广布属（９属）较少;这种分布格局显示了热带区系成分向亚热带地区渗透和过渡的特点;④广东蕨类区系与广西（特别是东南部）最为相似,属相似性指标达０．８４,种的相似性系数亦达０．６２,广东与海南、湖南南部、福建、江西南部亦较相似,充分显示了华南蕨类植物区系的整体性．     

贵州雷公山国家级自然保护区藻类植物区系研究

在野外调查与室内分类研究的基础上,首次对雷公山自然保护区藻类植物进行了区系分析。结果表明:该区有藻类植物432种(含54个变种和2个变型),隶属于6门8纲24目45科96属。其区系成分以国内外广泛分布为主,占总种数的38.44%,还出现热带种类和高海拔高纬度冷水性种类。此外,属和种的相似性系数比较反映了分类级别越高,其相似性就越大。     

昆虫区系多元相似性分析方法

由植物学领域首先提出的相似性概念已广泛应用于动植物区系地理研究以及生物学、生态学等诸多自然学科乃至社会科学领域.根据Jacard提出的二元相似性系数公式SI=C/(A B-C)和Sprensen提出的二元相似性系数公式SI=2C/(A B),分别推导出2个计算多元相似性系数的数学表达式,SIJab…n=[(∑Hij)2/n (∑Hijk)3/n … Hab…n]/[∑Si-∑Hij-2∑Hijk-…-(n-1)Hab…n]和 SISab…n=[2(∑Hij)2/n (3∑Hijk)3/n … nHab…n]/ ∑Si,并用中国夜蛾广布种类在中国7个动物地理区的分布资料为例进行验证,从而可以直接从整体角度和宏观规模上简便、快捷地考量多个系统间的亲疏程度和相似关系.建议在以相似性为基础的聚类分析中,不必再先把2个系统合并成一个新系统后,再和第3个系统比较,而可直接计算多个系统的相似性系数,以避免由于合并带来的信息损失.还讨论了应该提高Sprensen公式0.5的显著性标准,以使同一组数据的两种计算结果趋向一致.     

中国近缘野生大麦的RAPD分析与进化途径探讨

采用ＲＡＰＤ技术对１２份中国近缘野生大麦和栽培大麦（Ｈｏｒｄｅｕｍ ｖｕｌｇａｒｅ Ｌ．）、１份多年生短芒大麦草（Ｈ．ｂｒｅｖｉｓｕｂｕｌａｔｕｍ（Ｔｒｉｎ．）Ｌｉｎｋ）进行了分析。６３个随机引物中有３６个能产生２８５个稳定的扩增产物,其中２１９个产物具多态性。将每个扩增产物看作一个独立的性状,按其有无列出二元数据矩阵,计算单匹配系数（Ｍ）,Ｎｅｉ氏相似性系数（Ｓ）。ＰＨＹＬＩＰ ３．５ｃ软件包聚