用基因表达连续分析进行基因组转录图谱分析

20 0 0年 6月 ,公用基金资助的人类基因组计划 (ｈｕｍａｎｇｅｎｏｍｅｐｒｏｊｅｃｔ,ＨＧＰ)和Ｃｅｌｅｒａ公司在美国白宫宣布了人类基因组草图的完成。这是关于人类基因组研究的标志性成果 ,象征成基因组的研究从结构基因组(ｓｔｒｕｃｔｕｒａｌｇｅｎｏｍｉｃｓ)过渡到功能基因组 (ｆｕｎｃ ｔｉｏｎａｌｇｅｎｏｍｉｃｓ)的研究。他们的论文分别在Ｎａｔｕｒｅ[1] 和Ｓｃｉｅｎｃｅ[2 ] 上发表。他们从基因组预测的基因数分别为 31 778(ＨＧＰ的估计 )和2 6 588(Ｃｅｌｅｒａ公司 )条。这比预先估计的 6 00 0 0～ 1 0 0 0 0 0要少。…     

水稻基因组测序完成

在 2 0 0 2年 4月 5日出版的《Ｓｃｉｅｎｃｅ》上发表了由中国 12家科研单位共同完成的水稻 (ＯｒｙｚａＳａｔｉｖａＬ .ＳＳＰ .ｉｎｄｉｃａ)亚型的基因组序列。该水稻基因组全长是 4 6 6× 10 7个碱基对 ,含有 4 6 0 2 2到 5 5 6 15个基因 ,功能基因占基因组的 92 .0 %。 80 .6 %的拟兰芥基因与该水稻的基因同源 ,但该水稻只有 4 9.4 %的基因与拟兰芥的基因同源。在同期的《Ｓｃｉｅｎｃｅ》上 ,还发表了由美国 6家科研机构共同完成的水稻 (ＯｒｙｚａＳａｔｉｖａＬ .ＳＳＰ .ｊａｐｏｎｉｃａ)亚型的基因组序列。该亚型的基因组全长 …     

微生物功能基因组学研究

自从1995年流感嗜血杆菌的基因组序列测定完成之后[1],目前已有75种(株)微生物的基因组完成测序,160多种(株)微生物的基因组测序正在进行中[2]。随着各种微生物基因组测序工作的不断完成和序列信息的积累,微生物基因组学研究的重点已由结构基因组学向功能基因组学转移。微生物功能基因组学研究不仅要阐明微生物基因组内每个基因的作用或功能,还要研究基因的调节及表达谱,进而从整个基因组及其全套蛋白质产物的结构、功能、机理的高度去了解微生物生命活动的全貌,揭示微生物世界的各种前所未知的规律,并使之为人类和社会服务。与真核生物相比,虽然微生物的基因组相对简单,但微生物基因组学研究仍具有重大的科学和经济意义。在细菌基因组中,既有编码在极端环境下起催化作用的酶的基因,也有编码分解化学污染物的酶的基因,这些基因在真核细胞是不存在的。通过微生物功能基因组学研究,还能发现药物靶位和疫苗抗原。微生物基因的功能及表达研究结果也能为研究复杂生物的基因功能提供参考。近些年微生物功能基因组学研究受到了普遍重视。日本组织了十几所大学和研究机构,计划用5年时间完成大肠杆菌的功能基因组研究[3]。日本还与欧洲联合正在开展枯草杆菌功能基因组学研究[4]。其它微生物的功能基因组学研究也在进行中。由于微生物的种类繁多,功能基因组研究的内容又较丰富,要全面介绍微生物功能基因组学研究是困难的。本文仅从未知功能基因的鉴定、药物靶位及疫苗抗原研究、致病机制研究、生物功能图谱研究4个方面进行简要的评述。     

探索CO2失汇之谜

Ｓｃｉｅｎｃｅ杂志一年一度的 10大科技进展 (Ｂｒｅａｋ ｔｈｒｏｕｇｈ)评选揭晓。大气“ＣＯ2 失汇” (Ｍｉｓｓｉｎｇｃａｒｂｏｎｓｉｎｋ)现象的阐明被列为其中之一 (ＴｈｅＮｅｗｓａｎｄＥｄ ｉｔｏｒｉａｌＳｔａｆｆｓｏｆＳｃｉｅｎｃｅ ,2 0 0 1)。这是一件令生态     

评《科学》发表的《中国南方百色盆地中更新世似阿舍利石器技术》

《Ｓｃｉｅｎｃｅ》2 0 0 0年 3月 3日出版的一期发表了中美科学家共同撰写的《Ｍｉｄ ＰｌｅｉｓｔｏｃｅｎｅＡｃｈｅｕｌｅａｎ ｌｉｋｅｓｔｏｎｅｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙｏｆｔｈｅＢｏｓｅＢａｓｉｎ ,ＳｏｕｔｈＣｈｉｎａ》[1] (以下简称《百色旧石器》) ,同期刊登的还有记者的采访报道[2 ] 。随后国内媒体先后发表了采访两位中国作者的报道[3— 5] 。 2 0 0 1年 1月 1 7日百色旧石器的发现因“人类起源再添新证 ,百色旧石器挑战‘莫氏线’理论”被中华人民共和国科学技术部评为 2 0 0 0年中国基础科学研究十大新闻[6] 。2 0 0 1年 1 …     

美国在5年内提供4800万美元进行植物染色体研究

《日经生物技术》2 0 0 0年 10月 9日号 16页报道 :美国ＮａｔｉｏｎａｌＳｃｉｅｎｃｅＦｏｕｎｄａｔｉｏｎ(ＮＳＦ) 9月 2 2日宣布 ,今后在 5年内将提供总额 4 80 0万美元的研究经费进行 16种植物染色体研究。目的是促进包括玉米、小麦、水稻等主要粮食作物基因构造和基因分析。ＮＳＦ的ＡｓｓｉｓｔａｎｔＤｉｒｅｃｔｏｒｆｏｒＢｉｏｌｏｇｉｃａｌＳｃｉｅｎｃｅｓＭａｒｙＣｌｕｔｔｅｒ说 :重点集中在“以全染色体为研究对象 ,进行参与在叶绿体生物发生过程、植物营养、寄生、环境胁迫的植物反应等基因机能的研究。该研究项目最大…     

水稻(籼稻)全基因组框架序列研究简介

水稻为世界一半以上的人口提供了主要食物。水稻基因组的常染色质部分长约 43 0个ｍｂ ,是拟南芥基因组长度的 3 .7倍 ,约为人类基因组长度的七分之一。我们最近完成了水稻的籼亚种——— (ＯｒｙｚａｓａｔｉｖａＬ .ｓｓｐ .ｉｎｄｉｃａ)中的全基因组序列草图的绘制 (Ｓｃｉｅｎｃｅ ,2 96 :79～ 92 ,2 0 0 2 )。籼稻在中国与东南亚广泛种植。我们分析的籼稻品种 93＿1 1就是袁隆平院士培育的超级杂交水稻两优培 9(ＬＹＰ9)的父本。水稻基因组全长 46 6ｍｂ ,包含有 46 0 2 2～ 5 5 0 1 5个基因。在已测序的序列中功能区占 92 .0 %。通过…     

第7届国际种子生物学工作会议简讯

第 7届国际种子生物学工作会议于 2 0 0 2年 5月 12～ 16日在西班牙Ｓａｌａｍａｎｃａ召开。会议由国际种子科学学会 (Ｉｎｔｅｒ ｎａｔｉｏｎａｌＳｏｃｉｅｔｙｆｏｒＳｅｅｄＳｃｉｅｎｃｅ,ＩＳＳＳ)主办 ,西班牙Ｓａｌａｍａｎｃａ大学理学院承办。著名种子生物学家、Ｉ     

人的基因数到底是多少?

《生命的化学》2 0 0 0年 2 0卷 2期上有文章说人基因组中的基因数超过 14万 ,但 2 0 0 0年 5月 10～ 14日在美国冷泉港实验室召开的关于基因组测序及其生物学的会议上 ,来自德国、美国及法国等国家的大多数科学家认为人基因组中基因数低于 5万 ,比较一致的看法是 3万 5千左右。在此次会议上 ,展开了关于人基因数的争论 ,5月 19日出版的Ｓｃｉｅｎｃｅ杂志上刊登了这次会议关于人基因数的争论情况。会议的一部分内容将发表在 6月份的ＮａｔｕｒｅＧｅｎｅｔｉｃｓ上。Ｂｅｒｋｅｌｅｙ果蝇基因组计划负责人ＧｅｒａｌｄＲｕｂｉｎ指出 ,果蝇…     

本刊常务编委昌增益博士被聘为《Protein Science》杂志编委

清华大学生物系教授、医学院院长助理昌增益博士近日被聘为《ＰｒｏｔｅｉｎＳｃｉｅｎｃｅ》杂志编委 (ＥｄｉｔｏｒｉａｌＡｄｖｉ ｓｏｒｙＢｏａｒｄｍｅｍｂｅｒ) .任期从 2 0 0 2年 1月 1日开始 ,为期 3年 .《ＰｒｏｔｅｉｎＳｃｉｅｎｃｅ》为国际蛋白质学会所主办的蛋白质科学研究领域最具权威性的专业刊物 ,2 0 0 0年的影响因子为 4 6 .该刊物的编委全部来自全球知名的高校和研究机构 ,其中绝大多数为美国本土的科学家 .昌博士是该刊物创刊以来在中国聘任的第一位编委 ,也是目前编委会中唯一来自亚洲的科学家 .昌博士受聘后的主要…     

沙门菌CWDMs脂代谢检测

采用毛地黄皂苷敏感试验和菌细胞胆固醇、甘油三脂及胆碱酯酶定性与定量分析法,检测伤寒杆菌和甲型副伤寒杆菌经L 型变异后形成的细胞壁缺陷突变株(CW DM )的脂类代谢活性,了解这些CW DM 变异的性质和探讨细菌细胞壁缺陷突变与细菌演变的关系。结果表明,沙门菌CW DM s 具有显著的胆固醇和甘油三脂代谢活性、对毛地黄皂苷高度敏感并且还具有与白色念珠菌相似的胆固醇和甘油三脂的含量,但未能检出胆碱酯酶活性。CW DM s返祖菌丧失了脂类代谢酶类和胞浆膜不含胆固醇,恢复了与其亲代细菌型相似的代谢特征。提示在沙门菌天然即存在有与脂类及胆固醇代谢相关的基因,细胞壁的缺陷导致这些脂类及胆固醇代谢基因活化,以致 CW DM s 能够表达固醇和甘油三脂代谢活性和胞浆膜含有胆固醇     

沙门菌CWDMs氨基酸代谢的检测

采用氨基氨利用生长试验和谷丙转氨酶（ＧＰＴ）、谷草转酶（ＧＯＴ）、乳酸脱氨酶（ＬＤＨ）、肌酸激酶（ＣＫ）、α－闳丁酸脱氢酶（α－ＨＢＤ）、γ－谷志肽酶（γ－ＧＴ）,酸性磷酸酶（ＡＣＰ）定性与定量分析法,检测伤ＣＷＤＭｓ变异的特点及其机制,探讨ＣＷＤＭｓ变异的性质及其与细胞壁缺陷突变的关系。结果表明,沙门菌ＣＷＤＭｓ变异的性质及其与细胞壁缺陷突变的关系。结果表明,沙门菌ＣＷＤＭｓ在仅含蛋氨酸或脯氨     

沙门菌CWDMs乳酸脱氢酶同功酶的观察

采用聚丙烯酰胺凝胶电泳法检测伤寒杆菌和甲型副伤寒杆菌的ＣＷＤＭｓ及其宁代细菌型和伤寒杆菌粗糙型的乳酸脱氢酶（ＬＤＨ）同功酶,以了解沙门菌ＣＷＤＭｓ生物氧化的特点和机制,探讨ＣＷＤＭｓ变异的性质。结果表明,伤寒杆菌和甲型副伤寒杆菌的细菌型及伤寒杆粗糙型在聚丙烯酰胺凝胶电泳后显示出相同的４种具有不同泳动速率的ＬＤＨ同功酶,但ＣＷＤＭｓ仅显示２种ＬＤＨ。ＣＷＤＭｓ的２种ＬＤＨ同功酶与其亲代细菌型及伤寒杆     

两种蚤的幼虫形态

关于蚤类幼虫形态的研究,进展比较缓慢,我国王敦清1956年首次描述7种蚤的幼虫形态以后,由柳支英,虞以新(1957),孙昌秀(1965),叶瑞玉(1982,1986),费荣中(1986)等学者先后共描述过约29种蚤的幼虫形态。到目前为止,我国已知蚤类幼虫形态约36种,隶属6科19属。本文描述未见报道的无棘鬃额蚤Frontopsylla aspiniformis Liu etWu(1960)和青海双蚤Amphipsylla qinghaiensis Ren et Ji(1979)两种蚤山幼虫形态。     

光照对蕨类植物配子体假根向重力性的影响

对８种蕨类植物配子体假根向重力性反应的研究结果表明,除卷柏Ｓｅｌａｇｉｎｅｌｌａ ｔａｍａｒｉｓｃｉｎａ Ｓｐｒｉｎｇ配子体假根无向重力性反应并且其生长方向与光照方向无关外,其它７种的配子体假根均有向重力性反应,并且假根的向重力性反应在配子体发育初期,因光照的方向不同而异,表现为负向光性。随着配子体发育至片状体阶段,光对其向重力性反应的影响逐渐减弱,而重力的影响增强。在蕨类植物配子体发育初期,光对     

中国鳐类脑颅的研究

作者解剖观察了33种,隶于4目、7亚目、15科、19属的中国鳐类脑颅的形态。研究结果认为:锯鳐目和鳐目是原始类群,它们均具吻软骨,其中圆犂头鳐科和团扇鳐科是特化类群。电鳐目亦具吻软骨,它们是特化和退化类群。在较高等的鲼目则无吻软骨。依据鳐类不同的分类阶元,其脑颅亦各具有不同的式型。