植物蛋白质组学研究进展Ⅰ. 蛋白质组关键技术

随着模式植物拟南芥和水稻基因组测序相继完成, 使植物基因组学研究成功迈入到功能基因组学研究的时代。这为蛋白质组学产生及其发展奠定了坚实的基础。文章重点介绍了蛋白质组学的概念、产生背景和蛋白质组学的关键技术。蛋白质组学的关键技术包括双向电泳、高效液相色谱、蛋白芯片、质谱技术、蛋白质组学的相关数据库、定量蛋白组技术、蛋白复合体标签亲和纯化技术和酵母双杂交系统。同时对当前蛋白质组技术面临的挑战和发展前景进行了讨论。     

湖北宜昌奥陶纪大湾组的三叶虫新种 Ovalocephalus eoprimitivus sp.nov.

本文记述湖北宜昌地区奥陶纪大湾组下部的一个三叶虫新种Ovalocephalus eoprimitivus sp.nov.,主要特征是头鞍缺失前颈环横沟。Ovalocephalus Koroleva为泛冈瓦纳的标志分子,在中国奥陶系分布极为广泛。这一新种的时代为弗洛期—大坪期,系该属目前所知地层层位最低的分子。     

黔西南法郎组(Ladinian-E.Carnian)菊石

一前言贵州全境的三叠系,尤其是中三叠统发育良好,分布广泛。早、中三叠世,大致以东面的福泉马场坪开始,向西经青岩、平坝至安顺,折向镇宁经贞丰至册亨,再由册亨向西入云南境一线为界;该线之南、之东,基本上为盆地相沉积,该线之北、之西,基本上为碳酸盐岩台地相沉积;而大致沿该线的南北的一个窄长的条带     

一株产酶真菌Phaeophlebiopsis sp.转录组分析

对从药渣中分离的真菌ZYJHYZ254进行鉴定及产酶活性研究,从转录组分析菌株不同生长时期差异表达基因对其生长发育及产酶调控的影响,以筛选高产木质纤维素水解酶真菌,寻找调控关键基因。鉴定ZYJHYZ254为拟暗射脉菌Phaeophlebiopsis sp.,产酶在第5-7天最高。从生长3 d与7 d的菌丝中共检测到1 232个差异基因,以3 d的菌丝为对照,显著上调、下调基因分别有826及406个,基因注释和GO、KEGG功能富集分析结果表明差异表达基因主要与蛋白质合成、代谢及酶合成相关。此外,共有387个CAZymes基因表达,GH数量最多,约占49.61%,其次为AA (97)与GT (62),约占25.06%与16.02%。GH16 (24个)占GH的12.50%,含量最多,主要编码葡萄糖苷酶、木聚糖酶等,AA中AA3 (37个)占比38.14%,编码氧化酶、脱氢酶等。结果表明ZYJHYZ254中生长3 d与7 d的菌丝经功能富集分析发现差异表达基因主要与蛋白质合成、代谢,以及酶合成相关。进一步研究发现在两个生长时期中CAZymes基因表达最多的是GH16与AA3,预示了该菌葡萄糖苷酶、木聚糖酶、β-半乳糖苷酶、氧化酶与脱氢酶含量最丰富,对降解特殊生物质中的木质纤维素具有重要意义。     

中国鲤科鱼类染色体组型的研究 Ⅱ.鲴亚科四种鱼的染色体组型

鲴亚科(Xenocyprininae)鱼类多为中小型鱼类,常见于江河湖泊等较宽阔的水域中,我国长江、黑龙江、黄河及珠江诸流域皆有分布,共有10种,隶属4个属(伍献文等,1964)。迄今尚未见有该亚科鱼类染色体组型的研究报道。本文是对其中三属四种鱼的染色体组型的观察结果。这四种鱼是银鲴(Xenocypris argentea)、黄尾鲴(Xenocypris davidi)、细鳞斜颌鲴(Plagiognathops microlepis)和逆鱼(Acanthobrama simoni)。其中黄尾鲴和细鳞斜颌鲴均为新的淡水养殖鱼(沈德长等,1981;陈楚星,1979)。     

ELYMUS SIBIRICUS,E.NUTANS和E.BURCHAN—BUDDAE的形态学鉴定及其染色体组

为了进一步研究Ｅｌｙｍｉｕｓ ｓｉｂｉｒｉｃｕｓ Ｌ．,Ｅ．ｎｕｔａｎｓ Ｇｒｉｓｅｂ．和Ｅ．ｂｕｒｃｈａｎ－ｂｕｄｄａｅ（Ｎｅｕｓｋｉ）Ｔｚｅｌｅｖ［＝Ｒｏｇｅｇｎｅｒｉａ ｎｕｔａｎｓ （ｋａｎｇ） Ｋｅｎｇ］ 的外部形态差及其系统学关系,本文对这三种植物的６个穗部形态性态状进行了观测和比较,并对这三个Ｅｌｙｍｕｓ种进行了种间杂交及杂种Ｆ１的减数分裂染色体配对行为的分析研究。结果表明：这三个Ｅ     

集胞藻Synechocystis sp.PCC 6803脂质组的分析

以集胞藻Synechocystis sp.PCC 6803为研究对象,研究建立了基于超高效液相色谱耦合串联质谱技术脂质组学分析方法.鸟枪法脂质组学通过电喷雾离子化有效分离油脂粗提物中所含单个脂质分子,在三重四极杆扫描碎片离子,能够利用特征片段离子鉴定光合甘油酯的种类和酰基组成,具有高效、灵敏度高和质量准确度高等优点.对...     

中国鲤科鱼类染色体组型的研究——Ⅰ.鳊亚科10种鱼的染色体组型

本文报道了鳊亚科10种鱼的染色体组型研究结果。它们的染色体二倍数均为2n=48,由中部、亚中部和亚端部着丝点染色体组成,没有端部着丝点染色体。臂数NF=88—92。初步推测该亚科鱼类染色体的基本二倍数是2n=48。对它们的核型特征和染色体演化方式分析表明,它们的染色体相对长度的变化具有相似的特征。它们的核型也大致相似,基本上可概括为14—20 M+24—28SM+4—8ST,都有一对最大的可资区别的染色体,这反映了该亚科鱼类校型的同源性。因此预测在这些鱼的种间乃至属间进行人工杂交获得成活,甚至能育后代的可能性较大。     

黑龙江水系鱼类染色体组型研究 I.约亚科11种鱼的染色体数和组型

本文报告了黑龙江水系约亚科8属11种鱼的染色体组型，认为峋亚科鱼类的核型具育明显的属的 特异性。其中条纹似白约、东北鲸、东北黑鳍鲸、兴凯领须约、高体约、细体约和突吻约等7种鱼的核型 为初次报道。     

Elymus sibiricus, E. nutans 和 E. burchan-buddae 的形态学鉴定及其染色体组亲缘关系的研究

为了进一步研究Elymus sibiricus L.、E．nutans Griseb．和E．burchan-buddae(Neuski)Tzelev [＝Roegneria nutans(Keng)Keng]的外部形态差异及其系统学关系,本文对这三种植物的6个穗部形 态性状进行了观测和比较,并对这三个Elymus种进行了种间杂交及杂种F1的减数分裂染色体配对行 为的分析研究。结果表明：这三个Elymus种的穗长及颖长等性状均变异很大,而内稃的长、宽则变异 不大并具有明显的种间差异。E. nutans×E．barchan-buddae及E.nutans×E．sibiricus的杂种F1均完 全不育,减数分裂不规则。E．nutans×E．burchan-buddae杂种F1的减数分裂构型为：7.70I+13.40 Ⅱ+0.06Ⅲ+O.08 Ⅳ,而E．sibiricus×E．nutans杂种F1的构型为11.98 Ⅰ+9.61Ⅱ+O.64Ⅲ+0.39 Ⅳ+0.01V。由本实验的形态学和细胞学的研究结果得出以下结论：1．利用内稃形态性状结合穗部 其它性状的差异能对这三个物种进行较准确的鉴定;2．E．nutans与E.burchan-buddae的亲缘关系较 近,而E．nutans与E．sibiricus的亲缘关系则较远;3. E,burchan-buddae×E．nutans的杂种Fl中存在着染色体配对控制因子。     

镰刀菌李瑟组研究——Ⅱ.镰刀菌李瑟组的分类性状评价及其种类

镰刀菌属(Fusarium)通常是分12—16个组,李瑟组(Liseola)是其中之一。该组的重要性不仅分布极广,还包括许多作物的重要病原菌,如引起水稻、棉花、甘蔗、玉米、香蕉等病害的病原菌外,还有污染食品和饲料的产毒菌,     

绦虫类细胞遗传学研究 Ⅲ.泡状带绦虫染色体组型分析

本文采用空气干燥法制片,首次报道了泡状带绦虫染色体组型。泡状带绦虫染色体数目为2n=18。染色体组型是由7对中部着丝粒,一对亚中部着丝粒和一对端部着丝粒染色体组成。     

牛肝菌属卷边组Boletus sect. Appendiculati物种的分子识别

依据牛肝菌属卷边组Boletus sect. Appendiculati内7个物种的核糖体基因rDNA内转录间隔区（internal transcribed spacer,ITS）序列比对,设计5对ITS特异引物,分别用于卷边牛肝菌Boletus appendiculatus与亚卷边牛肝菌B. subappendiculatus、卷边牛肝菌与拟桃红牛肝菌B. pseudoregius、华靛牛肝菌B. roseoflavus与卷边牛肝菌B.?appendiculatus、华靛牛肝菌与华美牛肝菌B. speciosus、拟桃红牛肝菌与华美牛肝菌的相互识别。ITS区段的PCR扩增结果表明,5对ITS特异引物皆成功扩增出可用于辨别这些近缘物种的目的条带。但未能设计出ITS特异引物,以识别华靛牛肝菌与桃红牛肝菌B. regius两个近缘物种。     

中国灵芝科的分类研究 Ⅺ.灵芝亚属灵芝组

灵芝(Ganoderma lucidum)远在东汉(纪元102—200)年间的《神农本草经》中就有记载。中国劳动人民认识它远在此之前。国外最早的记载是1781年W.Curtis的“Boletus lucidus W.Curt.,t.no.224”.此种模式标本已不存在。Karsten(1881)在赫尔辛基植物博物馆留下一号标本作为新模式(neoty pc)。不同的分类学家认为在同一种不同的标本上皮壳构造可能有变化,甚致在同一号标本中也有变化。菌肉的颜色也有变化。或许菌肉颜色变暗是由于纬度和海拔高度的不同,平均温度渐渐增加所致(steyaert,1972)。有些分类学家认为菌柄的有无不能作分类的依据。Steyaert(1975)证明甚致硬皮灵芝(Ganoderma tornatum coinplex)的孢子因纬度和海拔高度的不同有改变。总而言之,我们可以说灵芝复合种(Ganoderma complex)在自然界的存在是不稳定的。诚然,这是一条自然规律。在自然界每一个生物种都是连续不断的变化着。但也相对的稳定。它们在自然界的矛盾中生长和发育。本文作者同意其他分类学家的意见,即在灵芝属中孢子诸性状是唯一地分类根据。种与种之间孢子的性状是清楚的不同。同时他建议应用每一个种的综合性状作分类依据或许是正确的。因为不同的分类学家对灵芝有人持广义的概念,也有人持狭义的概念。对它的亲缘种自然也有不同。下列种类现作者认为可能是它的亲缘种类。它们是:无柄灵芝;弱光泽灵芝;四川灵芝;紫芝以及松杉树芝。现作者假定灵芝在本组中是一个中心种。其它亲缘种围绕它而诞生。于是形成一个较大的种群。也有分类学家称之为灵芝复合种。长期以来灵芝复合种已经成为分类上的困难问题。有人认为成了本组分类的绊脚石。作者研究本组真菌已有多年。根据他的经验认为持种的狭义概念大概更合乎自然规律。对于以上观点作者拟在另文中阐述。本文因限于篇幅,只报道4个新种。其中1新种应隶属紫芝组。它们是:大青山灵芝(Ganoderma daiqingshanense Zhao),昆明灵芝(G.kunmingense Zhao),多分枝灵芝(G.ramosissimum),澄海灵芝(G.chenghaiense Zhao)。以上所有引证标本都保藏于中国科学院微生物研究所真菌标本室。     

AspC基因导入前后E.coli BL21蛋白质组的解析

为了考察表达天冬氨酸转氨酶工程菌在转基因前后蛋白质水平的差异变化,采用固相pH梯度-SDS聚丙烯酰胺双向凝胶电泳对转基因前后的大肠杆菌（E．coli BL21）的总蛋白进行分离,银染、显色后,使用2D蛋白质图象分析系统Image Master 2D Platinum 5．0和SWISS-2D PAGE蛋白质组数据库对双向电泳图谱进行分析,识别了近600个蛋白点,比较分析了与苯丙氨酸合成途径相关的关键蛋白的差异,初步探讨了AspC基因的导入后大肠杆菌蛋白质水平的精细调控。