甲胎蛋白基因的DNase Ⅰ敏感性和超敏感区与基因表达的关系

我们用大鼠AFP基因cDNA pRAF 87和5'端基因克隆片段为探针,分别探测了AFP基因活跃表达的胚肝组织、具表达潜能的成年肝组织以及不表达的肾组织AFP基因转录区和调控区的DNase Ⅰ敏感性和超敏感区。结果表明;胚肝组织和成年肝组织AFP基因在转录区和5'端调控区都显示出较高的DNase Ⅰ敏感性,而肾组织则不敏感。胚肝组织AFP基因存在三个DNase Ⅰ超敏感区:基因转录起始区,离转录起始区上游约-3 kb左右区域,另一超敏感区位于基因内部4.1 kb EcoR Ⅰ片段内。成年肝组织在转录起始区也存在一超敏感区,在基因内部4.1 kb EcoR Ⅰ片段显示较高的DNase Ⅰ敏感性。推测AFP基因上游-3 kb区域(1.5 kb HindⅢ片段区)DNase Ⅰ超敏感区可能与增强基因转录活性相关,而转录起始区超敏感区可能是维持细胞组织专一性表达所必需,基因转录区域内部DNase Ⅰ超敏感区可能与AFP基因维持具活跃表达或潜能表达的染色质空间结构相关。     

凡纳滨对虾DNaseⅠ基因的克隆及原核表达

利用RT-PCR和RACE技术,从凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)肝胰腺中克隆了DNaseⅠ基因的全长cDNA序列。该序列全长1614bp,包含1209bp的开放阅读框,编码一个含403个氨基酸的蛋白;5′非翻译区为116bp,3′非翻译区为289bp。实时定量PCR分析结果表明,DNaseⅠ基因在肝胰腺的表达量是其他器官表达量的16～162倍,表明凡纳滨对虾DNaseⅠ基因属于胰腺型表达。本研究还利用酶切重组构建原核表达载体,并在大肠杆菌(Escherichia coli)中成功表达出了有活性的重组DNaseⅠ蛋白。     

固相DNaseⅠ足迹法研究DNA-蛋白质相互作用

传统的DNaseⅠ足迹法程序繁杂,并且要求目的蛋白经过一定程度的纯化.而固相DNaseⅠ足迹法通过结合有模板的磁珠,先富集序列特异的DNA结合蛋白,进行DNaseⅠ酶切,然后用测序胶分离并分析结果.此方法简便易行,重复性好,并减少了对操作者的放射性损害,尤其适用于研究未经纯化的核蛋白粗提物内序列特异蛋白.     

RNA促进小鼠重组染色质白蛋白基因DNaseⅠ消化敏感性

同样的基因在不同的分化细胞中表达不同,基因的选择性表达问题涉及分化和衰老的本质。转录基因对DNaseⅠ(DNA酶Ⅰ)消化敏感,本文研究了RNA对小鼠重组染色质白蛋白基因DNaseⅠ消化敏感性的影响。分离BALB/c小鼠脑细胞核,加入终浓度为2mol/L的NaCl破坏核小体结构,加入不同量、不同来源的RNA,装透析袋,逐渐降低离子强度进行染色质重组。重组染色质中加入DNaseⅠ消化DNA,PCR扩增白蛋白基因的外显子1到外显子2约1200bp区段,PAGE电泳后,用银染色观察不同来源RNA促进DNaseⅠ对白蛋白基因的消化作用。不同组织来源（肝、肺、肾、脑）RNA对小鼠重组染色质中白蛋白基因DNaseⅠ消化敏感性均有促进作用,其中肝和肺RNA促进消化作用较强;酵母tRNA无显著促进消化作用;消化促进作用与RNA剂量有关。RNA能增加DNaseⅠ对白蛋白基因的消化敏感性且有组织（细胞）来源特异性。又委托丹麦Chemical R D 实验室合成2条与白蛋白基因互补的各23核苷酸的RNA,用其进行重组试验。结果表明,重组混合物中含有低至0.2μg/mL的RNA,即可以发挥显著的DNase I消化促进作用。     

脱氧核糖核酸内切酶与细胞凋亡

哺乳动物细胞广泛存在细胞凋亡。脱氧核糖核酸内切酶(DNase)在细胞凋亡中发挥重要作用,染色质DNA降解、浓缩及细胞核结构的破坏都与DNase有关。目前已发现多种DNase参与不同类型细胞的凋亡。本重点对DNaseⅠ、DNaseⅡ、NUC18、NUC70、AN34、DFF(DFF40/DFF45)等内源性DNase与哺乳动物细胞凋亡的关系作系统的归纳和分析。     

黄鳝二价体上微量DNaseⅠ敏感性和限制性内切酶原位切割分析

采用DNase Ⅰ超敏感性分析和限制性内切酶介导的原位切口平移技术(Restriction Enzyme Nick Translation,RE-NT)对黄鳝二价体基因组结构进行了分析研究。已知DNaseⅠ超敏感性与潜在活性基因分布密切相关。结果表明,经DNaseⅠ介导的原位切口平移处理,在黄鳍二价体上可展现类D带带型,而由限制性内切酶介导的原位切口平移结果显示,AluⅠ和MspⅠ均在黄鳝二价体上诱导产生类G带带型,HpaⅡ和HaeⅢ则优先切割5号二价体上一特定区域,诱导出一段由标记信号所构成的类C带,对上述结果进行了分析和讨论。     

The distribution of cofilin and DNase I in vivo

Actin is the principal component of the cytoskeleton, a structure that can be disassembled and reassembled in a matter of seconds in vivo. The state of assembly of actin in vivo is primarily regulated by one or more actin binding proteins (ABPs). Typically, the actions of ABPs have been studied one by one, however, we propose that multiple ABPs, acting cooperatively, may be involved in the control of actin filament length. Cofilin and DNase I are two ABPs that have previously been demonstrated to form a ternary complex with actin in vitro. This is the first report to demonstrate their co-localisation in vivo, and differences in their distributions. Our observations strongly suggest a physiological role for higher order complexes of actin in regulation of cytoskeletal assembly during processes such as cell division.     

外源RNA对小鼠白蛋白基因表达及DNaseⅠ敏感性的影响

兔肝RNA诱导培养的小鼠成纤维细胞 ,大鼠肝RNA注射入小鼠前列腺 ,用免疫组织化学染色检测外源RNA对小鼠白蛋白基因表达的影响 ;不同RNA诱导培养的小鼠成纤维细胞 ,提取细胞核 ,DNaseⅠ消化 ,PCR法扩增小鼠白蛋白基因 ,检测白蛋白基因消化情况。发现外源RNA可促进小鼠白蛋白基因表达并增加该基因DNaseⅠ敏感性     

巴豆油正丁酸对Raji细胞的联合诱导作用

以4mM正丁酸,400ng/ml巴豆油对Raji细胞进行联合激发,24小时后DNase活性及EA阳性细胞百分率均平行地急剧上升,72小时后达到高峰,以后EA阳性细胞急速下降,而DNase活性仍保持在高峰水平,粗酶液中的DNase活性能被EBV阳性血清中和90％以上。 激发Raji细胞粗酶液DEAE层析谱显示,有三个DNase活性峰,主峰洗脱浓度为220mM磷酸盐。检测了未激发及经激发(48小时)Raji细胞提取液的DNA多聚酶活性,前者能被50mM(NH_4)_2SO_4所抑制,抑制?原酶活性的23.3％,后者能被50mM(NH_4)_2SO_4所激活,激活为原酶活性的147.7％。     

Soluble expression and characterization of a GFP-fused pea actin isoform（PEAc1）

A pea actin isoform PEAcl with green fluorescent protein (GFP) fusion to its C-terminus and His-tag to its Nterminus, was expressed in prokaryotic cells in soluble form, and highly purified with Ni-Chelating Sepharose^TM Fast Flow column. The purified fusion protein (PEAcl-GFP) efficiently inhibited DNase I activities before polymerization,and activated the myosin Mg-ATPase activities after polymerization. The PEAcl-GFP also polymerized into green fluorescent filamentous structures with a critical concentration of 0.75μM. These filamentous structures were labeled by TRITC-phalloidin, a specific agent for staining actin microfilaments, and identified as having 9 nm diameters by negative staining. These results indicated that PEAc 1 preserved the essential characteristics of actin even with His-tag and GFP fusion, suggesting a promising potential to use GFP fusion protein in obtainning soluble plant actin isoform to analyze its physical and biochemical properties in vitro. The PEAcl-GFP was also expressed in tobacco BY2 cells,which offers a new pathway for further studying its distribution and function in vivo.     

银杏与玉米花粉肌动蛋白含量的比较研究

通过免疫印迹鉴定,证明银杏(Ginkgo biloba L.)花粉中存在肌动蛋白。同时对银杏和玉米(Zeamays L.)花粉肌动蛋白含量进行了比较。结果表明,银杏花粉肌动蛋白含量明显少于玉米花粉肌动蛋白含量。SDS-PAGE扫描图谱显示,银杏花粉肌动蛋白含量只有玉米花粉的1/6。两种花粉DNaseⅠ活性抑制结果表明,银杏花粉肌动蛋白含量约为玉米花粉的1/7。     

精子介导法生产转基因牦牛杂种胚胎的研究

研究外源DNA转染对牦牛精子体外受精(IVF)、早期胚胎发育以及绿色荧光蛋白(GFP)基因在早期胚胎表达的影响。用构建融合人乳铁蛋白基因绿色荧光蛋白表达载体(pAcGFP1-hLF)转染的牦牛精子IVF黄牛卵母细胞,生产的胚胎在荧光显微镜下观察GFP表达情况。结果显示,用环形质粒、线性质粒pAcGFP1-hLF转染的精子及未转染精子IVF后的卵裂率分别为56.4%、54.8%和61.0%,线性转染的囊胚率显著低于环形转染(17.7%与35.7%)。环形质粒转染的精子用DNaseⅠ消化、不消化及未转染的精子IVF后卵裂率分别为44.8%、55.2%和56.3%,囊胚率分别为33.3%、33.3%和30.2%。未经DNaseⅠ消化洗涤的环形质粒组GFP胚胎阳性率显著高于线性质粒组(99.3%与76.6%);DNaseⅠ消化组GFP胚胎阳性率极显著低于不消化组(25.4%与99.3%)。结果表明,用环形质粒DNA转染牦牛精子不会影响其受精及早期胚胎发育能力,但DNaseⅠ消化洗涤显著降低GFP胚胎阳性率。     

单胚RT-PCR：基因表达动态研究及应用技术探讨

为进一步探讨单胚RT-PCR技术的适用性,我们测试了3个特定的基因STM、MP和ASKη在拟南芥(Arabidopsisthaliana(L.)Heynh.)早期胚胎发生过程中的动态表达情况。进一步证实以该技术研究某些特定基因的表达动态是可行的。着重探讨了扩增产量与模板量的对应关系、基因组DNA的干扰以及DNaseⅠ处理过程中的mRNA降解等主要技术问题。结果表明:材料制备时显微操作技术的稳定是确保单胚RT-PCR结果稳定的关键。应尽量缩短DNaseⅠ处理时间,以避免mRNA降解。     

中性粒细胞胞外诱捕网在矽肺中的作用研究

目的:通过构建二氧化硅诱导动物矽肺模型,探讨中性粒细胞胞外诱捕网(neutrophil nxtracellular traps,NETs)在矽肺中可能的作用。方法:将C57BL/6J雄性小鼠完全随机分为磷酸盐缓冲液(phosphate buffered solution,PBS)组、脱氧核糖核酸酶Ⅰ(deoxyribonuclease Ⅰ, DNase Ⅰ)组、二氧化硅+PBS组、二氧化硅+DNase Ⅰ组。通过气管内滴注二氧化硅(0.2 g/kg)混悬液构建小鼠矽肺模型,PBS组与DNase Ⅰ组注入等体积的PBS。在二氧化硅(silicon dioxide,SiO_2)混悬液注入后的第0小时、10小时小鼠气管内注入DNase Ⅰ(5 mg/kg),以后DNase Ⅰ持续给药:5 mg/kg/day,直到SiO_2混悬液注入后的28天。二氧化硅(SiO_2)干预28天后,取各组小鼠肺组织与肺泡灌洗液,通过PicoGreen荧光染料检测支气管肺泡灌洗液(bronchoalveolar lavage fluid,BALF)中NETs水平,酶联免疫吸附实验(enzyme-linked immunosorbent assay, ELISA)检测BALF中转化生长因子β1 (transforming growth factor-β1,TGF-β1)与炎症因子白细胞介素6(interleukin-6,IL-6)、白细胞介素1β(interleukin-1β,IL-1β)、肿瘤坏死因子α(tumor necrosis factor-α,TNF-α)水平,HE染色和Masson染色观察肺组织的病理学变化,Western Blot检测肺组织中NETs特异性组分瓜氨酸化组蛋白3(citrullinated-histone3,Cit-H3)表达。结果:SiO_2干预28天后,与PBS组相比,二氧化硅+PBS组小鼠肺组织炎症损伤加重,BALF中促炎介质IL-1β、IL-6、TNF-α水平上升;肺组织发生纤维化,大量硅结节形成;肺组织中Cit-H3蛋白表达量增加,BALF中NETs水平显著升高。予以NETs抑制剂DNase Ⅰ进行干预后,肺组织NETs水平显著下降,二氧化硅诱导的肺部炎症损伤、纤维化显著减轻。结论:NETs水平升高可能介导了二氧化硅诱导的小鼠矽肺模型肺部炎症损伤与纤维化。     

CAD与ICAD的最新研究进展

在细胞凋亡中,除了人们早期研究发现的可导致DNA断裂的DNaseⅠ,DNaseⅡ,DNaseγ以及cyclophilins等因素以外,最近人们又发现了一种新的可导致DNA断裂的染色质固缩的分子－CAD及其抑制剂I－CAD,本 文详细介绍了CAD与ICAD的基因结构,分子生物学特性,以及CAD,ICAD之间的相互作用机理,同时对CAD的活化方式及其在细胞凋亡中作用的最新研究进展进行了详细的概述,为以CAD为基础的细胞凋亡研究提供了重要的指导作用。     

单胚RT-PCR:基因表达动态研究及应用技术探讨

为进一步探讨单胚RT-PCR技术的适用性,我们测试了3个特定的基因STM、MP和ASKη在拟南芥(Arabidopsisthaliana(L.)Heynh.)早期胚胎发生过程中的动态表达情况.进一步证实以该技术研究某些特定基因的表达动态是可行的.着重探讨了扩增产量与模板量的对应关系、基因组DNA的干扰以及DNase Ⅰ处理过程中的mRNA降解等主要技术问题.结果表明:材料制备时显微操作技术的稳定是确保单胚RT-PCR结果稳定的关键.应尽量缩短DNaseⅠ处理时间,以避免mRNA降解.     

大鼠老化过程大脑皮层及小脑神经元染色质构象分析

 本文在前文~[2]的基础上进一步以MCN和DNaseⅠ为探针研究大鼠脑神经元终末分化后不同生理时期染色质构象,结果表明:MCN酶解DNA产物PAGE显示脑老化过程大脑皮层及小脑神经元染色质核小体单体DNA分别保持在176bp和215bp水平,核小体连接DNA长度存在组织差异,但不受老化影响;<2>DNaseⅠ酶解DNA产物PAGE显示各年龄组大脑皮层及小脑神经元染色质DNA存在10bp间隔重复结构和相同的泳动区带分布特征,提示脑老化中染色质具有稳定的B型双螺旋结构和一致的螺线管卷曲形式。染色质DNaseⅠ降解率随年龄增加而降低,提示老化导致活性染色质区域减少,老化过程脑神经元染色质构象改变成为其转录功能减退的结构基础。     

Immunolcocalization of actin in intact and DNA—and histone—depleted nuclei and chromosomes of allium cepa

The presence of actin in eukaryotic nuclei and chromosomes,and especially in higher plant nuclei and chromosomes,has not been well established.We detected actin in meristematic cells of Allium cepa with indirect immunofluorescence technique and observed bright fluorescence in the intact nuclei and chromosomes,indicating that actin is present in the nuclei and chromosomes of the higher plant.We labeld sections of the meristematic cells of A.cepa with immunogold technique,gold parti cles were concentrated in condensed chromatin and nucleoli,confirming the results of the immunofluoresence observations.We traeated the nuclei and chromosomes of A.cepa with DNase I and 2M NaCl and obtained DNA-and histone-depleted nuclei and chromosomes.Indirect immunofluorescence tests showed that the DNA-and histonedepleted nuclei and chromosomes reacted positively with the anti-actin antibodies.These results demonstrate that the anti-actin antibodies.These results demonstrate that actin exists not only in intact nuclei and chromosomes,but also in DNA-and histone-depleted nuclei and chrmosomes of the plant.In addition,our immuno-fluorescence tests indicate that tropomyosin is present in the nuclei and chromosomes of A.cepa.     

蚯蚓体内一组脱氧核糖核酸酶的酶学性质研究

目的：研究一组新型蚯蚓脱氧核糖核酸酶（earthworm Desoxyribonucleases, EWDs）的主要生化性质。方法：采用SDS-PAGE电泳、MALDI-TOF、酶活性测定等方法。结果：确定了EWD1、EWD2、EWD3(总称为：EWDs)的分子量分别为157.2kDa、69.1kDa和63.5kDa;Km值分别为1.58mg/ml、3.95mg/ml、1.52mg/ml。EWDs在55℃时,酶活性完全丧失。这三种脱氧核糖核酸酶最适pH范围在pH4.0～5.6之间。Mn2＋、Ca2＋是蚯蚓组织脱氧核糖核酸酶EWD1、EWD2、EWD3的抑制剂,Mg2＋对EWD3有较明显的抑制作用。结论：蚯蚓中的EWDs分子量明显大于DNaseⅠ和DNaseⅡ。对EWDs的温度、pH值、激动剂、抑制剂等影响因素的研究,发现这些参数与已发现的DNases相比较有明显差别。这些提示：蚯蚓组织中发现的脱氧核糖核酸酶EWDs具有特殊的酶学特征,不同于DNaseⅠ和DNaseⅡ,是种新型的脱氧核糖核酸酶,但其作用机理和分类有待于进一步的研究和归类。     

核酸内切酶在细胞凋亡中的作用

核酸内切酶在形成细胞凋亡的典型特征——DNA片段化中,发挥着直接的重要作用.介绍了已知的参与细胞凋亡的二价金属离子依赖性和非依赖性核酸内切酶种类,其中二价金属离子依赖性主要有nuc18、DNaseⅠ、Ca^2＋/Mg^2＋核酸内切酶、Ca^2＋/Mn^2＋核酸内切酶、DNaseγ、nuc58和nuc40;二价金属离子非依赖型主要有DNaseⅡ及类似核酸内切酶.此外,还初步探讨了核酸内切酶降解染色质DNA的过程及其作用机制.