Meta分析中几种常用效应值的介绍

效应值是定量Meta分析中的结合统计量,其计算方法主要依赖于对原文献数据的获取程度,介绍并比较适合3种原文献数据报道形式的几种效应值的计算方法。     

Meta分析中几种常用效应值的介绍

效应值是定量Meta分析中的结合统计量,其计算方法主要依赖于对原文献数据的获取程度,介绍并比较适合3种原文献数据报道形式的几种效应值的计算方法。     

Meta分析中几种常用效应值的介绍

效应值是定量Meta分析中的结合统计量,其计算方法主要依赖于对原文献数据的获取程度,介绍并比较适合3种原文献数据报道形式的几种效应值的计算方法。     

整合分析中结合效应值和总异质性的介绍

整合分析(meta-analysis)是对同一主题下多个独立实验结果进行综合的统计学方法,被认为是到目前为止最好的数量综合方法,其统计量为效应值。结合效应值(cumulative effect size)和总异质性(total heterogeneity)分别是整合分析中描述效应值中心趋向和变异程度的两个指标,是在整合分析中最重要的两个参数。在整合分析中随数据结构的不同又有多种求结合效应值和总异质性的方法。介绍了与三种数据结构(无结构数据、分类数据、连续数据)相对应的这两个指标的计算方法。     

植物群落对景观温度特征指示作用的研究

以德国Kraichgau地区为研究样区,根据转化糖方法获得的野外实测温度数据,就植物群落温度平均指示值在景观尺度上对生境温度的指示效果进行了深入探讨。结果表明：1)群落温度平均指示值与测定的效应温度之间具明显线性正相关;2)群落温度平均指示值能够反映不同坡向条件造成的生境温度差异,但效果随计算方法不同而异。3种不同方法的比较结果说明,直接根据样方资料获得的计算结果,对坡向条件造成的生境温度差异反映明显;3)以样带数据为基础的研究结果对温度随坡向和坡位变化的反映均不够明显。样带没有达到足够的宽度以及样带中局部地段上的种类组成受人为影响严重可能是未达到预期对比效果的主要原因。     

基于集合卡尔曼滤波的南雄烟草LAI数据同化研究

叶面积指数(LAI)是表征烟草生长健康状态的重要指标之一,获取准确的LAI数据是监测烟草生长走势的重要步骤。以广东省南雄地区为试验区开展了集合卡尔曼滤波同化方法在烟草LAI的应用研究。通过野外实测得到南雄烟草生长期内的高光谱数据,并计算每个生长期的归一化植被指数(NDVI),依据NDVI值获得LAI测量数据;通过积温数据和实测LAI数据构建了符合南雄地区烟草LAI变化规律的LOGISTIC模型;并以LAI为研究变量,利用集合卡尔曼滤波数据同化技术融合NDVI数据计算得到的LAI和简化LOGSITIC模型拟合得到的LAI这两种不同的数据信息,获取实验区烟草生长期时间序列上的连续LAI数据。最后,进一步对比了数据同化方法、NDVI计算LAI方法和LOGISTIC模型拟合这3种方法获取烟草LAI的效果。结果显示:数据同化方法、NDVI计算LAI方法和LOGISTIC模型拟合3种方法均可一定程度上表征烟草LAI的变化状态,其中数据同化方法拟合效果最优。实验发现NDVI计算LAI方法在烟草生长前后期LAI值出现偏大或偏小的异常情况;LOGISTIC模型拟合则不能有效的描述烟草LAI的突发性变化;同化方法综合作物生长模型和遥感监测的优势,能够动态调节参数得到LAI优化结果,同化后LAI结果和真实值吻合,变化曲线更符合烟草的实际生长状况。     

整合分析中两种假设模型的介绍及实例分析*

整合分析(meta-analysis)是对同一主题下多个独立实验结果进行综合的统计学方法,被认为是到目前为止最好的数量综合方法。在进行整合分析时,首选应提出统计假设,根据假设的不同可将整合分析分为固定效应模型(fixedeffect model)和随机效应模型(random effect model),前者假定有相似的多个研究在同一分组里有一个共同的真实效应值,由于取样误差,导致在实际效应值的测定中各研究间存在差别;在后者中,假定各研究间有随机变量,因此,不共享一个真实效应值。介绍了两种假设模型下整合分析的计算方法,并进行了实例分析。     

生态学整合分析中两种常用效应值的实例应用比较

整合分析(meta-analysis)是对同一主题下多个独立实验结果进行综合的统计学方法,被认为是到目前为止最好的数量综合方法,其统计量为效应值,反应比(InR)和Hedges'd值是生态学应用中最常用的两个效应值。以综合植物生理生态学指标对大气CO₂浓度倍增响应为实例,比较这两种效应值的不同之处。采用两种效应值指标会对同一个生理生态指标产生不同的总效应值大小,有时甚至会改变效应值的方向;InR相对Hedges'd更易产生正效应值;Hedges'd较InR可拉大不同生理生态指标之间总效应值的差异;Hedges'd具有正负效应对称性,而InR却具有正负效应的不对称性。     

基因组育种值估计的贝叶斯方法

基因组育种值估计是基因组选择的重要环节,基因组育种值的准确性是基因组选择成功应用的关键,而其准确性在很大程度上取决于估计方法。目前研究和应用最多的基因组育种值估计方法是贝叶斯(Bayes)和最佳线性无偏预测(BLUP)两大类方法。文章系统介绍了目前已提出的各种Bayes方法,并总结了该类方法的估计效果和各方面的改进。模拟数据和实际数据研究结果都表明,Bayes类方法估计基因组育种值的准确性优于BLUP类方法,特别对于存在较大效应QTL的性状其优势更明显。由于Bayes方法的理论和计算过程相对复杂,目前其在实际育种中的运用不如BLUP类方法普遍,但随着快速算法的开发和计算机硬件的改进,计算问题有望得到解决;另外,随着对基因组和性状遗传结构研究的深入开展,能为Bayes方法提供更为准确的先验信息,从而使Bayes方法估计基因组育种值准确性的优势更加突出,应用将会更加广泛。     

应用生物效应数据库法建立淡水水体沉积物重金属质量基准

重金属是水体沉积物中的重要污染物,可能对底栖生物和水生态环境产生严重的危害.生物效应数据库法是国际上广泛接受的沉积物质量基准计算方法.本文介绍了利用该方法计算沉积物质量基准的详细过程,并应用该方法初步建立了Cu、Zn、Cd、Pb、Ni 5种重金属的淡水沉积物质量基准,对建立基准值进行了可比性、可靠性和可预测性分析.结果表明: Cd、Ni、Pb、Zn、Cu的临界效应浓度(TEL)分别为3.0、31.4、47.3、74.9和45.5 mg·kg^-1(以干质量计),可能效应浓度值(PEL)为19、76.9、204.1、403.6和181.1 mg·kg^-1(以干质量计).除Zn外,其他4种重金属的TEL、PEL值与其定义的生物效应基本一致,符合针对保护底栖生物制定的沉积物质量基准的要求,具有较高的可靠性,可以作为淡水水体沉积物重金属质量基准建议值.     

R法遗传参数估值置信区间的计算方法和重复估计次数的研究

探讨R法遗传参数估值置信区间的计算方法和重复估计次数(NORE)对参数估值的影响,利用4种模型通过模拟产生数据集。基础群中公、母畜数分别为200和2000头,BLUP育种值选择5个世代。利用多变量乘法迭代(MMI)法,结合先决条件的共扼梯度(PCG)法求解混合模型方程组估计方差组分。用经典方法、Box-Cox变换后的经典方法和自助法计算参数估值的均数、标准误和置信区间。结果表明,重复估计次数较多时,3种方法均可;重复估计次数较少时,建议使用自助法。简单模型下需要较少的重复估计,但对于复杂模型则需要较多的重复估计。随模型中随机效应数的增加,直接遗传力高估。随着PCG和MMI轮次的增大,参数估值表现出低估的趋势。     

种畜生产性能测验的评定中采用简化动物模型的BLUP法研究

本文是探讨采用简化动物模型计算最优线性无偏预测值(BLUP)的方法。BLUP是一种评定种畜遗传价值的有效方法,但是如果涉及的动物很多,则需要解较大系列的方程,常使计算代价很大,而采用一种减少评定种畜育种值的元素数的等价线性模型,可以大大简化计算。这里利用普通动物模型和简化动物模型,以包括父亲和外祖父后裔测验资料的一组简单数据为例,对比说明这两种解法计算的BLUP值的恒等性。一般采用包括父亲和外祖父的简化模型与普通模型比较,方程组的阶数可缩小30—50％左右,解亲缘系数矩阵的逆阵和混合模型方程组所需时间减少到10％左右,计算机的存储记忆也大大减少。     

融合Kriging算法的河套灌区ET估算方法评价

为解决数据缺乏时对大区域ET估算的限制, 评价了融合Kriging空间插值算法的河套灌区6种ET估算方法。基于Kriging算法和气象数据, 得到7种ET估算方法的河套灌区区域ET值, 将试验站实测ET值与6种方法ET估算结果进行精度验证, 并以PM计算结果为标准, 评价融合Kriging空间插值算法的不同方法在河套灌区的估算精度与适用性, 分析不同方法与气象因子响应关系的差异性。结果表明, 综合法(KP、PVB)与PM的结果最接近, 计算结果最大偏差0.045-0.490 mm·d-1。推荐综合法为融合Kriging空间插值算法的河套灌区ET最佳估算方法, 适用于灌区所有土地类型ET估算。平均气温、温差、相对湿度较小的地区可用HS法。日照时数、平均气温、相对湿度较大的地区与风速变化较小的地区可用PT法。相对湿度较小的地区可用IA法和PVB法。     

生态学试验设计与解释中的常见问题

一个"好"的试验,统计检验的显著差异可证明处理效应存在;而一个"坏"的试验,统计检验的显著差异本身并不能证明处理效应的真实存在.试验单位的不独立就可能使干扰因素偏倚地影响试验结果,是多种形式的伪重复的根本原因.如果不统筹地考虑试验方法和数据分析方法,环境要素的时空格局就可能被错误地当成处理效应.以案例分析的形式探讨了中国生态学试验设计与解释中常见的3个问题:(1)简单伪重复问题,这是Hurlbert[2]早已指出的伪重复情形中的一种,通常是把取样的重复当成了处理的重复;(2)把反复测量结果当成重复的问题,即对同一个对象的反应变量前后进行多次观测,却把这些观测值视为重复而进行统计检验所造成的问题;(3)混淆时空效应与处理效应的问题,由于取样方法(破坏性取样)或者研究对象(例如流动的水体)性质的特殊性等原因,数据中所体现出来的格局有可能由于时空效应而并非处理效应所造成.在这3种情况下,数据的产生方式与所用统计方法的前提相违背.     

利用分子标记和数量性状基因型值构建作物核心种质库的研究

提出了一种基于分子标记数据及数量性状基因型值构建作物种质资源核心种质库的方法.采用包括基因型与环境互作的遗传模型及相应的混合线性模型统计分析方法,无偏预测各材料的基因型值,分别用基因型值和分子标记数据计算个体间的相似系数,加权得到最终的相似距离.采用不加权类平均法（UPGMA）进行系统聚类,用多次聚类随机取样法构建核心种质库.以水稻DH群体111个基因型8个农艺性状、175个分子标记位点的数据为实例,按四种抽样比率（25%,20%,15%,10%）构建了四个核心种质库,比较了核心种质库与整个群体的分子标记多样性及数量性状的遗传变异,评价了所用方法的有效性。     

贝叶斯方法估计阈性状育种值的原理和计算技术

本文介绍了估计阈性状育种值的贝叶斯方法的原理,演示了描述阈性状观察值、建立后验概率密度函数、以及导出非线性方程组的方法．并就这一估计方法的计算技术进行了讨论,针对动物遗传育种中方程组系数矩阵往往很大,超出计算机内存的情况,提出了不需要建立方程组,在数据上迭代求解的计算方法．本文还综述了这一非线性方法与线性方法在阈性状育种值估计上的比较．     

一个用于机率值分析的计算机程序

<正> 机率值分析是杀虫剂毒力测定和抗性研究中的一种生物统计方法。因该法计算比较麻烦,数据处理工作量较大,所以在实际应用中受到一定限制。鉴于我国目前微型计算机日益普及,本文用BASIC语言编写了一个机率值分析的计算机程序。该程序对计算过程中的数据转换来用计算机自动查表方法,因此运用该程序,只要向计算机输入测定剂量数,系列剂量值,各剂量的试虫数和死虫数,在半分钟内便可打印出统计内容所要求的全部数据分析结果。该程序在苹果-Ⅱ微型计算机实例应用中表明,既简便快速,又准确可靠。     

莫扎特奏鸣曲K.448对脑电功率谱与重心频率的影响

采用脑电功率谱(power spectrum,PS)和重心频率(gravity frequency,GF)分析方法研究"莫扎特效应"代表音乐--Sonata K.448的神经电生理效应.在静息和播放不同音乐状态下记录16名非音乐专业大学生的脑电,通过平均周期图法计算脑电PS和GF.结果显示:3种音乐都显著升高了GF值,...     

大沽夹河底栖大型无脊椎动物耐受值估算

耐受值表现为水生生物在一定水平的干扰作用下生存和繁殖的相对能力,在生物学评价中起着不可或缺的重要作用。通过查阅文献资料、野外采样和实验室分析与鉴定,获得大沽夹河23个采样点1998～2007年环境要素数据和2006～2007年底栖大型无脊椎动物数据。应用等标指数法和算术平均法计算环境梯度值,利用加权加和法估算底栖大型无脊椎动物的耐受值,建立底栖大型无脊椎动物44个分类单元的耐受值谱。研究表明：（1）根据环境要素值和底栖大型无脊椎动物数据、采用数学方法估算底栖大型无脊椎动物耐受值,比专家经验或以生物多样性划分环境梯度等方法,更加客观;（2）耐受值谱表明,大沽夹河底栖大型无脊椎动物以敏感性和耐受性类型为主,过渡性类型较少。（3）与前人研究成果对比,耐受值在目、科分类单元比较一致,在属、种分类单元存在差异;（4）限于条件,底栖大型无脊椎动物分类鉴定有些粗略,环境梯度计算未包含底质、水文要素,需进一步改进。     

数量性状的核质互作遗传效应分析:二倍体植株遗传模型

提出了能分析二倍体植株数量性状核质互作效应的遗传模型,该模型把控制数量性状总的遗传效应分为核效应、质效应和核质互作效应,以及它们分别与环境作用的效应。其中,核质互作效应可进一步分解为加性核质互作与显性核质互作。基于平衡与非平衡两种双列杂交试验设计,蒙特卡罗模拟结果表明:采用混合线性模型方法进行统计分析,可以有效地估计各项遗传效应值及其方差分量。此外,运用该模型对棉花的4个数量性状(单株铃数、衣分、2.5%跨长和麦克隆值)进行了遗传分析。