三江白猪与其他5个品种猪的群体遗传关系的分析

应用100条RAPD引物对三江白猪及其杂交亲本长白猪和东北民猪,以及大约克夏、圣特西和法系大白猪进行亲缘关系的DNA多态分析。其中15条引物的扩增结果具有明显的多态,将其扩增结果进行聚类分析,发现三江白猪与长白猪（遗传距离d = 0.090）、与东北民猪（d = 0.175）的亲缘关系较近,与大约克夏(d = 0.263)、法系大白(d = 0.223)、圣特西猪(d = 0.580)的亲缘关系较远。Abstract: One hundred primers were used to analyze the polymorphism of kinship of Sanjiang White pig and its parents, Landrace and Dongbei Min pig, Yorkshire, French Hybrids(Fh 019 strain),French Yorkshire by RAPD. Amplification results of 15 primers showed obvious polymorphisms, which were analyzed by clustering. The results indicate that the genetic relationship of Sanjiang White Pig, and Landrace, and Dongbei Min pig are respectively closer(d=0.090,,0.175), and that of Sanjiang White pig and Yorkshive(d=0.263), French Yorkshire(d = 0.223), Fh 019strain (d = 0.580) are respectively further.     

三江白猪线粒体DNA的多态性

采用22种限制性内切酶分析了三江白猪mtDNA多态性。在60头个体中检出30种限制性态型,归结为7种基因单倍型;其间的差异来自少数限制性位点的突变。单倍型间平均遗传距离为0．35％,群体遗传多态程度为0．044％。三江白猪遗传多样性非常贫乏,说明三江白猪与地方种猪起源于一个共同祖先,在品种形成早期受到创立者效应的制约。     

5个泥蚶群体遗传多样性的RAPD分析

采用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术 ,对 5个泥蚶群体的遗传多样性进行了研究。在选择的 2 0个随机引物中共检测到 15 4个扩增片段 ,长度在 30 0bp～ 2 30 0bp之间 ,每个个体扩增条带在 1～ 11条不等。利用Popgen3.2和PHILIP统计软件 ,获得实验数据 ,确立了 5个群体间的亲缘关系。结果表明 :( 1)泥蚶的 5个地理群体分化不明显 ,没有形成不同的地理种群 ;( 2 )聚类分析显示 ,韩国群体与浙江群体亲缘关系最近 ,然后依次为山东群体和福建群体 ;( 3) 5个群体无论是在多态位点比例还是在平均遗传杂合度上都处于较高水平 ,说明泥蚶当前种质资源状况良好 ,遗传多样性水平较高 ,泥蚶养殖有很好的发展前景 ;( 4)与韩国野生群体相比 ,其他 4个泥蚶群体在多态位点比例和遗传平均杂合度上都有不同程度的降低 ,表明人为等因素已经开始影响到泥蚶的种质资源状况。因此 ,为持续发展泥蚶养殖业 ,必须加强保护泥蚶现有的种质资源并制定相应的渔业管理措施。     

无锡水蜜桃品种群遗传多样性及与其他群体亲缘关系的SSR分析

无锡水蜜桃品种群体是典型的南方桃优势群体,为研究比较该群体的遗传多样性,以41个无锡水蜜桃品种和91个其他桃品种为试材,利用25对位于不同连锁群上的SSR引物评价群体特征,并分析了群体内外的亲缘关系.群体遗传多样性比较结果表明:无锡水蜜桃具有较高的多态性位点百分率(71.74%),仅次于华北品种群(74.64%);该品种群体具有中等程度的遗传多样性,Nei′s遗传多样性指数(He)和Shannon信息指数(H0)分别为0.2068和0.3165,两个指数值均不及华北、西南、华南以及西方国家群体.群体内聚类结果表明:无锡水蜜桃群体内并不存在明显的遗传分化,但在相似系数为0.83时,无锡水蜜桃的主栽品种聚于同一组.群体间聚类结果表明:无锡水蜜桃与上海水蜜桃群体间亲缘关系最近,相似系数为0.994,其次是日本桃群体(0.985)和浙江桃群体(0.971),这4个类群在聚类图中较早的聚为一类,这与无锡水蜜桃的地理起源和演化相符.     

江西省主要地方鸡种的RAPD分析及其群体遗传关系的研究

采用RAPD技术分析了南城黑鸡、余干五黑鸡、泰和乌骨鸡、东乡绿壳蛋鸡、崇仁麻鸡、宁都三黄鸡、广丰白耳黄鸡和万载康乐黄鸡等8个江西地方鸡种、1个培育鸡种--景德黄鸡以及1个外来鸡种--以色列隐性白羽鸡基因组池DNA的多态性,经OPERONA,B,C,D,G5组100种随机引物扩增筛选,14种引物获得了33个多态标记.各品种间的遗传距离指数的计算结果和UPGMA聚类关系图表明:在10个鸡种间,南城黑鸡和余干五黑鸡的遗传距离最近,两者有着极密切的亲缘关系.据此认为这两个鸡群可视为同一品种的两个地方系.此外,广丰白耳黄鸡和景德黄鸡也表现出较密切的亲缘关系,这与景德黄鸡在培育过程中曾掺有白耳黄鸡血缘的选育历史相吻合。 Abstract:Random amphfied polymorphic DNAs (RAPD) analysis was explored to investigate genetic polymorphisms of pooled genomic DNA from 8 native and 1 cultivated chicken breeds in Jiangxi province as well as 1 exotic chicken breed,which include Guangfeng baier huang,Jingde huang,Yugan wuhei,Nancheng hei,Congren ma,Taihe Silky Fowl,Ningdu san huang,Dongxiang green-shell,Wanzai kangle huang and Israel Recessive White Feather Fowl.of 100 OPERON random primers screened,14 primers produced 34 polymorphic RAPD markers.The genetic distance index and UPGMA dendrogram indicated that Nancheng hei and Yugan wuhei chickens had very closely genetic relationship,the genetic distance between the two populations was closer than any other pair of breeds.Therefore,the two chicken populations were suggested to be classified into one breed.In addition,Guangfeng baier huang and Jingde huang shown intimately relationship,it was consistent with the cultivation history of Jingde huang chicken breed,in which Guangfeng baier huang was introduced as one of parental breed.     

RAPD分析在绢丝昆虫亲缘关系研究中的应用：Ⅱ．柞蚕品种间的遗传差异

采用RAPD技术,对5个柞蚕品种的遗传差异进行比较研究,结果表明,所采用40个随机引物中,有27个引物扩增谱清晰且重复性较好,扩增总片段数253条,单个引物的扩增片段数在4－16之间,片段大小在0．33－3．0kb之间。不同柞蚕品种间的遗传差异较小,遗传距离（D）在0．066－0．1659之间,根据D值,由UPGMA聚类分析软件绘制了它们的分子进化树。     

利用RAPD标记研究荔枝品种的新缘关系

采用改进的ＣＴＡＢ方法提取３４个荔枝品种的基因组ＤＮＡ为模板,从５０个１０碱基的随机引物中获得了３７个多态性ＲＡＰＤ标记,聚类分析结果表明这３４个荔枝品种可以分成４组,第一组有“状元红”、“元红”、“桂林”、“宋家香”、“台湾荔”、“下番枝”、“东刘一号”、“妃子笑”、“白糖罂”、“香丸”、“绿沙”;第二组有“无栗子”、“水东”、“乌叶”、“蔡家肉丸”、“青壳糯米糍”、“糯米糍”;第三组有“桂味”     

6个中外猪品种的RAPD分析

应用RAPD技术分析了梅山猪、淮南猪、通城猪、八眉猪、合作猪、大白猪的遗传变异。用276个随机引物对6个猪种混合DNA扩增筛选,24个引物产生多态性。此24个引物经重新优化反应条件体系后,对276个个体DNA进行扩增。结果6个猪种的遗传多样性指数分别为0.178672、0.17781、0.15995、0.14549、0.16949和0.14157,群体内平均遗传多样性指数为0.16216,总群体遗传多样性指数为0.2534。基于Rogers公式计算的遗传距离采用NJ和UPGMA法进行聚类分析,结果6个猪种的亲缘关系与它们的地理分布基本一致。 Abstract:The genetic variation of Meishan,Huainan,Tongcheng,Bamei,Hezuo and Largewhite pigs were analyzed by RAPD markers.Twenty-four single polymorphic primers were selected out of 276 primers by amplifying six pool DNA.The index of Shannon were 0.178672,0.17781,0.15995,0.14549,0.16949,0.14159 respectively;Hpop was 0.16216,Hsp was 0.2534.The phylogenetic tree was constructed using NJ and UPGMA.The results indicated that the phenylogenetic relationship of the six pig breeds was consistent with their distribution.     

用RAPD技术研究9个家猪群体的遗传结构

目的：利用RAPD技术对9个家猪群体的遗传多样性进行分析,方法：采用RAPD技术对13/17罗伯逊易位纯合子猪易位杂合子猪及正常核型猪的三个群体,丹系长白猪群体,加系双肌臀杜洛克猪群体,加系双肌臀大约克猪群体,加系双肌臀长白猪群体及欧洲猪与易位杂合子猪产生的两个杂交后备猪群体的遗传多样性进行分析,并分别计算其共有带率F及遗传距离指数D,采用最小距离法绘制其树状聚类图。结果：19条引物的扩增结果产生多态性,共得到316条清晰稳定的多态型片段,片段长度在200-4000bp之间,由Nei的公式计算获得的遗传距离介于0.016-0.092之间,参照系统进化树可将9个品系划分为3个组群。结论：9个品系之间存在着明显的遗传差异,可作为进一步育种方案设计的依据。     

三个地理群体赤眼鳟遗传多样性的RAPD分析

利用RAPD技术对宿鸭湖、青龙湖和丹江口水库3个野生赤眼鳟群体的遗传多样性进行分析.9个RAPD引物共获得93个扩增位点,其中多态位点56个,多态位点比例为60.22%.3个群体的多态位点比例分别为53.01%、54.12%和57.95%,遗传距离分别为0.1548、0.1613和0.1764,Shannon信息指数分别为0.2249、0.2318和0.2437.群体间遗传距离以宿鸭湖和青龙湖群体最近(0.1257),青龙湖与丹江口水库群体最远(0.1416).结果表明3个赤眼鳟群体的遗传多样性均较丰富,但群体间地理遗传分化差异并不明显.     

五种品系猪亲缘关系的RAPD分析

应用190个RAPD引物对贵州小型猪,巴马小型猪、西双版纳近交系小耳猪JB和JS亚系、荣昌猪Ⅰ系、长白猪的亲缘关系进行了初步分析,其中39个引物的扩增结果具有非常明显的品系间多态性,将其扩增结果以RAPDistance package Version 1?04程序进行分析,计算相对遗传距离指数1－F,再用NJ法进行聚类分析,构建系统树。结果表明,三种小型猪相互间亲缘关系较近,尤以贵州小型猪与巴马小型猪更近。荣昌猪Ⅰ系和长白猪关系较近,但与小型猪关系较远。 关键词：随机扩增多态DNA;小型猪;亲缘关系 The phylogenetic relationship of five species of pigs including Guizhou miniature pig,Bama pig,Xisuangbanna inbred pig,Rongchang Pig and Landrance was studied by RAPD analysis.Thirty-nine single polymorphic primers were selected out of 190 primers.The amplified fragments of thirty-nine primers were analysed by the RAPDistance package version 1.04 and the phylogenetic tree was constructed using NJ method.The results indicated as the following: three strains of miniature pigs have close phylogenetic relationship and the phylogenetic relationship between Guizhou miniature pig and Bama miniature pig was much closer.Landrance and Rongchang pig have close phylogenetic relationship too,but their phylogenetic relationship is far from the three strains of miniature pigs.     

贵州地方山羊品种的RAPD分析

用180条引物对黔东南小香羊、贵州白山羊、贵州黑山羊和黔北麻羊4个贵州地方山羊品种(种群),以及南江黄羊和波尔山羊进行RAPD分析,其中27条引物扩增出多态性图谱。这27条引物共扩增出281条带,多态带为115条,平均多态频率为40．92％(范围20％～80％);每条引物平均扩增条带为10．41条(范围4～16条);扩增带分子量在210～2800bp。贵州白山羊与贵州黑山羊之间的遗传距离指数(0．0605)最小,而波尔山羊与其他品种之间的遗传距离指数(0．1059～0．1488)最大。NJ法聚类结果显示,贵州白山羊与贵州黑山羊间的亲缘关系最近,其次为黔北麻羊,而黔东南小香羊与其他3个贵州地方品种的亲缘关系较南江黄羊还远。分析表明,黔东南小香羊在遗传上为一独立的品种;而贵州地方山羊品种间具有较近的亲缘关系,遗传变异较小,具有较高的遗传稳定性。     

24个中外猪种(群)的AFLP多态性及其群体遗传关系

利用12对AFLP引物组合检测了19个中国地方猪种（群）,1个培育猪种和4个欧美引进猪种混合基因组DNA的遗传变异,根据AFLP分析结果计算了24个猪种（群）间的遗传相似系数,据此构建了UPGMA聚类关系图,结果表明,AFLP标记有着很高的多态检测效率（Ai),平均每个引物组合检测到17.3个多态标记,非常适合于猪种（群）遗传多样性分析和品种鉴定;中国地方猪种与欧美引进猪种间的遗传分化十分明显,两类猪群间的亲缘关系较远;南昌白猪与大白猪,铅山黑猪与玉山黑猪有着极近的亲缘关系,分别与其育成历史,地理分布和RAPD分析结果相一致。另外还对部分猪种（群）的聚类分析结果与其形态学,地理分布和现行分类情况不相一致的原因进行了探讨。     

太湖猪遗传多样性和系统发生关系的RAPD分析

报道了对太湖猪７个类群,红灯笼猪,约克夏种猪及太湖地区野猪共５７个个体随机扩增多态ＤＮＡ（ＲＡＰＤ）分析的结果,重建了太湖猪的系统发生树。实验从４０个引物中选用重复性较好的１３个引物对所有个体进行了随机扩增,共获得１９８个ＲＡＰＤ标记,单个引物获得的标记数在３－１６间。     

香菇品种遗传多样性RAPD分子标记的研究

对32个中国栽培香菇品种和2个野生子实体的遗传多样性进行了RAPD标记研究,9个引物共扩增出113条DNA带,83.19%具有多态性。结果显示,34个香菇菌株间均有遗传上的差异,但遗传相关性极高,表明中国栽培菌株间的遗传背景单一。     

56个中国地方猪种微卫星基因座的遗传多样性

采用FA0—ISAG联合推荐的27个微卫星DNA标记对56个中国地方猪品种和3个引进猪种(杜洛克猪、长白猪、大白猪)进行遗传多样性分析,通过计算等位基因频率、有效等位基因数、平均遗传杂合度、基因分化系数、多态信息含量和遗传距离并进行系统聚类分析,评估其种内遗传变异和种间遗传关系。以聚类结果为基础,将56个中国地方猪种分为12类：Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ类都是《中国猪品种志》中的华北型猪种;Ⅳ类相当于其中的江海型猪种;Ⅴ、Ⅵ、Ⅶ、Ⅷ和Ⅸ类的品种大部分属于华中型;Ⅹ和Ⅺ类相当于华南型品种;Ⅻ类相当于西南型品种。提出保种场结合保护区是一种比较符合我国地方猪种实际状况的保种模式。研究结果可为我国地方猪种种质特性研究提供基础数据,为我国地方猪品种资源的合理保护和利用提供科学依据。