一种改良的植物基因组DNA通用提取方法

高质量的基因组DNA是分子生物学研究的基础,而从富含糖类和次生代谢物且异质性强的植物材料中分离DNA相对困难。本方法在CTAB法和商业DNA提取试剂盒的基础上,在裂解细胞之前,对植物材料进行预处理．去除干扰DNA提取的代谢物,并在后续步骤中进行了一些优化。该方法适于多种不同的植物种类,所提取的基因组DNA质量较好,能满足下一步基因操作的要求,是一种通用的植物基因组DNA提取方法。     

一种用于PCR的番茄DNA快速粗提方法

在对植物进行分子生物学研究时需要提取植物基因组DNA并对其进行PCR克隆,目前实验室常用CTAB法提取植物DNA,但其步骤相对繁琐,需要用有机溶剂反复抽提,在样本较多时,耗时较长。NaOH可以提取多种物种DNA,本研究优化了实验室条件下更加快速、经济、安全、高效的提取植物DNA的方式,主要包括以下步骤：利用液氮快速粉碎植物样品;采用碱裂解(0.5 mol/L NaOH)的方式一步提取DNA;提取的DNA利用TE缓冲液进行中和;以中和的粗提DNA作为模板进行PCR反应。本研究利用简单的DNA提取流程并结合PCR检测方式,完成了番茄转化子的快速初步鉴定。同时还证明了该NaOH法可用于番茄不同组织的DNA提取。本研究中整个操作过程步骤简单,耗时短,可在短时间内完成大量植物样品的DNA提取,无需使用氯仿、异丙醇等有毒物质,完成提取时间约为CTAB提取法的1/5,而且提取的不同组织DNA完整性较好,质量可观,满足常规的PCR检测,可用于基因克隆及转化子筛选鉴定,具有一定的利用价值和应用前景。     

响应面法优化胆木基因组DNA的提取方法

为了得到较高质量的胆木基因组DNA,并将该方法应用于其他茜草科植物。本研究采用DX8Trial软件分别对PVP、β-巯基乙醇、Na Cl、CTAB、EDTA等胆木DNA提取因素进行设计,同时加入醋酸钠进行单因素试验,确定胆木基因组DNA的最佳提取方案,并将该方案应用到6种茜草科植物进行基因组DNA提取。结果得出最优提取方案为5%PVP、3.25%β-巯基乙醇、4.24%NaCl、2%CTAB、3%EDTA,提取过程中加入75%乙醇720μL以及醋酸钠90μL,该方案同时也适用于6种茜草科植物基因组DNA提取。响应面法的应用为胆木植物DNA提取提供了依据,为其分子生药学研究提供依据。     

元宝枫叶片总DNA提取方法的优化

由于元宝枫叶片细胞含有大量的多糖、单宁、色素和酚类物质,严重影响基因组DNA的提取,在提取元宝枫叶片总DNA的过程中,对常用的CTAB法进行了大胆的革新.结果表明,采用细胞核裂解前加入不溶性聚乙烯吡咯烷酮(PVP)和将加入RNase A消化RNA的步骤改在最后进行等技术,可以从元宝枫叶片快速提取高质量DNA,该研究为从富含多糖、单宁、色素和酚类物质的植物中提取基因组DNA,提供了可行的分析方法.     

麦冬基因组DNA提取方法研究

为了从富含多糖、多酚的顽拗植物麦冬中分离出高质量基因组DNA,分别建立了改良CTAB法和改良SDS法。通过使用核分离液和CTAB/NaCl溶液、提取液中加入0.35倍体积无水乙醇等最大限度地除去杂质。将两种方法提取的8种麦冬DNA与两种离心柱式试剂盒提取的DNA在纯度、产率等方面进行对比,并进行双酶切和SRAP分析。麦冬类植物SRAP反应体系的建立尚属首次。结果表明,改良CTAB法和改良SDS法均能从8种麦冬叶片中提取到高质量的基因组DNA,改良CTAB法提取纯度更高,提取幼叶DNA纯度可以与离心柱式试剂盒媲美,能够满足多种分子生物学试验要求。在后续试验中,用改良CTAB法从20多种沿阶草族植物中提取到了高纯度DNA。该方法通用性好,提取的DNA纯度高,对其他顽拗类植物基因组DNA的提取具有借鉴意义。     

地高辛标记探针在Southern杂交分析中的技术要点

外源基因是否成功导入受体材料的基因组中 ,必须从转化植株中找到分子生物学的检测证据。目前 ,PCR、Southern杂交等作为常用检测手段而被广泛采用。虽然 PCR技术可以快速得到结果 ,但是 ,以农杆菌介导的材料必须慎重这一结论 ,以免由于农杆菌污染造成假阳性。而 Southern分析由于操作程序繁琐 ,对植物基因组DNA的提取、纯化、酶切等技术要求较高 ,有时使杂交结果不甚理想。我们在植物基因转化的研究中 ,对荞麦 ,桑树 ,紫景天 ,洋麻等基因组 DNA的提取、纯化、酶切进行了探讨 ,对流程中的有关步骤进行技术改良 ,使酶切后的 PNA在凝胶…     

典型樱亚属植物基因组DNA改良提取方法研究

本实验在传统的CTAB法及试剂盒法的基础上,利用DNA提取缓冲液作为样品预处理液,配合其他操作步骤的优化,设计出针对樱亚属植物基因组DNA的新型提取方法,并对提取的DNA进行ISSR-PCR分子标记实验以检验其质量。实验结果表明,改进后的CTAB法及试剂盒法均能有效地去除样品中含有的多糖、色素、黄酮等杂质,而试剂盒法提取的DNA纯度和质量总体而言高于CTAB法。ISSR-PCR结果显示,两条引物对样品DNA均能进行有效扩增,并且扩增条带清晰,无明显降解。改良后的两种方法能高效高质量地提取樱亚属植物DNA,并且具有较高的通用性,可以运用于其他物种DNA的提取工作中。     

高盐沉淀CTAB法提取温室菊花基因组DNA

根据温室菊花植物组织富含多酚、多糖的具体特性,对CTAB法加以改进:在待沉淀液中加入1/2体积5 mol·L～NaCI.改进后的方法获得的DNA质量良好,电泳条带清晰,提取过程无明显的DNA降解,基本上排除了多酚物质的干扰.以提取的DNA为模板,用一对引物扩增菊花中18S基因,得到条带单一,大小与已知一致,说明获得的DNA可以进行PCR扩增,EcoR I 酶切基因组DNA图谱表明,提取的DNA能被限制性内切酶完全酶切,可以满足相关的分子生物学研究.     

石蜡包埋组织中DNA的提取

从石蜡包埋组织中提取DNA,是进一步研究抑癌基因的基础,而石蜡包埋组织中提取到的DNA往往已被降解成小分子且量微,作者经多次摸索试验,改进了一些步骤,取得了较好的抽提效果。     

转基因植物快速检测方法的研究

本试验对转基因植物检测中的DNA提取和PCR扩增程序作了改进。经试验,本研究建立的DNA快速提取法与目前广泛使用的CTAB法相比更为简便,快速和经济,提取的DNA质量主扩增效果无明显差异,可用于多种转基因植物,多种植物组织的DNA提取,利用复合PCR法可在同一反应管中同步检测35N,NOS及CP4－EPSPS基因,明显提高了检测效率。应用本试验建立的DNA快速提取－复合PCR扩增－银染检测技术可在6小时内得出结果,达到了快速,简便,灵敏,可靠的检测目的。     

Recycling Isolation of Plant DNA,A Novel Method

DNA is one of the most basic and essential genetic materials in the field of molecular biology.To date,isolation of sufficient and good-quality DNA is still a challenge for many plant species,though various DNA extraction methods have been published.In the present paper,a recycling DNA extraction method was proposed.The key step of this method was that a single plant tissue sample was recycled for DNA extraction for up to four times,and correspondingly four DNA precipitations(termed as the 1st,2nd,3rd and 4th DNA sample, respectively) were conducted.This recycling step was integrated into the conventional CTAB DNA extraction method to establish a recycling CTAB method.This modified CTAB method was tested in eight plant species,wheat,sorghum,barley,corn,rice,Brachypodium distachyon,Miscanthus sinensis and tung tree.The results showed that high-yield and good-quality DNA samples could be obtained by using this new method in all the eight plant species.The DNA samples were good templates for PCR amplification of both ISSR and SSR markers.The recycling method can be used in multiple plant species and can be integrated with multiple conventional DNA isolation methods,and thus is an effective and universal DNA isolation method.     

适于涡虫基因组DNA快速制备的改良的CTAB法

提取得到高质量的DNA样品是进行分子生物学研究的必要前提。为了找到一种适用于提取涡虫基因组DNA的常规方法,我们以东亚三角头涡虫为材料,分别用改良的CTAB法、SDS法、SDS-蛋白酶K法对涡虫的基因组DNA进行了制备,并对3种方法制备的涡虫基因组DNA进行了检测与比较。根据比较结果,我们认为改良的CTAB法最适合于涡虫基因组DNA的快速制备,为涡虫的分子生物学研究打下了基础。     

A Comparison of DNA Extraction Methods using Petunia hybrida Tissues

Extraction of DNA from plant tissue is often problematic, as many plants contain high levels of secondary metabolites that can interfere with downstream applications, such as the PCR. Removal of these secondary metabolites usually requires further purification of the DNA using organic solvents or other toxic substances. In this study, we have compared two methods of DNA purification: the cetyltrimethylammonium bromide (CTAB) method that uses the ionic detergent hexadecyltrimethylammonium bromide and chloroform-isoamyl alcohol and the Edwards method that uses the anionic detergent SDS and isopropyl alcohol. Our results show that the Edwards method works better than the CTAB method for extracting DNA from tissues of Petunia hybrida. For six of the eight tissues, the Edwards method yielded more DNA than the CTAB method. In four of the tissues, this difference was statistically significant, and the Edwards method yielded 27–80% more DNA than the CTAB method. Among the different tissues tested, we found that buds, 4 days before anthesis, had the highest DNA concentrations and that buds and reproductive tissue, in general, yielded higher DNA concentrations than other tissues. In addition, DNA extracted using the Edwards method was more consistently PCR-amplified than that of CTAB-extracted DNA. Based on these results, we recommend using the Edwards method to extract DNA from plant tissues and to use buds and reproductive structures for highest DNA yields.     

胡椒叶片基因组DNA提取方法比较

目的：研究建立胡椒叶片中提取高质量DNA的方法。方法：采用各种CTAB法和SDS法的改良方法,提取胡椒叶片中的总DNA,并对DNA进行紫外和电泳检测。结果：改良CTAB法4和5提取的DNA经电泳检测,有一条明亮主带,且无拖尾现象,样品槽无荧光出现,说明抽出的DNA纯度较高,一致性好;测定其OD260和OD280值,并计算其比值,OD260/OD280值在1.8-2.0之间,提取率在51.667-60.000μg/g之间,获得的基因组DNA质量高。结论：改良CTAB法4和法5可从胡椒幼叶中提取高质量DNA。     

降香黄檀基因组DNA的提取方法研究

目的：建立适合降香黄檀基因组DNA的提取方法。方法：采用常规SDS法、常规CTAB法和改良CTAB法等3种方法提取降香黄檀叶片基因组DNA,经电泳、吸光度、酶切检测比较提取结果;对采用改良CTAB法提取的基因组DNA进行ISSR-PCR检测。结果：改良CTAB法通过增加洗涤样品步骤,有效去除了多糖和多酚类物质,提取的DNA质量好,无降解现象,无蛋白质、盐离子及RNA污染。结论：改良CTAB法是一种高效的提取方法,使用该方法所得DNA的质量完全能够满足相应的分子操作需要。     

苔藓植物DNA提取方法研究

提取高质量的 DNA是对苔藓植物遗传多样性进行研究的基础。该文以苔藓植物为试材 ,用 5种方法 ,即快速提取法、改良 CTAB法、CTAB法、SDS法及高盐法 (第一种为自行设计 ,第二种是对原有方法的改进 )对苔藓植物 DNA提取方法进行了比较研究。结果表明 ,快速提取法和改良 CTAB法是 2种适合于苔藓植物 DNA提取的方法。这 2种方法提取的 DNA浓度和纯度均比较高 ,凝胶电泳显示无明显降解现象 ,适宜作为 PCR扩增的模板 ,并成功地进行了 RAPD扩增。     

一种高效的哺乳动物粪便DNA提取通用方法

以粪便为材料提取动物DNA进行动物保护遗传学和分子生态学研究的关键是能否提取到高质量的粪便DNA.然而提取方法通用性不好和产物质量不高等问题阻碍了粪便DNA分析技术的推广.本文介绍的改进型十六烷基三甲基溴化铵提取法可广泛适用于各食性哺乳动物粪便DNA提取,在11种不同食性动物的粪便DNA提取实验中验证了它的可靠性和通用性.本方法成本低廉(3元/样),用实验室常规试剂即可完成粪便DNA提取,其产物纯度高于专用试剂盒QIAamp DNA Stool Kit,在拥有超过专业试剂盒提取效果的同时尽可能的降低了实验成本,有利于粪便DNA技术的推广.     

Two micro-scale protocols for the isolation of DNA from polysaccharide-rich plant tissue

The high polysaccharide content of some plant species hinders the successful isolation of their DNA. As an alternative to the macro-extraction methods previously published for polysaccharide-rich plants, we present two techniques (STE/CTAB and HEPES/CTAB), which are performed in microcentrifuge tubes. These protocols are suitable for small amounts of silica gel-preserved plant tissue such as are commonly available from endangered plants. The critical step to remove polysaccharides was performing initial washes in either STE (0.25 M sucrose, 0.03 M Tris, 0.05 M EDTA) or HEPES (2% β-mercaptoethanol, 0.2% PVP, 0.1 M HEPES, pH 8.0) buffer. Precipitating the DNA at room temperature with isopropanol also aided in decreasing polysaccharide co-precipitation. Of the two protocols we present the STE/CTAB method has the advantages of being more cost-effective and avoiding the use of the hazardous chemical β-mercaptoethanol.     

改良CTAB法提取林木树种基因组DNA的研究

目的:验证改良CTAB法提取不同林木树种基因组DNA的效果,寻求一种对于不同林木树种基因组DNA提取普遍使用的方法。方法:采用改良的CTAB法提取22种木本植物基因组DNA,并对其进行定性、定量分析及酶切分析。结果:采用本法可以去除多糖和其他次生代谢物并获得高质量的DNA。结论:该方法可以作为一种适于在实验室进行的林木树种基因组DNA的提取方法。