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全基因组扫描寻找强直性脊柱炎的易感基因位点 总被引:13,自引:1,他引:12
为了寻找中国人群强直性脊柱炎(ankylosing spondylitis,AS)的易感基因位点,采用全基因组扫描法对9个强直性脊柱炎家系进行基因分型、参数连锁分析和非参数连锁分析。在参数连锁分析中,D6S276位点的最大LOD值为3.8821(0=0.0),精细分析显示距D6S276位点附近的D6S1691和D6S1618的LOD值分别为1.5717(0=0.1)及2.0056(0=0.1)。在非参数连锁分析中,位于D6S276附近的LOD值高达5.0623,非参数连锁分析的NPJ值为3.7561,最小P值为0.000233。上述结果提示,D6S276与强直性脊柱炎之间存在较强的连锁关系,D6S1691-D6S276-D6S1618区域可能存在强直性脊柱炎的易感基因位点。此外,D3S1292、D4S1535和D18S64的最大LOD值分别为1.2768(0=0.2)、1.1246(0=0.2)和1.1851(0=0.1),提示这些标记与AS之间存在一定的连锁关系。 相似文献
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在复杂性状疾病的家系连锁研究中,Haseman-Elston回归分析和方差组成模型是常用的两种数量性状连锁分析方法。前者主要针对同胞对的性状值差或和的平方进行回归分析;后者引用方差组成模型,将数量性状分解为遗传方差和环境方差,可估计二者对表型的影响。两种方法可应用于同胞对、核心家系或扩展家系,定位数量性状基因座。本文对这两种模型的原理、算法及其进展进行了综述,并给出了常用的统计软件包。
Abstract:In this article, we discussed two model-free methods for detecting genetic linkage for quantitative traits, Haseman-Elston regression approach and variance components approach. The former is a regression approach for detecting linkage based on the squared difference or squared sums in quantitative trait values of sib-pairs and their estimated marker IBD scores. The latter can jointly model covariate effects along with variance components, including genetic component and non-genetic sources of variability. We have outlined the model assumption, the algorithm and the extensions for the both methods. 相似文献
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不宁腿综合征遗传学研究进展 总被引:2,自引:0,他引:2
不宁腿综合征(Restless legs syndrome, RLS)遗传学研究近年来获得了许多重要的进展, 极大地丰富了对于这种疾病分子机制的认识。RLS是一种常见的复杂疾病, 几个遗传流行病学和双生子研究对RLS遗传组分进行了剖析, 说明RLS是一个遗传性很强的性状, 其遗传力约为50%。采用基于模型的连锁分析方法或者是不依赖于模型的连锁分析方法目前已定位了5个重要的RLS疾病连锁位点: 12q13-23, 14q13-21, 9p24-22, 2q33和20p13, 为定位克隆RLS致病基因或者易感基因提供了连锁图谱。最新基于高通量的SNPs分型平台开展的全基因组分析确立3个与RLS显著关联的区域: 6p21.2, 2p14和15q23。文章结合作者近年来从事不宁腿综合征遗传学的研究工作, 对该领域的重要成果进行了汇总和评述。 相似文献
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关联分析及其在植物中的应用 总被引:2,自引:0,他引:2
关联分析是新近开始在植物数量性状研究和植物育种中应用的一种分析方法.它以连锁不平衡为基础鉴定某一群体内性状与遗传标记或候选基因间的关系,是对分子育种中QTL分析的补充和提高.本文在介绍连锁不平衡的定义和度量方法的基础上,讨论连锁不平衡程度和群体结构对关联分析的影响,综述了关联分析在植物方面的研究进展,并最后讨论了关联分析在植物数量性状和分子育种研究中可能的应用. 相似文献
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动物中有许多重要的离散性状,与常规的数量性状类似,其遗传基础受多基因控制并受到环境因子的修饰。由于多基因离散性状的表型特殊性,利用常规的QTL连锁分析方法很难获得理想的统计效果,相应地发展了许多基于广义线性模型框架内的非线性方法。本文就目前离散性状的QTL连锁分析方法作简要综述,并对可预期的改进方法进行了展望。 相似文献
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BC群体不同连锁模式分子区间标记QTL作图相关方法的精确度分析 总被引:1,自引:0,他引:1
该文分析了BC群体不同连锁模式分子区间标记QTL作图相关方法的精确度,提出了相应参数的适用范匿,连锁顺序的检测方法,分析步骤,为QTL作图提供了理论基础。 相似文献