玉米F2群体分子标记偏分离的遗传分析

以优良玉米杂交组合 (综 3× 87 1)的F2 群体为材料 ,构建了包含 15 0个SSR标记和 2 4个RFLP标记的玉米分子标记连锁图。通过对 174个分子标记的分析 ,发现有 4 9个分子标记表现偏分离 (P <0 0 5 ) ,占总标记数的2 8 2 %。这些偏分离标记有 11个偏向父本综 3,占 2 2 5 % ;12个偏向母本 87 1,占 2 4 5 % ;2 5个偏向杂合体 ,占5 1 0 %。还有 1个标记同时偏向双亲。同时在 9条不同的染色体上发现 14个偏分离的热点区域 ,其中 4个与已经定位的配子体基因的位置相近 ,由此表明配子体基因是导致偏分离的部分原因。所发现的SDR6 1和SDR7 2似乎是两个新的偏分离热点区域。进一步讨论了引起偏分离的原因 ,以及偏分离标记对QTL定位的影响。对于单位点的QTL分析而言 ,偏分离标记一般不会影响QTL定位的位置和效应 ;对于两位点的上位性分析而言 ,则要求较少的偏分离标记和较大的群体     

偏分离分子标记的作图方法

对取自MAPMAKER软件小鼠F_2群体(含333个体)的5个RFLP连锁标记数据作了共显性分子标记偏分离的分析。先确定选择类型的方程组(配子或合子),随后采用Newton-Raphson迭代法估算标记间的重组值。在构建分子标记遗传图谱时,如果两个相邻标记均存在偏分离,最好采用纳入偏分离因子的估算方法。在估计F_2群体标记间偏分离重组距离上,用连续x~2检测方法比传统x~2检测更为准确。     

栽培大豆与半野生大豆杂种F_2群体中RFLP标记的偏分离及其形成原因的分析

本文研究了大豆５６个ＤＮＡ限制性片段长度多态性（ＲＦＬＰ）标记在一栽培大豆／半野生大豆杂种Ｆ２群体中的分离。结果表明,２５％的ＲＦＬＰ标记表现了偏分离,偏离的方向主要趋于栽培大豆亲本,其形成原因主要是存在着配子体选择。这对研究大豆的遗传及育种选择等有着重要的指导意义。     

遗传群体偏分离研究进展

偏分离是指观察到的基因型比例偏离预期的孟德尔分离频率方式,无法用传统的遗传理论和方法加以分析。偏分离被认为是一种重要的进化动力,并对遗传连锁图谱的构建造成影响。本文针对偏分离的现象、偏分离的影响因素和形成原因,以及对QTL定位的影响等方面进行综合分析,系统阐述了植物分离群体偏分离的研究进展,为后续研究提供有益的参考。     

遗传群体偏分离研究进展

偏分离是指观察到的基因型比例偏离预期的孟德尔分离频率方式,无法用传统的遗传理论和方法加以分析。偏分离被认为是一种重要的进化动力,并对遗传连锁图谱的构建造成影响。本文针对偏分离的现象、偏分离的影响因素和形成原因,以及对QTL定位的影响等方面进行综合分析,系统阐述了植物分离群体偏分离的研究进展,为后续研究提供有益的参考。     

偏分离分子标记的作图方法

对取自MAPMAKER软件小鼠F2群体(含333个体)的5个RFLP连锁标记数据作了共显性分子标记偏分离的分析。先确定选择类型的方程组(配子或合子),随后采用Newton-Raphson迭代法估算标记间的重组值。在构建分子标记遗传图谱时,如果两个相邻标记均存在偏分离,最好采用纳入偏分离因子的估算方法。在估计F2群体标记间偏分离重组距离上,用连续χ2检测方法比传统χ2检测更为准确。Abstract The comparative analysis of segregation distortions of the codominant markers data presented in software MAPMAKER are made, where five RFLPs markers involve in a mouse F2 population with 333 individuals. The successive χ2 test begins with the determinations of gametic or zygotic selection types, followed by the estimation of recombination fractions between two markers with the Newton-Raphson iteration method. It is better to use the molecular marker showing segregation distortion for constructing a genetic map, in the case of seriously skew segregation between both the adjoining markers. The successive χ2 test provides better accuracy than that of classical χ2 test for the estimation of the recombination values in F2 population with segregation distortion.     

栽培大豆与半野生大豆杂种F2九体中RFLP标记的偏分离及其形成原因…

本文研究了大豆５６个ＤＮＡ限制性片长度多态性（ＲＦＬＰ）村记在一栽培大豆／半野生大豆杂种Ｆ２群体中的分离,结果表明,２５％的ＲＦＬＰ标记表现了偏分离,偏离的方向主要趋于栽培大豆亲本,其形成原因主要是存在着配子体选择。这对研究大豆的遗传及育种选择等有着重要的指导意义。     

亚洲棉种内群体异常偏分离的分子标记检测

利用3个形态标记、20个SSR和11个SRAP多态性标记,研究它们在“如东鸡脚桠果”与“美国中棉971”杂交的F2群体中的分离情况。结果表明,77.42%的分子标记表现为偏分离,所有的偏分离标记都偏向母本“如东鸡角桠果”;如此高的偏分离比例以及偏分离标记都偏向一个亲本,这种现象在棉花中是比较罕见的。3种类型的SSR标记和非物种特异性的SRAP标记都表现偏分离,而形态标记则表现为正常分离,这表明该异常偏分离现象是由材料本身的遗传特性所决定的。通过分析偏分离的共显性标记的等位基因频率(p=q)以及各种基因型频率(p2:2pq:q2)的F2分布,发现大多数标记的等位基因频率差异显著而F2基因型频率分布正常,表明这些标记产生偏分离可能是配子体选择的结果。     

RIL群体区间分子标记-QTL定位的相关方法

分析了RIL群体中以分子区间标记进行QTL定位的相关方法．通过对分子标记赋值可获得与数量性状表型值的简单相关系数．然后,在此基础上进行连锁检验．此外．在特定情况下利用R值,可以估计数量性状座位(QTL)和分子标记位点(ML)间的重组值．     

大豆耐盐机理及相关基因分子标记

大豆耐盐涉及多种生理代谢途径.耐盐大豆能够通过Cl-排除、控制Na 的吸收和转运、合成渗透调节物质、改变细胞膜膜脂组分及相关酶类的活性等多种形式来适应盐胁迫;野生大豆群体具有盐腺,从形态结构上适应盐逆境;大豆-根瘤菌共生体在盐胁迫下通过互作来提高整体的耐盐性.分子生物学技术应用于大豆耐盐研究,已获得了一些与耐盐相关基因连锁的分子标记.广泛搜集筛选大豆栽培种和野生种资源,利用分子生物学技术和基因工程提高大豆耐盐性,将成为未来大豆耐盐研究的主要内容.     

水稻日本晴与广陆矮4号杂交F2群体SSR标记偏分离原因探析

以全基因组测序已经完成的材料粳稻日本晴和完成了第4染色体全序列测序的籼稻广陆矮4号的杂交F2作为构图群体,共90个单株,构建了一张含148个微卫星标记的水稻分子遗传图谱。该F2群体显著偏分离非常高,发现有49个分子标记表现偏分离（P〈0．05）,占总标记数的33．11％,这些偏分离标记中有36个偏向广陆4号,13个偏向杂合体,没有偏向日本晴的偏分离标记。讨论了配子体基因和孢子体基因导致偏分离的原因,通过已经定位的配子体基因和杂种不育基因分布在偏分离集中的区域来进一步说明配子体基因和杂种不育基因确实是导致偏分离形成的原因,而且还通过未定位的标记分析了偏分离的原因。     

Analysis of Segregation Distortion of Molecular Markers in F2 Population of Rice

A genetic linkage map comprising 148 SSR markers loci was constructed using an F₂ population consisting of 90 lines derived from a sub-specific cross between a japonica variety Nipponbare and an indica variety Guangluai-4. The F₂ population showed high significantly distorted segregations. Among these SSR markers, 49 markers (33.11%) showed the genetics distortion(P<0.05). Of them, 36 markers deviated toward male parent indica GuangLuAi-4 and 13 markers toward heterozygote, but none toward the female parent Nipponbare. It was found that the segregation distortion might be caused by gametophyte and zygote. Since most gametophyte loci and sterility loci were mapped in segregation distortion regions, it indicated that the segregation distortion may be caused by these gametophyte loci and sterility loci. Finally, this research also analyzed the skewed segregation of some markers, which had not been mapped on chromosome.     

利用微卫星标记评估大豆重组近交系ＮＪＲＩＫＹ

分离群体的构建及其合理性评估是遗传作图等基因组研究的基础,利用 ＳＳＲs标记以对科丰１号为母本、南农１１３８－２为父本构建的大豆ＲＩＬs群体ＮＪＲＩＫＹ进行了分析评估。随机选取覆盖大豆基因组的１３８对ＳＳＲs引物对两个亲本进行多态性筛选分析,８６对具有多态性,多态率高达约６２．２３％,共计９０个多态位点。进一步利用具多态性的ＳＳＲs位点对供试群体的分析表明不仅绝大多数位点符合１：１分离比,而且各家系也趋于纯合。该ＲＩＳs群体各家系的基因型组成近似正态分布,是一种适于遗传作图及其他基因组研究理想的ＲＩＬs群体     

两例水稻极端异常分离现象的遗传分析

遗传异常分离既是自然界非常普遍的现象, 也是生物进化的动力之一。产生异常分离的原因可能与配子体或孢子体的选择有关。利用6个以类病变(lmi)和矮杆突变体(d6)为亲本的杂交组合(F2或F3), 对该类病变和矮杆基因的遗传规律及异常分离现象作初步的分析。结果显示, lmi×02428和d6×93-11的F2群体以及F3株系中存在极端异常分离的现象; LMI基因附近的分子标记ST8-1和D6基因附近的ST7-1、ST7-2、RM5490的带型分离同样也极显著偏离期望比; 偏分离因子与类病斑LMI和矮杆基因D6紧密连锁, 分别位于第8染色体分子标记ST8和ST8-2之间以及第7染色体分子标记ST7-1和ST7-3之间。异常分离现象还与杂交的组合有直接的关系。     

抗茎腐病分子标记在159份玉米自交系中的验证及实用性评价

为了评价抗茎腐病基因分子标记在辅助育种中的实用性,本研究对159份玉米自交系进行了茎腐病田间抗性鉴定,并检测了与4个茎腐病抗性QTL(qRfg1、qRfg2、Rpi QI319-1和Rpi QI319-2)紧密连锁的11个分子标记在上述材料中的扩增情况。结果表明:供试玉米自交系的平均发病率为26.30%,发病率低于30.0%的材料占67.92%,抗病资源丰富。来源于国外、东北、西南和黄淮海地区的材料平均发病率分别为27.67%、17.92%、15.12%和36.80%,与东北和西南地区种质相比,黄淮海地区抗性种质相对缺乏。通过比较分子标记扩增带型与田间茎腐病表型,发现与同一QTL连锁的不同分子标记的检测结果存在较大差异,其中分子标记STS01(qRfg1)、STSZ479(qRfg2)、bnlg1866(Rpi QI319-1)和bnlg1716(Rpi QI319-2)的阳性检测结果与田间表型符合度较高,分别为76.79%、78.95%、91.67%、73.33%,具有上述特异扩增多态性的材料平均发病率分别为22.06%、19.01%、10.65%、19.63%,可作为抗茎腐病分子检测的有效标记。本研究为开展玉米抗茎腐病分子育种提供了重要参考。