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相似文献
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1.
王瑛  王燕 《动物学报》1996,42(2):189-196
以λ噬菌体EMBL-3为基因载体,构建大麻哈鱼(Oncorhynchus keta)基因组文库,并从中分离出含全长的生长激素(csGH)基因的克隆。本研究首次报道了对csGH全长核苷酸序列分析的结果。发现csGH基因由6个外显子和5个内含子组成,长度为3361碱基对(bp)。由该序列可推导出含210个氨基酸的多肽,其中存在22个疏水氨基酸残基的信号肽。本研究所分析的csGH的外显子和内含子,其排列方式与其他鲑类(Salmonids)和罗非鱼(Tilapia)是相似的,而与鲤科鱼类(Carps)不同,后者外显子和内含子的排列方式与哺乳类和鸟类相似。将所测定的 csGH基因的编码区与已发表的 csGHⅡ和csGH Ⅱ两种 cDNA序列进行比较,证明本研究所克隆的 csGH基因应属于 csGH Ⅱ,因它们的编码序列 100%同源。  相似文献   

2.
LIM类同源框基因(homeoboxgene)保守性很强,在动物界广泛存在。各种LIM类同源框基因的共同点是:在结构上,LIM类同源框基因的编码蛋白都具有同源域和LIM结构域;在生物学功能方面,都与早期发育中胚胎细胞谱系的决定和胚胎细胞分化有关。本实验提取青岛文昌鱼基因组DNA,用一对简并引物对其LIM类同源框基因Bblim进行PCR扩增,将所得DNA片段克隆到pBluescriptⅡKS(+)质粒上,经测序发现,其同源框区比大多数LIM类基因的同源框区要长得多,其上插入有一个长度为138bp的内含子(Fig.1)。这个内含子的序列中有真核生物核基因mRNA内含子的典型序列。并且与该基因cDNA克隆的测序结果相吻合。从而,可以确认该序列中这个内含子的存在。已知绝大多数LIM类同源框基因的同源框区无内含子。因此,有必要对其作深入研究。  相似文献   

3.
马铃薯HMGR基因的克隆,序列分析及其表达特征   总被引:8,自引:0,他引:8  
采用RT-PCR技术,从马铃薯(Solanum tuberosum L.)幼叶中克隆了一个约1.0kb的cDNA片段,序列分析结果表明,该cDNA与忆报道的马铃薯HMGR基因家族的三种类型基因具有较高核酸序列同源性,与HMGRⅠ基因同源性为77.0%,HMGRⅡ基因为93.2%,HMGRⅢ基因为77.1%。其中3’端非翻译区序列与HMGRⅠ、HMGRⅡ、HMGRⅢ三种基因同源性分别为50.2%,8  相似文献   

4.
作者曾报道了一个玉米(Zea mays L.)基因组特异的重复序列DNA(克隆MR64)通过小麦(Triticum persicum Vav.ex Zhuk.)与玉米杂交导入一个小麦加倍单倍体(DH)植株中。利用分析主宰该重复DNA序列可以稳定地传递到小麦DH3代植株。通过Intermet在DNA数据库中进行序列相似性搜寻和同源性比较,结果显示,MR64的DNA序列和玉米的最近报道的两个逆转座子P  相似文献   

5.
水稻D1snoRNA及其基因的鉴定和功能分析   总被引:1,自引:0,他引:1  
测定和比较了籼稻(OryzasativaL.sp.indica)、粳稻(O.sativaL.sp.japonica)和多年生野生稻(O.rufipogonW.Grifith)hsp70基因第一个内含子中D1DNA以及部分上游序列,并通过Northern杂交及cDNA序列分析对D1DNA编码的D1snoRNA进行了实验鉴定。D1snoRNA属于反义snoRNA家族,它与水稻25SrRNA互补序列为14个核苷酸长。根据理论计算,D1snoRNA具有指导水稻25SrRNA中第807位的核糖甲基化功能。D1DNA与C1DNA相隔仅105个核苷酸,在内含子中如此短的距离内连续编码两种snoRNA是罕见的,这一结构为研究串联结构的snoRNA转录后加工机制提供了一个良好的研究体系。  相似文献   

6.
酵母内含子在基因序列中的分布对基因转录效率的影响   总被引:4,自引:2,他引:4  
对酵母中高效转录和低效转录基因内含子序列寡核苷酸使用情况的对照分析,显示两类内含子的序列结构有差异,并且高效转录基因内含子序列含有较多潜在的转录因子结合位点,由此推测内含子可能参与基因转录的调控.这个结论有待更多的数据证实.对内含子和外显子在两组基因序列中的分布(长度、位置等)进行详细比较分析后显示,高效转录基因内含子和低效转录基因内含子的长度有比较明显的界限.两组基因中外显子长度的均值虽然有些差异,却没有明显的界限.基因序列长度与外显子长度的情况相似.虽然内含子的相对位置在两类基因中都很靠近5′端,但是从实际位置看,高效转录基因中比较多的内含子很靠近基因的5′端,有些则位于5′-UTR区域.这些结果提示,基因的转录效率与内含子的长度有关,与外显子及基因序列的长度无关,内含子的位置也可能影响转录效率,内含子对基因转录的调控可能与基因上游的转录调控有关联,或者是上游调控的延续.  相似文献   

7.
DNA序列信息的一种新的测度   总被引:4,自引:3,他引:1  
根据信息理论给出了测度DNA序列信息的一种新的方法,获得DNA序列4个层次的信息量测度:Ib,If(1),If(2)andIf(3),这4种信息测度可分别用来测度DNA的碱基序列、密码子序列、编码蛋白质序列和功能蛋白质序列的信息量。从M.edulis的线粒体基因组中两个较短的编码蛋白质的DNA序列和使用具有不同倍性的间并密码子组组成的模拟DNA序列中所获得计算结果表明,这些信息测度确实能用来揭示所  相似文献   

8.
番茄抗病基因Cf9的3′UTR区含有内含子序列   总被引:2,自引:0,他引:2  
从番茄(LycopersiconesculentumMil.)抗病品种“中杂9号”基因组DNA中扩增并克隆了番茄抗叶霉病基因Cf9。序列分析结果表明,该基因全长2751bp,含有一个编码863个氨基酸的开放阅读框架。在该基因的3′UTR区发现了一段未曾报道的内含子序列,长115bp,它所处的位置与番茄另一个抗叶霉病基因Cf2内含子的位置相似,其5′和3′边界序列为一重复序列,TCCAGG(T)ATTC,并与Cf2基因内含子边界序列高度同源。与已报道的Cf9的cDNA序列相比,它的第371位的核苷酸T突变成了C,从而使其编码蛋白的LRR区第121位的亮氨酸突变为脯氨酸。  相似文献   

9.
在114名青年人中筛查出的两例血型糖蛋白(GP)变种,携有MiⅢ基因特殊的变异片段.先证者均为海南省黎族男性,属杂合子.借助聚合酶链式反应(PCR)获得跨越MiⅢ基因外显子2~4的基因组序列,再进行被扩增DNA的直接测序,确证其基因结构属(δ-α-δ)杂化体.通过基因的微转换机理,δ基因的假外显子在其3'端同显示5'剪接信号的α基因外显子3及内含子3融合,前两者形成一组合外显子3.MiⅢ基因的近端(δ-α)断点(Breakpoint)在组合外显子3内(第825~850位核苷酸);而远端(α-δ)断点则在内含子3内(第904~968位核苷酸).  相似文献   

10.
为了研究人体组织超声图象的局部特征,并为进行人体组织定征研究提供新的参数,提出了一个分析超声图象局部分形指数的新方法-局部分形指数小波分析法LFWAM(LocalFractalScaleWaveletAnalysisMethod)。应用此法研究了人体肝脏组织超声图象分形体的构造规则;进行了局部分形指数的分析。验证了LFWAM法分析肝脏超声图象局部特性的有效性,得出了局部分形指数更能全面、细致地刻画肝脏组织超声图象分形特征的结论,为进而研究局部病变的识别与图象的分割提供了基础。  相似文献   

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