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小麦蓝矮植原体染色体DNA的分离 总被引:2,自引:0,他引:2
[目的]分离小麦蓝矮(WBD)植原体染色体DNA,并建立WBD植原体染色体分离纯化体系.[方法]采用差速离心和脉冲电泳(PFGE)方法富集纯化WBD植原体染色体DNA,并通过PCR和Southern blot进行检测验证,实时荧光定量PCR方法对分离纯化效果进行定量检测.[结果]脉冲电泳凝胶中出现一条大小约为650 kb的条带,经PCR检测和Southern blot分析表明该条带为WBD植原体的染色体DNA.实时荧光定量PCR检测结果表明采用差速离心与脉冲电泳结合的方法可以将WBD植原体基因组的相对拷贝数提高436.5倍.[结论]采用差速离心与脉冲电泳法结合可以有效地从感染WBD长春花中分离到纯的WBD植原体染色体DNA,WBD植原体染色体DNA大小约为650 kb. 相似文献
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DNA提取方法的研究进展 总被引:15,自引:0,他引:15
样本DNA的提取是PCR反应的关键步骤。本文介绍了近年来国内外几种常用的DNA提取方法,如:传统法、螯合树脂法、玻璃粉法、磁珠法、免疫亲和法等,并对各种方法的优缺点进行了综合评述。 相似文献
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一种简便的海藻DNA提取方法 总被引:9,自引:0,他引:9
把包裹缠绕在大量粘性多糖中的海藻DNA提取出来是一个十分困难的。研究表明,DNA样品中的酸性多糖会抑制限制性酶切反应和PCR扩增,而海藻组织中主要的碳水化合物是硫多糖和羧酸多糖,而且比陆生植物的中性多糖更易水溶,使溶液高度粘稠,在DNA提取中很难去除... 相似文献
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三种快速提取植物DNA改良方法的比较 总被引:19,自引:0,他引:19
DNA是生物遗传信息的载体,快速提取高分子量、纯净的DNA是进行核苷酸序列测定、基因文库构建和遗传转化等研究的重要步骤。研究以水稻、小麦、大麦、大豆、豌豆和紫云英等为材料,比较了三种改良法提取植物DNA的效果。结果表明,三种改良后的方法不仅保留了原法的许多优点,而且方法简单,不经CsCl_2密度梯度离心能较干净地去除蛋白质及RNA,获得较纯净的、大分子的双链DNA,在不同程度上满足了各种植物提取DNA的需要。 相似文献
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目的:针对分子育种工作的繁琐性及葱属植物次生代谢物较多的特点,研究一种利用普通试剂及简单仪器高效快速提取葱属植物DNA的方法。方法:对碱处理法稍加改进,在碱性环境中高温裂解细胞,将释放的DNA保存在Tris缓冲液中,用PCR检测提取质量并分析DNA的保存时间。结果:与用试剂盒提取的DNA相比,扩增产物无显著差异,利用此方法提取DNA并分析了13个洋葱品种的细胞质雄性不育类型;保存时间分析显示,DNA在常温下只能保存5d,在4℃或-20℃可至少保存2个月。结论:该方法方便快速、成本低、适于田间操作,得到的DNA可满足分子生物学实验的基本要求,可用于以PCR为基础的分子标记辅助育种。 相似文献
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提取得到高质量的DNA样品是进行分子生物学研究的必要前提。为了找到一种适用于提取涡虫基因组DNA的常规方法,我们以东亚三角头涡虫为材料,分别用改良的CTAB法、SDS法、SDS-蛋白酶K法对涡虫的基因组DNA进行了制备,并对3种方法制备的涡虫基因组DNA进行了检测与比较。根据比较结果,我们认为改良的CTAB法最适合于涡虫基因组DNA的快速制备,为涡虫的分子生物学研究打下了基础。 相似文献
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The nucleotide sequences of two extrachromosomal elements from tomato big bud (TBB) and one extrachromosomal element from Candidatus Phytoplasma australiense (Ca. P. australiense) phytoplasmas were determined. Both TBB plasmids (3319 and 4092 bp) contained an open reading frame ( approximately 570 bp) with homology to the rolling circle replication initiator protein (Rep). This gene was shorter than the rep genes identified from other phytoplasma plasmids, geminiviruses and bacterial plasmids. Both TBB extrachromosomal DNAs (eDNAs) encoded a putative DNA primase (dnaG) gene, a chromosomal gene required for DNA replication and which contains the conserved topoisomerase/primase domain. We speculate that the replication mechanism for the TBB phytoplasma eDNA involves the dnaG gene instead of the rep gene. The Ca. P. australiense eDNA (3773 bp) was shown to be circular and contained four open reading frames. The rep gene was encoded on ORF 1 and had homology to both plasmid (pLS1) and geminivirus-like domains. 相似文献
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一种提取野生苎麻总DNA的方法 总被引:9,自引:0,他引:9
用CTAB法提取野生苎麻总DNA ,结合野生苎麻中酚类、黄酮类等次生代谢物质多的特点 ,加入一定浓度的PVP、β—巯基乙醇 ,可以获得高分子量DNA ,经实验鉴定 ,其纯度符合分子遗传实验要求。 相似文献
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一种蜘蛛基因组DNA的简易提取方法 总被引:6,自引:0,他引:6
本文介绍了1种改进的蜘蛛基因组DNA的提取方法.通过与传统DNA提取方法的比较,本方法具有可在常温条件下进行、DNA得率高、简便、经济等优势. 相似文献
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Genome analysis of uncultivable plant pathogenic phytoplasmas is hindered by the difficulty in obtaining sufficient quantities of phytoplasma enriched DNA. We investigated a combination of conventional enrichment techniques such as cesium chloride (CsCl) buoyant gradient centrifugation, and new methods such as rolling circle amplification (RCA), suppression subtractive hybridization (SSH), and mirror orientation selection (MOS) to obtain DNA with a high phytoplasma:host ratio as the major first step in genome analysis of Candidatus Phytoplasma australiense. The phytoplasma:host ratio was calculated for five different plasmid libraries. Based on sequence data, 90% of clones from CsCl DNA enrichment contained chromosomal phytoplasma DNA, compared to 60% from RCA CsCl DNA and 20% from SSH subtracted libraries. Based on an analysis of representative libraries, none contained plant DNA. A high percentage of clones (80-100%) from SSH libraries contained extrachromosomal DNA (eDNA), and we speculate that eDNA in the original DNA preparation was amplified in subsequent SSH manipulations. Despite the availability of new techniques for nucleic acid amplification, we found that conventional CsCl gradient centrifugation was the best enrichment method for obtaining chromosomal phytoplasma DNA with low host DNA content. 相似文献
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一种从鱼类肌肉组织中提取基因组DNA的简易方法 总被引:9,自引:0,他引:9
以泰山螭霖鱼、黄河鲤鱼、东平湖鲫鱼为材料,采用改进的酚-氯仿抽提法和蛋白酶K消化法提取基因组DNA,并对其进行紫外分光光度、琼脂糖凝胶电泳、聚丙烯酰胺凝胶电泳、微卫星PCR扩增等方法的鉴定。结果表明,本方法提取的鱼类基因组DNA浓度为0.9-3.25μg/μL,D260nm/D280nm值为1.79-1.87,电泳条带整齐明亮,适合微卫星PCR扩增。因此,本方法能够从鱼类肌肉组织中获得较为纯净的基因组DNA,适于进一步的分子生物学研究之用。 相似文献
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目的:探讨适用于微生物多样性研究的棉田土壤微生物总DNA提取方法。方法:采用4种方法提取不同连作和轮作处理的棉田土壤微生物总DNA,比较其纯度、产率、片段大小,并应用ARDRA技术验证其质量。结果:其中3种方法均可获得23kb的DNA片段,但不同方法提取的DNA的产率和纯度上有明显差异。改良CTAB-SDS法提取的DNA完整性好,得率为24.20μg.g-1干土,纯化后A260/A280和A260/A230为分别为1.80和1.70,纯化回收率可达70.1%,完全适用于后续的PCR分析。结论:采用该法提取棉田土壤总DNA简便而高效。对该法提取获得的棉田土壤微生物总DNA进行ARDRA和DGGE分析,所得图谱能较全面地反映不同处理间微生物多样性及群落结构的差别,为不同栽培体系下棉田土壤微生物的分子生态学研究提供了基础。 相似文献