小包脚菇属分类研究进展

小包脚菇属Volvariella又名草菇属,是一类具有较高经济价值的食用真菌,著名的栽培食用菌草菇Volvariella volvacea即为该属成员。文中从小包脚菇属的分类历史、资源现状、分子系统学研究等方面进行了综述。小包脚菇属分类研究存在的主要问题是形态学研究的分类特征相对较少,已有的分子系统学研究涉及的类群和基因片段偏少,不能很好的反映种、属间的系统发育关系,其确切分类地位需进一步研究;解决上述问题是今后小包脚菇属分类研究的主要方向。     

毛茛科分子系统发育研究进展

毛茛科(Ranunculaceae)在被子植物的系统演化中占有十分重要的地位,其系统位置和科下演化关系一直备受争议。近20多年的分子系统学研究表明,以往基于形态学的分类系统与分子系统学研究结果存在巨大差异。通过形态学性状界定的绝大多数亚科都没有得到分子系统学支持。此外,通过形态学确定的一些属如升麻属(Cimicifuga)、黄三七属(Souliea)、獐耳细辛属(Hepatica)、白头翁属(Pulsatilla)和水毛茛属(Batrachium)等,根据分子系统学研究均应予以归并。而分子系统学研究也确立了一些类群的属级地位,如露蕊乌头属(Gymnaconitum)等。以中国分布的毛茛科植物为例,通过以往分子系统学研究,共有10个属被归并,2个属新被确立。然而,毛茛科分子系统学研究对于科下许多类群之间的关系目前仍然没有得到很好的解决,如毛茛亚科和翠雀族等类群的系统发育关系仍需要进行深入研究后方能确定。该文对近年来国内外有关毛茛科的分子系统学研究进展进行了综述,并对该科尚存的一些问题和未来的研究方向进行了讨论。     

中国姬鼠属的系统学研究述评

姬鼠属分布在欧亚大陆及其邻近的岛屿上, 种类及数量均较多。但对该属的分类和系统发育关系一直存在争议, 尤其近几年对姬鼠属分子系统学的研究, 产生了一些与形态学、生物地理学等研究不同的结果。文章综述了姬鼠属系统学研究的一些工作, 根据所归纳的初步论点, 试拟定了中国现生种类的系谱; 并对中国姬鼠属系统学的进一步研究, 提出了一些建议。     

鸢尾属分子系统发育学研究进展

鸢尾属植物具有重要的观赏价值和经济价值,研究该属属内系统演化关系对该属种质保存、利用和遗传育种具有重要意义.目前,有关鸢尾属各分类单元的系统学关系长期处于争议状态.因此,该文以经典分类系统主要观点为基础,从不同分类单元的系统关系总结了鸢尾属分子系统发育学研究进展.结果表明:现有分子系统发育学研究结果大多支持鸢尾属为并系...     

桃种质资源亲缘关系的研究进展

种质资源是现代育种和生物技术研究的物质基础。桃种质资源亲缘关系的研究将为探讨桃的起源、进化、分类、育种和资源利用提供科学依据。本文从形态学、细胞学、孢粉学、生物化学及DNA分子标记等几个方面综述了桃种质资源亲缘关系的研究进展,探讨了桃种质资源亲缘关系的研究现状、前景及尚需解决的问题,并就进一步开展桃种质资源亲缘关系的研究进行了分析,提出桃种质野生种、近缘野生种厦不同栽培品种群间的分子系统学关系是今后研究的重点。     

综合纲系统学研究进展

综合纲是形态十分特殊的多足动物类群,其系统发育地位一直备受争议。目前,综合纲的分类学和系统发育研究相较其他节肢动物类群欠缺,全世界仅记录204种,且主要集中在欧洲、美洲和大洋洲,亚洲和非洲地区的研究十分匮乏。综合纲1目2科13属的分类体系较为完备并被广泛采用,但其内部幺蚰科和幺蚣科之间进化关系尚不明确。综合纲与少足纲、倍足纲共同组成前殖孔类的系统发育假说得到了形态学及分子序列数据等方面的支持,但意见分歧依然存在。中国综合纲动物的系统学研究较为薄弱,目前仅有零星的报道。现从经典分类学和系统发育学两个方面对综合纲系统学研究的最新进展进行综述,以期推动中国综合纲动物系统学研究的开展。     

基因序列在蚤蝇科分子系统学研究中的应用

概述基因序列在双翅目蚤蝇科分子系统学研究中的应用。对蚤蝇科已测序的分类单元和基因序列进行了总结,12S rDNA和16S rDNA应用最广泛,涉及蚤蝇科17个属;获得基因序列最多的是Melaloncha属。蚤蝇科分子系统学研究内容为高级阶元系统发育分析、物种鉴定和隐存种发现。今后蚤蝇科分子系统学研究应增加蚤蝇标本的种类与数量,选择标准化基因。     

中国葡萄座腔菌属分类研究概况

葡萄座腔菌属Botryosphaeria及其无性型包括许多植物病原菌以及有经济价值的类群,是腔子囊菌的重要类群.简要回顾了我国该属真菌的分类研究历史,概述了近年来取得的相关研究进展,提供了中国已知种类检索表,展示建立在分类学基础上的分子系统学研究结果,即葡萄座腔菌属Botryosphaeria是多谱系的类群,可分为多个分支,各分支代表其不同的无性型类群.对开展该类真菌的物种多样性和分子系统学研究进行了展望.     

鼢鼠亚科 Mysopalacinae动物系统学研究现状与展望

现生鼢鼠是分布于东亚的一类典型地下啮齿动物,中国西部是其多个种的模式产地和主要分布区域。该类动物分布广、数量多,经济和生态意义重要,有关其控制和管理问题长期存有困扰。有效的物种管理离不开分类及生态学知识,但学界对该类群的分类地位与系统发育关系等至今仍有争议。随着分子系统学等现代科学技术的发展,其系统发育和分类地位等产生了许多新的研究结果。本文对近年来鼢鼠现存种系统学方面取得的研究进展进行了梳理,综述了鼢鼠亚科动物各系统分类的观点及其主要依据,分析了一些存在的问题,并就如何进一步分类研究等提出了建议,旨在促进鼢鼠亚科动物系统分类学研究的发展,为该类群物种资源合理利用与管理等提供基础资料。     

燕麦属系统学研究进展

对燕麦属(Avena L.)分类学、系统学、多倍体起源3个方面的研究进展进行了综述。燕麦属系统学研究存在的关键问题有:燕麦属的系统位置存在争议;燕麦属的范畴即大穗燕麦转隶归属问题缺少确证;燕麦属的系统发育关系尚未解决;六倍体栽培燕麦基因组起源备受争议;燕麦属分化时间尚未估测。六倍体栽培燕麦基因组起源争议的根源在于对A、C、D基因组间分化程度缺乏精准认识。总的来说,分子系统学、细胞遗传学、古地质学、古气候学的整合研究将为燕麦属多倍体起源和分化提供令人信服的新证据,对于深度利用谷类作物野生近缘种核心种质资源具有重要科学意义。     

长江流域野生猕猴桃遗传资源的潜在价值、现状分析与保护策略

长江流域是猕猴桃属(Actinidia)植物起源和演化的关键分布区, 富集了全世界重要的猕猴桃属野生物种资源和中华-美味猕猴桃物种复合体(Actinidia chinensis-A. deliciosa species complex)的种群遗传资源。作为水果作物, 猕猴桃在100多年前从长江流域经上海到新西兰, 通过栽培、驯化, 逐渐发展成新兴果树产业。目前, 猕猴桃植物的研究已在二倍体“红阳”中华猕猴桃(Actinidia chinensis cv. Hongyang)的基因组测序、种间关系的重测序分析和基础的分子系统发育、种群遗传结构等方面取得长足进步, 但基于最新研究成果的基本资源评价还相当匮乏, 对猕猴桃野生资源的保护与可持续利用亟待加强。本文回顾了栽培猕猴桃的驯化简史与猕猴桃属植物系统分类的研究进展, 通过与其他流域的比较, 对长江流域野生猕猴桃资源的潜在价值和现状进行分析, 阐述了该流域猕猴桃属植物的分布特点和受威胁的状况, 并针对目前存在的问题提出建立长效的保护机制、加强遗传资源的基础科研调查和系统评价, 以及健全种质资源保存规范和促进可持续利用等相应保护的策略。     

真菌系统学大趋势：越来越多的分类单元

分子生物学技术与真菌系统学的有机融合,为真菌分类和系统发育研究带来了革命性的变化。最近20年来,真菌学家们建立了大量的新目、新科、新属和新种,掀开了真菌多样性及其起源进化研究的新纪元,但很多重要的系统发育问题仍没有解决,特别是大量目间、科间的亲缘关系并不清楚。细分是真菌系统学的主流趋势,野生食用菌和毒蘑菇的分类也是如此,近年涌现了越来越多的新分类单元,如在2010-2019年的10年间,中国发表大型真菌（含地衣）新种1 240余个。本专刊收载的15篇论文是对我国野生食用菌和毒蘑菇研究工作的部分总结,对真菌资源利用、毒蘑菇中毒预防与治疗具有较重要的科学意义和应用价值。     

Ancestral state reconstruction reveals multiple independent evolution of diagnostic morphological characters in the "Higher Oribatida" (Acari), conflicting with current classification schemes

Background  

The use of molecular genetic data in phylogenetic systematics has revolutionized this field of research in that several taxonomic groupings defined by traditional taxonomic approaches have been rejected by molecular data. The taxonomic classification of the oribatid mite group Circumdehiscentiae ("Higher Oribatida") is largely based on morphological characters and several different classification schemes, all based upon the validity of diagnostic morphological characters, have been proposed by various authors. The aims of this study were to test the appropriateness of the current taxonomic classification schemes for the Circumdehiscentiae and to trace the evolution of the main diagnostic traits (the four nymphal traits scalps, centrodorsal setae, sclerits and wrinkled cuticle plus octotaxic system and pteromorphs both in adults) on the basis of a molecular phylogenetic hypothesis by means of parsimony, likelihood and Bayesian approaches.     

Application of the methods of molecular systematics to classification and identification of bacteria of the genus Bifidobacterium

The methods of molecular systematics currently used in the classification and identification of bifidobacteria are reviewed. The sequencing of the 16S rRNA gene and some other genes considered to be phylogenetic markers is a universal and effective approach to taxonomic characterization of members of the genus Bifidobacterium and to reliable identification of new isolates. Various techniques of obtaining DNA fingerprints (PFGE, RAPD, rep-PCR) are widely used for solving particular problems in identifying bifidobacteria. Bacteria of the genus Bifidobacterium are important organisms in biotechnology and medicine. The research into molecular systematics of bifidobacteria provides a basis not only for the solution of taxonomic problems, but also for monitoring of individual species in the environment and for more detailed study of the genetics and ecology of this group of microorganisms.     

台湾海峡鱼类绦虫的分子系统学研究

利用DNA测序技术对台湾海峡部分鱼类绦虫的16S rRNA和18S rRNA基因片段序列进行了分析。使用PAUP4·0b10软件构建的进化树显示,目前关于绦虫二叶目、锥吻目、假叶目、盘头目和四叶目的划分是比较合理的,绦虫进化基本遵循了头节形态从简单到复杂的进化规律。报道了国内首次发现的双叶目绦虫,进化树结果初步支持了巨槽属和棘头属的划分。此外,结果也支持了前孔属绦虫的分类地位。但是,对耳槽属绦虫与阶室属绦虫的形态学划分与分子系统学相矛盾,利用16S rRNA基因对盘头目各种的进化树分析与形态学差异很大,这些问题都需要更多研究来进行深入分析。     

A taxonomic wish-list for community ecology

Community ecology seeks to explain the number and relative abundance of coexisting species. Four research frontiers in community ecology are closely tied to research in systematics and taxonomy: the statistics of species richness estimators, global patterns of biodiversity, the influence of global climate change on community structure, and phylogenetic influences on community structure. The most pressing needs for taxonomic information in community ecology research are usable taxonomic keys, current nomenclature, species occurrence records and resolved phylogenies. These products can best be obtained from Internet-based phylogenetic and taxonomic resources, but the lack of trained professional systematists and taxonomists threatens this effort. Community ecologists will benefit most directly from research in systematics and taxonomy by making better use of resources in museums and herbaria, and by actively seeking training, information and collaborations with taxonomic specialists.     

Historical origins and genetic diversity of wine grapes

The genomic resources that are available to the grapevine research community have increased enormously during the past five years, in parallel with a renewed interest in grapevine (Vitis vinifera L.) germplasm resources and analysis of genetic diversity in grapes. Genetic variation, either natural or induced, is invaluable for crop improvement and understanding gene function, and the same is true for the grapevine. The history and vineyard cultural practices have largely determined the genetic diversity that exists today in grapevines. In this article, we provide a synopsis of what is known about the origin and genetics of grapes and how molecular genetics is helping us understand more about this plant: its evolution, historical development, genetic diversity and potential for genetic improvement.     

Systematics,conservation and sustainable development

The contribution of systematics to conservation and sustainable use of species is discussed. An adequate inventory of species is required for both areas and recent field work shows that the inventory is far from complete. This supports the first mission of Agenda 2000 which is to discover described and inventory global species diversity. The importance of making these data available in data base format is stressed. Sound systematics is a necessity for conservation legislation where control depends on the ability to identify organisms correctly. The establishment of reserves is also dependent upon data from systematics about centres of diversity and endemism and examples of this are given. Molecular systematics has made new tools available to conservation such as genetic fingerprinting which is useful both to breeding programmes of rare species and for identification for legal proceedings.Systematics is also one of the foundations for programmes of sustainable development especially in the search for new crops, non-timber forest plants from extraction forests and the identification of wild relatives of crop species. Examples of the role of systematics in a fuelwood programme in Zimbabwe, a sustainable development programme in northeast Brazil and in the search for a chemical component with medicinal properties for curing AIDS are given. The more predictive a classification we can develop using modern cladistic and molecular techniques the more useful systematics will be for both conservation and sustainable development. The goal of Agenda 2000 to organize the information derived from the programme in an efficiently retrievable form that best meets the needs of science and society is a laudable target that is crucial for conservation and the sustainable use of the plant resources of the world.