银松素合酶基因地高辛标记RNA探针的合成

目的:体外转录合成银松素合酶(PS)基因地高辛标记反义RNA探针。方法:通过双酶切把PScDNA全长序列接到pBlueskriptⅡKS( )的多克隆位点上;同时,经由NCBI比对确定PScDNA的特异序列,设计含有SalⅠ和XbaⅠ这2个酶切位点的上、下游引物,用PCR法扩增含有该位点的目的片段,并连接到pBlueskriptⅡKS( )的多克隆位点上;最后利用pBlueskriptⅡKS( )上的启动子T7,用T7RNA聚合酶在体外转录合成地高辛标记PS全长及特异序列的反义RNA探针。结果:通过对构建探针的单、双酶切,PCR及电泳鉴定,表明成功合成了PS基因地高辛标记的全长及特异序列的反义RNA探针。结论:RNA探针的合成为后续马尾松PS基因表达的RNA原位杂交研究打下了基础。     

RNA原位杂交技术及其在植物基因表达研究中的应用

原位杂交 ( In situ Hybridization)是一种在细胞水平上研究基因表达调控的最直接有效的分子生物学技术。这一技术最初应用于动物染色体上的基因物理定位 〔1〕和特定 m RNA在组织中的空间定位〔2〕,后来又作为诊断工具检测感染病毒的细胞 〔3〕。到 80年代后期 ,原位杂交技术开始应用于植物基因表达调控的研究 〔4～ 6〕。植物基因的时空表达研究是探讨植物生长发育机制的重要手段。由于 RNA原位杂交技术能够精确确定基因表达的时空分布 ,而得到了越来越广泛的应用 ;从营养器官生长发育〔7～ 9〕、生殖器官生长发育〔10～ 13〕、自交不…     

RNA原位杂交技术的一些应用技巧

目的:检测基因在动物组织或细胞中的时空表达模式。方法:转录反义RNA探针;利用RNA原位杂交技术检测人和小鼠牙原基中若干基因的表达。结果与结论:通过优化条件,转录出完整的反义RNA探针,并成功地利用RNA原位杂交技术在组织中检测到基因的表达;分析了一些在RNA原位杂交的过程中可能碰到的问题及其解决方法。     

叶际微生物对马尾松凋落针叶分解的影响

叶际微生物作为最先定殖在凋落叶上的微生物类群,可能直接参与凋落叶的分解。为验证此猜想,该研究通过扩增子高通量测序技术和室内分解实验,探究了马尾松(Pinusmassoniana)叶际微生物多样性及叶际微生物对马尾松凋落物的分解影响。结果表明:(1)马尾松的叶际存在着丰富而多样的微生物群体,针叶在凋亡后,叶际微生物群落发生变化。成熟针叶、凋落针叶、分解层针叶共有大量可操作分类单元(OTUs)。(2)马尾松针叶分解过程可分为两个阶段:快速分解期(前8个月)和缓慢分解期(8个月以后)。衰亡针叶(刚凋落但未接触土壤)叶际微生物可直接参与马尾松凋落针叶分解,且分解速率表现为叶际微生物+土壤微生物处理>叶际微生物处理>土壤微生物处理。在马尾松针叶分解过程中叶际微生物与土壤微生物存在协同作用。(3)凋落针叶分解速率与木质素和纤维素分解速率呈极显著正相关关系,但与木质素和纤维素分解酶活性无显著相关关系。木质素分解酶——多酚氧化酶与过氧化物酶活性极显著负相关,纤维素分解酶——β葡萄糖苷酶活性与纤维二糖苷酶活性则呈极显著正相关关系。综上,该研究结果表明叶际微生物可直接参与凋落针叶的分解,且其对...     

松突圆蚧为害对马尾松针叶主要次生物质的影响

对受松突圆蚧不同程度为害的马尾松针叶主要次生物质的测定表明,不同受害程度的马尾松与其针叶内的次生物质含量呈显著的相关性。黄酮、单宁和总酚含量随着为害程度的加重而发生变化,先增加,后降低,这说明了受害程度的强弱对马尾松诱导化学物质变化有影响,次生代谢物质的合成需要消耗能量和物质,影响主要代谢。这是被害松树针叶枯黄、枝干枯死直至植株枯死的原因之一。     

菌根化技术在广西马尾松育苗中的应用

通过对马尾松苗木的菌根土接种及苗圃地选择的试验,可知培育马尾松菌根化苗木,应选择土壤中菌根菌含量丰富的马尾松疏残林地、近年采伐迹地、林中空地、林缘下方,以及前茬是马尾松或湿地松的老苗圃地作为马尾松苗圃地。在这些地类上,结合施以足量腐熟有机肥做基肥,培育的马尾松苗木菌根感染率一般都在85%以上,苗木质量好。上述地类外的新垦苗圃地,应在生长健壮,无病原菌,而且最好是生长有马勃子实体的马尾松林下,挖取0—20厘米表土层进行菌根土接种,培育的松苗也可获得较高的菌根感染率。历史上未种过松类、栎类,附近又无松林的荒山荒地,用作马尾松苗圃地,苗木的菌根感染率极低,质量差。     

转查耳酮合酶基因矮牵牛共抑制的研究

查耳酮合酶是花色素合成途径的一个关键酶. 将查耳酮合酶基因(chalcone synthase A, chsA)导入矮牵牛(Petunia hybrida)后, 转基因植株的外源与内源chsA基因一起发生共抑制, 导致花色改变. 将β-葡糖苷酸酶基因(uidA)连在chsA基因下游形成融合基因, 通过土壤农杆菌介导的途径转化矮牵牛. 利用GUS组织染色检测到共抑制的发生具有发育特异性, 在花组织发育时期开始发生, 发生的起始需要内源基因与外源基因的相互作用. RNA原位杂交实验表明, 共抑制的发生没有组织特异性, 且初步表明共抑制发生后, RNA可能是在细胞质中发生降解的.     

马尾松染色体荧光带型的研究

对马尾松有丝分裂中期染色体荧光带纹的分析结果表明,其色霉素Ａ的染色体的荧光带赤;１对为着丝粒区和臂间我均有带纹的中间着丝染色体。６对为臂间区有带纺的中间着丝粒染色体;２对为着丝粒区有带纹的中间着丝粒染色体;３对无带纹的中间或近中着丝粒染色体;１对为着丝粒区有带纹的近中着丝粒染色体。     

原位杂交技术及其在果树研究中的应用

原位杂交技术是近年来快速发展起来的一门新技术,本文介绍了原位杂交技术的基本原理、方法及其发展前景,以及该技术与其它生物学技术相结合而形成的一些新技术。综述了这些技术在果树研究中的应用情况。     

原位杂交技术在稻属研究中的应用

在文献综述的基础上,对原位杂交技术在稻属的应用进行了介绍,主要包括3个方面:(1)特定 DNA序列的定位;(2)构建染色体的物理图谱及其与遗传图谱之间的关系;(3)稻属基因组间关系的研究。     

Developmental expression of 2ar (osteopontin) and SPARC (osteonectin) RNA as revealed by in situ hybridization

2ar has been identified as a gene inducible by tumor promoters and growth factors in a variety of cultured mouse cell lines (Smith, J. H., and D. T. Denhardt. 1987. J. Cell. Biochem. 34:13-22). Sequence analysis shows that it codes for mouse osteopontin, an RGDS-containing, phosphorylated, sialic acid-rich Ca++-binding protein originally isolated from bone (Oldberg, A., A. Franzen, and D. Heinegard. 1986. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 83:8819-8823; Prince, C. W., T. Oosawa, W. T. Butler, M. Tomana, A. S. Brown, and R. E. Schrohenloer. 1987. J. Biol. Chem. 262:2900-3907.). In this paper we use Northern blot analysis and in situ hybridization to localize expression of 2ar during mouse embryogenesis. 2ar RNA is first detected in developing limb bones and calvaria at 14.5 d p.c., in a population of cells distinct from those expressing SPARC (osteonectin). High levels of 2ar expression are also seen in the bone marrow-derived granulated metrial gland cells of the deciduum and placenta, and in a number of epithelial tissues, including embryonic and postnatal kidney tubules, uterine epithelium and sensory epithelium of the embryonic ear. The temporal and spatial pattern of 2ar expression seen in vivo suggests that the protein plays a wider role than previously realized, in processes which are not confined to bone development.     

High-throughput analysis of gene expression on tissue sections by in situ hybridization

Genome-scale sequencing projects, high-throughput RNAi screens, systematic gene targeting, and system-biology-based network predictions all depend on a validation of biological significance in order to understand the relevance of a particular finding. Such validation, for the most part, rests on low-throughput technologies. This article provides protocols that, in combination with suitable instrumentation, make possible a semi-automated analysis of gene expression on tissue sections by means of in situ hybridization. Knowledge of gene expression localization has the potential to aid, and thereby accelerate, the validation of gene functions.     

昆虫小器官RNA荧光原位杂交技术

【目的】在昆虫基因表达和功能研究中,RNA原位杂交技术越来越受到青睐。该技术不仅能定性定量反应基因表达的时空特异性,而且能在细胞水平上检测基因表达的调控模式。为了将该技术更好地在昆虫小器官研究中运用,我们以果蝇幼虫翅芽为例优化了改技术。【方法】解剖果蝇3龄幼虫翅芽进行原位杂交实验。【结果】我们发现影响原位杂交结果的因素十分复杂,包括取材时期,探针的合成,预杂交/杂交的时间和温度,清洗时间,适当的对照等。通过RNA荧光原位杂交实验,我们揭示了调控细胞记忆的trithorax基因在3龄翅芽广泛表达,并且受到转录因子Optomotor-blind的负调控。【结论】这一技术方法为研究昆虫小器官的基因表达和调控提供了便捷手段。     

Analysis of microRNA expression by in situ hybridization with RNA oligonucleotide probes

In situ hybridization is an important tool for analyzing gene expression and developing hypotheses about gene functions. The discovery of hundreds of microRNA (miRNA) genes in animals has provided new challenges for analyzing gene expression and functions. The small size of the mature miRNAs ( approximately 20-24 nucleotides in length) presents difficulties for conventional in situ hybridization methods. However, we have described a modified in situ hybridization method for detection of mammalian miRNAs in tissue sections, based upon the use of RNA oligonucleotide probes in combination with highly specific wash conditions. Here, we present detailed procedures for detection of miRNAs in tissue sections or cultured cells. The methods described can utilize either nonradioactive hapten-conjugated probes that are detected by enzyme-coupled antibodies, or radioactively labeled probes that are detected by autoradiography. The ability to visualize miRNA expression patterns in tissue sections provides an additional tool for the analyses of miRNA expression and function. In addition, the use of radioactively labeled probes should facilitate quantitative analyses of changes in miRNA gene expression.     

马尾松受害诱导的化学物质滞后变化

通过接种马尾松毛虫Dendrolimus punctatus和人工剪叶,分析比较了不同受害方式对马尾松针叶内化学物质的影响。结果表明,害虫取食松针诱导的次生代谢物质(单宁、酚类物质)比人工剪叶处理略有增加,而营养物质-可溶性糖变化不大。对马尾松进行害虫取食为害、人工剪叶受害、未受害三种处理后,连续3年跟踪测定了松针叶内化学物质含量的变化。结果发现,无论是害虫取食为害,还是人工剪叶受害,针叶内次生代谢物质含量都减少,可溶性糖含量降低,直至一年后才恢复到原有的水平;蛋白质变化的趋势则始终是受害处理的含量比未受害处理的含量高,表明马尾松受害后诱导的化学物质变化具有滞后特性。