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相似文献
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1.
汉坦病毒的基因分型及其序列分析   总被引:3,自引:0,他引:3  
为了探讨从核苷酸水平耐汉坦病毒进行分型,设计两对型特异性引物,采用反转录和聚合酶链式反应(RT-PCR),对亚太地区18株汉坦病毒进行了扩增鉴定,并对其中7株汉坦病毒的PCR产物进行了测序分析。PCR的分型结果表明,Ⅰ型引物只能扩增血清Ⅰ型病毒的cDNA;Ⅱ型引物也只能扩增血清Ⅱ型病毒,其间无交叉反应。采用巢式PCR和限制性内切酶验证了PCR产物的特异性。序列分析结果表明,R36M片段G1区的核苷酸序列与血清Ⅰ型病毒代表株76-118的同源性为78.4%,而与血清Ⅱ型病毒R22的同源性为68.1%;R36与汉坦病毒序列同源性的成对比较结果也表明,R36与血清Ⅰ型病毒的同源性均高于血清Ⅱ型病毒;Leakey虽然能被Ⅱ型引物扩增,但其序列与血清Ⅱ型病毒R22的同源性仅为44.9%,故不属于血清Ⅱ型病毒。上述研究结果表明,反转录聚合酶链反应能对多数汉坦病毒准确分型,但最终结果尚有赖于序列分析。  相似文献   

2.
李金中  何洪彬 《病毒学报》1999,15(2):180-184
根据Barrett报道的犬瘟热病毒Onderstepoort弱毒株的融合蛋白基因序列,设计合成了一对能扩增324bp基因片段的引物。将异硫氰酸胍-酚-仿一步法提取得到的细胞总RNA进行反转录,以此产物为模板进行PCR扩增,并对PCR扩增条件进行了优化。经鉴定,以此对引物进行的PCR扩增,得到了与设计片段大小和酶切位点相同的产物,且不扩增犬细小病毒、犬腺病毒和狂犬病病毒犬的三种病原的核酸,这表明此方  相似文献   

3.
PCR和生物素探针对HFRSV的检测和分型的探讨   总被引:2,自引:0,他引:2  
分析比较肾综合征出血热病毒(HFRSV)76/118株和R_(22)株的核苷酸序列,根据引物设计原则及检测分型的目的,设计并合成了3对引物。1对引物取于两毒株间的高同源区段,作为共同引物和外引物;另两对引物取于两毒株间的低同源区段,分别作为野鼠型引物、家鼠型引物和内引物。建立了DNA聚合酶链反应(PCR)和NestPCR方法,并用NcstPCR合成了两种型特异的生物素探针。PCR检测76/118、A_9、陈、R_2、R_225个毒株,用外引物时均扩增出1条约300bp的条带;用内引物的野鼠型引物时,除R_(22)株之外,其余4株均扩增出1条约70bp的条带。斑点杂交试验证实了PCR检测分型的准确性。NestPCR和生物素探针斑点杂交试验可以测出1-10bg的目的cDNA。  相似文献   

4.
应用聚合酶链反应(PCR),对分离自不同地区、不同宿主来源的26株肾综合征出血热病毒进行了分型,其中包括4个型别的国际标准株,用异硫氰酸胍-酚-氯仿方法从感染的Vero-E6细胞中提取总RNA,设计了5对寡核苷酸引物,一对为汉坦病毒特异性引物;4对为不同型特异性引物。PCR分型表明,26株中除1株Rr可同时被汉坦(HYN)和Seoul(SEO)两型特异性引物扩增外,其余25株分别只被4个型别引物中的一个所扩增,依次为HTN16株,SEO7株,Puumala(PUU)1株,ProspectHill(PH)1株。PCR分型的结果与空斑减少中和试验完全一致,表明PCR可以对肾综合征出血热病毒准成分型。应用限制性内切酶分析了扩增产物,结果与理论基本一致,证实了扩增产物的特异性。  相似文献   

5.
用NestedPCR检测牛白血病病毒的前病毒形式。从牛白血病病毒基因gp51上选择两对引物进行NestedPCR体外扩增,产物经2%agarose凝胶电泳和用生物素标记的探针鉴定,证实其特异性。结果表明该方法能从两个BAT-BLV细胞内检测出BLV的前病毒DNA形式。  相似文献   

6.
RT—nested PCR检测肾综合征出血热患者血清病毒核酸   总被引:3,自引:0,他引:3  
采用异硫氰酸胍-酚-氯仿(AGPC)一步法提取病毒RNA,并依据肾综合征出血热病毒(HFRSV)核蛋白(NP)编码基因保守区核苷酸序列合成两对巢式引物,建立了逆转录巢式聚合酶链反应(RT-nestedPCR)检测HFRSVRNA方法,应用此法对HFRSV感染的VeroE6细胞培养液及HFRS患者血清中的病毒RNA进行检测。结果显示,感染细胞培养液及35例HFRS患者血清均为阳性,正常的VeroE6  相似文献   

7.
糖单孢菌16S rDNA的PCR-RFLP分析   总被引:5,自引:0,他引:5  
PCR-RFLP分析适用于种和种间水平的多相分类研究。文章对PCR-RFLP方法应用于糖单孢菌属分类有具体方法进行了探讨;报道了一组适于糖单孢菌属PCR-PFLP分析的限制性内切酶,并用这组酶对6株糖单孢菌属分离株进行了研究,进一步探讨了实验菌株在该属的分类地位。同时指出了PCR-RFLP方法应用中应注意的问题。  相似文献   

8.
应用反转录—聚合酶链反应检测口蹄疫病毒   总被引:9,自引:0,他引:9  
朱彩珠  卢永干 《病毒学报》1998,14(3):272-278
建立了一种适用于检测动物(猪、牛、羊)组织(肌肉、淋巴结、脊髓、扁桃体和蹄冠皮)和牛食道-咽部分泌物(O-P液)中的口蹄疫(FMD)病毒核酸(RNA)的反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)技术。引物对是人工合成的两条20mer寡核苷酸片段,它们的序列相应于FMD病毒结构蛋白VP1基因后2/3区段,在4个血清型之间基本一致(保守)。PCR产物经琼脂糖凝胶电泳检测。试验结果表明,RT-PCR具有良好的  相似文献   

9.
利用简并引物RT-PCR扩增技术,结合RT-PCR扩增片段RELP分析,对洋水仙14个病毒病样品进行分组检测,结果表明洋水仙植物上存在有四种以上PVY组病毒侵染。它们可能是TBV、NYSV、NSSV和OnYDV等。  相似文献   

10.
王业富  齐义鹏 《病毒学报》1999,15(3):252-259
用苜蓿银纹夜蛾核型多角体病毒凋亡抑制基因p35的合成引物,从棉铃虫核型多角体病毒基因组中用PCR扩增到1kb片段。采用PCR-双脱氧核苷酸链终止银染法,测定了所扩增到的1010bp全序列,发现其开放阅读框完整,长897bp,编码299个氨基酸。  相似文献   

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A study of four species of Erysiphaceae (Uncinula salicis, Podosphaera leucotricha, Erysiphe cichoracearum, and Microsphaera diffusa) revealed that the binucleate stages of the ascocarp are initiated in a similar manner to those of Diporotheca rhizophila Gordon & Shaw. The “appendages” developing on immature ascocarps are considered to be receptive hyphae. Appendages characteristic of mature ascocarps are produced much later. Lysis of certain centrum cells occurs, and asci are initiated from some of the remaining binucleate centrum cells. Resorption of centrum cells by the asci is supported by this investigation, corroborating Björling's earlier studies on Erysiphe graminis.  相似文献   

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